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雞IGF1、IGF2基因的遺傳互作效應

2016-01-27 15:42:32金崇富王金玉張跟喜等
江蘇農業科學 2015年11期
關鍵詞:效應分析

金崇富 王金玉 張跟喜等

摘要:以IGF1、IGF2基因作為影響雞生產性能的候選基因,采用DNA測序和PCR-SSCP技術分析2個基因的單核苷酸多態性及互作效應。結果表明,IGF1基因P1位點與IGF2基因P2位點對12、16周齡雞的質量存在互作效應。

關鍵詞:雞;遺傳多樣性;IGF1R基因;IGFBP-3基因;互作效應

中圖分類號:S831.2文獻標志碼: A文章編號:1002-1302(2015)11-0285-02

收稿日期:2014-11-27

基金項目:江蘇省重點實驗室開放課題(編號:K13032);江蘇省農業科技自主創新資金[編號:CX(13)3044]。

作者簡介:金崇富(1985—),男,江蘇建湖人,碩士研究生,助理研究員,主要從事動物遺傳育種與繁殖研究。Email:jincf001@sina.com。

通信作者:陳應江,副研究員,主要從事畜牧業研究。胰島素樣生長因子(IGFs)是人體最重要的生長因子之一。IGF家族由2個多肽類生長因子(IGF-Ⅰ、IGF-Ⅱ)、2類受體(IGF-ⅠR、IGF-ⅡR)、7種結合蛋白(IGFBP1-7)組成,它們是動物生長軸上的重要因子,具有強烈的促生長和分化作用[1]。類胰島素樣生長因子-Ⅰ(insulin-like growth factor-Ⅰ,IGF-Ⅰ)是介導生長素作用的物質,在研究生長素的促生長作用時被發現并深入研究。類胰島素樣生長因子-Ⅱ(insulin-like growth factor-Ⅱ,IGF2)是調節動物生命活動最重要的多肽生長因子之一[2],是生長激素發揮作用的中間信使,進而發揮促進生長發育的作用[3]。

王慧華研究發現,IGF1基因G49754A/G49778A位點對京海黃雞的初生質量有顯著影響[2]。Amills等在IGF-Ⅰ基因的5′-UTR發現,HinfI-RFLP與107 d雞的日增質量存在相關性[4]。楊鳳萍等在京海黃雞IGF2基因中檢測到外顯子2發生G→C突變,并與其生產性狀具有顯著相關性[5]。李源等研究發現,IGF2基因C2C2型個體的12、16周齡質量極顯著大于C1C2型個體(P<0.01)[3]。

在分析多基因調控的數量性狀時,須同時分析多個位點,以便得到基因與性狀之間的真實相關性,從而在利用DNA標記進行輔助選擇時獲得更大的遺傳進展[6]。以江蘇省鹽城市地方草雞為研究對象,分析IGF1、IGF2基因的互作效應,以期為鹽城市地方草雞生產性狀的分子遺傳機制研究提供依據。

1材料與方法

1.1試驗材料

在江蘇沿海地區農業科學研究所生態養殖基地的母雞群中,翅靜脈采集138份血樣,每份1.5 mL,以ACD抗凝并于 -20 ℃ 保存備用。用DNA提取試劑盒抽提基因組DNA。

1.2引物設計

1.3PCR-SSCP分析

將2.5 μL PCR產物添加至7.5 μL變性緩沖液中,98 ℃變性10 min,隨后迅速冰浴5 min。將變性的PCR產物點樣添加至10%聚丙烯酰胺凝膠中,于140 V電壓電泳12 h。電泳結束后進行銀染顯色并拍照記錄結果。

1.4IGF1、IGF2基因綜合標記

采用SPSS軟件的廣義線性模型(GLM)綜合分析IGF1、IGF2基因的互作效應,選取互作效應顯著的雞,對其生產性狀進行基因型組合,并對不同基因型組合間的差異進行最小二乘(LSD)分析。

2結果與分析

2.1PCR-SSCP分析結果

采用PCR-SSCP分析P1、P2引物擴增片段。P1擴增片段有3種帶型,定義為AA、AB、BB(圖1);P2擴增片段有3種帶型,定義為CC、CD、DD(圖2)。

2.2序列分析結果

由引物P1的PCR產物片段測序結果(圖3)可知,BB型與AA型相比在160 bp處發生了G→A突變。由引物P2的PCR產物片段測序結果(圖4)可知,DD型與CC型相比在1 087 bp處發生了G→A突變。

2.3IGF1、IGF2基因對生產性狀的互作效應

由IGF1、IGF2基因對生產性狀的互作效應(表1)可知,IGF1、IGF2基因對鹽城市地方草雞的12、16周齡質量存在互作效應。

3結論與討論

培育具有綜合性能的優良家禽品種已成為現代家禽育種的重要目標。由于家禽的很多經濟性狀是由多基因控制的數量性狀,可通過分子標記選擇世代中含有多個目標基因的個體,再從中選出優良個體,實現有利基因的聚合,使品種具有更優良的生產性能。

通過分子標記將多個影響家禽生產性狀的基因聚合,此方面的研究尚不多見。侯啟瑞在京海黃雞群體中對IGF1與IGF2、LYZ與gag-env分別進行聚合分析,發現其存在互作效應[7]。趙秀華在京海黃雞群體中對IGFBP-1、IGFBP-2、STAT5基因進行3基因互作效應分析,結果表明,3基因合并效應>2基因合并效應>單基因效應,且組合基因型效應不是單基因型效應的簡單相加,其效果優于單基因型效應[8]。李國輝等以白耳雞為試驗對象,檢測GH、POU1F1、PRL基因的單核苷酸多態性,分析3個基因的單基因效應與聚合基因型效應[9]。本研究中鹽城市地方草雞IGF1、IGF2基因對其12、16周齡質量具有互作效應;在生產中,可通過選擇這2個基因的SNPs進行分子標記輔助育種,其風險低于單基因選擇。

參考文獻:

[1]張力,李樹濃. 胰島素樣生長因子-1[J]. 國外醫學生理:病理科學與臨床分冊,1997,17(2):174-176.

[2]王慧華. 京海黃雞IGF-I基因多態性與生產性能的關系及其遺傳規律的研究[D]. 揚州:揚州大學,2010.

[3]李源. IGF2基因,IGF2R基因多態性及其與京海黃雞生產性能的相關性研究[D]. 揚州:揚州大學,2010.

[4]Amills M,Jiménez N,Villalba D,et al. Identification of three single nucleotide polymorphisms in the chicken insulin-like growth factor 1 and 2 genes and their associations with growth and feeding traits[J]. Poultry Science,2003,82(10):1485-1493.

[5]楊鳳萍,李其松,戴國俊,等. 京海黃雞IGF-Ⅱ基因SNPs及其與生產性能關系研究[J]. 畜牧獸醫學報,2008,39(11):1470-1475.

[6]王金玉,陳國宏. 數量遺傳與動物育種[M]. 南京:東南大學出版社,2004.

[7]侯啟瑞. IGFs、LYZ基因和EAV-HP DNA序列SNPs與京海黃雞經濟性狀的關聯分析[D]. 揚州:揚州大學,2010.

[8]趙秀華. 京海黃雞IGFBP-1、IGFBP-2和STAT5基因遺傳效應及表達規律的研究[D]. 揚州:揚州大學,2012.

[9]李國輝,張學余,蘇一軍,等. 3個基因SNPs及基因聚合對白耳雞產蛋數的遺傳效應[J]. 江西農業大學學報,2010,32(4):661-667.趙莎莎,周澤偉,鄭玲敏,等. 飼用L-色氨酸添加劑的Ames試驗[J]. 江蘇農業科學,2015,43(11:287-289.

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