金文進,李春杰,王正鳳
(1.甘肅工業職業技術學院化工學院,甘肅天水741025;2.草地農業生態系統國家重點實驗室,蘭州大學草地農業科技學院,甘肅蘭州730020;3.白銀市農業科學研究所,甘肅白銀730900)
禾草內生真菌的多樣性及意義
金文進1,2,李春杰2*,王正鳳3
(1.甘肅工業職業技術學院化工學院,甘肅天水741025;2.草地農業生態系統國家重點實驗室,蘭州大學草地農業科技學院,甘肅蘭州730020;3.白銀市農業科學研究所,甘肅白銀730900)
禾草內生真菌是一個多樣性十分豐富的微生物類群,因其具有重要的生理和生態作用而成為當前國內外研究的熱點。禾草內生真菌的多樣性主要有種的多樣性、宿主多樣性、生境多樣性、形態多樣性以及遺傳多樣性。主要是感染冷季型禾草的香燭菌屬(Epichlo?)及其無性態Neotyphodium屬。全球生態環境復雜、宿主植物多樣性豐富,導致內生真菌的多樣性更加豐富,從而會發現更多新的真菌分類單元,這在菌種收集和保藏方面獨具優勢。內生真菌可使禾草提高抗逆性并適應逆境甚至極端環境條件,這對于深入探討內生真菌-宿主之間的相互作用,有目的性和科學性地構建新的禾草內生真菌共生體及植物微生態系統的研究都具有十分重要的意義。
禾草;內生真菌;多樣性
在禾草中度過全部或大部分生命周期,而外部不引起明顯病害癥狀的一大類真菌叫禾草-內生真菌,其中,香柱菌屬(Epichlo?)的無性型Neotyphodium與禾草的關系最為密切而成為國內外研究的熱點[1]。到19世紀70年代后期,內生真菌與禾本科植物的互利共生關系才被逐步揭示[1-3]。禾草內生真菌普遍存在并具有多樣性,在天然草地和人工草地的禾草中均有廣泛分布[4]。同時,自然生態系統中禾草-內生真菌的關系復雜而多變,土壤養分難以滿足雙方的需求,表現出從拮抗到互利的多種共生關系[5-6]。禾草生存環境的異質性及內生真菌的遺傳多樣性都很高,這種差異不僅與禾草和內生真菌的基因型有關,也與禾草的環境條件及內生真菌的種類有關,因此,正是這種生境的特殊性決定了禾草內生真菌的研究既有理論的廣度和深度,又有多方面的應用潛力。從20世紀80年代中期起,國內外在禾草內生真菌的多樣性研究中取得了一定的成就[4,7-12]。本文將簡要概述這方面的研究進展。
第18屆國際植物會議上,真菌等的命名規則進行了調整。利用這一規則,Leuchtmann[13]等將與禾草共生的香燭菌屬的有性型Epichlo?和其無性型Neotyphodium的種類通過重新組合共形成了43個分類單元,包括種、亞種和變種,將原來命名的一些種降級為變種、亞種或作為異名歸并,如:N.lolii變為E.festucae var.lolii,E.clarkii變為E.typhina subsp.clarkii,E.yangzii并入E.bromicola;原來的N.chilense和N.starrii兩個種未被承認[14-31](表1)。目前,許多帶內生真菌的禾草仍有待于進一步的鑒定、分類和命名[12,25,32-35]。然而,對于Epichlo?typhina而言,仍然是較大的一個種,宿主禾草包括12個屬,需要從形態、生理生化及系統發育等方面更進一步的深入研究,很可能分解為幾個不同的種或種以下的分類單元。從目前的研究結果分析,平均每種宿主禾草有4~5種內生真菌,按地球目前25萬種植物計算,內生真菌總數可超過100萬種[36]。
近年來,我國在禾草內生真菌種的多樣性研究中也成績顯著,新種不斷出現。2004年Li等[20]將分離于我國甘肅醉馬草(Achnatherum inebrians)的內生真菌命名為E.gansuensis(Neotyphodium gansuense);在此基礎上,2007年,美國Schardl教授實驗室又將分離于我國新疆的醉馬草內生真菌命名為E.gansuensis var.inebrians(N.gansuense var.inebrians)[22];后來,南京農業大學王志偉課題組和南開大學高玉葆課題組分別在鵝觀草屬(Roegneria)、佛子茅屬(Calamagrostis)、羊茅屬(Festuca)、早熟禾屬(Poa)及羽茅(A.sibiricum)上相繼發現了8個種[14,18,26-28]。我國禾本科植物資源很豐富,已經檢測到越來越多的禾草內生真菌共生體[11-12,34],相信更多的內生真菌分類單元將會被發現。
同種禾草的內生真菌分布特征及形態學特征因地理區域而異[37];張欣等[38]從內蒙古中東部地區羽茅6個地理種群中共分離得到19株不同形態的Epichlo?屬真菌;Ren等[8]對內蒙古羽茅不同地理種群中分離出的484株菌株形態特征進行了分析,結果表現出較高的多樣性;金文進[9]對我國甘肅、新疆、青海、內蒙古等不同地理種群、不同組織的21株E.gansuensis菌株進行形態多樣性分析,結果發現這些菌株的菌落顏色、質地、生長速率、分生孢子大小、形狀等都存在較大的差異。Schulthess和Faeth[39]從天然禾草亞利桑那羊茅5個地理種群的葉片中共分離得到400多株不同形態的菌株;Simpson等[40]研究發現,相同基因型的菌株隨著培養時間的不同,其形態可發生可逆性的變化。導致形態多樣性的原因可能是:宿主植物和內生真菌的基因型不同,環境及其基因型與環境的互作、協同進化[41-42];或是體外分離培養條件等的差異造成菌的形態多樣性。這也從另一個角度反映出:目前經典的形態學分類標準已很難準確地反映菌的分類學地位,必須建立與宿主植物內環境相似的生態模型,確保內生真菌的分離和培養,同時也應該探究從活體植物組織內直接檢測和鑒定內生真菌的方法和技術。
禾草內生真菌具有嚴格的宿主特異性[6,11,22,43],因此,內生真菌的多樣性很可能與宿主數有一定的關系。目前全世界至少已在80個屬290多種以上禾本科植物中發現有內生真菌,溫帶禾草可能有10%的種類帶有內生真菌,而早熟禾亞科約30%的種有Epichlo?內生真菌[6,44]。全世界已報道至少有30個屬的禾草帶有Epichlo?內生真菌[4],我國至少在25個屬的天然草地禾草中發現內生真菌[11,20,23,33-34]。同種Epichlo?真菌甚至有不止一種禾草與其共生,如醉馬草和羽茅均可與E.gansuensis共生。不同宿主分離到的內生真菌數量和種類不同,同一宿主不同個體分離到的內生真菌種類也有差異[45]。這可能與宿主植物本身基因型及其周圍環境因子有關[46]。從目前已有的文獻報道來看,同屬不同種的禾草也有感染,如早熟禾、羊茅等,說明宿主的多樣性不僅表現在屬上,而且還表現在種上。尚未發現有性態Epichlo?并產生子座的宿主種類仍然較多。
禾草內生真菌在南北半球不同的生態環境均有分布[15,22-23,47],已報道的Epichlo?種主要分布在歐洲、北美洲、亞洲、南美洲和非洲的禾本科植物中(表1);多個Epichlo?種和變種廣泛分布于世界各地不同生境中[6,28,32,47],但侵染率卻呈現出豐富的多樣性,有些種群在不同的生境中相當穩定,有些則變化明顯[23,33-34,44,48]。這可能是:宿主植物和內生真菌之間的相容性不同、侵染種子的菌絲失活;或是由于宿主植物的空間分布、種子的傳播方式不同,隨著空間和時間以及環境選擇壓力的變化,其侵染率也會相應地發生改變[49];或是因為真菌和植物基因之間的相互作用以及環境因素等共同造成[7];中等侵染率的內生真菌種群可能是不穩定的,其侵染率有增加或降低的趨勢,這決定于所在環境條件的選擇[33,44]。調查發現,一般在干旱、半干旱的地區被內生真菌侵染的禾草種類較多、帶菌率較高,且極少發現有性態Epichlo?屬香燭;而濕潤地區則較易形成香燭。對于內生真菌與醉馬草、披堿草等共生體,分布范圍可從海拔1000~4000 m,帶菌率可為0~100%。
同一宿主內生真菌不同菌株所產生的次生代謝成分并不相同,這就意味著宿主與內生真菌可能進行遺傳物質的交換,從而導致它們遺傳性狀的多樣化。Epichlo?屬起源有3種途徑[50]:直接起源于Epichlo?屬的某個種;Epichlo?的種間雜交;Epichlo?與其無性態Neotyphodium雜交。全球不同生境禾草內生真菌起源種不多,卻依靠雜交重組產生了新的遺傳特性,進而適應了不同的環境,產生了豐富的遺傳多樣性,出現了許多新的種、亞種及變種[13]。內生真菌進化的多樣性加上宿主的不斷進化,增強了共生體的遺傳多樣性[51]。
分子標記技術揭示禾草內生真菌的種數不多,但種群的遺傳多樣性卻很豐富。Lappalinen和Ylimattila[10]利用RAPD技術研究發現,同種內生真菌往往具有多樣化的遺傳型;De Jong等[52]利用SSR標記評價了禾草內生真菌的遺傳多樣性,結果表明Epichlo?菌之間的多態標記超過了85%;Saha等[53]利用SSR標記發現羊草內生真菌的多樣性很豐富;Oberhofer和Leuchtmann[54]研究發現,H.europaeus是目前Epichlo?菌中多樣性最豐富的草種,已報到可以和Epichlo?的4個種共生;分離自我國不同生態區的瘋草內生真菌具有一定的遺傳多樣性[42];張欣等[38]研究發現不同地理種群內生真菌菌株由于其地理分布廣、氣候差異大、群落類型差別也較大,從而造成不同地理種群內生真菌形態上的分化以及種群間明顯的遺傳分化和較高的遺傳多樣性;魏宇昆等[7]通過形態學和RAPD方法對4個樣地所含的27個羽茅內生真菌菌株的遺傳多樣性進行了研究,結果表明,羽茅內生真菌在形態和基因水平上均表現出較高的遺傳多樣性。李偉等[11]對分離自我國的22株Epichlo?菌遺傳多樣性分析顯示:菌株間存在一定的遺傳多樣性;陳永敢等[12]利用RAPD標記對我國Epichlo?內生真菌進行了真菌種類、宿主種類、采集地和菌株間的遺傳多樣性探討,結果也表明遺傳多樣性很豐富,許多不同宿主的菌株獨立聚類,同時不同地理,不同種類的菌株聚類也不同。
目前,美國肯塔基大學Christopher Schardl實驗室已經完成E.festucae等內生真菌的測序,澳大利亞維多利亞農業生物技術中心German Spangenberg實驗室已經完成var.lolii和E.coenophiala等內生真菌的序列。這將有利于進一步深入研究禾草內生真菌的功能基因多樣性。
目前,有關內生真菌的研究主要集中在分離,鑒定,人工接種及提高植物抗性方面。內生真菌有些生長很慢,而且主要生長在宿主內部組織,所以很容易被宿主表面雜菌覆蓋,有的甚至不適宜在體外基本培養基上生長。另外,內生真菌產生的次生代謝物種類豐富而量很少,這就加大了其分離和鑒定等的難度。國內外關于內生真菌提高禾草抗逆性的研究結果也不盡一致[2,25],新西蘭已成功人工構建了抗逆、無毒的禾草共生體,我國尚處于試驗研究階段,但進展良好。許多研究者還提出禾草內生真菌的生物多樣性可能在生物群落和生態系統水平方面具有一定的作用:具有較強抗逆性的帶菌禾草能迅速占據生態位,具有更強的競爭優勢[37],導致能量的傳遞受到干擾,群落結構發生改變,進而影響植物群落的演替[55-57]。以上種種問題,使內生真菌的多樣性研究顯得尤為重要,生物多樣性豐富的地區,內生真菌的多樣性就更豐富,特定地區獨有的禾草植物研究,發現新菌的可能性會更大,同時全球生態環境復雜,研究多樣性還可以收集和保藏菌種,而且極端環境多樣性的研究,很可能具有獨特的生物學特性,這對于從各個層面上深入探討內生真菌-宿主間的相互作用,了解它們和人類自身生存環境的密切關系,探究內生真菌的生物學本質及其未知的生態學作用具有重要的意義。另外,還可為植物微生態系統的研究提供更多的資料。
7.1 植物生長調節劑
研究認為,內生真菌促進植物生長是因為它可以產生生長素等激素類物質。人們從體外培養的高羊茅E. coenophiala內生真菌中已分離到了IAA[58],Latch等[59]認為黑麥草感染植株生物量的增加可能與赤霉素(GA)有關。內生真菌產生的次生代謝物很豐富,環境相容性好又不容易造成環境污染,所以將有望成為很好的植物生長調節劑的來源。
7.2 生物農藥
黑麥草內生枝頂孢菌產生的活性物質過胺已證實是一種廣譜昆蟲拒劑、E.uncinata代謝物是一種廣譜殺蟲物質,從感染的早熟禾(P.am pla)分離到的黃酮類化合物對蚊子幼蟲有毒性,巴布達橄欖(Bontia daphnoides)雜草內生真菌(Nodulisporium sp.)產生的一種吲哚二萜類代謝物具有殺滅大蒼蠅幼蟲的活性,黑麥草內生真菌產生的生物堿有抗阿根廷莖象蟲(Listronotus bonariensis)的活性,有些內生真菌的代謝物具有抗病原菌、抗線蟲等多種生物學活性[16,24,60-62],這些為植物病蟲害的生物防治拓寬了新思路,可以直接從內生真菌中尋找具有抗病、抗蟲作用的活性化合物,或利用尋找的先導化合物來研制新的生物農藥,或把具有抗病、抗蟲活性的內生真菌直接接入或感染植物作為拮抗菌或增產菌而發揮生防作用,也可將內生真菌作為外源基因的載體,將某些基因導入到內生真菌中,提高植物的抗病蟲能力,這些在農業上已有成功應用[63]。當然,要使這些新思路全部成功并應用于工農業生產,還有許多諸如活性代謝物產生的遺傳背景、結構與毒性關系、作用機制及其作用的穩定性、持久性和針對性等復雜問題有待深入研究。
7.3 草坪草、牧草、禾谷類作物育種
內生真菌具有雙重特性,所以篩選出既有抗蟲性和抗逆性又對植食動物無害的內生真菌種類,是牧草育種科學家育種的新目標。早在20世紀90年代,數十種帶菌的草坪草品種就已被新西蘭和美國內生真菌學家與牧草育種家聯合培育出,后來又利用內生真菌種類的多樣性、遺傳多樣性、產檢多樣性等相繼培育出優質、無毒的黑麥草以及高羊茅新品種[64-65]。新西蘭科學家還育成了防治飛機場鳥擊的機場綠化新品種[66]。我國人工草業正在蓬勃發展,這方面的研究才剛剛起步,尚缺乏具有自主知識產權的帶菌草坪草和帶菌抗逆無毒的牧草新種質、新材料和新品種。從小麥(Triticum aestivum)近源屬、種入手,是各國都在積極嘗試將內生真菌應用于禾谷類糧食作物育種的新思路,但還未見效。也有人計劃將來源于我國天然草地的抗逆、無毒的Epichlo?內生真菌菌系導入優良牧草,進而導入飼用的燕麥(Avena sativa)、大麥(Hordeum vulgare)、玉米(Zea mays),最終應用于糧食作物小麥,創建禾草/禾谷類作物新種質、新材料,為進一步選育糧、飼作物新品種奠定物質基礎。
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Research advances on diversity of grass Epichlo?endophytes
JIN Wenjin1,2,LI Chunjie2*,WANG Zhengfeng3
1.College of Chemical and Engineering,Gansu Industry College,Tianshui 741025,China;2.State Key Laboratory of Grassland Agro-ecosystems,College of Pastoral Agriculture Science and Technology,Lanzhou University,Lanzhou 730020,China;3. Baiyin Institute of Agricultural Sciences,Baiyin 730900,China
Grass Epichlo?endophyte is a microorganism community with abundant biodiversity;it has become one of the most popular research topics,because of its ecological and physiological functions and the great application potentiality in the fields of agriculture and medicine as biocontrol agents and foreign gene carrier at home and abroad.In this review,the diversity of endophytic fungi in grasses have been summarized,mainly cool-season grasses infected with these endophytes mostly belong to Clavicipitaceae genera of Epichlo?(anamorph Neotyphodium).It mainly included the diversities of fungal species,symbiotic host,habitat,morphology and genetics.Eco-environmental complex and abundant plant biodiversity lead rich diversity of endophytic fungi,and more and more new endophyte taxa should be discovered.This is more likely that has unique advantages in the collection and preservation of new fungi.Endophyte could improve the stress tolerance of host grass,make grass to be adapted under stressed even extreme environmental conditions.It has great significance to study deeply on interactions between plant and endophyte,and to build novel symbiosis and the micro-ecosystem of plants.
grass;endophytic fungus;diversity
10.11686/cyxb20150120 http://cyxb.lzu.edu.cn
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2014-02-22;改回日期:2014-08-29
國家重點基礎研究發展計劃(973項目)課題(2014CB138702),國家自然科學基金項目(31372366)和蘭州市科技攻關計劃項目(2008-SY-12)資助。
金文進(1971-),女,甘肅天水人,副教授,碩士。E-mail:jinwenjin06@163.com
*通訊作者Corresponding author.E-mail:chunjie@lzu.edu.cn