李聞天,龔美霞,戴偉宏,張 蕾,王文靜,劉朝良,孟 艷
(安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,安徽 合肥 230036)
家蠶(Bombyx mori)基因組框架圖、精細(xì)圖以及各種數(shù)據(jù)庫(kù)的相繼建立和不斷完善,為發(fā)掘和鑒定家蠶基因、研究基因的生物學(xué)功能及應(yīng)用前景奠定了良好的信息平臺(tái)基礎(chǔ)[1-3]。lemon(lem)是一種典型的黃體色家蠶突變體,其幼蟲體表富含墨蝶呤(sepiapterin,SP)[4]。SP屬于喋啶類化合物,是 GTP 分解代謝途徑的中間產(chǎn)物。在高等動(dòng)物中,SP是補(bǔ)救途徑合成四氫生物蝶呤(tetrahydrobiopterin,BH4)的前體,經(jīng)墨蝶呤還原酶(sepiapterin reductase,SPR)和二氫葉酸還原酶(dihydrobiopterin reductase,DHFR)催化完成(圖 1)[5,6]。
SPR是以NADPH為輔酶催化蝶啶衍生物代謝的醛酮還原酶[7],由GTP分解到BH4生成的從頭合成途徑中,SPR是催化最后一步反應(yīng)的必需酶[7],對(duì)于生物體合成BH4具有非常重要的生理功能。BH4是芳香族氨基酸羥化酶的必需輔酶,也是一氧化氮合酶的重要輔助因子。BH4的合成不足會(huì)導(dǎo)致神經(jīng)遞質(zhì)的缺乏以及細(xì)胞內(nèi)皮功能障礙,引發(fā)多種神經(jīng)性生理代謝疾病[8-10]。

圖1 四氫生物蝶呤的補(bǔ)救合成途徑Fig.1 Salvage pathway of tetrahydrobiopteri synthesis.BH2,dihydrobiopterin,DHFR,dihyrofolate reductase
我們的前期研究表明,家蠶SPR(BmSPR,Gen-Bank登錄號(hào):AB465548)基因(BmSpr)的全長(zhǎng)ORF為801 bp。與哺乳動(dòng)物 SPR類似,BmSPR是家蠶體內(nèi)合成BH4的重要酶之一,其活性的嚴(yán)重缺乏會(huì)導(dǎo)致幼蟲因BH4的合成不足而死亡[11]。家蠶lem突變體是提取和純化獲得天然 SP的重要遺傳資源。為了將從lem中大量提純的SP應(yīng)用于BH4的體外生物合成研究,本文對(duì)重組質(zhì)粒pET-24b-BmSpr的原核表達(dá)系統(tǒng)進(jìn)行了優(yōu)化,得到了穩(wěn)定表達(dá)BmSPR融合蛋白的實(shí)驗(yàn)條件,并對(duì)純化獲得的重組蛋白進(jìn)行了酶學(xué)鑒定及活性分析。
重組質(zhì)粒6×His pET-24b-BmSpr由本實(shí)驗(yàn)室前期構(gòu)建;E.coli感受態(tài)細(xì)胞 Rosetta(DE3)和BL21(DE3)購(gòu)自北京全式金公司;PCR擴(kuò)增相關(guān)試劑購(gòu)自TaKaRa公司;Anti-His Antibody、羊抗鼠 IgG-HRP、HRP-DAB底物顯色試劑盒為 Tiangen公司產(chǎn)品;蛋白純化、蛋白定量試劑盒分別為 QIAGEN公司和上海生工生物工程有限公司產(chǎn)品;PD-10蛋白脫鹽柱購(gòu)自GE公司;Immobilon-P PVDF膜為Millipore公司產(chǎn)品;SP標(biāo)準(zhǔn)品及 NADPH購(gòu)自 Sigma公司,其他試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。
1.2.1 檢測(cè)陽(yáng)性克隆的引物序列
正向引物:M13F,5'-GTTTTCCCAGTCACGAC-3';
反向引物:M13R,5'-CAGGAAACAGCTATGAC-3'。
1.2.2 PCR反應(yīng)體系 25 μL反應(yīng)體系中含10×擴(kuò)增緩沖液 2.5 μL,0.3 U Tag 酶和 0.2 ~0.5 μg 模板 DNA,dNTP Mix、正反向引物的終濃度分別為0.8 mmol/L、0.4 μmol/L 和 0.4 μmol/L,最后用 ddH2O補(bǔ)齊。
1.2.3 PCR反應(yīng)參數(shù)的設(shè)定 95℃預(yù)變性10 min,反應(yīng)25個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)包括94℃變性55 s,54℃退火58 s,72℃延伸1 min。循環(huán)結(jié)束后72℃延伸10 min,反應(yīng)產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)確認(rèn)。
運(yùn)用熱擊法將pET-24b-BmSpr重組質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)化到BL21(DE3)及Rosetta(DE3)菌株感受態(tài)細(xì)胞,37℃,150 r/min活化一個(gè)小時(shí)后,將100 μL菌液均勻涂布于 LB 平板(含15 μg/mL Kanamycin),37℃培養(yǎng)過(guò)夜。挑取經(jīng)菌落PCR鑒定的陽(yáng)性克隆,接種到含Kanamycin的LB液體培養(yǎng)基中,37℃,180 r/min震蕩培養(yǎng)至 OD600≈0.5時(shí),加入 1.0 mmol/L 的IPTG誘導(dǎo)重組蛋白的表達(dá),對(duì)照組不加 IPTG。誘導(dǎo)4 h后,收集菌體,超聲波破碎,離心,分別收集上清和細(xì)胞沉淀,進(jìn)行SDS-PAGE檢測(cè)[12],分析不同菌株中重組BmSPR蛋白的表達(dá)情況。
以1.0 mmol/L的 IPTG誘導(dǎo)濃度,對(duì)照組不加IPTG,分別使用4℃、16℃、28℃和37℃誘導(dǎo)培養(yǎng)4 h后,收集菌體總蛋白進(jìn)行SDS-PAGE檢測(cè),分析不同誘導(dǎo)溫度下重組BmSPR蛋白在Rosetta(DE3)宿主菌中的表達(dá)情況。使用不同濃度梯度的 IPTG(0.2、0.4 、0.6 、0.8 、1.0 、1.2 、1.5 和 2.0 mmol/L)和不同誘導(dǎo)培養(yǎng)時(shí)間(0、1、2、3、4、5 和 6 h),于37℃誘導(dǎo)重組蛋白在Rosetta(DE3)中的表達(dá)。收集菌體總蛋白進(jìn)行 SDS-PAGE檢測(cè),分析重組蛋白在不同誘導(dǎo)條件下的表達(dá)情況。
在37℃培養(yǎng)條件下,用250 mL的LB液體培養(yǎng)基培養(yǎng)含重組質(zhì)粒pET-24b-BmSpr的E.coli Rosetta(DE3)的陽(yáng)性菌株,用 0.4 mmol/L的IPTG誘導(dǎo)重組蛋白的表達(dá),最后破碎細(xì)胞收集上清液,進(jìn)行 SDSPAGE檢測(cè)。
擴(kuò)大培養(yǎng)后,4℃ 8000 r/min離心10 min收集E.coli細(xì)胞,超聲破碎,并收集細(xì)胞破碎上清液。參照說(shuō)明書,用Ni-NTA親和層析柱(QIAGEN)對(duì)重組蛋白進(jìn)行純化。經(jīng)10%SDS-PAGE電泳檢測(cè)確認(rèn)后,將凝膠上的蛋白轉(zhuǎn)至PVDF膜上,以His-Tag單克隆抗體(Tiangen)為一抗,羊抗鼠IgG-HRP抗體(Tiangen)為二抗,進(jìn)行Western blot分析,然后參照HRP-DAB顯色試劑盒 (Tiangen)說(shuō)明書進(jìn)行顯色反應(yīng)[13]
使用BCA法試劑盒(上海生工)對(duì)純化后的蛋白進(jìn)行定量,并參照Katoh[14]的方法,進(jìn)行SPR酶活性分析。反應(yīng)體系為0.1 mL(含100 mmol/L磷酸鉀緩沖液 pH 6.4,SP 50 μmol/L,NADPH 100 μmol/L),加入0.2 μg重組酶蛋白,37℃反應(yīng) 10 min后,在420 nm處測(cè)定底物SP的OD值變化。對(duì)照組則不加重組蛋白。根據(jù)反應(yīng)前后SP吸光值的變化和標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算酶活單位。酶活力單位定義為:每分鐘還原1 nmol SP所需的酶量 (nmol/min·μg-1)。設(shè)定不同梯度的溫度(20-90℃)和反應(yīng)液 pH(20 mmol/L Britton-Robinson buffer,pH 2.0-12.0),檢測(cè)不同溫度及pH對(duì)酶活性的影響,探究重組蛋白的最適反應(yīng)條件。
篩選轉(zhuǎn)化成功的重組質(zhì)粒陽(yáng)性克隆,經(jīng)菌落PCR排除假陽(yáng)性,并經(jīng)測(cè)序(上海生工)確認(rèn)序列準(zhǔn)確無(wú)誤,用IPTG(1.0 mmol/L)誘導(dǎo)重組子在不同宿主細(xì)胞的表達(dá)。菌落PCR結(jié)果如圖2所示,PCR產(chǎn)物大小約為800 bp,與預(yù)期相符。SDS-PAGE結(jié)果顯示,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)后,在E.coli菌株 Rosetta(DE3)及BL21(DE3)的細(xì)胞破碎上清液中均出現(xiàn)大小約為30 kDa的特異性條帶,與目的蛋白的預(yù)測(cè)分子量相符,且兩菌株之間的表達(dá)量沒有明顯差異 (圖3),在細(xì)胞沉淀中目的蛋白的表達(dá)量相對(duì)較少(數(shù)據(jù)未附)。

圖2 陽(yáng)性克隆的菌落PCR鑒定Fig.2 Identification of pET-24b-BmSpr positive transformants by colony PCR
以Rosetta(DE3)為宿主菌,使用1.0 mmol/L的IPTG誘導(dǎo),分別以4℃、16℃、28℃和37℃誘導(dǎo)表達(dá)4 h,分析重組蛋白在不同誘導(dǎo)溫度條件下的表達(dá)情況。結(jié)果如圖4所示,無(wú) IPTG誘導(dǎo)時(shí),SDS-PAGE未檢測(cè)到目的蛋白的表達(dá),37℃誘導(dǎo)條件下目的蛋白的表達(dá)量明顯高于其他誘導(dǎo)溫度。
以Rosetta(DE3)為宿主菌,在37℃的培養(yǎng)條件下,通過(guò)改變IPTG濃度 (0.2-2.0 mmol/L)及培養(yǎng)時(shí)間(1-6 h),分析重組蛋白在不同誘導(dǎo)培養(yǎng)條件下的表達(dá)情況。結(jié)果如圖5所示,無(wú)IPTG誘導(dǎo)時(shí),SDS-PAGE未檢測(cè)到目的蛋白的表達(dá),而不同IPTG誘導(dǎo)濃度(圖5A)之間及不同誘導(dǎo)時(shí)間(圖5B)之間對(duì)目的蛋白的表達(dá)量幾乎沒有影響,表明重組蛋白在該表達(dá)系統(tǒng)能夠穩(wěn)定表達(dá)。

圖3 重組BmSPR在不同E.coli菌株中的表達(dá)情況Fig.3 Expression of recombinant BmSPR in different E.coli strains

圖4 不同誘導(dǎo)溫度下重組BmSPR表達(dá)量的SDSPAGE分析Fig.4 SDS-PAGE analysis of the expression of recombinant protein at different inducing temperature

圖5 不同濃度IPTG(A)及不同培養(yǎng)時(shí)間(B)對(duì)重組BmSPR誘導(dǎo)表達(dá)的SDS-PAGE分析Fig.5 SDS-PAGE analysis of the induced expression of recombinant BmSPR by different concentrations of IPTG(A)and different incubation time(B)
根據(jù)上述表達(dá)條件的優(yōu)化結(jié)果,以E.coli Rosetta(DE3)菌株為宿主菌,用 0.4 mmol/L IPTG大量誘導(dǎo)BmSPR的體外表達(dá),培養(yǎng)3 h后破碎細(xì)胞,收集上清液蛋白,SDS-PAGE確認(rèn)了重組蛋白的表達(dá)(圖 6A)。
用Ni-NTA親和層析柱對(duì)重組BmSPR蛋白進(jìn)行純化,SDS-PAGE檢測(cè)得到符合預(yù)期分子量大小的單一條帶,初步說(shuō)明重組蛋白純化效果較佳 (圖6B)。Western blot檢測(cè)發(fā)現(xiàn),經(jīng)IPTG誘導(dǎo)且純化過(guò)的蛋白得到特異性條帶,而對(duì)照組(未經(jīng)誘導(dǎo))沒有檢出信號(hào),再次證明了所表達(dá)和純化的蛋白為目的重組蛋白 BmSPR(圖6C)。

圖6 重組BmSPR的表達(dá)(A)、純化(B)與鑒定(C)Fig.6 SDS-PAGE analysis of the expression(A)and purification(B)and western blot analysis of the identification(C)of recombinant BmSPR
如圖7A所示,BmSPR在40-70℃的溫度范圍內(nèi),保持較高的活性,50℃為最適反應(yīng)溫度。為分析pH對(duì)BmSPR活性的影響,使用終濃度為50 mmol/L不同 pH(2.0-12.0)的 Britton-Robinson buffer,酶蛋白加入各反應(yīng)體系,于37℃反應(yīng)10 min后計(jì)算酶活性。如圖7B所示,BmSPR在 pH 4-6之間表現(xiàn)出較高的酶活性,pH 5為最適pH值。

圖7 不同反應(yīng)溫度(A)和pH(B)對(duì)BmSPR酶活性的影響Fig.7 Relative enzymatic activities of BmSPR at different reaction temperatures(A)and pH values(B)
本實(shí)驗(yàn)用 E.coli不同菌株 (圖3),通過(guò)改變誘導(dǎo)溫度、IPTG誘導(dǎo)濃度和誘導(dǎo)時(shí)間對(duì)家蠶SPR的體外表達(dá)條件進(jìn)行了優(yōu)化 (圖4,圖5),最終選用 E.coli Rosetta(DE3)對(duì)其進(jìn)行大量誘導(dǎo)表達(dá)分析,SDS-PAGE和 Western blot的檢測(cè)結(jié)果表明BmSPR融合蛋白能夠在原核表達(dá)系統(tǒng)中穩(wěn)定表達(dá)(圖6)。以SP為反應(yīng)底物,用分光光度法分析所純化蛋白的酶活性的數(shù)據(jù)顯示,當(dāng)溫度為50℃、pH值為5時(shí),BmSPR對(duì)SP表現(xiàn)出良好的催化活性(圖7),為通過(guò)表達(dá)重組BmSPR的方式,開展體外合成制備BH4的課題研究提供了重要依據(jù)。
作為芳香族氨基酸羥化酶和一氧化氮合酶的重要輔酶,BH4的合成缺陷會(huì)引起肌張力低下、不明原因的高熱、發(fā)育遲緩、腦脊液中神經(jīng)遞質(zhì)代謝產(chǎn)物的濃度偏低等神經(jīng)系統(tǒng)疾病[15,16];同時(shí)也是導(dǎo)致高血壓、動(dòng)脈粥樣硬化、糖尿病等內(nèi)皮功能異常的重要原因[16]。口服BH4已被作為臨床治療其中某些疾病的常規(guī)方案[17-19]。然而經(jīng)化工合成市售的 BH4價(jià)格非常昂貴[18]。因此,低耗高效的BH4生產(chǎn)工藝的開發(fā)創(chuàng)立顯得十分必要[20]。隨著與BH4合成相關(guān)的酶如 GTPCHI[21]、PTPS[22]、DHPR[23]、SPR[11,24]以及DHFR[25]等的研究日益增多,酶基因的克隆與功能鑒定,蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)的探明,使得BH4合成代謝的調(diào)控通路愈發(fā)清楚。這些研究一方面有助于加速對(duì)BH4缺乏癥實(shí)現(xiàn)基因治療的進(jìn)程,另一方面為非化工途徑合成BH4的應(yīng)用基礎(chǔ)研究奠定必要的理論基礎(chǔ)。
原核表達(dá)系統(tǒng)是目前應(yīng)用最普遍的基因工程蛋白表達(dá)系統(tǒng),具有操作簡(jiǎn)單、高效低廉等明顯優(yōu)勢(shì)[26]。我們利用大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng),獲得了純度較高、催化活性較好的重組 BmSPR(圖6,7)和BmDHFR[25]。家蠶 lem突變體的幼蟲體表沉積大量的SP[4,27],本課題組已建立了從 lem 蠶高效地分離純化SP的實(shí)驗(yàn)體系[27],并且對(duì)BH4的補(bǔ)救合成途徑所需要的兩個(gè)酶進(jìn)行了分子克隆和功能分析[11,25]。下一步我們打算利用從lem突變體大量提取的SP為底物,篩選共表達(dá)BmSPR和BmDHFR的工程菌,進(jìn)行體外合成制備BH4的研究試驗(yàn),以期獲得一種較為簡(jiǎn)便有效的合成BH4的方法。
[1]WANG J,XIA Q Y,HE X,et al.SilkDB:a knowledgebase for silkworm biology and genomics[J].Nucleic Acids Res,2005,33(1):399-402.
[2]XIA Q Y,ZHOU Z Y,LU C,et al.A draft sequence for the genome of the domesticated silkworm(Bombyx mori)[J].Science,2004,306(5703):1937-1940.
[3]XIA Q Y,GUO Y,ZHANG Z,et al.Complete resequencing of 40 genomes reveals domestication events and genes in silkworm(Bombyx)[J].Science,2009,326(5951):433-436.
[4]TSUSUE M,AKINO M.Yellow pterins in mutant lemon of silkworm and mutant sepia of D.melanogaster[J].J Zool Mag(Tokyo),1965,74:336-341.
[5]THONY B,AUERBACH G,BLAU N.Tetrahydrobiopterin biosynthesis,regeneration and functions[J].Biochem J,2000,347(1):1-16.
[6]CURTIUS H C,HEINTEL D,GHISLA S,et al.Tetrahydrobiopterin biosynthesis-Studies with specifically labeled(2H)NAD(P)H and 2H2O and of the enzymes involved[J].Eur J Biochem,1985,148(3),413-419.
[7]FAN C L,BROWN G M.Partial purification and some properties of biopterin synthase and dihydropterin oxidase from Drosophila melanogaster[J].Biochem Genet,1979,17(3-4):351-369.
[8]BLAU N,THONY B .Tetrahydrobiopterin in biomedical research [J].Inherit Metab Dis,2009,3(2):1-2
[9]SCHERER-OPPLIGER T,MATASOVIC A,LAUFS S,et al.Dominant negative allele(N47D)in a compound heterozygote for a variant of 6-pyruvoyltetrahydropterin synthase deficiency causing transient hyperphenylalaninemia [J]. Hum Mutat,1999,13(4):286-289.
[10]KIM H L,CHOI Y K,KIM D H,et al.Tetrahydropteridine deficiency impairs mitochondrial function in Dictyostelium discoideum Ax2 [J].FEBS Lett,2007,581(28):5430-5434.
[11]MENG Y,KATSUMA S,DAIMON T,et al.The silkworm mutant lemon(lemon lethal)is a potential insect model for human sepiapterin reductase deficiency[J].J Biol Chem,2008,284(17):11698-11705.
[12]LAEMMLI U K .Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4[J].Nature,1970,5259(227):680-685.
[13]ZHU B J,WU X Z.Characterization and function of CREB homologue from Crassostrea ariakensis stimulated by rickettsialike organism[J].Dev Comp Immunol,2008,32(12):1572-1581.
[14]KATOH S.Sepiapterin reductase from horse liver:purification and properties of the enzyme [J].Arch Biochem Biophys,1971,146(1):202-214.
[15]THONY B,LEIMBACHER W,BLAU N,et al.Hyperphenylalaninemia due to defects in tetrahydrobiopterin metabolism-Molecular characterization of mutations in 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase[J].Am J Hum Genet,1994,54(5):782-79.
[16]WERNER-FELMAYER G,GOLDERER G,WERNER E R.Tetrahydrobiopterin biosynthesis,utilization and pharmacological effects[J].Curr Drug Metab,2002,3(2):159-173.
[17]DHILLON B,BADIWALA M V,MAITLAND A,et al.Tetrahydrobiopterin attenuates homocysteine induced endothelial dysfunction[J].Mol Cell Biochem,2003,247(1-2):223-227.
[18]SHINOZAKI K,NISHIO Y,OKAMURA T,et al.Oral administration of tetrahydrobiopterin prevents endothelial dysfunction and vascular oxidative stress in the aortas of insulin-resistant rats[J].J Circulation,2002,87(7):566-573.
[19]HIGASHI Y,SASAKI S,NAKAGAWA K,et al.Tetrahydrobiopterin enhances forearm vascular response to acetylcholine in both normotensive and hypertensive individuals[J].Am J Hypertens,2002,15(4):326-332.
[20]YAMAMOTO K,KATAOKA E,MIYAMOTO N,et al.Genetic engineering of Escherichia coli for production of tetrahydrobiopterin[J].Metab Eng,2003,5(4):246-254.
[21]HATAKEYAMA K,INOUE I,HARADA T,et al.Cloning and sequencing of cDNA encoding rat GTP cyclohydrolase I.The first enzyme of the tetrahydrobiopterin biosynthetic pathway[J].J Biol Chem,1991,266(2):765-769.
[22]THONY B,LEIMBACHER W,BURGISSER D,et al.Human 6-pyruvoyltetrahydropterin synthase:cDNA cloning and heterologous expression of the recombinant enzyme[J].Biochem Biophys Res Co,1992,189(3):1437-1443.
[23]PARK D,PARK S,YIM J.Molecular characterization of Dro-sophila melanogaster dihydropteridine reductase[J].Biochim Biophys Acta,2000,1492(1):247-251.
[24]MANU SHARMA,DEMETRIUS M MARAGANORE,JOHN P A,IOANNIDIS,et al.Role of sepiapterin reductase gene at the PARK3 locus in Parkinson’s disease[J].Neurobiol Aging,2011,32:2108(e1-e5).
[25]WANG W J,GAO J S,WANG J,et al.Cloning,expression and enzymatic properties analysis of dihydrofolate reductase gene from the silkworm,Bombyx mori[J].Molecular Biology Reports,2012,39(12):10285-10291.
[26]NUC P,NUC K.Recombinant protein production in Escherichia coli[J].Postepy Biochem,2006,52(4):448-456.
[27]GAO J S,WANG J,WANG W J,et al.Isolation,purification and identification of an important pigment sepiapterin from integument of the lemon mutant of silkworm,Bombyx mori[J].Journal of Insect Science,2013,13:118.