博士和他的敵人

第一任博士在擊敗了Cyoermon的一次入侵后受重傷重生

第二任博士因違反時間領主的“永不干涉”原則而被流放地球，并被強制重生

第三任博士在“TheGreatone”的洞穴中被藍水晶溢出的致命輻射所傷而重生

第四任博士為了阻止Master威脅全宇宙的企圖。從數百英尺高空跌落地面奄奄一息而重生

第五任博士因接觸劇毒感染血毒癥，又將僅得的惟一一份解藥給了同伴，自己瀕死而不得不重生

第六任博士在Tardb的一次劇烈相撞中失去意識，進入重生狀態

在一次手術中由于醫生不了解時間領主兩顆心臟的生理結構而破壞了其循環系統。導致第七任博士的死亡

沒有人確切地知道第八任博士重生的原因

把同伴Rose從吸食了大量時間漩渦能量中拯救出來導致第九任博士的重生因拯救老人Wilf而吸收了大量輻射導致第十任博士重生

Daleks

Dalek（音譯成“戴立克”）曾挑起字宙最大的戰爭——時間大戰，而被時間領主一族所滅，同時，時間領主一族除Doctor和Master外，也幾乎滅絕。Dalek是《神秘博士》劇集里最大的反派，身材小，樣貌丑陋，一世都蜷縮在特殊金屬制作的外殼中。他們冷酷無情，以毀滅為最高榮譽和目標，卻又多次利用Doctor的仁慈而逃生。

但事實上，當Daleks出現的次數多了以后，反而覺得它們略有些可愛：沒有音調起伏的金屬聲音重復地說著“exterminate（消滅）”，馬桶吸外型的伸縮操縱臂，氣泡膜一樣的圓形突起……它們從未被根除，總是躲在宇宙時空的某一個角落伺機反擊，甚至企圖操縱第二次世界大戰以此統治地球——當然，卻從未如愿以償。

Cybermen

Cyberman（復數Cybermen，音譯成“賽博人”）是一種虛擬機器化生物（賽博格，cyborg）角色，他是《神秘博士》中持久出現的反派。Cyberman最開始完全是一種有機生命物種，起源于地球雙行星Mondas的人形機器人，他們為了自我保護，把更多的人造器官移植到自己的身體上，這導致這個種族變得邏輯無情并且相當精明，他們所有的情感都被從他們的思想中刪除。Cybermen和Daleks在一次聯手對地球的進攻中導致了第十任博士與搭檔Rose的分離。

Weeping Angels

Weeping Angels（哭泣天使）被“有道詞典”摘錄成固定名詞詞組，它們是專門偷時間的一種古老得能和宇宙相提并論的完美生物。哭泣天使的進食方式是將受害者送回過去的某個時間點，以此來獲得時間能量進食。當它們被別的生物注視時，它們在某個位置點上靜止不動像一尊石雕天使；一旦對方移開視線，它們立即悄無聲息地迅速行動。為了避免同伴之間的相互注視導致石化現象被永恒鎖定，它們往往捂住雙眼，這使得它們看上去就像在哭泣一樣。如果不幸遇見哭泣天使，你惟一能夠做的就是：不要眨眼。

The MaSter

Master（法師）是Doctor反復出現的對手，正如莫里亞蒂教授對于福爾摩斯一樣。法師與博士是同一族人，同樣在時間大戰中幸存。他8歲時參加了時間領主的成人儀式，在儀式上被帶到無節制裂縫前看到了時空裂縫，目睹了時空漩渦后的他，人格受到影響進而變得瘋狂。時間大戰結束后，他處處出現與博士作對，而同時，他與博士之間又存在著一種相互對應相互依賴的關系。