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多重PCR法用于雞、鴨肉源性的鑒定

2014-12-16 08:11:02段慶梓尚柯張玉張良
食品研究與開發(fā) 2014年5期
關(guān)鍵詞:檢測(cè)

段慶梓,尚柯,張玉,張良

(成都市食品藥品檢測(cè)中心,四川成都610045)

目前,針對(duì)肉制品源性鑒定方法主要有蛋白質(zhì)鑒定(等電聚焦電泳、酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)、色譜等)和基因鑒定兩類。但食品中的肉類在經(jīng)過蒸煮、熏烤等加工烹調(diào)過程后,失去了原有的蛋白質(zhì)特性,因此蛋白質(zhì)對(duì)肉類的鑒定存在一定的局限性。而利用PCR進(jìn)行基因鑒定則很大程度上彌補(bǔ)了這一不足,DNA的耐熱性強(qiáng),在高溫處理過的食品中仍能提取出小片段的DNA,并且DNA鑒別不依賴于組織和細(xì)胞的類型[1-3]。

近些年來,通過PCR方法對(duì)肉質(zhì)源性的鑒定已經(jīng)有了一定的研究。Dalmasso等選擇12S rDNA和16S rDNA兩個(gè)基因,建立了反芻動(dòng)物、禽類、魚類和豬肉的特異性引物,分別擴(kuò)增出不同大小的片段來實(shí)現(xiàn)混合樣品中物種的鑒定[4]。陳文炳等開發(fā)了真核生物所共有的18 S核糖體DNA(18S rDNA)與食品中豬、牛、羊、雞等多種動(dòng)物物種特異性基因片段之間的二重PCR檢測(cè)方法[5]。Tanabe等構(gòu)建了一對(duì)豬特異性引物,用于特異性擴(kuò)增豬Cytb中基因長(zhǎng)度為130bp的序列[6];Fujimura等構(gòu)建了一對(duì)雞特異性引物,能特異性擴(kuò)增16S rDNA上一段102 bp的片段,在其他禽類中都沒有擴(kuò)增出該產(chǎn)物[7]。

本文通過對(duì)雞、鴨的Cyt-b基因進(jìn)行序列比對(duì),設(shè)計(jì)了一條共同的上游引物(CD-U1)和雞、鴨各自的下游引物(C-L1,D-L1),并通過調(diào)節(jié)PCR反應(yīng)中3條引物的比例,同時(shí)以豬肉作為負(fù)對(duì)照,擴(kuò)增得到的雞、鴨片段大小分別為505 bp和436 bp,而豬肉無任何條帶的擴(kuò)增,說明所設(shè)計(jì)的引物具有較好的特異性。同時(shí),將PCR的結(jié)果進(jìn)行測(cè)序,并分別與GenBank中雞、鴨的Cyt-b基因序列進(jìn)行比對(duì),結(jié)果顯示我們所擴(kuò)增的即為雞、鴨Cyt-b基因的片段。且該多重PCR方法可檢測(cè)出混合樣品中雞、鴨肉的比例最低為10%。因此,該多重PCR方法可根據(jù)所得基因片段的大小差異來對(duì)禽肉中雞肉和鴨肉的成分進(jìn)行鑒定。

1 材料

1.1 樣品的采集

雞肉、鴨肉、豬肉均購自當(dāng)?shù)爻泻娃r(nóng)貿(mào)市場(chǎng)。

1.2 主要試劑

動(dòng)物基因組DNA提取試劑盒(購自Generay公司)、DNA聚合酶、10×緩沖液(含Mg2+離子)(購自TransGen公司)、DL1000 Marker和6×Loading Buffer(購自寶生物工程公司)、dNTP和GoldView染料(購自SolarBio公司),其余試劑均為國產(chǎn)分析純。

1.3 引物設(shè)計(jì)

通過查閱文獻(xiàn)[8-11]并參照GenBank中已提交的雞(GU261716.1)、鴨(EU755252.1)的序列,設(shè)計(jì)了雞、鴨共同的一條上游引物(CD-U1)和其各自的特異性下游引物(C-L1,D-L1)。CD-U1與C-L1擴(kuò)增雞的片段大小為505 bp,CD-U1與D-L1所擴(kuò)增鴨的片段大小為436 bp。引物序列見表1。

表1 雞、鴨多重PCR引物序列Table 1 Primer sequence of chicken and duck for multiplex PCR

2 方法

2.1 基因組DNA提取

依照Generay公司動(dòng)物組織基因組提取試劑盒操作說明分別提取雞肉、鴨肉和豬肉的基因組DNA,所取組織量均為20 mg。提取的DNA用20 μL滅菌的超純水溶解,放置-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

2.2 多重PCR反應(yīng)體系的確定

經(jīng)引物比例調(diào)節(jié)后的PCR反應(yīng)體系見表2。

表2 雞、鴨肉質(zhì)鑒定的多重PCR反應(yīng)體系Table 2 Multiplex PCR system for detecting chicken and duck

配制完畢后充分混勻進(jìn)行如下PCR反應(yīng):94℃預(yù)變性 2 min,30 個(gè)擴(kuò)增循環(huán)(94℃30s,54℃30s,72℃30 s),72℃最后延伸10 min。反應(yīng)完畢后,將PCR產(chǎn)物取出,用瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè)分析。

3 結(jié)果

3.1 多重PCR引物比例的確定

分別以不同體系的混合雞、鴨DNA為模板(表3),來調(diào)整三個(gè)引物之間的比例,按2.2方法進(jìn)行反應(yīng),進(jìn)而確定多重PCR反應(yīng)的最佳引物比例。

表3 雞、鴨多重PCR預(yù)實(shí)驗(yàn)?zāi)0灞壤齌able 3 Template proportion of chicken and duck for preliminary PCR μL

1)當(dāng)引物比例 CD-U1∶C-L1∶D-L1=0.25∶0.15∶0.15時(shí),進(jìn)行PCR反應(yīng),電泳結(jié)果見圖1(a)。

2)當(dāng)引物比例 CD-U1∶C-L1∶D-L1=0.25∶0.1∶0.25時(shí),進(jìn)行PCR反應(yīng),電泳結(jié)果見圖1(b)。

圖1 不同引物比例的PCR預(yù)實(shí)驗(yàn)Fig.1 Different primer proportion of preliminary PCR

由圖1可以顯示,當(dāng)引物比例CD-U1∶C-L1∶DL1=0.25∶0.15∶0.15時(shí),不論模板量的多少,雞條帶(505 bp)亮度總高于鴨條帶(436 bp),不符合預(yù)期結(jié)果;而當(dāng)引物比例 CD-U1∶C-L1∶D-L1=0.25∶0.1∶0.25時(shí),雞、鴨條帶的亮度隨不同體系中模板量的變化而變化,且在雞、鴨模板量相同的條件下,所擴(kuò)增條帶亮度一致,符合預(yù)期試驗(yàn)結(jié)果。因此選取引物比例CDU1∶C-L1∶D-L1=0.25∶0.1∶0.25為多重 PCR的引物比例。

3.2 雞、鴨肉成分的鑒定

將所提取的雞、鴨肉和豬肉基因組DNA分別按2.2方法進(jìn)行PCR檢測(cè),電泳結(jié)果如圖2所示。

圖2 雞、鴨肉鑒定的PCR結(jié)果Fig.2 PCR results of detecting chicken and duck

陽性對(duì)照,陰性對(duì)照和空白對(duì)照均成立,即雞肉擴(kuò)增出505 bp的條帶,鴨肉擴(kuò)增出436 bp的條帶,而豬肉和空白對(duì)照中均無條帶。

3.3 雞、鴨肉混合樣品的檢測(cè)

雞、鴨混合(即PCR模板中雞肉與鴨肉DNA的比例)依次為(0 ∶1);(0.1 ∶0.9);(0.25 ∶0.75);(0.5 ∶0.5);(0.75 ∶0.25);(0.9 ∶0.1);(1 ∶0)。模板混合均勻后,按2.2方法進(jìn)行PCR擴(kuò)增,電泳檢測(cè)結(jié)果見圖3所示。

圖3 多重PCR檢測(cè)雞鴨肉不同比例的混合模板Fig.3 Multiplex PCR detection of Mixture template containing chicken and duck.

第1泳道(模板完全為鴨肉)為鴨肉436 bp的條帶;第7泳道(模板完全為雞肉)為雞肉505 bp的條帶。第4泳道(雞、鴨模板比例為0.5∶0.5)則同時(shí)出現(xiàn)雞肉和鴨肉的條帶,且亮度一致,表明所選取的引物比例合適。整個(gè)PCR結(jié)果隨混合模板中雞、鴨DNA量的變化而相應(yīng)的改變。因此,該多重PCR體系可檢測(cè)出混合樣品中雞、鴨肉的比例最低為10%。

3.4 成都市雞、鴨肉的鑒別檢測(cè)

分別在成都市的生產(chǎn)、流通和餐飲環(huán)節(jié)隨機(jī)抽取雞、鴨肉各30批,用所建立的多重PCR方法進(jìn)行鑒別,部分(10個(gè)批次)檢測(cè)結(jié)果見圖4。

圖4 雞、鴨肉鑒別檢測(cè)的部分(10批)PCR結(jié)果Fig.4 Partial PCR results of detecting chicken and duck

PCR結(jié)果顯示目前成都市市場(chǎng)上的雞、鴨肉風(fēng)險(xiǎn)度較低,暫無摻偽造假現(xiàn)象。

4 討論

本實(shí)驗(yàn)所選取的雞、鴨特異性引物均位于線粒體Cyt-b上,因?yàn)榫€粒體在動(dòng)物的各個(gè)組織均大量存在,并且Cyt-b基因具有很高的保守性[12]。通過比對(duì)雞、鴨的Cyt-b基因序列,確定了針對(duì)雞、鴨的特異性檢測(cè)引物,并進(jìn)行了相應(yīng)引物比例的PCR反應(yīng)。同時(shí),還對(duì)雞、鴨混合模板進(jìn)行了PCR試驗(yàn),結(jié)果表明該方法所建立的多重PCR體系可檢測(cè)出混合樣品中雞、鴨肉的比例最低為10%。為了進(jìn)一步驗(yàn)證PCR結(jié)果的準(zhǔn)確性性,將PCR產(chǎn)物送由華大基因公司進(jìn)行測(cè)序,并將測(cè)序結(jié)果與GenBank中雞、鴨的Cyt-b基因進(jìn)行比對(duì)(圖5)。比對(duì)結(jié)果顯示,我們所擴(kuò)增的雞(505 bp)片段和鴨(436 bp)片段確實(shí)位于Cyt-b基因上,表明試驗(yàn)結(jié)果真實(shí)可靠。同時(shí),用該方法對(duì)成都市場(chǎng)上的雞、鴨肉抽樣檢測(cè)顯示,目前市場(chǎng)上暫無雞、鴨肉的摻偽造假現(xiàn)象。

圖5 雞、鴨PCR測(cè)序結(jié)果分別與GenBank中Cyt-b基因的序列比對(duì)Fig.5 The sequence of PCR results for chicken and duck were compared with Cyt-b gene in Genbank,respectively

由于目前相關(guān)法律法規(guī)沒有明確規(guī)定,要求市場(chǎng)上的肉類制品標(biāo)示出所含肉類的種類及含量,所以市售的肉制品均只標(biāo)明成分而不標(biāo)明各成分含量。在這種情況下,對(duì)肉制品中不同種屬的肉類進(jìn)行定量檢測(cè)意義不大,故本試驗(yàn)中所使用的引物其特異性和靈敏度完全符合市場(chǎng)檢測(cè)的要求[10]。因此,本實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的引物具有特異性強(qiáng)、靈敏度高的特點(diǎn),建立的PCR檢測(cè)方法樣品用量少,結(jié)果準(zhǔn)確,適合大規(guī)模推廣應(yīng)用。

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