我國(guó)科學(xué)家主導(dǎo)完成白菜、甘藍(lán)基因組測(cè)序和分析
由我國(guó)科學(xué)家領(lǐng)銜的白菜、甘藍(lán)和油菜全基因組測(cè)序項(xiàng)目又取得階段性重大成果,完成了甘藍(lán)基因組測(cè)序和分析。該研究近日在線發(fā)表在國(guó)際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《自然·通訊》。
甘藍(lán)基因組測(cè)序是白菜、甘藍(lán)和油菜等蕓薹屬全基因組測(cè)序項(xiàng)目的一部分。這是繼白菜基因組測(cè)序項(xiàng)目后的又一重大成果。據(jù)甘藍(lán)項(xiàng)目組技術(shù)負(fù)責(zé)人、中國(guó)農(nóng)科院油料所劉勝毅研究員介紹,甘藍(lán)基因組至少包含45 758個(gè)蛋白編碼基因,與白菜基因組相似,其基因組的大部分能夠與十字花科近緣模式植物擬南芥基因組建立共線性關(guān)系,進(jìn)而為基因組進(jìn)化研究提供了良好的模式材料。通過(guò)對(duì)這組模式材料的分析,科學(xué)家最終揭示出甘藍(lán)和白菜基因組間存在轉(zhuǎn)座子擴(kuò)增的不對(duì)稱性、串聯(lián)重復(fù)基因擴(kuò)增的不對(duì)稱性、可變剪切數(shù)量的不對(duì)稱性及共線性區(qū)外基因丟失率的不對(duì)稱性,而在種內(nèi)的亞基因組間存在基因丟失率差異以及亞基因組間同源基因的序列分化、表達(dá)分化、可變剪切分化等不對(duì)稱性進(jìn)化。該研究發(fā)現(xiàn)甘藍(lán)基因組擁有合成更多更廣抗癌類物質(zhì)的基因基礎(chǔ)。
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