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雅點六齒小蠹的SS—COI技術(shù)鑒定

2014-05-30 10:48:04張總澤陳艷林陽武李敏
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年9期
關(guān)鍵詞:檢測

張總澤 陳艷 林陽武 李敏

摘要 [目的] 采用SSCOI技術(shù)鑒定雅點六齒小蠹。[方法]采用基于線粒體DNA細胞色素C氧化酶亞基I(mtDNA COI)基因序列的種特異性(speciesspecific COI,SSCOI)PCR方法,設(shè)計雅點六齒小蠹SSCOI引物ipsc1和ipsc2。[結(jié)果] 該引物特異性強,能擴增出清晰、單一的長度為594bp的特異性條帶,與白云杉齒小蠹(Ips perturbatus)、黑條木小蠹(Trypodendron lineatum)、橡膠材小蠹(Xyleborus affini)、歐洲根小蠹(Hylastes ater)、咖啡果小蠹(Hypothenemus hampei)、長林小蠹(Hylurgus ligniperda)進行對照,均無條帶出現(xiàn)。[結(jié)論]建立的雅點六齒小蠹PCR鑒定方法在實際檢疫工作中得到驗證和應(yīng)用,表明該方法特異、靈敏、穩(wěn)定,可以應(yīng)用于口岸檢疫鑒定工作。

關(guān)鍵詞雅點六齒小蠹;SSCOI;PCR;檢測

中圖分類號S433.5文獻標識碼A文章編號05176611(2014)09-02588-02

基金項目福建檢驗檢疫局科技計劃項目(FK201159,F(xiàn)K201224);質(zhì)檢公益性行業(yè)科研專項(201410076)。

作者簡介張總澤(1984- ),男,內(nèi)蒙古牙克石人,農(nóng)藝師,從事昆蟲檢疫鑒定工作。

雅點六齒小蠹Ips concinnus Mannerheim,又名粒點六齒小蠹、西特喀云杉齒小蠹,屬于鞘翅目(Coleoptera)、小蠹科(Scolytidae)、齒小蠹屬(Ips),分布于美國(阿拉斯加、加利福尼亞、俄勒岡、華盛頓)和加拿大(不列顛哥倫比亞),為害西特喀云杉Picea sitchensis (Bong.) Carrière,是我國進境植物檢疫性有害生物。該蟲屬于初期性害蟲,以幼蟲和成蟲侵害健康樹木,取食寄主的有機成分,造成寄主大面積死亡。我國是木材進口大國,近年來,隨著國際貿(mào)易的不斷增長,進口木材和木質(zhì)包裝量也日益增加,特別是一些口岸直接進口未經(jīng)處理的北美原木,使該蟲入侵的風(fēng)險極大,我國口岸曾多次截獲該蟲[1-2]。由于該蟲在我國尚未分布,所以,加強檢疫是防治該蟲最為重要的技術(shù)措施。

雅點六齒小蠹的鑒定主要基于成蟲的形態(tài)特征,包括額面特征、前胸背板刻點、鞘翅末端的齒、雄蟲生殖器等[3]。而對于口岸檢驗檢疫工作中常截獲到的幼蟲,則無法用常規(guī)的形態(tài)學(xué)手段鑒定,給快速通關(guān)和貿(mào)易便利化造成困難。近年來,應(yīng)用分子生物學(xué)方法鑒定有害生物越來越廣泛,特別是PCR方法,由于具有快速、微量、靈敏等顯著優(yōu)點,在各口岸檢驗檢疫部門已經(jīng)普及。筆者采用基于線粒體DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)細胞色素C氧化酶亞基I(cytochrome c oxidase subunit I,COI)基因序列的種特異性PCR(speciesspecific COI,SSCOI)方法[4],設(shè)計了雅點六齒小蠹的特異性引物,對該方法進行了技術(shù)驗證,為快速準確鑒定該蟲提供技術(shù)保障。

1材料與方法

1.1供試蟲源雅點六齒小蠹(Ips concinnus)、白云杉齒小蠹(Ips perturbatus)、黑條木小蠹(Trypodendron lineatum)、橡膠材小蠹(Xyleborus affinis)、歐洲根小蠹(Hylastes ater)、咖啡果小蠹(Hypothenemus hampei)、長林小蠹(Hylurgus ligniperda)均為福建口岸近年檢疫截獲的小蠹科昆蟲標本,所有試蟲均為成蟲,經(jīng)形態(tài)學(xué)鑒定后用于研究。

1.2DNA提取采用生工磁珠法動物基因組DNA抽提試劑盒(上海生工生物工程有限公司)提取試蟲DNA。具體步驟:取單頭小蠹成蟲,去除鞘翅后置于-20 ℃冷凍10 min,取出后迅速放入1.5 ml離心管中[5],加入裂解液(400 μl Buffer MACL,200 μl Buffer MCL和20 μl Proteinase K),用塑料研磨棒充分研磨蟲體,然后按說明書步驟操作,提取的DNA置于-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.3引物設(shè)計登錄Genebank,查詢下載小蠹蟲COI基因序列(Genebank登錄號見表1)。利用Primer 5和Oligo 6軟件,根據(jù)引物設(shè)計原則[6-7],設(shè)計1對雅點六齒小蠹SSCOI引物:上游引物ipsc1 5′ATGTGGATACACGAGCATACTTTACC3′;下游引物ipsc2 5′GTAATCATTCAATAGAGGC3′。引物由上海生工生物工程有限公司合成。

1.4PCR擴增PCR反應(yīng)體系為25 μl,其中2×Taq PCR Master Mix(天根生化科技有限公司)12.5 μl,上下游引物各1 μl(10 pmol/L),模板DNA 1 μl,ddH2O 9.5 μl。經(jīng)預(yù)試驗優(yōu)化,PCR反應(yīng)程序:94 ℃預(yù)變性5 min;35個循環(huán):94 ℃ 40 s,55.5 ℃ 40 s,72 ℃ 50 s;最后72 ℃延伸10 min。取10 μl PCR擴增產(chǎn)物,在1.5%瓊脂糖凝膠上以90 V電泳分離30 min,染色后在凝膠成像儀上觀察結(jié)果。

1.5特異性及靈敏度試驗

1.5.1特異性試驗。選取6種小蠹蟲成蟲,經(jīng)形態(tài)學(xué)鑒定后按照“1.2”的方法提取DNA,以雅點六齒小蠹為陽性對照。先用小蠹蟲通用引物C1J2183和C1N2611進行PCR擴增[8],以驗證DNA提取質(zhì)量。然后用SSCOI引物ipsc1和ipsc2進行PCR擴增,以檢驗該引物的種特異性。

1.5.2靈敏度試驗。將提取的雅點六齒小蠹DNA按10-1、10-2、10-3、10-4、10-5倍梯度稀釋,用SSCOI引物ipsc1和ipsc2進行PCR擴增,以檢驗該檢測方法的靈敏度。

1.6PCR方法的驗證與應(yīng)用用口岸截獲的小蠹科昆蟲DNA為模板,以雅點六齒小蠹為陽性對照,用特異性引物ipsc1和ipsc2進行PCR擴增,以檢驗該方法的準確性和穩(wěn)定性。

2結(jié)果與分析

2.1DNA提取質(zhì)量檢驗利用小蠹蟲通用引物C1J2183和C1N2611對提取的7種小蠹蟲DNA模板進行PCR擴增,電泳結(jié)果顯示,7種小蠹蟲均能擴增出清晰單一的目的片段,長度約為470 bp(圖1)。說明所提取的DNA模板純度較高,能滿足試驗需求。

3討論

準確的物種鑒定是檢疫工作的首要任務(wù)和基本前提。口岸檢驗檢疫部門對于截獲的幼蟲,一般情況下要將其在室內(nèi)飼養(yǎng)至成蟲,但受檢測周期長、小蠹蟲的飼養(yǎng)難度大等限制,不能滿足快速通關(guān)的要求。近年來,利用分子生物學(xué)技術(shù)快速鑒定昆蟲種類已經(jīng)成為趨勢,在mtDNA COI基因序列分析技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的SSCOI引物鑒定技術(shù),由于具有重現(xiàn)性好且條帶單一等優(yōu)點,在昆蟲快速鑒定中得到廣泛應(yīng)用。

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