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銀離子摻雜DNA的拉曼光譜研究

2013-12-31 00:00:00班戈李素蕊
科技創新與應用 2013年29期

摘 要:文章研究了摻雜了銀離子的DNA的拉曼光譜。結果顯示結合了銀離子的DNA發生了一系列的變化,鳥嘌呤和腺嘌呤的伸縮振動峰1576、1487、1375和727cm-1向低波數移動了4-10cm-1,堿基之間氫鍵的拉曼譜峰1665cm-1明顯變寬,DNA中PO2-的對稱伸縮振動峰1091和788cm-1分別移動到了1085和781cm-1, B構象830cm-1譜峰強度明顯降低。說明銀離子和 DNA堿基之間的氫鍵產生了相互作用,使DNA雙鏈解旋,并且DNA的構象也發生改變。

關鍵詞:拉曼光譜;銀離子;DNA

分子自組裝是近年研究的熱點,更是納米器件發展的重要組成部分。自從DNA內部電子轉移現象的發現,DNA引起了更多的關注。由于DNA鏈極易斷裂,它并不是理想的電子導體,但是利用DNA雙鏈結構作為模板構造納米尺度金屬導線已經取得了很大的成就,比如M-DNA,就是將二價金屬離子如Cu2+,Zn2+,Ni2+摻雜到DNA的堿基或磷酸骨架中,摻雜后的M-DNA呈現出特殊的導電特性,有望成為新得到納米材料和生物傳感器[1-4]。實驗發現銀離子(Ag+)極易和DNA結合,但是有趣的是Ag+和DNA結合的作用機制到現在也沒有定論。拉曼光譜技術在測量生物大分子時,具有需要樣品量小、結構信息量大、測量速度快、操作方便、對樣品無損傷、可以從分子水平實時監測分子之間的相互作用等優點[5],所以本文對銀離子摻雜DNA(后文簡稱為Ag+-DNA)溶液進行了拉曼光譜測量,得出了拉曼譜線并初步分析了其結合機理。

1 實驗方法和儀器

將1.6mg/ml的小牛胸腺DNA與20mM的Ag+溶液混合反應15分鐘后,置入顯微鏡下進行拉曼光譜測量。

拉曼光譜測定采用英國Renishaw公司生產的2000型共聚焦顯微拉曼光譜儀上進行,儀器的分辨率為2cm-1,波長為782nm、功率為25mw的半導體激光器為激發光源。

2 結果和討論

小牛胸腺DNA(a)和Ag+-DNA(b)的拉曼譜線如圖1所示。可見,加入銀離子后指定為堿基鳥嘌呤和腺嘌呤的伸縮振動峰1576,1487,1375,和 727cm-1向低波數移動了4-10cm-1,并且指定為堿基之間氫鍵的拉曼譜峰1665cm-1明顯變寬。說明銀離子打破了A和T與G和C之間的共價氫鍵并與其發生螯合,銀離子可能結合在AT和GC堿基對之間,也有可能與DNA的每個單鏈共價化合,導致DNA雙鏈解旋。DNA骨架中PO2-的對稱伸縮振動峰1091和788cm-1分別移到了1085和781cm-1,說明DNA的單鏈或雙鏈已經受到了影響,雙螺旋結構由有序變為無序。標識液態DNA呈現出B構象的拉曼譜峰830cm-1位置基本不變,但強度卻明顯降低,說明DNA的構象已經改變。另外胸腺嘧啶的振動譜線1249cm-1和糖環中C-O伸縮振動譜峰1047cm-1保持不變。綜上所述,銀離子的加入,使DNA的結構發生轉變,這一轉變主要表現在堿基堆積、氫鍵、和構象上,使DNA變得無序。

3 結束語

拉曼光譜表明:加入后銀離子后鳥嘌呤以及腺嘌呤的伸縮振動峰1576,1487,1375,和 727cm-1向低波數移動了4-10cm-1,堿基之間的氫鍵拉曼譜峰1665cm-1明顯變寬,DNA中的PO2-對稱伸縮振動峰1091和788cm-1分別移動到1085和781cm-1,B構象830cm-1譜峰強度降低。這說明銀離子和 DNA的堿基之間的氫鍵產生了相互作用,打破了A和T與G和C的共價氫鍵并與其發生螯合,銀離子可能結合在AT和GC堿基對之間,也有可能與DNA的每個單鏈共價化合,導致DNA雙鏈解旋,同時DNA的構象也發生了改變。實驗結果對銀離子和DNA相互作用機制的研究提供了一定的參考。

參考文獻

[1]Rakitin A.Aich P,Papadopoulos C.Kobzar Y.Vedeneev.Metallic conduction through engineered DNA: DNA nanoelectronic building blocks. Physics Review Letters 2001,86(16),3670-3673.

[2]Braun E.,Eichen Y.Sivan U.Yoseph G.B.DNA-templatedassembly andelectrode attachment of a conducting silver wire. Nature 1998 391,775-778.

[3]Wettig D.Li C.Z.Long Y. T.Kraatz H.B.Lee J.S.M-DNA:a Self-Assembling Molecular Wire for Nanoelectronics and Biosensing. Analytical Sciences 2003,19(1),23-26.

[4]Park S.H.Prior M.W.LaBean T.H.Finkelstein G. Optimized fabrication and electrical analysis of silver nanowires templated on DNA molecules.Applied Physics Letters 2006,89,033901.

[5]班戈,董瑞新,李珂,韓洪文,張霞,李書鋒.DNA銀納米線的制備及其拉曼光譜.光譜學與光譜分析,2009,29(5):402-405.

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