蘇瑾文,劉艷華,楊秉芬,程小星(解放軍309醫(yī)院結(jié)核病研究所ICU,北京 0009;解放軍309醫(yī)院結(jié)核病研究室;通訊作者,E-mail:xc36cn@63.com)
重癥肺結(jié)核[1]是指各型血型播散性肺結(jié)核及3個肺野以上的繼發(fā)性肺結(jié)核。其中重癥繼發(fā)性肺結(jié)核病灶范圍大,病理損害嚴(yán)重,肺結(jié)構(gòu)的破壞使得呼吸功能受到嚴(yán)重影響,死亡率增加[2]。已有研究證實肺結(jié)核組織損傷是由遲發(fā)型超敏反應(yīng)引發(fā)、Th2輔助T細胞介導(dǎo)的免疫反應(yīng)[3]所致,但其免疫病理機制仍不十分明確,本研究前期用基因表達譜芯片[4]篩選重癥繼發(fā)性肺結(jié)核患者的差異基因,以期發(fā)現(xiàn)并研究重癥繼發(fā)性肺結(jié)核患者差異基因與肺結(jié)構(gòu)嚴(yán)重損害的關(guān)系。芯片結(jié)果顯示有大量表達下調(diào)基因,其中趨化因子CCL3、CCL4表現(xiàn)為表達下調(diào),本研究進一步從多角度驗證了CCL3、CCL4的表達下調(diào),并對其表達下調(diào)與重癥病例病變的關(guān)系做了初步探索。
根據(jù)重癥肺結(jié)核的定義,結(jié)合自己的研究目的確定入選標(biāo)準(zhǔn)。重癥:病灶范圍在三個肺野以上,病灶斑片狀并伴有壞死、空洞、實變等病變。輕癥:結(jié)核病灶范圍在兩個肺野以下,病灶點狀或索條狀,且無空洞形成者。對照:正常健康人。排除標(biāo)準(zhǔn):①使用過激素者;②有合并癥者;③合并結(jié)核性胸膜炎和肺外結(jié)核者;④病變范圍兩個肺野以下有空洞者及三個肺野以上無空洞、壞死、實變者。肺結(jié)核的診斷按照中華醫(yī)學(xué)會《臨床診療指南》(結(jié)核病分冊)[5]。本研究得到解放軍309醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn),所有受試者均簽署知情同意書。
解放軍309醫(yī)院結(jié)核病研究所2012-04~2013-10確診為繼發(fā)性肺結(jié)核的患者90例,男性48例,女性42例,均無基礎(chǔ)疾病;同期健康對照33例,來自解放軍309醫(yī)院體檢中心健康查體者,男性17例,女性16例。其中5例重癥、5例輕癥、5例健康送檢芯片。其余病例用于做RT-PCR和ELISA檢測,每組20例。采集靜脈抗凝血2 ml,于室溫下放置,在采集后6 h內(nèi)處理。
Ficoll淋巴細胞分離液(美國GE公司)分離抗凝血。方法 :吸取2 ml平衡至室溫的Ficoll到離心管中,再緩慢加入2 ml混勻的抗凝血,1 000×g離心20 min,吸取中間的白膜層,分別用10 ml 1640完全培養(yǎng)基(美國Gibco公司)、350×g 7 min和1 ml 1640完全培養(yǎng)基、300×g 5 min洗滌,棄去上清,沉淀即為外周血單個核細胞。
Trizol法提取細胞總RNA。方法 :按1×106細胞/ml Trizol的比例加入Trizol(美國invitrogen公司),渦旋使其完全裂解,室溫靜置5 min;按0.2 ml氯仿/1 ml Trizol加入氯仿,渦旋30秒后室溫靜置5 min,4℃ 12 000×g離心15 min;取上層無色水相至新離心管中,按0.5 ml異丙醇/1 ml Trizol比例加入異丙醇,混勻后室溫放置10 min,沉淀 RNA,4℃12 000×g離心10 min,棄上清;加入1 ml 75%的乙醇洗滌沉淀,4℃ 7 500×g離心5 min,棄上清,室溫干燥10 min;加入100 μl DEPC水,-20℃保存。
采用TaKaRa PrimeScriptTMRT reagent kit[RR037A,寶生物工程(大連)有限公司]的逆轉(zhuǎn)錄試劑盒,按說明書操作,將RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA。反轉(zhuǎn)錄體系為:5 ×buffer 2 μl;Enzyme 0.5 μl;Oligo dT 0.5 μl;Random6 0.5 μl;Total RNA 5 μl;加 ddH2O 補充到10 μl。反應(yīng)條件為:37 ℃,15 min;85 ℃,5 s。
采用 KAPA SYBR FAST qPCR kit(KM4105,KapaBiosystems)熒光定量試劑盒測定外周血單個核細胞CCL3和CCL4 mRNA的表達,重癥、輕癥組各20例,健康對照8例。內(nèi)參基因:GAPDH。引物和內(nèi)參基因由上海生工生物公司合成。以cDNA為模板擴增基因,擴增反應(yīng)體系為:SuperReal Premix(SYBR Green)10 μl;Forward Primer 0.4 μl;Reverse primer 0.4 μl;cDNA(template)2 μl;RNase ddH2O 7.2 μl,總量為 20 μl。設(shè)定反應(yīng)條件:第一步 95 ℃3 min;第二步95℃ 3 s,60℃ 20 s,進行40個循環(huán)。
用2-Δct計算每個候選基因的相對表達量。當(dāng)目標(biāo)基因和參照基因有相同的擴增效率時,ΔCt目標(biāo)基因=Ct目標(biāo)基因-Ct內(nèi)參基因。
對CCL3、CCL4進一步用ELISA方法驗證細胞蛋白表達量。重癥、輕癥組和健康對照各20例用EDTA或肝素抗凝的外周血標(biāo)本2-4 ml,3 000 r/min、10 min離心吸取血漿。先用標(biāo)準(zhǔn)品倍比稀釋后做標(biāo)準(zhǔn)曲線,然后在微孔板內(nèi)每孔加樣100 μl,37℃孵育2 h,再經(jīng)洗板及先后加一抗、二抗、底物及終止反應(yīng)等步驟,最后用酶標(biāo)儀在450 nm處測定吸光值。
Graphad prism5統(tǒng)計軟件分析組間差異。用方差分析方法判斷數(shù)據(jù)是否符合正態(tài)分布,組間比較用非參數(shù)檢驗判斷重癥、輕癥繼發(fā)性肺結(jié)核患者與對照組之間表達量的統(tǒng)計學(xué)差異,P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
對45例重癥和45例輕癥患者的臨床資料總結(jié)見表1。
從表1的臨床資料中可看出,重癥患者痰抗酸染色陽性、復(fù)治、耐藥比例均高于輕癥組,有吸煙、飲酒史的患者比例高于輕癥組,病程在3年以上的比例高于輕癥組,營養(yǎng)狀況相對差,即白蛋白和血紅蛋白低于輕癥組。

表1 45例重癥與45例輕癥肺結(jié)核患者的臨床數(shù)據(jù) (n=45)Table 1 Com parison of clinical data between 45 cases of severe TB and 45 cases of mild TB (n=45)
本實驗以送檢芯片標(biāo)本為代表檢測RNA純度為A260nm/A280nm≥1.80;經(jīng)甲醛變性膠電泳檢測RNA完整性,9號RNA樣品電泳條帶清晰,28S∶18S rRNA條帶亮度大于或接近1∶1,其余樣品電泳條帶清晰,28S∶18S rRNA條帶亮度大于或接近2∶1;RNA總量≥1 μg,質(zhì)量符合芯片實驗要求(見圖1)。

圖1 細胞總RNA電泳圖Figure 1 Electrophoresis of cellular total RNA
分組比較篩選出差異基因數(shù)目為:重癥vs輕癥406條,重癥vs健康668條,輕癥vs健康12條;其中下調(diào)基因數(shù)目在重癥vs輕癥264條,重癥vs健康351條,輕癥vs健康12條。從中可見差異表達基因以下調(diào)為主,有較多免疫相關(guān)基因表現(xiàn)為下調(diào),其中CCL3 下調(diào)84.69%,CCL4 下調(diào)87.73%。
CCL3、CCL4的熔解曲線為單一峰,證實 PCR擴增特異性較好。從標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得的擴增效率為90%,因此相對表達量計算為1.90-Δct。對重癥、輕癥和健康對照組CCL3、CCL4的相對定量Ct值經(jīng)計算后進行統(tǒng)計。由于數(shù)據(jù)為非正態(tài)分布數(shù)據(jù),組間兩兩比較用非參數(shù)檢驗方法。統(tǒng)計結(jié)果顯示,RTPCR驗證重癥與輕癥、健康對照組比較CCL3、CCL4表達下調(diào),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,見表2),RT-PCR驗證結(jié)果與芯片相符。

表2 重癥、輕癥組和健康對照組RT-PCR檢測值的比較Table 2 Com parison of RT-PCR results between severe secondary TB,mild secondary TB patients and healthy controls
對ELISA方法檢測重癥、輕癥和健康對照組CCL3、CCL4的吸光值進行統(tǒng)計,因數(shù)據(jù)為非正態(tài)分布數(shù)據(jù),組間兩兩比較用非參數(shù)檢驗方法。重癥與輕癥組比較、重癥與健康組比較CCL3表達下調(diào)(P<0.05);重癥與輕癥組比較、重癥與健康對照組比較CCL4表達下調(diào)(P<0.05)。結(jié)果 顯示重癥患者CCL3、CCL4血漿蛋白表達水平下調(diào),與芯片結(jié)果相符(見表3)。

表3 重癥、輕癥組和健康對照組ELISA檢測吸光值的比較Table 3 Com parison of ELISA results between severe secondary TB,mild secondary TB patients and healthy controls
繼發(fā)性肺結(jié)核臨床特征有別于原發(fā)結(jié)核和原發(fā)后結(jié)核,以肺內(nèi)實質(zhì)性病變?yōu)橹鳎洳±磉^程可以有浸潤、滲出、干酪、增殖、纖維化、鈣化等,肺結(jié)構(gòu)損害輕重程度差異很大,輕者病灶局限,而重者有空洞、干酪壞死、實變、毀損肺等病變使肺結(jié)構(gòu)嚴(yán)重受損,成為肺部感染、呼吸功能障礙的基礎(chǔ)。不同的預(yù)后被認為是結(jié)核菌和機體特異性免疫反應(yīng)間復(fù)雜相互作用的結(jié)果。對病情與病變差異的原因和機制尚不十分明確,病變的加重與很多因素有關(guān),如吸煙、酗酒、各種合并癥(糖尿病、肝炎、器官移植、腎功能衰竭等)、治療依從性、社會經(jīng)濟因素等,但可能最終影響的仍是免疫功能。病例的臨床資料也提示重癥與輕癥相比吸煙、飲酒發(fā)生率高、病程長、痰菌陽性率高,營養(yǎng)狀況差等可能都是導(dǎo)致病變加重的因素。還有研究證實與遺傳素質(zhì)有關(guān)[6],因此我們用基因表達譜芯片來篩選無基礎(chǔ)疾病和合并癥的重癥繼發(fā)性肺結(jié)核患者與輕癥、健康人相比的差異基因,以期發(fā)現(xiàn)重癥患者肺部病變嚴(yán)重與其他人群有不同的基因表達。結(jié)果 顯示,重癥組有大量差異基因,其中CCL3、CCL4等免疫相關(guān)基因表現(xiàn)為表達下調(diào),差異基因表達的改變及其對信號通路的影響可能是導(dǎo)致重癥繼發(fā)性肺結(jié)核病變嚴(yán)重的分子基礎(chǔ)。由于芯片實驗也存在一定系統(tǒng)誤差,對于篩選出的差異表達基因仍需進一步用分子生物學(xué)手段驗證。本研究分別用實時熒光定量PCR和ELISA方法驗證了CCL3、CCL4在重癥、輕癥患者及健康對照組的表達情況,驗證結(jié)果與芯片相符,因此驗證差異基因的方法和結(jié)果是可靠的。
CCL3和CCL4屬于趨化因子CC配體[chemokine(C-C motif)ligand,CCL]家族,分別稱為巨噬細胞炎癥蛋白MIP-1α和MIP-1β。感染結(jié)核菌后可通過宿主細胞表面分子和結(jié)核菌細胞膜、細胞壁相互作用誘導(dǎo)巨噬細胞產(chǎn)生趨化因子[7]。研究發(fā)現(xiàn)肺結(jié)核患者的肺泡巨噬細胞、單核細胞THP-1細胞系、支氣管肺泡灌洗液和胸腔積液中都有CCL3、CCL4等因子產(chǎn)生[8]。感染牛型結(jié)核分支桿菌的樹突細胞CCL3、CCL4等趨化因子增高表達,并可誘導(dǎo)NK細胞亞群NKp46(+)CD2(-)向樹突細胞遷移[9]。因此,我們認為 CCL3、CCL4的產(chǎn)生是抗結(jié)核免疫反應(yīng)的體現(xiàn),機體感染結(jié)核菌后應(yīng)有一個升高的過程,從而參與早期固有免疫機制。印度人群的研究顯示,CC趨化因子的基因多態(tài)性和肺結(jié)核易感性或抗結(jié)核能力相關(guān),其中涉及CCL3、CCL4的基因多態(tài)性[10],可見,CCL3和CCL4在抗結(jié)核免疫中有重要的防御作用。但我們的驗證實驗顯示輕癥患者表達CCL3、CCL4與健康人相比無統(tǒng)計學(xué)意義,并沒有明顯升高表達現(xiàn)象,可能與研究的標(biāo)本和方法不同有關(guān)。
研究證實CCL3和CCL4均參與了結(jié)核肉芽腫的形成[11]。而肉芽腫的形成被認為是抗結(jié)核細胞介導(dǎo)的免疫反應(yīng)良好的表現(xiàn),如果參與免疫的細胞反應(yīng)失控將導(dǎo)致大量壞死和組織結(jié)構(gòu)破壞,空洞形成[12]。參與肉芽腫形成的細胞如肺泡巨噬細胞、多核巨細胞和樹突細胞等均可被結(jié)核菌誘導(dǎo)產(chǎn)生CCL3、CCL4?;罨?T細胞能被調(diào)節(jié)表達分泌CCL5、CCL3、CCL4等趨化因子,在募集淋巴細胞、Th1表達和肉芽腫形成中發(fā)揮了必不可少的作用[13]。因此,CCL3、CCL4通過趨化多種細胞在結(jié)核菌感染部位形成肉芽腫來發(fā)揮抗結(jié)核作用。本研究CCL3、CCL4在重癥肺結(jié)核患者表達下調(diào),提示其參與肉芽腫形成進而局限結(jié)核菌引起的炎癥反應(yīng)功能下降,使抗結(jié)核的免疫保護受到抑制,可能與病變加重、病灶擴大有關(guān)。重癥患者CCL3、CCL4表達下調(diào)的原因機制尚不清楚。我們推測感染結(jié)核菌后CCL3、CCL4及其他趨化因子是升高表達的,但由于多種原因病情未得到控制和好轉(zhuǎn),使得病情加重后患者的免疫功能受到抑制,其表達反而下調(diào)。由于結(jié)核病是一種慢性消耗性疾病,病變持續(xù)存在和擴大導(dǎo)致機體過度消耗和營養(yǎng)不良等情況發(fā)生,直接影響了免疫功能。
綜上所述,本研究通過芯片篩選重癥繼發(fā)性肺結(jié)核的差異表達基因,發(fā)現(xiàn)部分免疫相關(guān)基因下調(diào),CCL3和CCL4通過RT-PCR和ELISA驗證,結(jié)果顯示與芯片相符。CCL3和CCL4能吸引炎性細胞并通過參與肉芽腫形成來發(fā)揮抗結(jié)核作用,但其表達下調(diào)可能使感染結(jié)核菌的炎癥反應(yīng)和病灶不能局限而成為促使病變加重的因素之一,其表達下調(diào)在免疫病理中的機制不清楚,尚待進一步研究。
[1]劉同倫.實用結(jié)核病學(xué)[M].沈陽:遼寧科學(xué)技術(shù)出版社,1987:284-289.
[2]Ryu YJ,Koh WJ,Kang EH,et al.Prognostic factors in pulmonary tuberculosis requiring mechanical ventilation for acute respiratory failure[J].Respirology,2007,12(3):406-411.
[3]Kobayashi K,Kaneda K,Kasama T.Immunopathogenesis of delayed-type hypersensitivity[J].Microsc Res Tech,2001,53(4):241-245.
[4]蘇瑾文,劉艷華,楊秉芬,等.重癥繼發(fā)性肺結(jié)核患者基因表達譜的分析和驗證[J].中華醫(yī)學(xué)雜志,2014,94(42):3304-3309.
[5] 中華醫(yī)學(xué)會.臨床診療手冊(結(jié)核病分冊)[M].北京:人民衛(wèi)生出版社社,2005:7.
[6]施雯慧,陳偉.結(jié)核病發(fā)病影響因素研究進展[J].中華流行病學(xué)雜志,2012,33(12):1296-1300.
[7]Collins HL,Kaufmann SH.The many faces of host responses to tuberculosis[J].J Immunol,2001,103(1):1-9.
[8]Zlotnik A,Yoshie O.Chemokines:a new classification system and their role in immunity[J].Immunity,2000,12(2):121-127.
[9]Siddiqui N,Hope J.Differential recruitment and activation of natural killer cell sub-populations by mycobacterium bovis-infected dendritic cells[J].Eur J Immunol,2013,43(1):159-169.
[10]Singh B,Chitra J,Selvaraj P.CCL2,CCL3 and CCL4 gene polymorphisms in pulmonary tuberculosis patients of South India[J].Int J Immunogenet,2014,41(2):98-104.
[11]Zhu XW,F(xiàn)riedland JS.Multinucleate giant cells and the control of chemokine secretion in response to Mycobacterium tuberculosis[J].Clin Immunol,2006,120(1):10-20.
[12]Brighen ti S,Andersson J.Local immune responses in human tuberculosis:learning from the site of infection[J].J Infect Dis,2012,205:S316-324.
[13]Gonzalez-Juarrero M,Hattle JM,Izzo A,et al.Disruption of granulocyte macrophage-colony stimulating factor production in the lungs severely affects the ability of mice to control Mycobacterium tuberculosis infection[J].J Leukoc Biol,2005,77(6):914-922.