RNA-Seq技術揭示人體急進高原早期轉錄特征

陳　建，劉　寶，崔建華，張　龍，徐　剛，梁　顏，梁　羽，汪　健，高鈺琪(第三軍醫大學高原軍事醫學系高原特需藥品與衛生裝備研究室，解放軍第十八醫院高山病研究所，華大基因研究院，重慶400038)

RNA-Seq技術揭示人體急進高原早期轉錄特征

陳建，劉寶，崔建華，張龍，徐剛，梁顏，梁羽，汪健，高鈺琪△
(第三軍醫大學高原軍事醫學系高原特需藥品與衛生裝備研究室，解放軍第十八醫院高山病研究所，華大基因研究院，重慶400038)

目的:通過RNA-Seq技術探討人體急進高原早期的轉錄特征。方法:對從平原快速進入高原(5300 m)的19名青年健康男性志愿者，于進入高原前后采集靜脈血。提取總RNA進行測序，獲取原始序列數據，對原始序列數據進行質量控制處理后，將其比對到人類參考基因組(hg19)。統計相關讀段數計算不同轉錄本的表達量。對急進高原前后轉錄本表達譜進行轉錄本差異表達分析，針對差異表達轉錄本，對其進行基因本體及通路分析。結果:從37 908個轉錄本中篩選出836個差異轉錄本，其中274個轉錄本表達上調，562個轉錄本表達下調。人體急進高原早期多個生物學過程及信號通路參與了人體對高原低氧環境的反應。結論:面對高原低氧環境，人體在基因整體水平表現出了特有的差異表達譜特征，參與其中的生物學過程及信號通路對理解人體對高原低氧環境反應的分子機制具有重要的參考價值。

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