2013版SNOMED CT頂層概念調(diào)整及屬性關(guān)系

董燕等

【摘要】 SNOMED CT是結(jié)構(gòu)化的臨床術(shù)語(yǔ)集。介紹2013年版的SNOMED CT新增頂層概念 “SNOMED CT模型組件”及其亞類“連接概念”。概念含義的邏輯表示通過(guò)“定義屬性”定義，所有可用作“關(guān)系類型”的概念都?xì)w在“連接概念”下：“|is a|關(guān)系”和“概念模型屬性”中的59個(gè)“屬性關(guān)系”。并詳細(xì)說(shuō)明“關(guān)系”如何完整定義概念，以期為構(gòu)建中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)系統(tǒng)的研究工作提供參考。

【關(guān)鍵詞】 SNOMED CT； 臨床術(shù)語(yǔ)； 連接概念； 屬性關(guān)系

SNOMED CT（Systematized Nomenclature of Medicine-Clinical Terms，醫(yī)學(xué)系統(tǒng)命名法-臨床術(shù)語(yǔ)）是結(jié)構(gòu)化的臨床術(shù)語(yǔ)集，每個(gè)概念有基于含義的邏輯表示，并有唯一標(biāo)示的代碼。概念的邏輯定義通過(guò)建立概念間的“關(guān)系”來(lái)實(shí)現(xiàn)。“關(guān)系”包括了：“|IS-A|關(guān)系”與“屬性關(guān)系”。而這些“關(guān)系”歸于“連接概念（Linkage concept）”下。SNOMED CT的頂層概念根據(jù)研究發(fā)展而調(diào)整。了解分類結(jié)構(gòu)變化以及“關(guān)系”和概念定義，可為構(gòu)建中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)系統(tǒng)的提供參考和借鑒。

1 SNOMED CT頂層概念的調(diào)整

2010年1月時(shí)，在技術(shù)預(yù)覽中提出了“元數(shù)據(jù)層級(jí)”[1]。2013年公布的SNOMED CT新增的頂層概念是“SNOMED CT模型組件”（SNOMED CT Model Component），調(diào)整后的頂層概念仍是19個(gè)[2]，見(jiàn)表1。之前頂層概念“連接概念”以及“特殊概念”的亞類“命名空間概念”被移到“SNOMED CT模型組件”下作為亞類，

新增的“SNOMED CT模型組件”也被稱為“頂層元數(shù)據(jù)（Top Level Metadata）”，其下又包含4個(gè)亞類：“核心元數(shù)據(jù)概念”（Core metadata concept）、“基礎(chǔ)元數(shù)據(jù)概念”（Foundation metadata concept）、“連接概念”（Linkage concept）、“命名空間概念”（Namespace concept）。

“核心元數(shù)據(jù)概念”的子類可提供支持國(guó)際發(fā)布數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)信息。支持信息包括枚舉值集，這些枚舉值用于概念、描述和關(guān)系屬性。“基礎(chǔ)元數(shù)據(jù)概念”的子類為包括參考集在內(nèi)的派生結(jié)構(gòu)提供支撐元數(shù)據(jù)和結(jié)構(gòu)信息。“命名空間概念”每個(gè)子類概念有一個(gè)整數(shù)術(shù)語(yǔ)，是一種分配擴(kuò)展名稱空間標(biāo)識(shí)符。“連接概念”用于連接兩個(gè)或兩個(gè)以上的概念來(lái)表達(dá)組合含義。所有能被用來(lái)作為“關(guān)系類型”的概念都收在“連接概念”中。

2 連接概念

“連接概念”將兩個(gè)概念連起來(lái)，形成一個(gè)可以表達(dá)明確意義的短句，也就是說(shuō)多個(gè)概念通過(guò)“連接概念”相連即可形成一個(gè)概念表達(dá)充分的醫(yī)學(xué)語(yǔ)句。批準(zhǔn)使用的即為“概念模型屬性”。

“連接概念”下有兩個(gè)亞類：“連接聲明”（Link assertion）和“屬性關(guān)系”（Attribute）。“連接聲明”下有7個(gè)子類；“屬性關(guān)系”下的4個(gè)子類，見(jiàn)表2。其中“概念歷史屬性”下含7個(gè)子類，“概念模型屬性”下共含65個(gè)子類，“事實(shí)角色”下含1個(gè)子類，“未批準(zhǔn)屬性”下共含196個(gè)子類。

“連接聲明”亞類允許SNOMED CT概念用于HL7語(yǔ)句之間的關(guān)系維護(hù)。目前，該內(nèi)容支持英國(guó)國(guó)家衛(wèi)生服務(wù)部（NHS）衛(wèi)生聯(lián)絡(luò)機(jī)構(gòu)為在英國(guó)實(shí)施HL7版本3的關(guān)系編碼要求。

“屬性”亞類的概念用于SNOMED CT概念間的關(guān)系構(gòu)建，也稱為概念間的“關(guān)系類型”。一些“屬性”（即“關(guān)系類型”）可用來(lái)邏輯地定義一個(gè)概念，這稱為“定義屬性”。定義屬性示例：（1）“| is a |關(guān)系”。（2）|概念模型屬性|（Concept model attribute）：|偏側(cè)性|（Laterality），|操作部位|（Procedure site），|發(fā)現(xiàn)部位|（Finding site），|相關(guān)形態(tài)學(xué)|（Associated morphology）。

“屬性”下還包括“非定義屬性”，非定義屬性示例：（1）|未批準(zhǔn)屬性|（Unapproved attribute）：|因……緩解|（Relieved by），|評(píng)估|（Has assessment）。（2）|概念歷史屬性|（Concept history attribute） ：|被……替代|（REPLACED BY），|與……相同|（SAME AS）。“概念模型屬性”下共含65個(gè)子類，不屬于“定義屬性”有6個(gè)[3]：|一般認(rèn)為|（Commonly considered）、|有生活環(huán)境|（Has life circumstance）、|有生理狀態(tài)|（Has physiologic state）、|包括子標(biāo)本|（Includes sub-specimen）、|部分|（Part of）、|信息主題|（Subject of information）。

3 定義屬性

“定義屬性”（即“關(guān)系類型”）用來(lái)邏輯地定義一個(gè)“概念”。SNOMED CT目前使用60個(gè)“定義屬性”來(lái)構(gòu)建概念定義模型：“|is a|關(guān)系”（也稱為“父-子關(guān)系”或“上下位關(guān)系”）和“概念模型屬性”中的59個(gè)“關(guān)系類型”。

每個(gè)“定義屬性”通常屬于一個(gè)層級(jí)，有少數(shù)屬于多個(gè)層級(jí)，一個(gè)屬性可以應(yīng)用的層級(jí)被稱為屬性的“域”（domain）。也就是說(shuō)，“域”是特定的“關(guān)系類型”可應(yīng)用的層級(jí)，例如：“臨床發(fā)現(xiàn)”是|相關(guān)形態(tài)學(xué)|的“域”。每個(gè)屬性可以被賦予一組有限的值，這個(gè)值域集被稱為屬性的“值域（范圍）”（range）。例如，|相關(guān)形態(tài)學(xué)|的“值域（范圍）”是|形態(tài)異常結(jié)構(gòu)（形態(tài)學(xué)異常）|及其子類；|發(fā)現(xiàn)部位|的“值域（范圍）”是|身體結(jié)構(gòu)|層級(jí)結(jié)構(gòu)下的|解剖或獲得身體結(jié)構(gòu)（身體結(jié)構(gòu)）|及其子類。

同一個(gè)“關(guān)系類型”可以用于不同的“域”。“概念模型屬性”中的59個(gè)“關(guān)系類型”應(yīng)用的“域”的情況：“臨床所見(jiàn)”16個(gè)，“操作”23個(gè)，“操作”6個(gè)，“具有明確語(yǔ)境”6個(gè)，“事件”5個(gè)，“標(biāo)本”5個(gè)，“藥物/生物制品”2個(gè)，“身體結(jié)構(gòu)”1個(gè)，“物理性物體”1個(gè)。其中，應(yīng)用于“事件”概念類的5個(gè)“關(guān)系類型”同時(shí)也用于 “臨床所見(jiàn)”；“has active ingredient”同時(shí)用于“物理性物體”和“藥品/生物制品”。

圖1 肺炎|發(fā)現(xiàn)部位|肺組織

4 關(guān)系與概念定義

SNOMED CT中每個(gè)概念都有邏輯定義，通過(guò)“關(guān)系”與其他概念連接。“|is a|關(guān)系”和“定義屬性關(guān)系”被稱為SNOMED CT概念的定義性特征，通過(guò)與其他概念建立“關(guān)系”，在邏輯上代表一個(gè)概念。

除了“根概念”，每個(gè)活躍概念至少有一個(gè)“|is a|關(guān)系”與其父概念關(guān)聯(lián)。“|is a|關(guān)系”是SNOMED CT的層次結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)，見(jiàn)圖2。一個(gè)概念可以有不止一個(gè)“|is a|關(guān)系”與其他概念相連。在同一頂層結(jié)構(gòu)下，一個(gè)概念可有多個(gè)父概念，子類型關(guān)系可以多層級(jí)化，見(jiàn)圖3。

“屬性關(guān)系”是兩個(gè)“概念”之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系，用于指定某個(gè)概念的“定義特征”（源關(guān)系）。每個(gè)“屬性關(guān)系”有名稱（關(guān)系類型）和值（目標(biāo)關(guān)系）。

“|is a|關(guān)系”和“屬性關(guān)系”（即“關(guān)系類型”）組合通過(guò)表述某一“概念”的邏輯定義與該“概念”相關(guān)聯(lián)。邏輯概念定義包括一個(gè)或多個(gè)“上位類型”（由“|is a|關(guān)系”描述）和一組“定義屬性”，以區(qū)別于其他概念定義。完全定義概念|細(xì)菌性肺炎（疾病）|表示見(jiàn)圖4，每一行表示一個(gè)有值的“定義屬性”。圖5則是用圖形的方式來(lái)說(shuō)明部分關(guān)系。

5 小結(jié)

SNOMED CT（2013）的頂層概念19個(gè)，新增一個(gè)頂層概念“SNOMED CT模型組件”，“連接概念”為其亞類。“連接概念”用來(lái)連接兩個(gè)概念，形成對(duì)某一概念的表達(dá)。每個(gè)概念是邏輯定義，通過(guò)“關(guān)系”與其他概念連接：“|is a|關(guān)系”用于連接一個(gè)“概念”與同類型的更一般的概念；“屬性關(guān)系”（例如|發(fā)現(xiàn)部位|和|病原體|）用于連接“概念”與其他子類型中的相關(guān)值。需要特別注意，對(duì)“連接概念”的使用是非標(biāo)準(zhǔn)的，是探索性和試驗(yàn)性的。

SNOMED CT的體系構(gòu)建的原則與工作方法，適用于“中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)集”的構(gòu)建[4]。“中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)集”經(jīng)過(guò)幾年的建設(shè)，目前也面臨著結(jié)構(gòu)調(diào)整的需要，研究SNOMED CT的結(jié)構(gòu)調(diào)整和概念間“關(guān)系”，將為中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)系統(tǒng)的完善提供有力的參考和借鑒。

參考文獻(xiàn)

[1]董燕，崔蒙，賈李蓉.SNOMED CT層次結(jié)構(gòu)與標(biāo)識(shí)符[J].中國(guó)數(shù)字醫(yī)學(xué)，2012，7（2）：68-72.

[2] IHTSDO.SNOMED CT Technical Implementation Guide January 2013 International Release （US English）[OL][2013-01].http：//ihtsdo.org/fileadmin/user_upload/doc/[2013-04-28].

[3] IHTSDO.SNOMED CT User Guide January 2013 International Release（US English）[OL][2013-01].http：//ihtsdo.org/fileadmin/user_upload/doc/[2013-04-28].

[4]郭玉峰，劉保延，姚乃禮，等.基于SNOMED CT核心構(gòu)架研究的中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)集標(biāo)準(zhǔn)化特征要素初探[J].中國(guó)中醫(yī)藥信息雜志，2008，15（9）：96-97.

（收稿日期：2013-12-24） （本文編輯：歐麗）

圖1 肺炎|發(fā)現(xiàn)部位|肺組織

4 關(guān)系與概念定義

SNOMED CT中每個(gè)概念都有邏輯定義，通過(guò)“關(guān)系”與其他概念連接。“|is a|關(guān)系”和“定義屬性關(guān)系”被稱為SNOMED CT概念的定義性特征，通過(guò)與其他概念建立“關(guān)系”，在邏輯上代表一個(gè)概念。

除了“根概念”，每個(gè)活躍概念至少有一個(gè)“|is a|關(guān)系”與其父概念關(guān)聯(lián)。“|is a|關(guān)系”是SNOMED CT的層次結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)，見(jiàn)圖2。一個(gè)概念可以有不止一個(gè)“|is a|關(guān)系”與其他概念相連。在同一頂層結(jié)構(gòu)下，一個(gè)概念可有多個(gè)父概念，子類型關(guān)系可以多層級(jí)化，見(jiàn)圖3。

“屬性關(guān)系”是兩個(gè)“概念”之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系，用于指定某個(gè)概念的“定義特征”（源關(guān)系）。每個(gè)“屬性關(guān)系”有名稱（關(guān)系類型）和值（目標(biāo)關(guān)系）。

“|is a|關(guān)系”和“屬性關(guān)系”（即“關(guān)系類型”）組合通過(guò)表述某一“概念”的邏輯定義與該“概念”相關(guān)聯(lián)。邏輯概念定義包括一個(gè)或多個(gè)“上位類型”（由“|is a|關(guān)系”描述）和一組“定義屬性”，以區(qū)別于其他概念定義。完全定義概念|細(xì)菌性肺炎（疾病）|表示見(jiàn)圖4，每一行表示一個(gè)有值的“定義屬性”。圖5則是用圖形的方式來(lái)說(shuō)明部分關(guān)系。

5 小結(jié)

SNOMED CT（2013）的頂層概念19個(gè)，新增一個(gè)頂層概念“SNOMED CT模型組件”，“連接概念”為其亞類。“連接概念”用來(lái)連接兩個(gè)概念，形成對(duì)某一概念的表達(dá)。每個(gè)概念是邏輯定義，通過(guò)“關(guān)系”與其他概念連接：“|is a|關(guān)系”用于連接一個(gè)“概念”與同類型的更一般的概念；“屬性關(guān)系”（例如|發(fā)現(xiàn)部位|和|病原體|）用于連接“概念”與其他子類型中的相關(guān)值。需要特別注意，對(duì)“連接概念”的使用是非標(biāo)準(zhǔn)的，是探索性和試驗(yàn)性的。

SNOMED CT的體系構(gòu)建的原則與工作方法，適用于“中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)集”的構(gòu)建[4]。“中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)集”經(jīng)過(guò)幾年的建設(shè)，目前也面臨著結(jié)構(gòu)調(diào)整的需要，研究SNOMED CT的結(jié)構(gòu)調(diào)整和概念間“關(guān)系”，將為中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)系統(tǒng)的完善提供有力的參考和借鑒。

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[4]郭玉峰，劉保延，姚乃禮，等.基于SNOMED CT核心構(gòu)架研究的中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)集標(biāo)準(zhǔn)化特征要素初探[J].中國(guó)中醫(yī)藥信息雜志，2008，15（9）：96-97.

（收稿日期：2013-12-24） （本文編輯：歐麗）

圖1 肺炎|發(fā)現(xiàn)部位|肺組織

4 關(guān)系與概念定義

SNOMED CT中每個(gè)概念都有邏輯定義，通過(guò)“關(guān)系”與其他概念連接。“|is a|關(guān)系”和“定義屬性關(guān)系”被稱為SNOMED CT概念的定義性特征，通過(guò)與其他概念建立“關(guān)系”，在邏輯上代表一個(gè)概念。

除了“根概念”，每個(gè)活躍概念至少有一個(gè)“|is a|關(guān)系”與其父概念關(guān)聯(lián)。“|is a|關(guān)系”是SNOMED CT的層次結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)，見(jiàn)圖2。一個(gè)概念可以有不止一個(gè)“|is a|關(guān)系”與其他概念相連。在同一頂層結(jié)構(gòu)下，一個(gè)概念可有多個(gè)父概念，子類型關(guān)系可以多層級(jí)化，見(jiàn)圖3。

“屬性關(guān)系”是兩個(gè)“概念”之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系，用于指定某個(gè)概念的“定義特征”（源關(guān)系）。每個(gè)“屬性關(guān)系”有名稱（關(guān)系類型）和值（目標(biāo)關(guān)系）。

“|is a|關(guān)系”和“屬性關(guān)系”（即“關(guān)系類型”）組合通過(guò)表述某一“概念”的邏輯定義與該“概念”相關(guān)聯(lián)。邏輯概念定義包括一個(gè)或多個(gè)“上位類型”（由“|is a|關(guān)系”描述）和一組“定義屬性”，以區(qū)別于其他概念定義。完全定義概念|細(xì)菌性肺炎（疾病）|表示見(jiàn)圖4，每一行表示一個(gè)有值的“定義屬性”。圖5則是用圖形的方式來(lái)說(shuō)明部分關(guān)系。

5 小結(jié)

SNOMED CT（2013）的頂層概念19個(gè)，新增一個(gè)頂層概念“SNOMED CT模型組件”，“連接概念”為其亞類。“連接概念”用來(lái)連接兩個(gè)概念，形成對(duì)某一概念的表達(dá)。每個(gè)概念是邏輯定義，通過(guò)“關(guān)系”與其他概念連接：“|is a|關(guān)系”用于連接一個(gè)“概念”與同類型的更一般的概念；“屬性關(guān)系”（例如|發(fā)現(xiàn)部位|和|病原體|）用于連接“概念”與其他子類型中的相關(guān)值。需要特別注意，對(duì)“連接概念”的使用是非標(biāo)準(zhǔn)的，是探索性和試驗(yàn)性的。

SNOMED CT的體系構(gòu)建的原則與工作方法，適用于“中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)集”的構(gòu)建[4]。“中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)集”經(jīng)過(guò)幾年的建設(shè)，目前也面臨著結(jié)構(gòu)調(diào)整的需要，研究SNOMED CT的結(jié)構(gòu)調(diào)整和概念間“關(guān)系”，將為中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)系統(tǒng)的完善提供有力的參考和借鑒。

參考文獻(xiàn)

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[2] IHTSDO.SNOMED CT Technical Implementation Guide January 2013 International Release （US English）[OL][2013-01].http：//ihtsdo.org/fileadmin/user_upload/doc/[2013-04-28].

[3] IHTSDO.SNOMED CT User Guide January 2013 International Release（US English）[OL][2013-01].http：//ihtsdo.org/fileadmin/user_upload/doc/[2013-04-28].

[4]郭玉峰，劉保延，姚乃禮，等.基于SNOMED CT核心構(gòu)架研究的中醫(yī)臨床術(shù)語(yǔ)集標(biāo)準(zhǔn)化特征要素初探[J].中國(guó)中醫(yī)藥信息雜志，2008，15（9）：96-97.

（收稿日期：2013-12-24） （本文編輯：歐麗）