潘泳嘉,周遵春,王擺,高杉,孫紅娟,關曉燕,董穎,閆喜武
1. 大連海洋大學,大連 116023 2. 遼寧省海洋水產科學研究院,大連 116023
苯系物聯合暴露仿刺參管足轉錄組差異表達基因分析
潘泳嘉1,2,周遵春2,*,王擺2,#,高杉2,孫紅娟2,關曉燕2,董穎2,閆喜武1
1. 大連海洋大學,大連 116023 2. 遼寧省海洋水產科學研究院,大連 116023
為了分析苯系物(BTEXs)聯合暴露后仿刺參(Apostichopus japonicus)管足轉錄組差異表達基因,采用Illumina HiSeqTM2000測序技術,對1.0 mg·L-1苯系物(B)聯合暴露12 h后和對照組(C)的仿刺參管足組織分別進行轉錄組測序。經Trinity軟件進行de novo組裝,獲得了145 675條unigenes。利用公共數據庫進行同源比對,共注釋了35 330條unigenes。對比分析苯系物聯合暴露組和對照組的轉錄組測序結果,獲得了2 418個差異表達基因(DEGs) (|Log2Fold changes| ≥ 1且FDR ≤ 0.001),其中,上調表達和下調表達基因分別為1 049和1 369個。GOseq分析結果顯示,158個DEGs顯著富集在149個GO terms中,包括103個生物學過程、17個細胞組分和29個分子功能(P < 0.05);KEGG代謝通路分析結果顯示994個差異基因映射到268條代謝通路,這些差異表達基因參與的生理過程與其他生物的同源基因參與的信號傳導、癌癥、外源性化合物的生物降解代謝等過程相類似。上述結果為在轉錄組水平篩選苯系物的生物標志物,解析苯系物對仿刺參毒性作用的分子機制提供了科學參考。
苯系物;仿刺參;管足;差異表達基因;轉錄組測序
苯系物(BTEXs)包括苯(Benzene)、甲苯(Toluene)、乙基苯(Ethylbenzene)和二甲苯(Xylene)[1],具有較強的生物毒性作用。苯系物中的苯是致癌物,可導致白血病和淋巴瘤[2],引起染色體斷裂和阻礙染色體分離[3];甲苯具有神經毒性和致畸作用[4-5];乙基苯可以誘導細胞色素P450(Cytochrome P450, CYP)和細胞色素-c-還原酶系統,也是線粒體解偶聯劑,長期的乙基苯暴露,則會造成呼吸系統和腎臟損傷[6-7];二甲苯對人的神經系統、肝臟和腎臟具有損傷作用[8];此外,苯系物作為全球生產和使用最為廣泛的50種有機化合物之一,也是水環境中優先控制污染物之一。苯系物隨著海洋……