ChIP-seq比較分析人體心臟和脾臟的H3K9三甲基化差異

薛 雯，曹翠輝,2，眭維國，車文體，陳潔晶，郭 麗，戴 勇

(1.中國人民解放軍第181醫院 腎臟科 廣西代謝性疾病研究重點實驗室， 廣西 桂林 541002；2.廣西師范大學生命科學學院，廣西 桂林 541004； 3.深圳市人民醫院 暨南大學 第二臨床醫學院 臨床醫學研究中心， 廣東 深圳 518020)

ChIP-seq比較分析人體心臟和脾臟的H3K9三甲基化差異

薛 雯1，曹翠輝1,2，眭維國1，車文體1，陳潔晶1，郭 麗1，戴 勇3*

(1.中國人民解放軍第181醫院 腎臟科 廣西代謝性疾病研究重點實驗室， 廣西 桂林 541002；2.廣西師范大學生命科學學院，廣西 桂林 541004； 3.深圳市人民醫院 暨南大學 第二臨床醫學院 臨床醫學研究中心， 廣東 深圳 518020)

目的分析人體器官心臟和脾臟的H3K9me3的全基因圖譜，以期發現H3K9三甲基化的修飾與組織特異性的表達、功能和發育具有相關性。方法通過染色質免疫共沉淀的方法獲取各標本DNA，通過qPCR驗證ChIP結果，然后構建ChIP Sequencing文庫，與目的基因組序列比對，獲取比對Reads，接著進行全基因組的Peak分析，GO功能富集分析peak相關基因的生物學功能。結果心臟和脾臟間有169個基因有顯著地H3K9me3差異，其中心臟中H3K9me3的基因中有64個特殊基因，脾臟中H3K9me3的基因中有87個特殊基因。從這些基因中，挑選出8個表現H3K9me3 明顯的基因，然后再從這8個基因中挑選出兩個心臟和脾臟間表現H3K9me3差異最明顯的基因，分別是PTPN3和RBMS。結論H3K9me3差異可作為一個潛在的生物標志物或是表觀遺傳疾病的治療靶點。

H3K9me3；ChIP-seq；表觀遺傳學

在哺乳動物基因組中，組蛋白則可以有很多修飾形式。包括組蛋白末端的乙酰化，甲基化，磷酸化，泛素化以及ADP核糖基化等等，這些修飾都會影響基因的轉錄活性?！?br>