張文明,張媛媛,林燕萍(福建中醫(yī)藥大學(xué),福建福州350122)
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miRNA調(diào)節(jié)骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞成骨分化作用研究
The effects of imRNA in regulating osteogenic differentiation of bone marrow mesenchymal stem cells
張文明,張媛媛,林燕萍
(福建中醫(yī)藥大學(xué),福建福州350122)
關(guān)鍵詞成骨分化;miRNA;BMSCs
miRNA是一類(lèi)具有轉(zhuǎn)錄后調(diào)控功能作用的單鏈小RNA。從1993年在秀麗線(xiàn)蟲(chóng)發(fā)育時(shí)期發(fā)現(xiàn)第一個(gè)miRNA后,miRNA的研究取得巨大突破,目前在多種生物體內(nèi)發(fā)現(xiàn)數(shù)量龐大的miRNA,并且觀察到miRNA具有極其豐富的生物學(xué)功能,對(duì)生物體的發(fā)育代謝凋亡過(guò)程均具有調(diào)控作用。miRNA是一種非編碼的小RNA,長(zhǎng)度約為19~25個(gè)核苷酸,具有高度保守性。大約占到整個(gè)人類(lèi)基因組的1%,調(diào)控人類(lèi)30%以上基因的表達(dá)。參與各種生物體細(xì)胞早期發(fā)育和生長(zhǎng)、增殖、分化、分裂以及凋亡,并且參與重要基因的調(diào)控、體液調(diào)節(jié)、組織重建、內(nèi)分泌調(diào)節(jié),對(duì)疾病的發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)歸都具有重要影響[1-3]。其在多種生物體內(nèi)具有高度保守性,在不同的生物體系均起著關(guān)鍵作用,促進(jìn)快速應(yīng)答與機(jī)體生理和結(jié)構(gòu)的精確調(diào)控。它們基于與靶基因的3′非翻譯區(qū)序列互補(bǔ),從而對(duì)靶基因進(jìn)行降解或抑制,達(dá)到調(diào)控蛋白質(zhì)表達(dá)的目的。
miRNA可通過(guò)兩種不同的機(jī)制來(lái)達(dá)到對(duì)靶基因的調(diào)控:mRNA剪切與翻譯抑制。近期多數(shù)研究均表明,miRNA抑制或沉默靶基因mRNA的方式,決定于其與靶基因3′非翻譯區(qū)序列互補(bǔ)的程度。當(dāng)miRNA與靶基因mRNA的3′非翻譯區(qū)序列完全互補(bǔ)時(shí)即可導(dǎo)致mRNA降解,當(dāng)miRNA與靶基因3′非翻譯區(qū)序列不完全互補(bǔ)時(shí)可以導(dǎo)致mRNA抑制,說(shuō)明miRNA與靶基因mRNA相互配對(duì)程度決定了其對(duì)靶基因調(diào)控的方式。由于多數(shù)miRNA與靶基因mRNA完全互補(bǔ)程度并不高,目前發(fā)現(xiàn)miRNA對(duì)靶mRNA的主要作用方式主要是抑制作用。同時(shí)miRNA也可上調(diào)靶基因的表達(dá),從而對(duì)靶基因起到正性調(diào)控作用。研究表明大約40%~90%編碼蛋白的基因3′非翻譯區(qū)均存在miRNA靶作用點(diǎn)[4],目前認(rèn)為人類(lèi)基因組中有1 048條miRNA[5],而人類(lèi)30%~40%的基因在翻譯水平受miRNA的調(diào)控[6]。單個(gè)miRNA可以有多個(gè)靶基因mRNA,單個(gè)基因也可以被多個(gè)miRNA調(diào)控[7]。
miRNA的靶mRNA主要是細(xì)胞生物學(xué)過(guò)程中的轉(zhuǎn)錄因子、調(diào)節(jié)因子、生長(zhǎng)因子等,研究miRNA的功能主要通過(guò)研究其與靶基因的關(guān)系,其作用機(jī)制為miRNA 5′端的種子區(qū)與其靶基因3′UTR區(qū)結(jié)合,說(shuō)明只要找到細(xì)胞中miRNA的靶mRNA,就可以研究細(xì)胞中該miRNA的作用,靶基因的確定至關(guān)重要。由于miRNA及其靶基因mRNA序列在物種間具有高度保守性,這為miRNA的預(yù)測(cè)奠定了基礎(chǔ)。目前研究miRNA-靶mRNA之間相互作用的方法包括:靶基因預(yù)測(cè)軟件預(yù)測(cè)、熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)、構(gòu)建載體上調(diào)miRNA的表達(dá)和下調(diào)miRNA的表達(dá)檢測(cè)目標(biāo)mRNA。其中利用表達(dá)譜分析和生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)靶基因?yàn)閙iRNA功能研究提供大量線(xiàn)索。利用生物信息學(xué)技術(shù)用計(jì)算機(jī)軟件預(yù)測(cè)靶mRNA后,還需通過(guò)蛋白基因組學(xué)實(shí)驗(yàn)研究來(lái)驗(yàn)證靶基因的可靠性。根據(jù)miRNA調(diào)控機(jī)制的不同,實(shí)驗(yàn)研究驗(yàn)證分為兩個(gè)方面:通過(guò)對(duì)降解產(chǎn)物的逆轉(zhuǎn)錄和克隆測(cè)序可以完成對(duì)靶基因mRNA降解作用的驗(yàn)證。對(duì)于翻譯抑制機(jī)制,需要采用熒光素酶報(bào)告基因系統(tǒng),構(gòu)建載體上調(diào)和下調(diào)miRNA對(duì)靶mRNA進(jìn)行雙熒光驗(yàn)證、蛋白組學(xué)分析。
成骨細(xì)胞來(lái)源于骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞(bone marrow mesenchymal stem cells,BMSCs)[8],即決定骨形成的成骨細(xì)胞由BMSCs分化成熟而來(lái),BMSCs的數(shù)量和成骨分化功能直接影響成骨細(xì)胞的數(shù)量和功能活性,因此BMSCs向成骨細(xì)胞分化對(duì)維持骨穩(wěn)態(tài)非常重要。那么miRNA在BMSCs向成骨細(xì)胞分化中有何作用呢?2008年,Kobayashis發(fā)現(xiàn)在敲除了小鼠的內(nèi)切核酸酶Dicer后,小鼠BMSCs成骨分化功能消失[9]。小鼠軟骨細(xì)胞數(shù)量明顯減少,軟骨生成減少,密度下降。Dicer是miRNA合成所必需的一個(gè)內(nèi)切酶,說(shuō)明miRNA在骨形成和發(fā)育中有重要作用[10]。BMSCs的增殖活性與成骨分化過(guò)程均與miRNA密切相關(guān)。BMSCs成骨分化過(guò)程涉及多條信號(hào)通路,如BMP信號(hào)通路、Wnt信號(hào)通路、TGF-β通路、Notch信號(hào)通路等[11]。一般來(lái)說(shuō)miRNA對(duì)基因進(jìn)行負(fù)性調(diào)控,因此miRNA對(duì)成骨分化的作用可以是作用于促進(jìn)成骨的基因而抑制成骨,也可以是作用于抑制成骨作用的基因,從而間接地對(duì)成骨進(jìn)行正性調(diào)控[12]。
2.1促進(jìn)成骨分化的miRNA
Li Z等[13]發(fā)現(xiàn)在MC3T3細(xì)胞成骨分化過(guò)程中,miR-29b可以通過(guò)作用于抑制成骨的靶基因HDAC4、TGF-β3、ACVR2A,通過(guò)降解作用,阻止其表達(dá),從而促進(jìn)成骨。此外還有研究發(fā)現(xiàn)miR-29a通過(guò)抑制DKK1來(lái)激活WNT通路,通過(guò)與WNT通路形成循環(huán)來(lái)促進(jìn)成骨分化[14]。同樣,也有研究發(fā)現(xiàn)miR-27可以抑制靶基因APC,從而反激活WNT促進(jìn)成骨分化[15]。Liu Y等[16]認(rèn)為miR-17可能通過(guò)抑制牙周膜間充質(zhì)干細(xì)胞成骨分化的負(fù)性調(diào)控因子Smurf1,從而促進(jìn)牙周膜間充質(zhì)干細(xì)胞的成骨分化。He J等[17]發(fā)現(xiàn)miR-20b通過(guò)與其靶基因PPARγ結(jié)合,降低PPARγ的表達(dá),從而提高了成骨核心轉(zhuǎn)錄因子Runx2轉(zhuǎn)錄,促進(jìn)成骨分化。該研究認(rèn)為PPARγ通過(guò)促進(jìn)成酯分化,抑制成骨分化的轉(zhuǎn)錄因子。Zhou Q等[18]用伊班磷酸鈉干預(yù)牙周膜間充質(zhì)干細(xì)胞后發(fā)現(xiàn),miR-18及相關(guān)成骨轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)上升,表明miR-18可能在伊班磷酸鈉促進(jìn)牙周膜間充質(zhì)干細(xì)胞成骨分化過(guò)程中起到正性調(diào)控作用。miR-210在ST2成骨分化過(guò)程中可能通過(guò)沉默抑制成骨分化的重要基因AcvR1b來(lái)促進(jìn)成骨,過(guò)表達(dá)miR-210后堿性磷酸酶、成骨核心結(jié)合因子Runx2的表達(dá)上升[19]。
2.2抑制成骨分化的miRNA
Wei J等[20]發(fā)現(xiàn),miR-34b和miR-34c作為miR-34家族的2個(gè)成員通過(guò)兩條途徑來(lái)實(shí)現(xiàn)抑制成骨的作用,一方面CDK4、CDK6和CyclinD1蛋白積累等被miR-34b和miR-34c所阻礙,從而抑制了成骨細(xì)胞的數(shù)量;另一方面SATB2蛋白的表達(dá)降低從而抑制成骨細(xì)胞的分化。Li Z等[21]發(fā)現(xiàn)在BMP2誘導(dǎo)的C2C12細(xì)胞成骨分化中,對(duì)其中顯著下調(diào)的miR-133和miR-135進(jìn)行研究后發(fā)現(xiàn),miR-133的靶基因?yàn)镽unx2,而miR-135的靶基因?yàn)镾mad5,兩者共同作用來(lái)抑制骨的形成。那么在臨床上可以通過(guò)降低miR-133和miR-135的表達(dá)來(lái)促進(jìn)成骨作用,最終達(dá)到改善骨重建的作用。Wang X等[22]研究發(fā)現(xiàn)老年骨折患者的骨組織中高表達(dá)miR-214,miR-214是通過(guò)作用于活化轉(zhuǎn)錄因子4ATF4來(lái)降低成骨作用的。在動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中miR-214也被證實(shí)具有抑制成骨細(xì)胞活性的作用。Eskildscn T等[23]發(fā)現(xiàn)miR-138可以直接作用于成簇黏附激酶FAK,抑制FAK-ERK1/2信號(hào)通路,從而降低下游成骨核心結(jié)合因子Runx2和OSX的表達(dá)來(lái)降低成骨作用。同樣,在人骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞中過(guò)表達(dá)miR-138后骨形成下降,低表達(dá)miR-138后成骨作用增加。Zeng Y等[24]發(fā)現(xiàn)miR-100抑制干細(xì)胞成骨分化,該作用通過(guò)降低骨形態(tài)發(fā)生蛋白受體BMP-2來(lái)實(shí)現(xiàn)。Gao J[25]分離培養(yǎng)人的BMSCs后在成骨分化過(guò)程中篩選分化前后miRNA差異最大的hsa-miR-31、hsa-miR-106a、hsa-miR-148a,并且發(fā)現(xiàn)這些miRNA可能通過(guò)成骨核心結(jié)合因子Runx2、CBFB和BMPs起作用。Schaap-Oziemlak A M等[26]發(fā)現(xiàn)hsa-miR-135b可能作用于IBPS和Osterix,在無(wú)限成體干細(xì)胞(USSCs)中顯著下調(diào)。同樣miR-637在間充質(zhì)干細(xì)胞向成骨細(xì)胞分化中表達(dá)也降低,可能也是通過(guò)靶基因Osterix起作用的。
研究證實(shí)miRNA幾乎參與了生物學(xué)行為中所有的基因調(diào)控通路,具有極強(qiáng)的調(diào)控作用。miRNA對(duì)干細(xì)胞自我更新和分化調(diào)控機(jī)制是必須要明確的,也是目前科學(xué)家正在努力研究的熱點(diǎn)課題。生物,包括人類(lèi),在對(duì)環(huán)境適應(yīng)及進(jìn)化過(guò)程中伴隨著頻繁而持續(xù)的基因—基因和基因—環(huán)境相互作用,miRNA的高度保守性決定了其非常適合研究基因—基因和基因—環(huán)境相互作用。針對(duì)某種特殊疾病的病理,可能對(duì)某些特定表型具有陽(yáng)性或陰性效應(yīng)的miRNA基因,用生理及遺傳病理模型評(píng)估陽(yáng)性miRNA與蛋白編碼基因潛在作用靶點(diǎn)的關(guān)系,從而用于疾病的診斷與治療,可能將成為未來(lái)基因與疾病研究的熱點(diǎn),miRNA基因效應(yīng)的分子生理學(xué)認(rèn)識(shí)可能會(huì)帶來(lái)直達(dá)作用靶點(diǎn)的治療。
在一些增齡性疾病如絕經(jīng)后骨質(zhì)疏松癥(PMOP)的研究中,經(jīng)過(guò)生物信息學(xué)預(yù)測(cè)及基因芯片的篩選,發(fā)現(xiàn)某些特定的miRNA可能控制著B(niǎo)MSCs向成骨細(xì)胞分化,這些miRNA通過(guò)降低或提高成骨關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子來(lái)抑制或促進(jìn)BMSCs的成骨分化過(guò)程。越來(lái)越多的證據(jù)顯示,某些miRNA調(diào)控作用具有高度保守性,在進(jìn)化過(guò)程中以及不同物種間還保持完整的作用??梢酝ㄟ^(guò)檢測(cè)絕經(jīng)前后患者骨組織或血液、體液中的特異基因miRNA,由此來(lái)進(jìn)行PMOP的診斷。而進(jìn)一步發(fā)展和調(diào)整miRNA干擾載體,使它能在BMSCs成骨分化中起到促進(jìn)成骨作用,從而預(yù)防和治療PMOP,這將是一種全新的PMOP診治模式。但成骨過(guò)程中有多少特異性miRNA參與對(duì)BMSCs生物學(xué)行為調(diào)控?這些特異性miRNA又如何調(diào)控促進(jìn)代謝性骨病的發(fā)生?能否通過(guò)降低或提高特異性miRNA改變BMSCs的生物學(xué)特性?有待于我們進(jìn)一步研究。
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(編輯:梁葆朱)
中圖分類(lèi)號(hào):Q522
文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A
文章編號(hào):1671-0258(2016)02-0060-03
[基金項(xiàng)目]國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(81173282)
[作者簡(jiǎn)介]張文明,在讀博士,E-mail:393390125@qq.com
[通訊作者]林燕萍,教授,博士研究生導(dǎo)師,E-mail:lyp66@126.com