董 賀,馬艷妮,董 磊,趙華路,張俊武,王 芳,余 佳
(中國醫學科學院 基礎醫學研究所 北京協和醫學院 基礎學院 國家醫學分子生物學重點實驗室, 北京 100005)
miR- 29a和miR- 142- 3p促進髓系分化的基因調控網絡
董 賀,馬艷妮,董 磊,趙華路,張俊武,王 芳,余 佳*
(中國醫學科學院 基礎醫學研究所 北京協和醫學院 基礎學院 國家醫學分子生物學重點實驗室, 北京 100005)
目的深入了解miR- 29a/miR- 142- 3p參與促進髓系分化的調控網絡。方法首先實現miR- 29a和miR- 142- 3p在HL- 60細胞中的過表達,同時使用PMA以及ATRA分別誘導HL- 60細胞向單核及粒系分化。May-Grünwald-Giemsa染色方法觀察核形態變化,Real-time PCR檢測細胞內CD11和CD14的表達。mRNA表達譜芯片分析獲得表達模式相似的基因,利用DAVID和GeneMANIA進行GO categories 和信號通路歸類分析。PicTar和TargetScan進行靶基因預測,雙熒光報告基因實驗確定靶基因的真實性。結果miR- 29a/miR- 142- 3p過表達細胞與PMA/ATRA誘導分化細胞在整體基因表達模式上有較高的相似度,而表達模式相似的基因大多與細胞分化相關,且在GO分析中顯著富集。同時,ZBTB5、CaMKK2、SUV420H2、TRIB2和CANX被確定為miR- 29a新的靶基因。結論miR- 29a/miR- 142- 3p通過調節其靶基因活性,引發整個基因表達調控網絡的改變,使之趨向于髓系分化過程中的基因表達變化,從而促進髓系分化進程。
miR- 29a; miR- 142- 3p; 髓系分化;基因表達; GO分析
造血是貫穿人一生的重要生理過程,涉及多潛能造血干細胞(hematopoietic stem cells, HSC)的自我更新和向不同鏈系細胞的分化決定并進一步分化發育成熟。HSC首先分化成共同淋巴樣祖細胞(common lymphoid progenitor, CLP)和共同髓樣祖細胞(common myeloid progenitor, CMP)。CMP進一步分化成巨核/紅系雙潛能祖細胞(megakaryocytic-erythroid progenitor, MEP)和粒系/單核系祖細胞(granulocyte-monocyte progenitor, GMP)。GMP經過髓樣分化細胞限制的途徑分化發育成粒細胞、單核細胞,這一過程又稱為髓系分化[1- 2]。……