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人羊水特異蛋白質(zhì)組學的探討研究

2014-09-11 02:21:38朱斌陳芳侯常黎麗紅黃素華
新醫(yī)學 2014年6期
關鍵詞:血清分析研究

朱斌 陳芳 侯常 黎麗紅 黃素華

羊水對于胎兒的正常發(fā)育至關重要,其生成量和成分與胎兒的發(fā)育、胎盤和羊膜腔的功能密切相關[1]。羊水中蛋白質(zhì)組學研究亦成為近年研究熱點。本研究初步觀察了在羊水中特異表達的蛋白質(zhì)及高表達的蛋白質(zhì),旨在為妊娠相關疾病的發(fā)生、發(fā)病機制的探索研究提供理論依據(jù),現(xiàn)報告如下。

材料與方法

一、試劑及儀器

1.試 劑

主要有:ProteoPrep Blue Albumin and IgG Depletion Kit血清高豐度蛋白去除試劑盒、四甲乙二胺(Sigma,美國),固相化pH 4~7、24 cm梯度干膠條、Bradford染液(Bio-Rad,美國),丙烯酰胺、甲叉雙丙烯酰胺、Tris、甘氨酸十二烷基磺酸鈉(SDS)、尿素、CHAPs、過硫酸銨、碘乙酰氨、二硫蘇糖醇(Amersham Pharmacia Biotech,瑞典),一氯乙腈(成都貝斯特)。

2.儀 器

包括:IPGphor3等電聚焦儀、EttanDALT垂直電泳槽、Image scanner掃描儀、超聲儀(GE,美國),Autoflex speed?MALDI-TOF質(zhì)譜儀(Bruker Dalton,美國),冷凍離心機(中國科學院武漢科學儀器廠)等。

二、蛋白樣品的制備

選擇3名正常妊娠晚期(37周)孕婦,征得其知情同意后,以羊膜穿刺法采集3份羊水標本,每份5 ml,同時以肘部穿刺取靜脈血標本3份,每份5 ml。所采集的標本分別在4℃、16 000×g離心15 min,取上清,0.4μm過濾后分裝, -70℃保存。離心超濾濃縮樣品,ProteoPrep Blue Albumin and IgG Depletion Kit試劑盒去除血清高豐度蛋白質(zhì),加入4倍體積丙酮,-20℃沉淀過夜。沉淀所得到的蛋白于4℃、12 000×g離心20 min,棄上清,晾干,-80℃凍存?zhèn)溆谩S肂radford法定量蛋白質(zhì)濃度。

三、雙向凝膠電泳及圖像分析

將去除高豐度蛋白的蛋白團塊重溶。24 cm干膠條在含100μg蛋白質(zhì)樣本和水化液的460μl混合液中20℃水化10~12 h。將膠條放入等電聚焦盤中加電壓聚焦。第一向等電聚焦電泳 (IEF)后,待膠條平衡,再進行12%的聚丙烯電泳酰胺凝膠(SDS-PAGE)電泳,電泳所得的雙向凝膠用雙胺硝酸銀法染色及考馬斯亮藍染色,Imagescanner掃描儀進行透射掃描,獲得的數(shù)字化圖像運用ImageMaster 2D platinum 5.0軟件進行蛋白質(zhì)點的檢測、量化、背景扣除、點的匹配。著重選擇pH4~7,分子量10~55 KDa區(qū)域進行觀察,從羊水中找到僅在羊水中表達的蛋白質(zhì)點及在羊水中表達量高于血清2倍以上的蛋白質(zhì)點,隨機選取重復性和分辨率較高的10個差異蛋白質(zhì)點行基質(zhì)輔助激光解吸/離子化飛行時間質(zhì)譜 (MALDI-TOF/TOFMS)鑒定。

四、MALDI-TOF/TOF-MS分析

選取行MALDI-TOF/TOF-MS分析的蛋白質(zhì)點后行挖點、脫色、還原、烷基化、酶解、樣品回收及脫鹽處理、肽段提取后點靶上機,使用Autoflex speedTMMALDI-TOF-TOF質(zhì)譜儀進行質(zhì)譜分析。利用flexAnalysis軟件過濾基線峰、識別信號峰。利用Mascot軟件搜索NCBI及Uniprot數(shù)據(jù)庫,尋找匹配的相關蛋白質(zhì),同時查詢其功能,明確鑒定的蛋白質(zhì)為何種蛋白質(zhì)。

結 果

一、高豐度蛋白去除后雙向凝膠電泳分析結果

在pH 4~7、分子量10~55 KDa的區(qū)域中,羊水及血清的蛋白質(zhì)位點分布大部分相同,血清組的斑點多于羊水組(見圖1A、B)。經(jīng)ImageMaster 2D platinum 5.0軟件分析,羊水中約有(613±29)個蛋白質(zhì)點,血清中約有(785±64)個蛋白質(zhì)點,羊水中特異表達的蛋白點約50個(見圖1C),羊水中表達量高的蛋白點約50個(見圖1D)。

圖1 去除高豐度蛋白后的雙向凝膠電泳分析結果

二、MALDI-TOF/TOF-MS分析結果

隨機選取重復性和分辨率較高的10個濃度差異的蛋白質(zhì)斑點行質(zhì)譜分析鑒定,質(zhì)譜分析結果見圖2及表1。

討 論

羊水作為胎兒生長發(fā)育最為重要的因素之一,在多種妊娠疾病的發(fā)生中有重要作用。蛋白質(zhì)組學是繼人類基因組計劃完成后的新興學科[2]。隨著人類蛋白質(zhì)組學組織(HUPO)的正式成立,蛋白質(zhì)組學蓬勃發(fā)展,滲透到各個學科。近年來,國內(nèi)外均有學者對妊娠婦女血液、羊水進行了蛋白質(zhì)組學的研究,探索新的妊娠蛋白和疾病特異蛋白,以及蛋白質(zhì)在妊娠相關疾病發(fā)生、發(fā)展中的相互作用。然而,目前的多數(shù)研究集中于尋找羊水中特異性的差異蛋白,筆者前期經(jīng)nano LC/MS/MS對羊水的蛋白組學分析,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)羊水中人62種特異性蛋白[3]。本次通過比較Anderson等[4]和Michel等[5]的結果,新檢測到了22種僅在AF中表達的蛋白,其中14種是分泌型蛋白,其余8種分布于細胞膜、細胞質(zhì)和細胞核。羊水特異性蛋白斑點約50余個,與此前nano LC/MS/MS的結果相符,故本研究不行此類斑點的質(zhì)譜分析。

圖2 3種在羊水和血清中呈濃度差異表達的蛋白質(zhì)

表1 10個在羊水及血清中呈濃度差異表達的蛋白質(zhì)斑點質(zhì)譜分析結果

本研究初步探討在羊水和血清中均有表達,但羊水中表達量明顯要高于血清的一些蛋白質(zhì)。研究初步挑選其中10個重復性和分辨率較高斑點行質(zhì)譜鑒定,檢索UniProt等在線蛋白數(shù)據(jù)庫,除2個斑點為細胞膜及細胞質(zhì)蛋白外,余均為分泌型蛋白質(zhì)。這些蛋白的已知功能如下:硫酸類肝素蛋白多糖(HSPG2)是基底膜的主要成分,對心臟發(fā)育及血管調(diào)節(jié)起著重要作用,此類蛋白質(zhì)缺乏可導致常染色體隱性遺傳病侏儒綜合征的發(fā)生[6]。絨毛膜生成激素(CSH1)具有刺激泌乳、促進胎兒生長及新陳代謝等作用[7]。載脂蛋白AI為雙超螺旋模型的溶液結構B鏈,參與膽固醇的轉(zhuǎn)運,使其從組織中轉(zhuǎn)運至肝臟。因其影響膽固醇代謝,在HDL缺乏癥及淀粉樣變中起著重要的作用,其缺乏可引起早發(fā)冠心病,肝、脾腫大,復發(fā)性周圍神經(jīng)病變,進行性肌肉萎縮和無力,其突變可致淀粉樣多神經(jīng)病腎病、家族性淀粉樣多神經(jīng)病[8-9]。AMBP蛋白是α1微球蛋白前體,具有抑制胰蛋白酶、纖溶酶、粒細胞前溶酶體酶及草酸鈣結晶的作用[10]。另外,胰島素樣生長因子結合蛋白(IGFBP)具有延長胰島素樣生長因子的半衰期,調(diào)節(jié)IGF的促進生長作用[11]。載脂蛋白E與胎兒生長有一定關系[8]。硫氧還原蛋白過氧化物酶2(PRDX2),與細胞氧化還原調(diào)節(jié)有關,在清除新陳代謝過程中產(chǎn)生的過氧化物起著重要的作用,通過調(diào)節(jié)細胞內(nèi)過氧化氫的濃度,誘使生長因子和TNF-α的信息傳導[12]。BPIFA1蛋白與接觸刺激物后引起的氣道炎癥有一定的關聯(lián),與上呼吸道的天然免疫有一定關系。亦在腫瘤的演化進展起著一定的作用[13]。補體因子B是補體系統(tǒng)的替代途徑,被D因子激活成2個片段Ba、Bb,Bb結合3b因子產(chǎn)生C3或C5轉(zhuǎn)化酶,對B細胞的增殖及分化起著一定作用,Ba的作用與此相反,與溶血性尿毒綜合征非典型4(AHUS4)有關[14]。羊水的某些蛋白質(zhì)表達可反映妊娠生理或病理狀態(tài),可能有助于妊娠相關疾病如胎兒宮內(nèi)生長受限、子癇前期、早產(chǎn)、宮內(nèi)感染甚至羊水栓塞等的早期診斷。本研究中在羊水表達水平偏高的蛋白質(zhì)是否可提供某種診斷依據(jù)還待進一步研究證明。此外,鑒于本研究僅采用質(zhì)譜蛋白鑒定策略,今后將對羊水中呈差異表達的蛋白質(zhì)采用免疫印跡或其他的方法行進一步驗證,以確定其是完整的蛋白還是片段蛋白。

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