高群王,徐恭賢,王佳星
(渤海大學數理學院,遼寧錦州 121013)
1,3-丙二醇具有廣泛的應用領域,如在聚合材料的單體、化妝品、潤滑劑、醫藥等方面。1,3-丙二醇的生物合成尤其在工業領域有潛在價值,這主要是因為1,3-丙二醇成本低且無污染[1-3]。歐共體國家、美國、加拿大等大多采用化學合成法生產。然而,與傳統的化學合成法相比,微生物法具有轉化率高、副產物少、環境污染小等優點[4],但很難提高1,3-丙二醇的濃度。因此,提高1,3-丙二醇的產量備受全球關注。
近年來,甘油生物歧化為1,3-丙二醇過程的非線性動力學系統被學者們廣泛研究。文獻[5]運用過量動力學模型研究甘油轉化過程中的動態行為;文獻[6]通過引入過量項對過量動力學模型進行了修改,修改后的模型研究了實驗中的多穩態現象。在文獻[6]中建立的五維模型基礎上,文獻[7-11]針對甘油轉化1,3-丙二醇的連續發酵過程研究了參數辨識、平衡點的穩定性分析、振蕩現象和時滯現象。文獻[12-15]針對間歇發酵、連續發酵和批式流加發酵過程研究其參數辨識問題;文獻[16]應用AISOPE算法研究了甘油生物歧化為1,3-丙二醇過程的優化控制;文獻[17]采用加權和及NBI兩種方法求解其建立的多目標優化模型;文獻[18]證明了間歇發酵系統的穩定性;文獻[19]建立了甘油生物歧化為1,3-丙二醇過程的還原途徑酶催化八維非線性動力系統。但迄今為止未見有關于該生物過程穩態優化研究的報道。
本文針對孫亞琴建立的甘油生物歧化為1,3-丙二醇過程的還原途徑酶催化八維非線性動力系統,提出了一個使主要產物1,3-丙二醇產率達到最大的穩態優化模型,并應用內點法對其進行求解,取得了較好的應用效果。
本文考慮如下甘油生物歧化為1,3-丙二醇過程的還原途徑酶催化八維非線性動力系統[19-21]:


其中:X為生物量濃度(g/L);D為稀釋速率(h-1);Cso,Cse,Csi分別為進料底物濃度、反應器中胞外和胞內甘油濃度(mmol/L);C3-HPA為胞內3-羥基丙醛濃度(mmol/L);CPDi,CPDe分別為胞內和胞外 1,3-丙二醇濃度(mmol/L);CHAc為胞外乙酸濃度(mmol/L);CEtOH為胞外乙醇濃度(mmol/L);μ,qs,qpi,qEtOH(pi為1,3-PD,HAc)分別為細胞比生長速率、底物比消耗速率、產物1,3-丙二醇和乙酸的比生成速率及乙醇的比生成速率(mmol/(g·h));t為發酵時間(h);其余參數意義見附錄,取值如表1所示。
表1 式(1)~(15)中的參數取值

參數 取值 參數 取值Vs 0.151 L/g Ym 0.008 2 g/mmol Jmax 54.664 mmoL/(g·h) Ym1,3-PD s 67.69 mmol/g Km 1.340 mmol/L YmHAc 33.07 mmol/g KGDHt i 220.319 mmol/L Δqms 28.58 mmoL/(g·h)KPDOR i 0.418 mmol/L Δqm1,3-PD 26.59 mmoL/(g·h)KPD 25.137 h -1 ΔqmHAc 5.74 mmoL/(g·h)ms 2.20 mmoL/(g·h) As 1.896 ×10-4g/(L·h)m1,3-PD -2.69 mmoL/(g·h) K*11.43 mmol/L mHAc -0.97 mmoL/(g·h) K*1,3-PD s 15.50 mmol/L μm 0.67 h-1 K*85.71 mmol/L Ks 0.28 mmol/L Cprotein HAc 1.7 mg/mL a1 0.002 5 mmoL/(L·h)ΔUGDHtm-0.87 U/mg a2 5.18 mmoL/(L·h) ΔUPDORm-1.38 U/mg b1 0.06 mmoL/(L·h) Ks 1.35 mmol/L b2 50.45 mmoL/(L·h) Ks PDOR GDHt 2.41 mmol/L C*se 2 039 mmol/L αPDOR -1..87 U·h/mg C*1,3-PD 939.5 mmol/L αGDHt -3.53 U·h/mg C*0.14 mmol/L C*HAc 1 026 mmol/L KPDORm 0.53 mmol/L UPDORO 2.32 U/mg kPDOREtOH 360.9 mmol/L KGDHtm 0.217 UGDHtO 2.8 U/mg kGDHt 0.171 β60
針對甘油生物歧化為1,3-丙二醇過程(1)~(15),本文建立了如下使主要產物1,3-丙二醇產率達到最大的穩態優化問題:


針對穩態優化問題(16),本文采用約束優化方法中的內點法[22]對其進行求解。首先將問題(16)重寫為如下形式:


其中:


問題(17)可進一步轉化為如下只含等式約束的優化問題:


其中:r=(r1,r2,r3,r4,r5,r6,r7,r8,r9,r10,r11,r12,r13,r14,r15,r16,r17,r18,r19,r20)T。ri>0(i=1,2,…,20)為不等式約束條件的松弛變量,λ>0為障礙參數。令λ趨近于0,則問題(18)的解等價于問題(17)的解。

則優化問題(18)可進一步改寫為如下形式:

本文應用內點算法求解優化問題(19)。
首先使用直接迭代步[22],如果不能求得最優解,則使用共軛梯度步[22]。具體步驟如下:
1)給定精度ε>0,障礙參數λ(λ>0),松弛變量 ri>0(i=1,2,…,20),初始點 x(0),令迭代次數k=0。
2)在第k次迭代時,使用直接迭代步求解無約束優化問題:

其中θ(θ>0)為參數,令其最優解為(x(k))*。
4)給定 θk+1(θk+1> θk),k=k+1,轉回步驟2);若(x(k))*不能使步驟2)中無約束優化問題的 φ((x(k))*,r,θ)越來越小,則轉至步驟5)。
5)使用共軛梯度步,在一個信賴域中求解步驟2)中的問題,可求得其最優解為(x(k))*。
7)令θk+1=αθk(α >0),k=k+1,轉回步驟5)。
本文在Matlab軟件平臺上應用內點法求解穩態優化問題(16),其優化結果如表2所示。從表2中可見:當稀釋速率及初始甘油濃度分別為0.285 7 h-1和 730.798 7 mmol/L 時,1,3-丙二醇的最大產率為114.300 5 mmoL/(L·h)。

表2 優化結果
針對甘油生物歧化過程的穩態優化問題,本文建立了與其過程特點相適應的穩態優化模型,并利用內點法獲得了生物過程的最優操作條件,取得了較好的應用效果。

附錄:

續表
[1]Zeng A P,Biebl H.Bulk chemicals from biotechnology:the case of 1,3-propanediol production and the new trends[J].Advances in Biochemical Engineering Biotechnology,2002,74:239-259.
[2]Nakamura C E,Whited G M.Metabolic engineering for the microbial production of 1,3-propanedio[J].Current Opinion in Biotechnology,2003,14:454-459.
[3]Laffend A,Nagarajan V,Nakamura C E.Bioconversion of a fermentable carbon source to 1,3-propanediol by a single microorganism[J].WO96/53796,E.I.DuPont de Nemours and Genencor International,1996.
[4]徐恭賢,邵誠,錢偉懿.非線性生化過程的優化和控制[M].北京:科學出版社,2015.
[5]Zeng A P,Deckwer W D.A kinetic model for substrate and energy consumption of microbial growth under substrate-sufficient conditions[J].Biotechnology Progress,1995,11(1):71-79.
[6]修志龍,曾安平,安利佳.甘油生物歧化過程動力學數學模擬和多穩態研究[J].大連理工大學學報,2000,40(4):428-433.
[7]Gao C X,Feng E M,Wang Z T,et al.Parameters identification problem of the nonlinear dynamical system in microbial continuous cultures[J].Applied Mathematics and Computation,2005,169:476-484.
[8]Li X H,Feng E M,Xiu Z L.Stability and optimal control of microorganisms in continuous culture[J].Journal of Applied Mathematics and Computing,2006,22:425-434.
[9]Ma Y F,Xiu Z L,Sun L H,et al.Hopf bifurcation and chaos analysis of a microbial continuous culture model with time delay[J].International Journal of Nonlinear Scienc6es and Numerical Simulation,2006,7:305-308.
[10]Ye J X,Feng E M,Lian H S,et al.Existence of equilibrium points and stability of the nonlinear dynamical system in microbial continuous cultures[J].Applied Mathematics and Computation,2009,207:307-318.
[11]Lian H S,Feng E M,Li X F,et al.Oscillatory behavior in microbial continuous culture with discrete time delay[J].Nonlinear Analysis:Real World Applications,2009,10:2749-2757.
[12]張書喜.微生物發酵非線性多階段動力系統參數辨識[D].鞍山:遼寧科技大學,2012.
[13]沈邦玉,劉重陽,葉劍雄,等.微生物連續發酵系統參數辨識與優化算法[J].大連理工大學學報,2012,52(1):150-157.
[14]李想.甘油間歇發酵酶催化-基因調控動力系統的參數辨識[D].大連:大連理工大學,2014.
[15]王艷,李曉紅,馮恩民,等.微生物批式流加發酵非線性系統及其參數辨識[J].遼寧工程技術大學學報:自然科學版,2013,32(12):1704-1707.
[16]Xu G X,Shao C,Xiu Z L.Optimizing Control of Bio-dissimilation Process of Glycerol to 1,3-propanediol[J].Chinese Journal of Chemical Engineering,2008,6(1):128-134.
[17]劉穎.甘油連續生物歧化為1,3-丙二醇過程的多目標優化[D].錦州:渤海大學,2014.
[18]袁金龍,馮殊倫,馮恩民.甘油間歇發酵酶催化非線性動力系統的強穩定性[J].控制與決策,2014,29(8):1505-1508.
[19]Sun Y Q,Qi W T,Teng H,et al.Mathematical modeling of glycerol fermentation by Klebsiella pneumoniae:concerning enzymecatalytic reductive pathway and transport of glycerol and 1,3-propanediol across cell membrane[J].Biochemical Engineering Journal,2008,38:22-32.
[20]Xiu Z L,Song B H,Wang Z T,et al.Optimization of dissimilation of glycerol 1,3-paopanediol by Klebsiella pneumoniae in one-stage and two-stage anaerobic cultures[J].BiochemicalEngineering Journal,2004,19:189-197.
[21]孫亞琴.甘油生物歧化過程酶催化和基因調控的非線性數學模擬與分析[D].大連:大連理工大學,2010.
[22]Byrd R H,Hribar M E,Nocedal J.An interior point algorithm for large-scale nonlinear programming[J].SIAM Journal on Optimization,1999,9(4):877-900.