學術期刊數據政策及相關研究

陳全平(1.南開大學商學院信息資源管理系 天津 300071)(2.東莞松山湖圖書館 廣東東莞 523800)

學術期刊數據政策及相關研究

陳全平
(1.南開大學商學院信息資源管理系 天津 300071)
(2.東莞松山湖圖書館 廣東東莞 523800)

在數據密集型科學研究范式下，數據開放獲取變得日益重要。學術期刊是學術交流的重要載體之一，其數據政策直接影響科學研究的可重現性。文章分析了當前學術期刊制定實施的主體、客體與主要內容，并分別從傳統期刊、新興數據期刊進行了說明，分析了期刊數據政策實施的效果情況，以期為我國期刊制定數據政策提供參考。

學術期刊;數據政策;數據期刊;數據論文;數據出版

1 引言

2007年，計算機圖靈獎得主Jim Gtay提出了以協同化、網絡化與數據驅動為其主要特征的科學研究第四范式——數據密集型科學研究，此后，學術界對數據開放共享的需求日益強烈，全球范圍內廣泛興起開放數據運動，以增加數據資源的可獲得性與可用性。在這種背景下，科學研究過程當中的科研資助機構、出版商與期刊、數據中心等各個利益相關者都制定了相關政策來保障和促進數據共享。例如在國際組織與機構方面，經濟合作與發展組織(OECD)2007年頒布的 《公共資助科學數據開放獲取的原則和指南》提出開放數據的13條原則和指導方針;在科研資助機構方面，美國國家科學基金會(NSF)于2010年1月發布的項目管理指南規定:從2011年1月18日開始，所有提交到NSF的項目申請書必須包含一份不超過兩頁的“數據管理計劃”附件，該計劃應詳細描述申請者如何管理和傳播研究項目所產生的數據，包括數據類型、數據標準、數據獲取與共享政策、數據存檔與保存計劃;在數據倉儲與數據中心方面，Dtyad對數據存儲、數據利用、數據引用、數據發現等都有具體的規定;在學術期刊方面，期刊PLoS One自2008年就有了數據共享的政策:要求支撐論文發表的數據應該存儲在一個開放獲取的機構倉儲中，作為已發表論文的支持文件，在線出版的開放獲取數據期刊Scientific Data制定了數據提交規范、質量規范和相關權益規范等方面的政策。

學術期刊作為支持學術交流的重要載體，其數據政策對于促進數據共享、推進數據最大化使用、實現科研過程的可重現有非常重要的作用，本文對Web of Science、ScienceDitect、Wiley Online Libtaty、Google Scholatt和中國知網、萬方數據平臺、維普期刊網等中外文資源中的有關學術期刊數據政策方面的研究論文、學術報告和網絡文章進行了系統檢索、梳理、分析、歸納和總結，從學術期刊的數據政策制定與實施、數據政策模板、數據政策實施效果以及對我國學術期刊政策制定的啟示等方面進行了研究與分析。

2 學術期刊數據政策的制定與實施

2.1 學術期刊數據政策的主體、客體與內容

2.1.1 數據政策制定的主體

當前，主要的國際科學技術與工程以及醫學領域的學術期刊都已經制定了與數據開放、數據共享和數據利用相關的政策，王卷樂等指出當前國際上要求提交數據的期刊包括The Ametican Natutalist、Biological Joutnal of the Linnean Society、BMJ (Btitish Medical Joutnal)、Genetics、Joutnal of Fish and WildlifeManagement、PLOS、Science、Systematic Biology、ZooKeys等基本覆蓋了科學研究的各個領域。實際上，絕大多數的STM期刊都要求作者提交數據，特別是一些權威期刊將數據開放與共享作為論文發表的前提，例如:The Lancet要求實證研究的作者在發表論文時，作為出版的條件，必須提交數據、協議、計算機代碼、相關文件的電子副本到該期刊論文發表的在線數據歸檔中心;2005年，the Ametican Economic Review發布強制性政策，要求作者提交相關數據以提升研究結果的準確性;Natute 和Science也有要求作者將使用的數據和代碼公開的政策要求。一些經濟學、社會學領域的期刊也有類似的政策，學者Zenk-M·ltgen和Lepthien并就社會學領域期刊制定數據政策的情況進行了分析。

2.1.2 數據政策制定的客體

數據指“定性或定量的陳述或數字(或假定為)事實。數據可能是原始數據(例如，直接從測量得到的數據)，或衍生的原始數據，但他們尚未分析或解釋，只是進行了計算”。

在期刊制定數據政策的客體范圍方面，數據共享政策范圍不僅包括軟件、視頻、地理地質圖、本體、Web內容、數據模型以及文章研究結果背后的補充材料，在一些特定科學領域，還包括特定的研究材料，例如分子晶體結構文件、細胞、動物模型、DNA工具、試劑等。

在期刊制定數據政策針對的數據類型方面，學術期刊的數據政策主要針對三類數據:integtal數據，這類數據直接支持本文的觀點和結論; supplementaty材料，這類數據增強文章的論點; Related Content相關內容，這是單獨的內容，作者可能希望將論文與它們聯系起來，但這些數據不由期刊管理。

2.1.3 數據政策的內容

目前國際權威出版商&學術期刊大多制定了數據政策，其政策內容主要包括:

(1)要求數據開放共享。例如2010年，Evolution期刊要求在進化和生態學期刊上發表文章中使用的數據存放在可公開訪問的數字檔案中心，從2011年1月1日開始所有發表的論文都開始執行這一規定。BioMed Centtal出版社目前出版200多種期刊，其數據政策要求:所有研究文章都可以免費訪問、重復使用和再次傳播;在研究中與研究結果直接相關的數據必須開放共享。

(2)對數據提交方式、內容、范圍、時間點的規定。例如BMJ自2009年以來就鼓勵作者共享他們的數據，并要求在BMJ上發表論文必須將數據集發布在Dtyad(http://datadtyad.otg)資料庫。BMJ期刊現在又要求作者簽署數據共享聲明，解釋他們論文中的數據可以向誰，以怎樣的方式共享。范圍包括附件材料和完整的數據集。共享包括在得到請求時進行共享、在線通過密碼進行共享或者公布在網站上進行共享。從2013年1月1日開始，藥物和醫療設備試驗數據將被視為出版物，作者須承諾在合理要求情況下，這些匿名病人的數據是可用的，這一政策適用于在報道目前使用的一種或多種藥物或醫療器械研制進展時使用的數據，而不管這個試驗是否由誰資助。Natute集團更是將數據提交作為出版的條件之一，要求作者必須提交研究中相應的數據，并且要經過編輯審查和同行評議。

(3)數據期刊政策的變化。許多期刊不堪忍受維護數據的成本和負擔，轉而要求將數據提交給相應的公共數據倉儲和領域數據倉儲，例如:神經科學雜志Neutoscience最初要求作者將相關數據直接提交給編輯部，而在2010年秋天宣布將停止保存和同行評審論文的補充材料，不再要求作者提交新的手稿時提交任何額外的材料;實驗醫學雜志The Joutnal of Expetimental Medicine(JEM)由于補充材料數量增長，從2011年起只接受“必要”的補充表格和數字。

2.2 傳統學術期刊的數據政策

2.2.1 數據政策的實施

(1)科技期刊數據政策制定與實施情況:早在20世紀90年代中期，McCain在調查了850種期刊后發現只有132種有相關的數據政策。Shtiget等在2006年對醫學領域期刊的調查發現期刊很少有數據共享實施指南。Stodden分析了ISI數據庫中Statistics &Ptobability、Multidisciplinaty Science、Mathematical &Computational Biology領域以及Natute Genetics、Cell、Lancet、Natute Physics、Matetials Science and Engineeting Repotts等共計170種科技期刊在2011 年6月到2012年6月的數據政策 (數據共享政策、代碼共享政策、附件材料政策)等。Stutges等于2014年對400多種期刊的數據政策情況進行了調研，包括什么方式、什么時間、向哪里提交數據、數據的可獲得性、數據類型、數據一致性以及數據政策執行情況等，并對出版商、基金項目資助機構、數據服務管理者、圖書館員、研究管理者等利益相關者進行訪談，調查其對數據共享的態度。加利福尼亞的斯坦福大學的流行病學家John Ioannidis領導的團隊，2009年查看了發表在50種生物醫學期刊上的500篇文章，發現351篇論文涵蓋數據可用性的政策，但59%的人不認可這一政策，只有47篇論文在線存放完整的原始數據。

(2)社會科學領域期刊數據政策制定與實施情況:Ghetghina和Katsanidou分析了政治科學中具有代表性的120種政治科學期刊的研究數據政策(根據2010湯姆森路透社會科學引文索引)，發現18 種(15%)期刊采用數據可用性政策(明確期望作者分享數據)和7種(5.8%)期刊計劃采用這一政策。Wolfgang和Gteta對湯森路透集團SSCI數據庫中的140種社會學期刊的數據管理政策進行了網站調研和分析，發現7種期刊(5%)有清晰的數據政策，94種期刊 (67.1%)的出版商會提供一個通用的政策，并使用影響因子、語種、每年期數和期刊年齡四個特性分析了期刊特性和數據政策之間的相關性。

2.2.2 數據政策的強度

學者Piwowat和Chapman發表了一系列的重要論文來分析期刊數據政策的強度，將政策分為三類:沒有提及分享基因表達微陣列數據，要求共享基因表達微陣列數據的弱建議，強烈要求分享基因表達微陣列數據。他們使用湯森路透的期刊引證報告(JCR)發表的“基因表達微陣列數據”文章的期刊并提取期刊影響因子、分支學科類別和出版機構、是否開放獲取(出版模式)。對照每個期刊的作者指南，檢查它們任何提及數據共享的內容。發現有18個(26%)政策為弱(即非強迫性，僅要求或建議數據共享)，有24個(34%)政策為強(即在出版之前要提交一個提交數據后的數據庫檢索號)，期刊影響因子、期刊出版商(非商業期刊出版商)和開放存取(積極模式)與微陣列數據共享政策存在統計學上相關，在弱和強的數據共享政策之間沒有發現多變量關聯。

2.2.3 數據政策研究項目

作為The Joutnal Reseatch Data Ptoject研究項目，Stutges等基于湯森路透2011年期刊引證報告選擇了前200名高被引期刊 (高影響力的期刊)，后200后低被引期刊(低影響力期刊)，分析了作者或編輯政策聲明中的政策，并對政策內容、政策強度等進行了分析。

2011年，EutopeanDataWatchExtended(EDaWaX)項目進行了約141種經濟學術期刊數據可用性策略的評價研究，發現82%的數據政策是強制性的(Mandatoty)，65.5%的期刊數據政策要求作者提供數據說明和提交如何使用數據的文件(Documentation)，51.7%的期刊數據政策需要提交計算代碼 (數據清洗或分析的語法)，62%的期刊數據政策需要提交作者寫的程序，90%的數據可用性政策要求作者發表之前提供數據(Point in time)，超過72%的期刊提供了這種可能性分析數據政策豁免(Exemption)，在28種有豁免政策的期刊中超過60%的期刊有相應的規則，有2種期刊有開放數據格式(Open fotmats)的建議，大多數期刊沒有要求作者提供軟件版本和計算使用的操作系統這些細節，11種期刊 (7.8%)有重復結果部分的相關政策(teplication policy)。研究還發現，有數據可用性政策期刊已經比沒有這樣政策的期刊的影響因子高。此外，作者指出Ametican Economic Review數據可用性政策是可以代表這一領域其他期刊重用數據政策的最佳實踐。EDaWaX建議需要的數據可用性政策應該是:①期刊數據政策應規定共享數據是強制性的;②必須提供對原始數據進行計算的必要說明;③在發表文章之前，必須將數據文件交給期刊編輯;④所有提交的文件必須公開使用，除非它們包含敏感數據;⑤期刊的數據政策應該包含用于復制研究方法方面的程序;⑥期刊應該包含一個復制的部分，包括復制失敗的結果，這將鼓勵作者提供優質的，有據可查的數據;⑦數據應以開放格式提交，最好是ASCII格式，便于保存和互操作性;⑧應該提供用于分析數據的操作系統和軟件的版本。

2.3 新型數據期刊的數據政策

為了使數據作為“一流的研究成果”，并保證其是可用、同行評審、可被引用、容易被發現、可重復使用。Callaghan等提出數據出版的概念，提倡學術出版商開發新格式的文章，即數據論文。數據論文用來描述數據集，提供在什么地方、為什么、如何提供數據等信息的文章。數據論文發表由此產生數據期刊，即與科學數據相關的期刊，因此，幾乎所有的數據期刊都天然地有相關的數據政策，且都比較詳細。

2.3.1 數據集描述

期刊提供給作者自己的一套指令、指南和模板，說明被接受論文的類型以及數據論文的結構與格式。論文內容的指南和模板包含兩類規則和信息:傳統學術交流相關信息和數據集的特定信息。數據論文要遵循一定的數據標準、計算機可讀、可檢索，而且要求所提交的數據論文應當對數據進行結構化和規范化描述，以便能夠產生更多的可引用、可發現、可解釋、可重用和可再生的科學數據，其中手稿需要包含標題、摘要、方法、數據記錄、技術驗證、用法說明、圖、表等要素，而且各要素有相應的格式要求，如字符長度和圖表數量。

2.3.2 促進數據可用

期刊應提出一個數據集存放 “推薦的可信數據庫”或“合格數據庫”的列表，這些倉儲滿足以下基本要求:①他們必須獲得認證(Acctedited)，是國際或機構公認的;②他們必須保證數據集永久訪問和長期可用性;③數據倉儲庫中的數據集必須有一個獨特的數字對象標識符(如DOI)，這個標識符必須包括在相關的數據論文中;④倉儲庫中的數據集必須是免費提供的。在大多數情況下，數據期刊編輯更喜歡依靠第三方數據倉儲供應商。例如，《Ecology》期刊要求數據集存儲在生態檔案中心 (美國生態學會出版期刊相關材料的數據倉儲)，《GigaScience》期刊推薦數據存儲在GigaDB數據倉儲。

2.3.3 支持數據引用

數據期刊一般應有專門對數據可用性與使用情況進行聲明的政策。根據DCC以及DataCite建議，通常期刊要求使用數據集情況包含在本文的參考文獻列表。期刊還發展了作者在參考數據時使用的格式(例如，BMC期刊)。期刊政策內容包括關于數據唯一標識符的使用，幾乎所有數據期刊都推動唯一標識符的使用，期刊推薦數據倉儲為存放的數據集分配DOI。

2.3.4 保證數據質量

大多數數據期刊采用常規封閉的同行評審，出版前進行匿名、私人的同行評審。一些期刊采用開放評審促進公正和客觀性、減少出版時間，例如期刊《Eatth System Science Data》和《F1000 Reseatch》。其中，期刊《Eatth System Science Data》使用一個兩階段方法，數據論文提交后，手稿在網上公布，作者公開回復和評論作為同行評議，從而產生一個修改稿，如果編輯批準，最后發表在期刊上。數據同行評審包括五類標準:①文稿質量:評估稿件撰寫的標準，要求論述清晰、體系完整;②數據論文和數據集之間的一致性用于評估的數據論文的內容有效性，作為評估數據集的一種手段;③數據質量:評估導致該數據集產生方法的標準;④數據可重用性:評估數據集的實際可重用性;⑤效用和數據貢獻:評估數據集的潛在價值標準。

3 學術期刊的數據政策模板

3.1 聯合數據存檔政策

Dtyad于2011年提出了聯合數據存檔政策(Joint Data Atchiving Policy，JDAP)，許多領域學科的優秀期刊都開始認可并采納該項政策，并把它作為期刊政 策 模 型 ， 如 Moleculat Ecology、Evolutionaty Applications、Joutnal of Hetedity等。JDAP政策要求作為出版條件，支持論文結論的數據必須存儲在合適的公共倉儲庫中。數據是科學研究的重要產出，應當被長久保存，以便用于后續研究。作者可以選擇將數據與論文同時出版，或者選擇論文出版后延期再公開相關數據。特別情況下要與期刊編輯協商，并要注重相關數據隱私保護問題。

3.2 數據政策模型框架

為方便學術期刊制定和審查數據政策，JISC資助諾丁漢大學 Centte fot Reseatch Communications (CRC)中心的the Joutnal Reseatch Data(JoRD)項目提出了期刊研究數據政策模型框架 (Joutnal Reseatch Data Policy Model Ftamewotk)，其主要內容包括:數據共享好處的描述;所包含或與文章相關的數據類型;數據的格式;數據相關的說明，例如數據引用和其他元數據;數據的數量限制;不同數據類型的數據如何保存;數據可用性以及如何訪問數據;在出版過程中提供數據的時間;數據是否應該公開、免費獲得或受其他限制;向作者提出的數據重用的任何條款或條件;是否允許數據政策的特例存在;遵守該政策的方法及如何控制;向作者關于不遵守政策后果的聲明;對于其他研究人員沒有遵從數據政策的投訴處理程序。

3.3 數據政策分析框架

我國學者吳蓉等根據實用主義方法論建立了包括數據提交規范、數據審查及存儲方式、數據權益管理等在內的學術期刊數據政策分析框架，以PLOS、Science、Natute為例對學術期刊的數據政策進行分析，研究結果顯示:學術期刊應制定數據提交政策(包括提交數據的強制性措施、提交數據的類型、提交數據的格式和方式)、數據審查及存儲政策(包括數據的開放時間和范圍、數據審查及可評審可查驗的位置、對學術論文的支持作用)與數據權益政策(包含數據的著作歸署權、數據的使用許可、數據的隱私保護及權利要求、作者的科學道德聲明等)。

4 學術期刊的數據政策實施效果

4.1 作者遵守數據政策的態度

對于論文作者來講，可能對將數據開放共享存在不同的態度。Rathi等給發表在6大醫學期刊的683位通訊作者發電子郵件，大約317人回應，他們認為，應當要求通過數據倉儲進行數據共享，數據共享應該能響應個人的數據請求，許多期刊有相關的數據政策要求發表論文時提交數據，但有些發表文章的作者有意識地不將其數據存儲到相應的數據倉儲，在相關請求的情況下也拒絕提供這些數據。Noot等研究分析了6個有明確數據政策的期刊(Evolution、Moleculat Biology and Evolution、Natute、PLoS Biology、Ptoceedings of the National Academy of Sciences USA、Science)，發現它們的作者在發表論文時，沒有提交DNA序列數據到基因庫，因此建議作者需要有一個月的緩沖期，超過這個緩沖期后，如果沒有提交數據到基因庫，那么出版物將會從期刊網站移除，直到將數據提交后才考慮發表相關論文。

4.2 作者遵守數據政策的行為

有跡象表明，研究人員數據共享的行為與期刊數據政策要求不一致。Vines等開展了期刊數據共享政策的一個實證研究，選擇2011～2012年間引用“sttuctute”數據集的期刊，檢驗推薦數據存檔(Recommend data atchiving)政策期刊在作者需求數據的情況下是否提供數據，作者在三周時間內三次向BMC Evolutionaty Biology和PLoS One期刊作者發郵件索取數據，平均回收率為59%，時間為平均7.7天。而Wichetts等在6個月只收到141心理學論文作者中26%的請求數據，Savag和Vickets只收到PLoS Medicine和PLoS Clinical Ttials臨床試驗數據集請求的十分之一。Lebetg和Neigel給30篇論文作者發電子郵件，要求其提供他們的序列數據集，但只收到其中一個作者的數據。可以看出，期刊數據政策的強度有待提高，作者出于競爭性的目的，延緩或拒絕提交數據，另外，數據安全、數據濫用等因素也客觀上影響了他們提交數據的意愿。

4.3 數據政策影響

數據的開放和重復使用不僅提高了數據的利用效率，促進了科研過程的可重現性，而且在一定程度上促進了相應期刊論文的曝光率，提升了相關論文被引用的幾率。Piwowat和Chapman研究發現:數據共享政策與該領域數據共享的流行程度正相關，特別是他們發現，在線可用微陣列數據的期刊影響因子比其他期刊的影響因子要高;當研究成果發表在高影響力期刊和研究成果的第一位或最后一位作者具有高水平職業經歷和影響力時，他們更有可能共享他們的原始數據;在期刊具有提交數據檢索號作為論文出版政策要求時，研究者更有可能共享他們的數據。

5 結語

當前，我國學術期刊在數據政策制定方面進展緩慢，制定數據政策的期刊數量較少，且以鼓勵性政策為主，不同學科期刊對數據政策的重視不一樣，國際影響力高的期刊更重視數據政策。在大數據時代，針對我國學術期刊的數據政策現狀，我們須借鑒國際經驗，加緊制定學術期刊數據政策，促使作者積極開放科學數據特別是直接支持發表論文中研究結果的數據。我國的學術期刊數據在開放數據的實施過程中，可以將數據提交作為論文發表的強制條件，參照國外期刊的“最小數據集”類型提交數據，選擇適宜各學科領域數據知識庫存儲的數據格式，將數據存儲到相應的專門存儲位置，明確數據使用對象和開放范圍限制，要求提供的數據能支持論文結論。

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Data Policy and Related Research of Academic Journals

Under the paradigm of data intensive scientific research，data sharing becomes more important.Academic journal is one of the important ways of scientific communication，and its data policies directly affect the reproducibility of scientific research.This paper analyzes the main body，objects and contents of the current academic journals data policies，and analyzes the effect of the implementation of the data policy besides traditional journals and new data journals，and analyzes the effect of the implementation of the data policy.

academic journal;data policy;data journal;data paper;data publication

G237.9;G255.7

A

10.11968/tsyqb.1003-6938.2015100

陳全平(1969-),男,南開大學情報學博士研究生,東莞松山湖圖書館副研究館員。

2015-07-13;責任編輯:魏志鵬