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大腸癌分子生物學特征—轉化醫學與臨床應用研究

2011-08-15 00:53:27韓英盛劍秋
中國繼續醫學教育 2011年12期
關鍵詞:基因突變檢測

韓英 盛劍秋

北京軍區總醫院消化內科

大腸癌分子生物學技術及其轉化應用研究在 CRC篩查和診斷方面具有重要臨床意義。

1 大腸癌分子路徑

大腸癌分子路徑主要有三種:(1)染色體不穩定(CIN)路徑:占全部散發性CRC病例的70%~85%以上;(2)CpG 島甲基化表型 (CIMP) 路徑:導致散發性CRC的另一條主要路徑,包括高度MSI不穩定(MSI)所致的散發性CRC;(3)純微衛星不穩定(MSI)路徑:由于DNA錯配修復 (MMR) 基因胚(種)系突變,例如遺傳性非息肉病性大腸癌 (HNPCC) 。

參與CIN路徑的基因異常包括:APC基因,KRAS基因突;TP53基因。APC或β-catenin基因突變頻率,在腺瘤早期高達80%。APC基因突變的發現率,結腸癌約為60%,直腸癌約為82%。TP53 基因是腺瘤演變為腺癌的傳統路徑中的晚期事件;SMAD4蛋白胚系突變會導致幼年性息肉病綜合征,此病和CRC有關。在CIN路徑導致的CRC中,完全具備全部上述分子生物學異常者只占極少數。

MSI是一種重要的基因組不穩定路徑。在腫瘤和胚系細胞DNA的微衛星區域內,核苷酸重復序列復制錯誤,因而造成不穩定性。復制這些短的重復序列時,DNA聚合酶非常容易出錯,此種錯配修復(MMR)功能障礙導致了MSI。MMR系統組成至少有7種蛋白,MLH1基因、MLH3、MSH2、MSH3、MSH6、PMS1和PMS2,7種蛋白間特異性結合,形成功能性異二聚體(heterodimers)。MLH1和MSH2在錯配修復機制中是不可或缺的,具有五種功能性異二聚體蛋白(heterodimeric proteins)(MSH2-MSH3,MSH2-MSH6,MLH1-PMS1,MLH1-PMS2,MLH1-MLH3)。

HNPCC與MLH1、MSH2、MSH6和PMS2的基因突變有關。檢測兩種單核苷酸(BAT25和Bat26)和三種二核苷酸(D5S346、D2S123和D17S250)。MSI-高度不穩定(MSI-H):上述5個檢測位點中,MSI≥2(40%);MSI-低度不穩定(MSI-L):只有一個檢測位點陽性;微衛星穩定(MSS):5個檢測位點均未發現不穩定性。

CIMP路徑是散發性CRC的另一常見路徑,約占散發性CRC的15%。CIMP路徑中啟動子區的甲基化異常,關鍵的抑癌基因(如MLH1)表達失活,導致表觀遺傳不穩定性,是散發性CRC的重要機制。CIMP陽性:3個以上的基因啟動子位點PMR≥10。CIMP陽性與BRAF基因突變密切相關;可分為兩型:CIMP-高(或CIMP1):與BRAF基因突變相關,CIMP-低(或CIMP2),與KRAS基因突變相關,其病理學癌前病變的特征為絨毛腺瘤;細化分型的目的是為了深入探討癌變機制。CIMP陽性CRC具有明確臨床及病理特征:腫瘤好發于近端結腸,多見于中老年女性(最終的表型取決于是否伴發因基因啟動子甲基化導致MLH1轉錄沉默所誘導的微衛星不穩定性)。CIMP陽性+非MSI-H表型CRC病理的浸潤進展更嚴重,臨床預后及轉歸較差;病理組織中缺乏腫瘤浸潤淋巴細胞;CIMP路徑的癌前病變主要是無蒂鋸齒狀腺瘤。典型的CIMP陽性+MSI-H CRC 與純MSI-H CRC的特征相似,預后較好。腺瘤性息肉(從單純腺瘤發展為進展期腺瘤,最終形成浸潤性腺癌)是CIN路徑CRC以及HNPCC的癌前病變。鋸齒狀息肉(也是很重要的一種息肉)是CIMP路徑CRC的癌前病變 。

已經建立了家族性CRC綜合征從實驗室到臨床(bench to bedside)的診斷方法,是大腸腫瘤轉化醫學研究的最前沿水平。家族性CRC綜合征研究成果有助于深化對CRC的認識。

2 大腸癌分子生物學檢測對臨床診療的指導

大腸癌分子生物學檢測對臨床診療的指導包括以下幾個方面:

(1)FAP是常染色體顯性遺傳綜合征。APC基因胚系基因突變(APC是CIN路徑中的重要基因)。特征是大腸腺瘤數目>100個。如果沒有手術干預,所有FAP病例均于50歲前發展為CRC。

(2)APC基因突變位點影響疾病的表型(無論是病變嚴重程度抑或相關的腸外特征都會受到影響)。APC基因中心區發生突變,大腸腺瘤數目較多,為典型FAP;

突變發生在基因兩端的3(或5)時,導致一種較為溫和的表型即所謂的衰減型FAP(AFAP),其特點是大腸腺瘤數目<100個,CRC發生發展緩慢,比典型FAP延遲大約15年。

(3)MUTYH。MUTYH是一種DNA糖基化酶,幫助修復由于DNA氧化損傷導致的堿基錯配防止基因突變(例如APC和KRAS),在CIN路徑CRC發生發展過程中發揮關鍵作用。DNA修復缺陷是MAP的病因;MAP是一種常染色體隱性遺傳疾病,導致多發性大腸腺瘤和癌癥。MAP在表型上和AFAP相似。MUTYH雙等位基因突變導致CRC風險增加93倍。

(4)MAP臨床遺傳學檢測、篩查及咨詢。應對下列對象進行APC和MUTYH基因胚系突變檢測、篩查及臨床遺傳學咨詢:大腸腺瘤>20個(包括異時性病變);發病年齡<60歲、腺瘤數目>/ = 5,本人或一、二級親屬中60歲前患CRC或高級別異型增生腺瘤者。檢測程序通常會根據家族史而定。 已經確定的臨床病理標準可用于判定HNPCC“高危”患者及親屬;“高危”者應接受進一步的分子生物學檢測:MSI分析以及免疫組化法檢測與HNPCC相關的四個MMR蛋白質,即MLH1、MSH2、MSH6和PMS2。如果MSI-H或腫瘤組織中選擇性表達蛋白質缺失,則先證者需要接受胚系基因檢測。HNPCC與 BRAF基因突變無關。BRAF檢測具有新的意義:BRAF陽性可以確定為CIMP路徑散發性CRC,從而排除HNPCC;臨床上,MSI-H+BRAF陽性CRC有助于判定其源于CIMP路徑MLH1基因甲基化,而不是HNPCC。

3 我們的研究工作

目前,我們已建立起以北京為中心,輻射北方地區的HNPCC協作組,共收集約200余個HNPCC家系。資料包括:患者腫瘤組織切片、患者及家系成員外周血樣本、提取的DNA、RNA以及相關臨床資料。建立了HNPCC MMR基因檢測綜合研究平臺。包括免疫組化檢測蛋白表達、微衛星不穩定性檢測、突變檢測、基因測序、大片段缺失和啟動子甲基化檢測等技術。利用該平臺對106個中國北方地區HNPCC家系進行了系統研究,43個家系中發現了致病性突變。

在14個FAP家系先證者中發現9例微小突變,突變檢出率為64.3%。包括6個移碼突變,2個剪接區突變和1個無義突變。發現4個新的APC基因微小突變。在微小突變檢測陰性的5例患者中,用MLPA的方法檢測出2例存在大片段缺失,這兩種大片段缺失均未見報道,大片段缺失的檢出率為14.3%。微小突變與大片段缺失的總檢出率為78.6%。

目前,EGFR受體導向治療前常規進行KRAS基因檢測。單克隆抗體西妥昔單抗(cetuximab)和帕尼單抗(Panitumumab)的靶點是表皮生長因子受體(EGFR) 和RAS-RAF-MEK-ERK路徑,在治療轉移性CRC方面發揮重要作用。KRAS突變、野生型KRAS但BRAF或PIK3CA突變,對表皮生長因子受體導向治療無反應。

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