王清,葛瑩,宋廣輝,趙素芝
(1 青島大學醫學院附屬醫院檢驗科,山東 青島 266100; 2 山東省煤炭泰山療養院內二科)
血清胱抑素C(Cys C)作為一種新的反映腎小球濾過率(GFR)的內源性標志物,為判斷腫瘤、肝硬化、腎衰竭等疾病中GFR的變化提供了快速、精確而又簡單的方法。有人已經原核表達了Cys C,由于融合蛋白以包涵體形式存在,包涵體蛋白的復性和純化過程非常復雜,而且由于原核生物密碼子的偏性,導致了真核基因在原核表達系統表達率較低[1]。畢赤酵母表達系統作為一種適宜表達外源基因的真核表達系統,得到了廣泛的應用[2]。本研究利用該表達系統,使Cys C基因在巴斯德畢赤酵母(P.pastoris)中表達,并對表達產物進行了免疫原性分析。現將結果報告如下。
1.1.1 菌種和質粒 P.pastoris GS115(His-,Mut+)和質粒p PIC9k由本室保存。
1.1.2 主要試劑和儀器 限制性內切酶(Takara生物技術有限公司),蛋白分子質量標準(上海拜力生物科技有限公司),G418、生物素、酵母氮源(YNB)和硝酸纖維素膜(上海生工生物工程有限公司),顆粒增強透射免疫比濁法(PETIA)CysC檢測試劑盒(北京利德曼生物技術有限公司),Bio-Rad Gene Pulser電轉化儀、CysC蛋白標準品(新城生物科技股份有限公司),鼠抗人CysC單克隆抗體(Abcam公司,英國)。
1.1.3 培養液 YEPD:酵母粉10 g,蛋白胨20 g,葡萄糖20 g,蒸餾水1 000 mL,p H 6.0,115℃濕熱滅菌20 min。MD:13.4 g/L YNB,4×10-4g/L生物素,20 g/L葡萄糖,15 g/L瓊脂。BMGY:2 g/L蛋白胨,1 g/L酵母提取物,100 mmol/L磷酸鉀緩沖液(p H 6.0),13.4 g/L YNB,4×10-4g/L生物素,1 g/L甘油。BMMY:將 BMGY 中的1 g/L甘油替換為5 g/L甲醇。MM:13.4 g/L YNB,4×10-4g/L生物素,5 g/L甲醇。
1.2.1 構建攜帶合成Cys C基因的重組表達載體p PIC9k-Cys C 根據 Cys C的 mRNA 序列(Gen-Bank公布)進行分析,按照P.pastoris GS115(His-,Mut+)表達系統密碼子偏好[3],優化基因序列,檢查基因內部有無特別復雜二級結構和重復序列;用P.pastoris GS115(His-,Mut+)偏愛的密碼子替代野生型Cys C基因序列中的酵母稀有密碼子,調整GC含量,消除富含AT的序列區段,避免翻譯的提前終止,并且避免可能影響mRNA穩定性的連續5個或5個以上的A/T或G/C重復序列。合成Cys C基因經同義密碼子修改以后,所編碼蛋白質的氨基酸序列并未發生變化。根據基因序列的分析結果,人工合成Cys C,連接至目的載體p PIC9k,構建p PIC9k-Cys C并轉化到感受態細胞DH5中,測序,驗證重組克隆中基因序列是否與要求相符。
1.2.2 轉化P.pastoris GS115 將5~20μg質粒DNA用SalⅠ線性化,電轉化GS115細胞(參數:電壓1.5 k V,電容25μF,電阻200Ω),電擊時間4~10 ms,His+轉化子接種到無組氨酸的MD平板上,30℃培養3~4 d。然后,PCR分析目的基因是否整合到基因組中。設計一對用于擴增插入片段的引 物,引物序列如下:5′AOX1-F,5′-GACTGGTTCCAATTGACAAGC-3′;3′AOX1-R,5′-GCAAATGGCATTCTGACATCC-3′。PCR 反應條件:94 ℃預變性5 min;94℃變性1 min,52℃退火1 min,72℃延伸1 min,25個循環;72℃延伸10 min。
1.2.3 重組酵母陽性轉化子的多拷貝整合篩選根據p PIC9k中的表達手冊(Invitr ogen公司)篩選多拷貝整合菌株。將轉化菌落分別點在G418濃度分別為0.5、1.0、2.0、3.0 g/L的 YEPD培養板上,30℃培養3~4 d,篩選多拷貝整合菌株。然后將高拷貝的重組子分別對應點于MM和MD培養板上,篩選His+Mut+陽性克隆。
1.2.4 Cys C的誘導表達 將G418篩選出的高拷貝轉化子3株分別接種于100 mL BMGY增菌培養液中,28~30℃、280 r/min振蕩過夜至A600為3~6。3 000 r/min離心5 min收集細胞,在4℃下將細胞沉淀物重新懸浮在500 mL含10 g/L酪氨酸BMMY(p H 6.0)培養液中,使懸浮液A600=1。每24 h加10 g/L甲醇,誘導表達5 d,收獲的時間間隔為0、24、48、72、96和120 h,用 PETIA Cys C檢測試劑盒確定最佳收獲時間。空載體p PIC9k轉化子作為陰性對照,在相同條件下被誘導。
1.2.5 SDS-PAGE和 Wester n blot分析 取30 μL培養物上清液在120 g/L SDS-PAGE上電泳,考馬斯亮藍R-250染色。通過SDS-PAGE分離的蛋白質轉移到硝酸纖維素膜上,然后用鼠抗人Cys C單克隆抗體(1∶1 000稀釋)孵育,并用小鼠抗兔Ig G(1∶4 000稀釋)與辣根過氧化物酶(HRP)耦聯。洗膜,用四甲基聯苯胺(T MB)反應10 min。
1.2.6 動物免疫及血清抗體檢測 將Bal b/c小鼠隨機分為A組和PBS組,每組12只。A組每只小鼠皮下注射50μg純化的酵母表達重組蛋白和等體積完全弗氏佐劑,PBS組注射PBS和等體積完全弗氏佐劑。首次免疫后14 d加強免疫1次,7 d后再免疫1次,追加免疫用不完全弗氏佐劑,共免疫3次。眶靜脈取血,4℃放置分離血清,-20℃凍存備用。應用標準品Cys C蛋白作為抗原間接ELISA檢測免疫小鼠血清中抗Ig G抗體。
1.2.7 Cys C定量測定 用PETIA Cys C檢測試劑盒確定最佳收獲時間。取各個時間間隔少量培養液,離心后用日立全自動生化分析儀PETIA Cys C試劑盒測定Cys C濃度,嚴格按說明書操作。
120個氨基酸密碼子中有77個進行了優化,消除避免可能影響mRNA穩定性的連續5個或5個以上的A/T或G/C重復序列9處,中止子由TAG轉換為TAA。優化基因序列后GC含量由原來的60.8%降低到37.7%。合成的基因使用同義的密碼子而氨基酸序列沒有變化。所設計的合成Cys C基因與野生型Cys C基因序列對比見表1。

表1 合成CysC基因與野生型CysC基因序列對比
以少量堿裂解法快速提取的重組質粒p PIC9k-Cys C,經Eco RⅠ及NotⅠ雙酶切及DNA序列分析顯示,重組質粒p PIC9k-Cys C符合設計要求,重組克隆構建成功。
電轉化法轉化畢赤酵母,能產生足夠數量的轉化體。
陽性表達菌在相對分子質量約19 000處有一條帶,空載體陰性對照菌未見該條帶。表達水平與拷貝數呈正比,即高拷貝高表達,產物約占分泌總蛋白的80%以上(圖1)。

圖1 表達產物的SDS-PAGE分析
通過SDS-PAGE分離的蛋白質轉移到硝酸纖維素膜上,能與相應Cys C抗體形成單一蛋白條帶,證明表達純化的蛋白是Cys C蛋白(圖2)。
ELISA間接法測定抗血清效價為1∶8 000;Wester n blot測定顯示抗血清能與Cys C標準品發生免疫反應。
Cys C定量測定結果顯示,Cys C高拷貝轉化子誘導表達的最佳收獲時間為120 h,其上清液濃度達到600~950 mg/L。

圖2 CysC表達蛋白鑒定
Cys C是一種半胱氨酸蛋白酶抑制劑,在抗病毒、抑制腫瘤的生長、預防食品加工過程中蛋白水解方面具有潛在的應用價值。此外,內源性Cys C是一種檢測GFR的新指標。雖然已在大腸埃希菌中表達了Cys C融合蛋白,但該蛋白多以包涵體形式存在,而且由于原核生物密碼子的偏性,導致了大腸埃希菌為宿主菌的原核表達產物量低[1-4]。
為了高純度、高產量表達Cys C蛋白,本研究選擇了p PIC9k作為表達載體,并在P.pastoris GS115中表達Cys C。因為許多外源蛋白質在酵母中表達,得到類似于在哺乳動物細胞中產生的、結構和生物活性相似的天然的蛋白質[5-6]。此外,p PIC9k中的α因子分泌信號序列,使得畢赤酵母成為非常有用的蛋白表達系統。p PIC9k為整合型分泌表達載體,畢赤酵母His+轉化子高拷貝整合事件自發發生的概率為1%~10%,p PIC9k含有細菌kan基因,賦予畢赤酵母遺傳霉素抗性。遺傳霉素抗性水平主要依賴整合的kan基因的數目。單拷貝p PIC9k整合入畢赤酵母基因組后,賦予P.pastoris約0.25 g/L的遺傳霉素抗性水平。任何載體多拷貝整合可增加遺傳霉素抗性水平,從0.5 g/L(1~2拷貝)到4.0 g/L(7~12拷貝)。由于kan基因與表達盒(p AOX1及目的基因)之間有遺傳連鎖,可從遺傳霉素高抗性推斷該克隆所包含多拷貝目的基因數[7]。由于基因的劑量效益,蛋白的表達可能會增加,拷貝數越高表達量也越高[8]。
外源蛋白可在P.pastoris胞內表達或分泌至胞外。分泌表達需要蛋白上的信號肽序列,將外源蛋白靶向分泌至胞外。P.pastoris只分泌很少的自身蛋白,加上P.pastoris最小生長培養基中只有少量的蛋白,這意味著分泌的外源蛋白是培養基中蛋白的主要組成成分,也可算作蛋白純化的第一步。
在P.pastoris中表達較高的基因往往是采用P.pastoris本身所偏愛的密碼子,研究也表明在所有61個密碼子中有25個是P.pastoris偏愛的。趙翔等[9]通過對P.pastoris的28個蛋白編碼同義密碼子的使用情況進行分析,確定了P.pastoris的19個高表達優先密碼子。多位學者通過對密碼子進行優化,改良基因,大大提高了異源基因在P.pastoris中的表達[10-12]。
在以往的研究中,P.pastoris表達的Cys C基因均使用野生型基因[13],其密碼子可能不是宿主細胞進行高水平表達所偏愛的密碼子,因此表達水平應有提升空間。本研究根據P.pastoris表達系統的特性,在氨基酸序列不變的條件下,重新設計Cys C基因,去除復雜的二級結構和重復序列,調整GC含量,消除富含AT的序列區段,避免翻譯的提前終止,并且避免可能影響mRNA穩定性的連續5個或5個以上的A/T或G/C重復序列。在120個氨基酸密碼子中有77個進行了優化,消除避免可能影響mRNA穩定性的連續5個或5個以上的A/T或G/C重復序列9處,終止子由TAG轉換為TAA。優化基因序列后,GC含量由原來的68.6%降低到43.6%。通過密碼子優化,Cys C的表達水平達到600~950 mg/L的標準,雖然其數值略低于通常高5~10倍的密碼子優化的研究結果[14],但它仍然高于其他研究結果[15]。
本研究用P.pastoris表達重組Cys C的優點為:①在酵母真核表達系統中進行重組表達,表達產物無需包涵體的變性和復性處理,也不需融合蛋白的凝血酶切割,誘導表達后收集培養液上清即可得到活性的Cys C;②表達量高,雜蛋白很少,表達量可以達到克級,即使不純化,蛋白純度也可達到80%以上;③根據酵母密碼子偏好,優化Cys C序列,可以進一步提高Cys C表達量。可見,根據P.pastoris密碼子的偏好,將人Cys C基因進行密碼子優化和表達,為外源基因的表達提供了一種理想的方法。
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