郭曉旭, 王巍峰
中國人民解放軍總醫院消化科,北京100853
線粒體基因組在消化系統疾病中的作用
郭曉旭, 王巍峰
中國人民解放軍總醫院消化科,北京100853
線粒體是人體細胞內重要的細胞器,通過合成ATP為各種生命活動提供能量。它還是人細胞核以外唯一含有遺傳物質DNA的細胞器。人的線粒體基因組較小,只編碼37個產物,包括2種核糖體RNA、22種轉移RNA及13種多肽(主要是構成4個呼吸鏈復合物的亞基),其中基因mt-ATP6和mt-ATP8分別編碼ATP酶的6亞基和8亞基,而這兩個亞基是ATP酶的重要組成結構。研究發現線粒體基因組的DNA異常會導致線粒體基因病,還可能參與腫瘤、衰老等疾病的發病機制。近年來研究發現其還可能是功能性胃腸疾病、炎性腸病等發病機制的重要環節。本文就線粒體基因組和常見消化系統疾病的關系,尤其與消化道腫瘤及癌前病變、功能性胃腸疾病等的關系作一概述。
線粒體基因組;核外DNA;ATP酶;消化系統疾病
通常一個細胞中有數百或數千個線粒體,其數量隨著組織細胞生理功能狀態的變化而變化,在生理功能旺盛的部位含量更多。線粒體是三羧酸循環和氧化磷酸化的好發部位,是為細胞生命活動提供能量的細胞器。線粒體由外膜、內膜、膜間隙及基質構成,含有大量酶類,其中最重要的是ATP酶。線粒體內還含有遺傳物質即線粒體基因組,對人類遺傳有重要影響。
1.1 線粒體基因組 人類線粒體DNA是一個環形DNA[1],全長16 569 bp,含有閉合雙鏈,由重鏈(H)和輕鏈(L)構成,其全部基因序列已經清楚,只編碼37個產物,包括兩種rRNA(核糖體RNA)、22種tRNA(轉移RNA)及13種多肽。這13 種多肽主要是4個呼吸鏈復合物的亞基,分別為NADH 還原酶的7個亞基(ND 1~6,ND4L),泛醌-細胞色素C還原酶的1個亞基細胞色素b(Cyt-b),細胞色素C 氧化酶(cytochrome C oxidase,COX)中的3個亞基(COXⅠ~Ⅲ)和ATP合成酶中的ATP6 和ATP8 兩個亞基。這些多肽都是細胞呼吸鏈中重要酶類的亞基,在細胞能量代謝中起重要作用。線粒體基因組是人類唯一的核外基因組,因其位于細胞質,其遺傳屬于細胞質遺傳。
1.2 ATP酶 ATP酶又被稱作ATP合成酶,人類線粒體中ATP酶由F1亞基和F0亞基構成。ATP酶位于線粒體內膜,當H+順梯度通過此酶時引起其亞基發生旋轉運動,使得ADP與Pi相結合生成ATP,為各種細胞活動提供能量。轉錄翻譯ATP酶的基因大部分位于核基因組,只有ATP酶的6亞基(ATP6)和8亞基(ATP8)由線粒體基因組的mt-ATP6及mt-ATP8基因轉錄翻譯。ATP酶是影響人體內生命活動的重要因子,它的亞基異常可導致功能異常,從而致病。
線粒體DNA單倍群 (haplogroup)是人類祖先的不同群體遷移形成的,因而有地域特點,同一單倍群的個體均具有相同的單倍型(haplotype)。人類線粒體DNA單倍型的進化樹表明了線粒體DNA單倍群之間的相互關系。不同人種間單倍型類別差異很大,同一民族在不同地域單倍型也有差異。據報道[2]線粒體單倍型與多種疾病易感性存在相關性:多因素分析顯示阿爾茨海默病與線粒體單倍型HV、U明顯相關,且不受APOE4的影響;最近有學者[3]研究發現漢族人群中具有線粒體DNA 單倍型 B5的人對阿爾茨海默病有遺傳易感性;帕金森病的發病率在線粒體單倍型H中升高,而在線粒體單倍型J和K中降低[4]。還有學者[5]發現男性低精子活力患病率在線粒體單倍型T中最高,而在線粒體單倍型H中最低。中歐人群中線粒體單倍型T中冠心病的發病率相對較高,另外也發現線粒體單倍型T中糖尿病相關的視網膜病變發生率更高[6]。功能性胃腸疾病及胃腸功能也與線粒體單倍型相關[7],但目前研究較少。
3.1 線粒體基因病 線粒體DNA異??梢鹁€粒體的結構或功能異常而致病。目前研究比較明確的是線粒體基因病。線粒體基因病種類較多,臨床上常分為以下幾種綜合征[8]:Leber’s遺傳性視神經病變(LHON)、線粒體腦肌病伴有乳酸血癥及卒中樣發作綜合征(MELAS)、肌陣攣癲癇伴破碎紅纖維綜合征(MERRF)、神經病共濟失調及色素性視網膜炎綜合征(NARP)、線粒體基因突變糖尿病等。上述疾病多數在年輕人中就發病,常有神經癥狀及消化道癥狀,尤其是消化道癥狀常在疾病早期就出現。雖然各種線粒體基因病的致病基因突變各不相同,但其發病機制相似,均通過影響線粒體功能導致各系統損傷,尤其是神經系統及肌肉組織的損傷。另外,核DNA基因突變也可導致線粒體病。但迄今為止發現的核DNA異常導致的線粒體病很少見,僅有幾種疾病的報道,包括線粒體神經胃腸腦肌病(MNGIE)、丙酮酸脫氧酶復合體缺乏癥(PDHA1)。
3.2 線粒體DNA異常與衰老、腫瘤 除了線粒體基因病,線粒體DNA異常還在多種疾病發生、發展中起重要作用,目前研究較多的是衰老、腫瘤等,尤其是針對消化道腫瘤的研究取得了較大的進展。
3.2.1 線粒體DNA異常與衰老:許多學者試圖揭示線粒體在衰老、年齡相關疾病中的作用。目前有研究[9]表明線粒體產生的自由基會對大分子物質(包括DNA)造成損傷,損傷積累可導致線粒體功能衰退,最終引發與年齡相關的疾病,如心血管疾病、神經退行性病變、糖尿病等。比如阿爾茨海默病是一種常見的老年人神經退行性疾病,越來越多證據表明線粒體新陳代謝和電子傳遞鏈缺陷與阿爾茨海默病的發生關系密切。有學者[10]認為其發病機制可能是環境因素導致核基因或線粒體DNA發生突變,繼而導致線粒體結構和/或功能損傷使ATP產量下降,同時活性氧增加并誘發神經細胞凋亡引發神經退行性變。
3.2.2 線粒體DNA異常與消化道腫瘤、癌前病變:在消化系統腫瘤中線粒體DNA可出現多種蛋白編碼基因的突變,可能參與腫瘤的發生及發展。另外,線粒體DNA改變與消化道腫瘤預后存在相關性。法國的研究小組[11]對365例結腸癌患者進行研究發現,38.3%的腫瘤存在D-loop突變,但這些突變與年齡、性別、腫瘤的位置及分期無關。有D-loop突變和無D-loop突變的兩組患者中3年生存率有明顯差異,說明結直腸癌中線粒體DNA改變與患者的生存期存在相關性。進一步分型研究發現結腸癌Ⅲ期患者輔助化療對無D-loop突變組效果更好,這說明D-loop突變可看作結直腸癌不良預后的一個指標,也可用于預測是否存在化療耐藥。近年來,對癌前病變的線粒體DNA研究成為本領域的熱點。針對幾種常見癌前病變如Barrett’s食管、結直腸腺瘤、炎癥性腸病的研究[12]顯示這些疾病中均存在線粒體DNA突變,大多數累及COXⅠ、ND4、ND5基因,也有非編碼區突變。
有學者[13]研究了Barrett’s食管基礎上的腺癌線粒體DNA改變,發現40%的病例存在D-loop突變,研究還提示氧化損傷可能是Barrett’s食管癌變中的一個機制。Barrett’s上皮中線粒體DNA突變是否可作為惡變的分子生物學標志值得深入研究。還有學者[14]報道潰瘍性結腸炎患者中線粒體DNA突變明顯增加,在潰瘍性結腸炎伴癌變的患者中線粒體DNA突變頻率更高。一項研究[15]對結直腸癌的另一種重要癌前病變-結腸腺瘤進行線粒體DNA的研究,注意到線粒體ATP6基因中G9055A在管狀腺瘤中100%的出現,在絨毛狀腺瘤57%出現,但在管狀絨毛狀腺瘤無一例出現,且線粒體ATP6基因的A9006G突變只出現在絨毛狀腺瘤,并占到57%。G9055A與A9006G在多絨毛腺瘤是缺如的,提示線粒體DNA突變在不同類型腺瘤中表達不一樣,有可能作為腺瘤病理鑒別的指標。也有研究[16]對消化道間質瘤中線粒體DNA微衛星不穩定性(MSI)和核DNA的微衛星不穩定性進行比較,發現線粒體DNA微衛星不穩定性與消化道間質瘤存在相關性,而與核DNA微衛星不穩定性無關。鑒于對癌前病變及良性病變惡變的研究進展,檢測癌前病變的線粒體DNA突變可作為早期發現癌變的分子生物學標志。
有學者[17]應用轉基因細菌模型模擬結腸癌中呼吸鏈復合物Ⅳ Ser458Pro、Gly125Asp的氨基酸改變,發現Ser458Pro導致模型呼吸鏈復合物Ⅳ的酶結構明顯改變,而Gly125Asp在模型中未引起酶的結構改變,但酶的活性下降約30%,且發現內源性質子漏出增加,影響質子的電化學梯度,這將導致整個呼吸鏈的功能受損。也有研究[18]顯示核DNA與線粒體DNA之間作用不協調也可能是腫瘤細胞線粒體功能異常的一個機制。有學者[19]借助單個細胞線粒體DNA的分析和干細胞線粒體DNA分析技術,發現線粒體DNA突變通過細胞分裂向新細胞傳遞,即使在干細胞也有線粒體DNA點突變,它也是通過細胞分裂向新細胞傳遞,這些突變同時伴有呼吸鏈中呼吸鏈復合物Ⅰ~Ⅳ的活性下降,免疫組化顯示約50%的腺隱窩中這些呼吸鏈復合物Ⅰ~Ⅳ存在某種程度的缺失。這一研究結果進一步支持線粒體DNA突變與呼吸鏈復合物異常存在相關性。
3.3 線粒體DNA異常與其他常見消化系統疾病
3.3.1 周期性嘔吐綜合征(cyclic vomiting syndrome,CVS):CVS多見于兒童,但也有成年發病者。以惡心及嘔吐為主要癥狀,可伴有或發展成偏頭痛,本病受母系遺傳的影響程度較大。近年來有報道[20]稱在兒童患者中,其發病可能與線粒體DNA單核苷酸多態性C16519T及 G3010A有關。
3.3.2 功能性胃腸疾?。篊amilleri等[7]報道了他們關于功能性胃腸疾病與線粒體DNA變異的研究結果。他們選取一種兒童周期性嘔吐伴偏頭痛中常見的兩個線粒體DNA突變位點即C16519T和G3010A作為檢測位點。因為白種人線粒體DNA單倍型H(7028C)與疾病易感性相關,所以他們同時把研究對象根據7028C/T分成H型組(7028C)和非H型組(7028T),比較兩組功能性胃腸疾病患病率的不同。共納入466例患者及233名健康志愿者,466例功能性胃腸疾病患者均符合Rome Ⅱ標準,其中175例為腹瀉型腸易激綜合征或功能性腹瀉,155例為便秘型腸易激綜合征或功能性便秘,84例為腸易激綜合征混合型。研究者還對患者進行胃排空實驗、結腸傳輸實驗及直腸動力檢測等胃腸感覺、運動實驗。最后他們發現H型組中便秘型腸易激綜合征及混合型腸易激綜合征患病率低于非H型組,另外,H型組帶有3010G的患者常常表現胃排空減慢,而帶有3010A的患者常常伴有慢性腹痛及消化不良。
另外,我們也研究了腹瀉型腸易激綜合征線粒體ATP6、ATP8基因單核苷酸多態性(SNP),發現患者ATP6、ATP8基因的SNP明顯高于健康對照組[21],而ATP6、ATP8基因是編碼ATP酶亞基的,這些SNP可能會影響到ATP酶的結構和功能,這可能是腸易激綜合征發病機制中一個重要因素,但其具體作用還需進一步的功能研究。
3.3.3 炎癥性腸病:有學者[14]報道潰瘍性結腸炎患者中線粒體DNA突變頻率明顯高于正常對照組,他們還同時研究了活性氧(ROS)應用的一種ROS標記物8-OHdG作指標,發現ROS高于正常,提示存在氧化應激和線粒體功能失調。這說明潰瘍性結腸炎中線粒體DNA突變、氧化應激、線粒體功能異常之間存在某種聯系。還有研究[22]檢測了潰瘍性結腸炎結腸黏膜中線粒體呼吸鏈復合物,發現復合物Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ功能下降50%以上。另有學者[23]深入研究了潰瘍性結腸炎中氧化應激情況,發現線粒體中一種乙酰乙酰輔酶A硫解酶活性在潰瘍性結腸炎下降80%左右,而克羅恩病患者及對照組無明顯變化,同時氫過氧化物在潰瘍性結腸炎中明顯升高,提示潰瘍性結腸炎中線粒體存在ROS增多,并可能是線粒體功能損傷的機制??肆_恩病在兒童中少見,國外報道[24]1例兒童克羅恩病伴隨肌無力、癲癇的罕見病例,本病例激素治療無效,但TNF-α拮抗劑英夫利昔單抗治療效果明顯。深入檢查發現線粒體呼吸鏈復合物Ⅲ和Ⅳ功能異常,類似于一種線粒體基因病,即MNGIE。但最后全面檢查后排除了MNGIE。因為此克羅恩患者存在線粒體異常,但又不符合線粒體基因病,所以推測線粒體異??赡茉诖丝肆_恩病例發病中起重要作用。
有學者[25]在動物實驗中進一步驗證了這些發現。結腸炎模型鼠中復合物Ⅳ含量增高,同時氧化應激的指數升高。推測這是因為炎癥修復過程中細胞再生需要更多能量供應,伴隨更多的ROS產生,從而產生氧化應激。有效降低氧化應激有助于預防腸道的氧化損傷。最新研究[26]顯示特定的線粒體基因多態性可以保護小鼠免患結腸炎。這個課題組應用一種特殊轉基因小鼠,它們含有相同的核基因組,但線粒體基因組不同。在硫酸葡聚糖鈉和三硝基苯磺酸納處理的結腸炎小鼠模型中,測試結腸黏膜細胞氧化磷酸化復合物活性和ATP水平。研究顯示氧化磷酸化復合物活性和ATP水平高的小鼠結腸炎明顯減輕。此研究顯示特定的線粒體DNA變異增加了黏膜的ATP水平從而可能對小鼠的結腸細胞有保護作用。
消化系統疾病如胃腸腫瘤、功能性胃腸疾病等存在線粒體基因組的異常,有可能作為疾病診斷及預后標志或治療靶點,但線粒體DNA異常在這些疾病發病機制中的確切作用尚不清楚,值得深入研究。
[1]Wallace DC,Mitochondrial DNA variation in human radiation and disease [J]. Cell,2015,163(1): 33-38.
[2]Maruszak A,Canter JA,Styczyńska M,et al. Mitochondrial haplogroup H and Alzheimer’s disease-is there a connection? [J]. Neurobiol Aging,2009,30(11): 1749-1755.
[3]Bi R,Zhang W,Yu D,et al. Mitochondrial DNA haplogroup B5 confers genetic susceptibility to Alzheimer’s disease in Han Chinese [J]. Neurobiol Aging,2015,36(3): 1604,e7-e16.
[4]Pyle A,Foltynie T,Tiangyou W,et al. Mitochondrial DNA haplogroup cluster UKJT reduces the risk of PD [J]. Ann Neurol,2005,57(4): 564-567.
[5]Ruiz-Pesini E,Lapea AC,Díez-Sánchez C,et al. Human mtDNA haplogroups associated with high or reduced spermatozoa motility [J]. Am J Hum Genet,2000,67(3): 682-696.
[6]Kofler B,Mueller EE,Eder W,et al. Mitochondrial DNA haplogroup T is associated with coronary artery disease and diabetic retinopathy: a case control study [J]. BMC Med Genet,2009,10: 35.
[7]Camilleri M,Carlson P,Zinsmeister AR,et al. Mitochondrial DNA and gastrointestinal motor and sensory functions in health and functional gastrointestinal disorders [J]. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol,2009,296(3): G510-G516.
[8]Rahman S. Gastrointestinal and hepatic mainfestations of mitochondrial disorders [J]. J Inherit Metab Dis,2013,36(4):659-673.
[9]Scheibye-Knudsen M,Croteau DL,Bohr VA. Mitochondrial deficiency in Cockayne syndrome [J]. Mech Ageing Dev,2013,134(5-6): 275-283.
[10]Hroudová J,Singh N,Fi?ar Z. Mitochondrial dysfunctions in neurodegenerative diseases: relevance to Alzheimer’s disease [J]. Biomed Res Int,2014,2014: 175062.
[11]Lièvre A,Chapusot C,Bouvier AM,et al . Clinical value of mitochondrial mutations in colorectal cancer [J]. J Clin Oncol,2005,23(15): 3517-3525.
[12]Sui G,Zhou S,Wang J,et al. Mitochondrial DNA mutations in preneoplastic lesions of the gastrointestinal tract: a biomarker for the early detection of cancer [J]. Mol Cancer,2006,5: 73.
[13]Feng GF,Zhang J,Feng LM,et al. Mitochondrial DNA haplpgroup associated with spern motility in the Han population [J]. Asian J Androl,2013,15(5): 630-633.
[14]Nishikawa M,Oshitani N,Matsumoto T,et al. Accumulation of mitochondrial DNA mutation with colorectal carcinogenesis in ulcerative colitis [J]. Br J Cancer,2005,93(3): 331-337.
[15]Mehrabi S,Akwe JA,Adams G,et al. Analysis of mtDNA sequence variants in colorectal adenomatous polyps [J]. Diagn Pathol,2010,5: 66.
[16]Kose K,Hiyama T,Tanaka S,et al. Nuclear and mitochondrial DNA microsatellite instability in gastrointestinal stromal tumors [J]. Pathobiology,2006,73(2): 93-97.
[17]Greaves LC,Preston SL,Tadrous PJ,et al. Mitochondrial DNA mutations are established in human colonic stem cells,and mutated clones expand by crypt fission [J]. Proc Natl Acad Sci U S A,2006,103(3): 714-719.
[18]Mazzanti R,Giulivi C. Coordination of nuclear- and mitochondrial-DNA encoded proteins in cancer and normal colon tissues [J]. Biochim Biophys Acta,2006,1757(5-6): 618-623.
[19]Greaves LC,Barron MJ,Plusa S,et al. Defects in multiple complexes of the respiratory chain are present in ageing human colonic crypts [J]. Exp Gerontol,2010,45(7-8): 573-579.
[20]Venkatesan T,Zaki EA,Kumar N,et al. Quantitative pedigree analysis and mitochondrial DNA sequence variants in adults with cyclic vomiting syndrome [J]. BMC Gastroenterol,2014,14: 181.
[21]Wang WF,Li X,Guo MZ,et al. Mitochondrial ATP 6 and 8 polymorphisms in irritable bowel syndrome with diarrhea [J]. World J Gastroenterol,2013,19(24): 3847-3853.
[22]Sifroni KG,Damiani CR,Stoffel C,et al. Mitochondrial respiratory chain in the colonic mucosal of patients with ulcerative colitis [J]. Mol Cell Biochem,2010,342(1-2): 111-115.
[23]Santhanam S,Venkatraman A,Ramakrishna BS. Impairment of mitochondrial acetoacetyl CoA thiolase activity in the colonic mucosa of patients with ulcerative colitis [J].Gut,2007,56(11): 1543-1549.
[24]Restivo NL,Srivastava MD,Schafer IA,et al. Mitochondrial dysfunction in a patient with crohn disease: possible role in pathogenesis [J]. J Pediatr Gastroenterol Nutr,2004,38(5): 534-538.
[25]Damiani CR,Benetton CA,Stoffel C,et al. Oxidative stress and metabolism in animal model of colitis induced by dextran sulfate sodium [J]. J Gastroenterol Hepatol,2007,22(11): 1846-1851.
[26]B?r F,Bochmann W,Widok A,et al. Mitochondrial gene polymorphisms that protect mice from colitis [J]. Gastroenterology,2013,145(5): 1055-1063,e3.
(責任編輯:馬 軍)
Effect of mitochondrial genome on digestive diseases
GUO Xiaoxu,WANG Weifeng
Department of Gastroenterology,General Hospital of PLA,Beijing 100853,China
The mitochondrion is an organelle where ATP production occurs.Meanwhile,it is the only organelle in which extrachromosomal DNA can be found in human. The mitochondrial genome in human is a small one,which contains 2 rRNA genes and 22 tRNA genes as well as 13 genes that encodes proteins that are the parts of the electrontransport chain.The subunit 6 and 8 of the ATPase are encoded by mt-ATP6 and mt-ATP8 from the mitochondrial genome.The abnormality of the mitochondrial DNA is found to be responsible for mitochondrial diseases.It is also reported that mutations in genes of the mitochondrial DNA are associated with aging,tumorigenisis,functional gastrointestinal diseases,inflammatory bowel disease and so on. Hereby,the role of mitochondrial DNA in the pathogenesis of digestive diseases,with special focus on digestive tumors,premalignant lesions and functional gastrointestinal diseases was reviewed in this article.
Mitochondrial genome; Extrachronmosomal DNA; ATPase; Digestive system diseases
10.3969/j.issn.1006-5709.2016.04.031
國家自然科學基金面上項目(81370489);海南省自然科學基金 (814326)
郭曉旭,碩士研究生,研究方向:消化系統疾病。E-mail:1021455107@qq.com
王巍峰,醫學博士,副主任醫師,副教授,碩士生導師,研究方向:胃腸動力的基礎和臨床及消化內鏡新技術。E-mail:wangphd126@126.com
R57
A
1006-5709(2016)04-0472-04
2015-05-07