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茶樹CsGPX基因克隆及干旱脅迫下的表達分析

2018-05-18 01:25:24喬新榮張繼英
江蘇農業科學 2018年8期

喬新榮,張繼英

(信陽農林學院,河南信陽464000)

谷胱甘肽過氧化物酶(glutathione peroxidase,簡稱GPX)是生物機體內重要的抗氧化酶,它可以清除機體內的H2O2及脂質過氧化物,阻斷活性氧自由基對機體的進一步損傷,保護細胞免受氧化脅迫,提高植物的抗逆能力[1-2]。谷胱甘肽過氧化物酶也可以作為信號分子,與激素交聯,調節植物的生長發育[3-4]。因此,對谷胱甘肽過氧化物酶進行開發和利用具有重要的意義,現已從煙草、柑橘、擬南芥、大白菜、番茄、豌豆、水稻、龍眼等許多植物中分離和鑒定[5]。

茶樹[Camellia sinensis(L.)O.Kuntze]屬于山茶科雙子葉植物,茶葉具有高效的抗癌、抗衰老、抗輻射、抗氧化、清除人體自由基、降血糖和血脂等一系列藥理功能。我國茶區地形分布復雜,包括平原、丘陵、山地和高原。這些地區經常出現季節性干旱、高溫、低溫等逆境,導致茶芽萌發遲、生長瘦弱,造成茶產量和品質下降。本研究擬克隆茶樹CsGPX基因,并對其進行生物信息學方面及干旱脅迫下的轉錄表達進行初步分析,旨在為今后通過基因工程研究CsGPX基因的表達,探究茶樹依賴CsGPX途徑清除活性氧的分子基礎,以期為鑒定和選育茶樹抗逆品種提供分子水平上的理論依據。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

本研究所使用的茶樹材料為河南省信陽茶葉示范園區信陽群體種。選取健壯茶樹的新梢幼葉,提取總RNA并反轉錄得到cDNA模板,利用RT-PCR技術克隆CsGPX基因片段。

選取長勢一致的茶樹健壯植株枝條,于人工氣候箱內進行Hoagland完全營養液水培,每3 d更換1次營養液,1周后進行干旱處理。用滲透勢為-1.0 MPa的聚乙二醇6000模擬干旱脅迫進行培養,分別收集脅迫 0、3、6、9、12、18、24 h的茶樹幼葉,液氮冷凍后保存,分別提取總RNA并反轉錄得到不同的cDNA模板,利用real-time PCR技術檢測CsGPX基因轉錄表達量。

1.2 試驗試劑

DNA分子量標準、Taq DNA聚合酶、dNTPs、克隆載體pMD18-T、DNA回收試劑盒、質粒提取試劑盒、反轉錄試劑盒,均購自天根生化科技(北京)有限公司;Trizol試劑購自Invitrogen公司;熒光定量試劑盒SYBR Premix Ex Taq,購自TaKaRa公司;在Primer Premier 5.0中進行引物設計;引物合成及測序由南京金斯瑞生物科技有限公司完成。

1.3 引物序列

CsGPX基因克隆引物為F1:5′-GTCAATGTTGCCTCACA ATGTGG-3′,R1:5′-CAGCTTCTTCACGTCCTTCTCAAT-3′。茶樹β-Actin基因real-time PCR引物為 F2:5′-AGGGTAT GCTCCTCCTCAT-3′,R2:5′-TCAGCAGTGGTGGTGAACAT-3′。CsGPX基因 real-time PCR引物為 F3:5′-GAGCCAGGG AATAATGAGC-3′,R3:5′-ATTGGAGCAGCATTCTCAC-3′。

1.4 CsGPX基因片段的信息學分析

分別利用 DNAMAN 6.0、Clustal X 1.81及 MEGA 5.2對CsGPX基因片段進行氨基酸序列推斷、保守序列分析、進化樹構建。

2 結果與分析

2.1 茶樹CsGPX基因片段的克隆

根據其他物種GPX基因的保守序列設計特異擴增引物F1和R1,利用Trizol試劑提取茶樹幼葉總RNA,檢測RNA的質量后,進行反轉錄獲得cDNA第1鏈,以此為模板,經PCR擴增獲得1條大小約為400 bp的目的片段(圖1)。反應程序為94℃預變性5min;94℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸50 s,32個循環;72℃延伸10min。擴增產物經1%瓊脂糖凝膠電泳后,用DNA凝膠回收試劑盒將目的片段回收純化,連接于克隆載體pMD18-T上,熱激轉化大腸桿菌DH5α。菌落PCR擴增鑒定后,挑取陽性克隆進行測序,經測序克隆到的基因片段長387 bp,利用DNAMAN 6.0軟件推斷其編碼129個氨基酸(圖2)。

2.2 茶樹CsGPX基因片段的生物信息學分析

從GenBank和PeroxiBase數據庫中下載擬南芥(AtGPX 1~AtGPX 8)、楊樹(PtGPX 1、2、5、8,PtGPX 6-1、PtGPX6-2)、水稻 (OsGPX1)、玉米 (ZmGPX1)、番茄 (SlGPX)、小 麥(TaGPX)等蛋白質的氨基酸序列,利用 DNAMAN 6.0和Clustal X 1.81軟件,與推斷的CsGPX基因片段編碼的氨基酸序列進行同源性比對。由圖3可知,CsGPX編碼的氨基酸序列具有GPX蛋白保守特征序列,即具有3個保守結構域(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ)以及酶活性中心的3個保守的半胱氨酸(C)殘基。初步推斷其克隆的基因序列是茶樹CsGPX基因片段。

利用 MEGA 5.2軟件,按 Neighbor-Joining方案對CsGPX及部分植物GPX蛋白的氨基酸序列進行分子系統進化分析,由圖4可知,CsGPX保守序列區域與擬南芥AtGPX6、楊樹PtGPX6-1、楊樹PtGPX6-2等親緣關系較近。

2.3 CsGPX基因在干旱脅迫下的轉錄表達分析

使用ABI7300熒光定量PCR儀進行表達量分析,采用20μL反應體系:10μL SYBR Premix Ex Taq,正、反向引物(10μmol/L)各0.5μL,0.4μL ROX Reference Dye(50×),2.0μL cDNA模板,6.6μL ddH2O。反應程序為95℃預變性90 s;PCR反應:95℃ 15 s,60℃ 40 s,共40個循環,每個樣品進行3次重復檢測,使用2-ΔΔCT法求得待測樣品的相對表達量。分別提取干旱脅迫處理 0、3、6、9、12、18、24 h茶樹幼葉的RNA,反轉錄為 cDNA,以此為模板,利用 Primer Premier 5.0設計茶樹β-Actin定量PCR引物為F2、R2,CsGPX基因定量PCR引物為F3、R3,以茶樹β-Actin片段為內參,檢測CsGPX在干旱脅迫下的轉錄表達量變化。由圖5可知,隨著干旱脅迫處理時間的延長,相對表達量呈現先升后降的變化趨勢,在處理12 h時,CsGPX轉錄相對表達量達到最大值,約是對照的6倍。隨后又降低,24 h后逐漸恢復至處理前的水平。

3 結論與討論

本研究中克隆茶樹CsGPX基因片段所編碼的氨基酸序列具有植物GPX的3個特征保守結構域,且含有GPX活性中心的3個保守的半胱氨酸殘基,因此,所克隆的CsGPX基因屬于植物GPX家族成員。且與已報道的AtGPX6、PtGPX6、TaGPX等親緣關系較近。初步研究CsGPX的轉錄表達受干旱脅迫誘導,表明CsGPX參與茶樹抗旱信號轉導途徑。已報道AtGPX6定位于線粒體和胞質,在多種組織的整個發育過程中都高度表達[3],鹽、鐵、鋁脅迫增強了AtGPX6的mRNA表達水平[6]。利用水楊酸(SA)、生長素(IAA)、脫落酸(ABA)、茉莉酸(JA)等處理后,也引起AtGPX6轉錄表達量的增加[3]。在AtGPX6基因的啟動子區含有ABA、SA、IAA響應元件。另外,定位于小麥葉綠體中的TaGPX基因轉入擬南芥超表達后,表現出對鹽、H2O2、ABA脅迫的強耐性,且鹽、H2O2、ABA信號轉導通路中的關鍵調節子基因(SOS1、RbohD、ABI1/ABI2)的表達水平也在轉基因株系中改變[7]。干旱脅迫下水稻的GPX酶活性也增強[8]。這些植物GPX的功能研究為CsGPX的深入研究提供了參考。將來對CsGPX基因的全長進行克隆,將其原核表達,檢測其亞細胞定位。也將進一步研究CsGPX酶活性在干旱脅迫中的變化以及其作用底物的特異性,為闡明CsGPX在干旱脅迫信號轉導中的作用機制奠定基礎。

參考文獻:

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[2]Yang X D,LiW J,Liu JY.Isolation and characterization of a novel PHGPx gene in Raphanus sativus[J].Biochimica et Biophysica Acta,2005,1728(3):199-205.

[3]Rodriguez Milla M A,Maurer A,Rodriguez Huete A,et al.Glutathione peroxidase genes in Arabidopsis are ubiquitous and regulated by abiotic stresses through diverse signaling pathways[J].Plant Journal,2003,36(5):602-615.

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[5]肖 蓉,羅慧珍,張小娟,等.干旱和鹽脅迫條件下棗樹谷胱甘肽過氧化物酶基因(ZjGPX)的差異表達及功能分析[J].中國農業科學,2015,48(14):2806-2817.

[6]Sugimoto M,Sakamoto W.Putative phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase gene from Arabidopsis thaliana induced by oxidative stress[J].Genes&Genetic Systems,1997,72(5):311-316.

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[8]Goswami A,Banerjee R,Raha S.Drought resistance in rice seedlings conferred by seed priming:role of the anti-oxidant defense mechanisms[J].Protoplasma,2013,250(5):1115-1129.

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