999精品在线视频,手机成人午夜在线视频,久久不卡国产精品无码,中日无码在线观看,成人av手机在线观看,日韩精品亚洲一区中文字幕,亚洲av无码人妻,四虎国产在线观看 ?

葉點霉屬真菌寄主(宿主)和地理分布的多樣性

2015-04-11 08:38:48吳石平劉作易
貴州農業科學 2015年6期
關鍵詞:分類植物

吳石平,陳 文,劉作易

(1.貴州大學 農學院,貴州 貴陽550025;2.貴州省植物保護研究所,貴州 貴陽550006;

3.貴州省農業科學院,貴州 貴陽550006)

葉點霉屬(Phyllosticta)是葡萄座腔菌目中最重要的幾個屬之一,廣泛分布于世界各地,常寄生或腐生于多種植物或有機基質上,是農作物、林木、經濟作物和觀賞植物上的重要病原菌[1-4]。有的葉點霉屬存在于植物體內,為植物的重要內生真菌,對植物的生長和抗病起著重要的作用,有的還可分泌一些有生物活性的化合物[5-7]。多樣性研究對新種的發現、物種的認識、完善生物演化理論、利用有益物種和控制有害物種有著重要意義[8]。由于葉點霉屬真菌的分類爭議較多及系統學資料缺乏,其多樣性研究未見報道。因此,筆者以近年已準確分類且有明確寄主、采集國家及序列數據的菌株為研究對象,進行寄主的多樣性及地理分布研究,以期為今后新種的發掘和鑒定、有益內生真菌的利用及其與寄主(宿主)植物的協同進化研究提供參考。

1 材料與方法

1.1 菌株

從近年發表的葉點霉屬真菌分類及鑒定文章[9-30]中篩選分類信息準確的菌株共67種203株(表1),其中,53株為模式(type)或外模(epi-type)菌株,提取這些菌株的基因序列獲取號,從Gene-Bank下載ITS、ACT、TEF-1 和GPDH 基因序列,同時提取這些菌株的寄主信息及地點(國家)。

1.2 系統學分析

采用 在線比對軟件MAFFT(http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/mafft)對篩選的基因序列進行比對;在BioEdit(1.7.3.0)中打開已完成比對的序列進行手工校正,并將序列兩端剪切整齊,將4個基因的序列進行連接;用Gblocks對保守區序列進行選擇,用PAUP(v4.0)軟件進行最大簡約法(MP)重建系統樹,并進行自展檢驗,將自展檢驗值標記在系統樹的分枝上。

1.3 多樣性分析

采用Shannon指數(H)和Simpson指數(D)[31]分析內生真菌的群落生物多樣性。

2 結果與分析

2.1 系統發育

6 7種的ITS、ACT、EF和GAPDH 基因聯合

表1 67種203株葉點霉屬真菌菌株Table 1 203 Phyllostictafungus strains of 67species

后,序列總的位點數為1 751個,其中,保守位點為912個,無簡約信息位點238個,最大簡約信息位點數601個(占總位點數的34.8%),采用最大簡約法分析得到48棵系統樹,經Kishino-Hasegawa檢驗,各個系統樹之間無顯著差異。系統發育樹的樹長為3 245,一致性指數(CI)為0.418,同型指數(HI)為0.582,保留指數(RI)為0.643,重標定指數(RC)為0.268。根據自展支持率、支系拓撲結構、支系包含的物種數量等信息將系統樹分為9個支系(圖示)。

圖示 葉點霉屬真菌的系統樹及寄主多樣性Fig. Phylogenetic tree and host diversity of Phyllostictafungus

2.2 寄主(宿主)的多樣性

經專化性分析(表2),葉點霉屬寄主范圍較廣,在蕨類植物、裸子植物和被子植物上均有分布。67種菌株的寄主分屬32目45科;在蕓香目、百合目、杜鵑花目、囊荷目、無患子目、微子目和鼠李目等7個目中分離到的菌株較多,共140個,占69.0%。7個目中,百合目上真菌的多樣性較多,其上分離的葉點霉屬真菌分屬于5 個支系,Shannon 指數為1.357,Simpson指數為0.732;其余各目中葉點霉屬真菌多樣性較小,其中,鼠李目(葡萄科)、荷囊目(芭蕉科)和無患子目的漆樹科上均只分離到1個支系的葉點霉真菌。不同種的寄主多樣性不相同(表3),其中,中央葉點霉(P.capitalensis)的寄主范圍最廣,54 個菌株來源于24 科的植物;芒果球座菌(G.mangiferae)的寄主也較廣,3個菌株分別來源于3科的植物;大多數種的寄主范圍較窄,均來源于一個科,甚至一個屬,如P.citricarpa 的16個菌株均分離于蕓香科的柑桔屬,P.vaccinii的16個菌株均分離于葡萄科。部分親緣關系較近的種只寄生于一個科或一個目的幾個科,如P.citriasiana、P.citriasiana和P.citriasiana 系統發育關系較近,均屬蕓香科;有的葉點霉在系統發育上屬于較高支持率的同一支系,卻分離于親緣關系較遠的植物,如P.fallopiae和P.alliacea 分別分離于雙子葉植物的蓼科和單子葉植物的百合科,從葉點霉屬真菌和宿主植物來看,其系統發育無明顯相關性(圖示)。

表2 不同寄主(宿主)植物上葉點霉的多樣性Table 2 Diversity of Phyllostictaon different hosts

表3 葉點霉屬真菌葉點霉屬真菌的寄主(宿主)數量Table 3 Host number of Phyllostictafungi

表4 不同國家葉點霉屬真菌的多樣性Table 4 Diversity of Phyllostictafungi of different countries

2.3 地理分布的多樣性

從表4看出,67種(203個菌株)葉點霉屬真菌來源于23個國家或地區。其中,來源于泰國、美國、中國、日本、巴西、澳大利亞和南非等7個國家和地區的菌株較多,共159個菌株,占78.3%;各個支系在地理分布上無明顯的偏好性。分離到菌株較多的7個國家中,美國的多樣性最高,34個菌株分屬于7個支系,shannon 指數和Simpson 指數分別為1.418和0.722;其次為中國和日本;泰國多樣性最低,38個菌株分屬于2個支系,且C1支系占了92.1%;shannon指數和Simpson 指數分別為0.642和0.542。

3 結論與討論

葡萄座腔菌科真菌由于孢子較小,可用于分類特征較少,所以寄生的部位和寄主常作為分類的輔助依據,如從銀杏葉部分離到的葡萄座腔菌就為銀杏葉點霉,胡桃科植物葉片上分離到的葡萄座腔菌就為胡桃葉點霉[32-33]。因此,葡萄座腔菌科內屬間分類長期以來較為混亂[34],在葉點霉屬的屬內種間分類也存在較多的爭議。筆者從系統學的角度分析了葉點霉屬的寄主多樣性,證實了大多數葉點霉屬真菌在種內存在寄主的特異性,部分親緣關系較近的種也存在寄主的特異性,僅寄生于一個科或一個目的幾個科,但整個葉點霉屬的系統發育關系與寄主的系統發育關系并無明顯相關性;一個科的寄主植物上常寄生(內生)多種葉點霉屬真菌,因此,以寄主植物來作為分類的輔助依據,有一定的弊端。

共選擇67 種,203個菌株進行研究,這些種在地域分布上無明顯的偏好性,但有的國家分離到的葉點霉種類較多,菌種多樣性較高,有的國家分離到的種類較少,多樣性較低,這有可能與葉點霉屬真菌在與寄主(宿主)協同進化過程中的寄主植物廣泛分布有關。具體原因有待于聯合種內和種間的數據進一步的試驗和分析。

[1] 張漢榮,羅金水,李美桂.國內外柑桔黑斑病研究進展[J].中國農學通報,2011,27(6):40-44.

[2] 洪勝福.香蕉黑星病發生規律及其防治技術[J].福建熱作科技,2010,35(1):14-15.

[3] 王興紅.中國柑橘黑斑病相關的葉點霉屬真菌種類,遺傳多樣性和快速診斷技術研究[D]:杭州:浙江大學,2012.

[4] 宋海超,張 勇,邢 波,等.海南石斛蘭葉片黑點病的病原鑒定及室內藥劑毒力測定[J].中國農學通報,2011,27(19):110-114.

[5] 韓 潔,趙杰宏.篦子三尖杉產高三尖杉酯堿內生真菌的分離 與 鑒 定[J].貴 州 農 業 科 學,2011(1):158-161.

[6] 杜少康,陳雙林,林 岱,等.銀杏葉部內生真菌多樣性的研究[J].菌物學報,2009(4):504-511.

[7] Kumaran R S,Muthumary J,Kim E K,et al.Production of taxol from Phyllosticta dioscoreae,a leaf spot fungus isolated from hibiscus rosa-sinensis[J].Biotechnology and Bioprocess Engineering,2009(14):8-10.

[8] 莊文穎.認識我國的菌物物種多樣性[J].大自然,2008(3):4-6.

[9] Zhou N,Chen Q,Carroll G,et al.Polyphasic characterization of four new plant pathogenic Phyllosticta species from china,japan and the united states[J].Fungal Biology,2014,119(5):433-446.

[10] Wulandari Nilam F,To- Anun Chaiwat.Phyllosticta capitalensis,p.Helicteres,p.Sterculiae and other Phyllosticta species from sterculiaceae[J].Journal of Agricultural Technology,2014,10(1):133-146.

[11] Wulandari N F,Bhat D J,To-Anun C.Redisposition of species from the Guignardia sexual state of Phyllosticta[J].2014,5:23-30.

[12] Hyde Kevin D,Nilsson R H,Alias S A,et al.One stop shop:Backbones trees for important phytopathogenic genera:I[J].Fungal Diversity,2014:1-105.

[13] Zhang K,Zhang N,Cai L.Typification and phylogenetic study of Phyllosticta ampelicida and P.Vaccinii[J].Mycologia,2013,12(3):547-556.

[14] Wong M H,Henderson J,Drenth A.Identification and differentiation of Phyllosticta species causing freckle disease of banana using high resolution melting(hrm)analysis[J].Plant Pathology,2013,62(6):1285-1293.

[15] Wikee S,Lombard L,Nakashima C,et al.A phylogenetic re-evaluation of Phyllosticta(botryosphaeriales)[J].Studies in Mycology,2013,76(1):1-29.

[16] Wikee S,Lombard L,Crous P W,et al.Phyllosticta capitalensis,a widespread endophyte of plants[J].Fungal Diversity,2013(2):1-15.

[17] Miles A,Tan Y,Tan M,et al.Phyllosticta spp.On cultivated citrus in australia[J].Australasian Plant Pathology,2013(1):1-7.

[18] Diego A,Pinho D B,Junior B T H,et al.First report of leaf spot caused by Phyllosticta yuccae on Yucca filamentosa in brazil[J].Plant disease,2013,97(9):1257.

[19] Zhang K,Su Y Y,Cai L.Morphological and phylogenetic characterisation of two new species of Phyllosticta from china[J].Mycological Progress,2012(2):1-10.

[20] Wong M H,Crous P W,Henderson J,et al.Phyllosticta species associated with freckle disease of banana[J].Fungal Diversity,2012,56(1):173-187.

[21] Wang X H,Chen G Q,Huang F,et al.Phyllosticta species associated with citrus diseases in china[J].Fungal Diversity,2012,52(1):209-224.

[22] Su Y,Cai L.Polyphasic characterisation of three new Phyllosticta spp[J].Persoonia-Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi,2012,28(1):76-84.

[23] Sultan A,Johnston P,Park D,et al.Two new pathogenic ascomycetes in guignardia and rosenscheldiella on new zealand's pygmy mistletoes(korthalsella:Viscaceae)[J].Studies in Mycology,2011,68(1):237-247.

[24] Glienke C,Pereira O,Stringari D,et al.Endophytic and pathogenic Phyllosticta species,with reference to those associated with citrus black spot[J].Persoonia:Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi,2011(1),26:47.

[25] Wulandari N F,To-Anun C,Lei C,et al.Guignardia/Phyllosticta species on banana[J].Cryptogamie,Mycologie,2010,31(4):403-418.

[26] Wulandari N,To-Anun C,Hyde K,et al.Phyllosticta citriasiana sp.Nov.,the cause of citrus tan spot of Citrus maxima in asia[J].Fungal Diversity,2009,34(2):23-39.

[27] Wickert E,Goes Antonio D,Lemos E G D M,et al.Phylogenetic relationships and diversity of Guignardia spp isolated from different hosts on ITS1-5.8S-ITS2 region[J].Revista Brasileira de Fruticultura,2009,31(2):360-380.

[28] Polashock J,Caruso F l,Oudemans P,et al.The north american cranberry fruit rot fungal community:A systematic overview using morphological and phylogenetic affinities[J].Plant Pathology,2009,58(6):1116-1127.

[29] Motohashi Keiichi,Inaba Shigeki,Anzai Kozue,et al.Phylogenetic analyses of Japanese species of Phyllosticta sensu stricto[J].Mycoscience,2009,50(4):291-302.

[30] Liu Q,Yu J C,Hu Y C,et al.Phyllosticta sp.Nov.,a new pathogenic species from Buxus sincia[J].Journal of Phytopathology,2009,157(7):470-473.

[31] Piclou E.Ecological diversity[M].J Wiley and Sons NY,UK,London:1975.

[32] 白金鎧.中國真菌志[M].北京:中國科學出版社,2003.

[33] Van D A H.Studies in Phyllosticta[J].Studies in Mycology,1973,5:1-110.

[34] Liu J K,Phookamsak R,Doilom M,et al.Towards a natural classification of botryosphaeriales[J].Fungal Diversity,2012,57(1):149-210.

猜你喜歡
分類植物
分類算一算
垃圾分類的困惑你有嗎
大眾健康(2021年6期)2021-06-08 19:30:06
分類討論求坐標
數據分析中的分類討論
教你一招:數的分類
植物的防身術
把植物做成藥
哦,不怕,不怕
將植物穿身上
植物罷工啦?
主站蜘蛛池模板: 欧美国产精品不卡在线观看 | swag国产精品| 国产美女主播一级成人毛片| 欧美精品亚洲精品日韩专区va| 国产成人综合网在线观看| 青青久在线视频免费观看| 成人蜜桃网| 最新国产网站| 一级毛片视频免费| 亚洲精品天堂在线观看| 成人在线观看不卡| 国产精品漂亮美女在线观看| 色偷偷综合网| 国产综合在线观看视频| 欧美激情一区二区三区成人| 54pao国产成人免费视频| 日本免费a视频| 男人天堂亚洲天堂| 国产亚洲欧美在线专区| 亚洲一区波多野结衣二区三区| 免费无码网站| 日本人妻一区二区三区不卡影院 | 精品国产一二三区| 亚洲日韩精品无码专区| 亚洲成人黄色在线| 免费一级全黄少妇性色生活片| 狠狠色综合网| 国产肉感大码AV无码| 99草精品视频| 国产成人亚洲无吗淙合青草| 国产成人1024精品下载| 国产91精选在线观看| 日韩欧美视频第一区在线观看| 免费黄色国产视频| 国产人碰人摸人爱免费视频| 制服丝袜 91视频| 九色91在线视频| 国产永久无码观看在线| 国产精品亚洲片在线va| 国产乱论视频| 日韩高清欧美| 在线亚洲精品自拍| 中文无码毛片又爽又刺激| 久久精品国产精品一区二区| 亚洲欧美另类色图| 国产在线91在线电影| 成年A级毛片| 自慰高潮喷白浆在线观看| 久久一级电影| 久久a毛片| 国产成人精品日本亚洲77美色| 18禁高潮出水呻吟娇喘蜜芽| 无码精油按摩潮喷在线播放 | 久久精品丝袜| 国产精品久久国产精麻豆99网站| 成人福利在线视频| 色有码无码视频| 国产精品亚欧美一区二区三区| 亚洲一欧洲中文字幕在线| 免费一级无码在线网站| 国产青青草视频| 特级精品毛片免费观看| 亚洲天堂伊人| 久久免费精品琪琪| 国产真实乱人视频| 国产精品人成在线播放| 欧美中文字幕无线码视频| 国产剧情一区二区| 久久亚洲国产一区二区| 国产美女精品在线| 国产黄色爱视频| 国产精品v欧美| 2020亚洲精品无码| 国产毛片高清一级国语| 99国产在线视频| 国产亚洲精品资源在线26u| 国产精品亚洲一区二区三区在线观看| 国产女人爽到高潮的免费视频| 久久久久中文字幕精品视频| 国产精品综合久久久| 欧美天堂在线| 精品一区国产精品|