葡萄糖激酶基因3個(gè)標(biāo)簽單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)與2型糖尿病的相關(guān)性研究*

張秀明,孫各琴,羅楚君,李晶晶,韓　慧,陳　瓊

(1.廣東省深圳市羅湖醫(yī)院集團(tuán)醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中心　518000;2.中山大學(xué)附屬中山醫(yī)院，廣東中山 528403)

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葡萄糖激酶基因3個(gè)標(biāo)簽單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)與2型糖尿病的相關(guān)性研究*

張秀明1,孫各琴2,羅楚君2,李晶晶2,韓慧2,陳瓊2

(1.廣東省深圳市羅湖醫(yī)院集團(tuán)醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中心518000;2.中山大學(xué)附屬中山醫(yī)院，廣東中山 528403)

目的探討葡萄糖激酶(GCK)基因3個(gè)標(biāo)簽單核苷酸多態(tài)性(tagSNPs)位點(diǎn)rs2971672、rs2268573、rs2300587與2型糖尿病的關(guān)系。方法選取2013年8月至2014年12月在中山大學(xué)附屬中山醫(yī)院住院的中國(guó)南方漢族2型糖尿病患者499例(2型糖尿病組)，同時(shí)選擇同期在該院康體保健中心體檢的漢族健康人499例作為對(duì)照組，對(duì)GCK基因的3個(gè)tagSNPs位點(diǎn)采用改良多重高溫連接酶檢測(cè)反應(yīng)技術(shù)(iMLDR)進(jìn)行基因分型，應(yīng)用Hardy-Weinberg平衡規(guī)律檢測(cè)標(biāo)本代表性，采用χ2檢驗(yàn)、Logistic回歸分析比較2型糖尿病組和對(duì)照組基因型和等位基因頻率的差異，并在加性、顯性和隱性3種遺傳模型下對(duì)各SNP位點(diǎn)進(jìn)行相關(guān)性分析。應(yīng)用Haploview軟件構(gòu)建GCK基因3個(gè)tagSNPs位點(diǎn)的單體型，分析是否存在連鎖不平衡(LD)及不同的GCK單體型與2型糖尿病易感性的關(guān)系。結(jié)果rs2268573、rs2300587的基因型(χ2=3.361、2.076，均P>0.05)和等位基因頻率(χ2=0.222、1.980，均P>0.05)在2型糖尿病組和對(duì)照組之間差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。rs2971672的基因型(χ2=6.896，P<0.01)和等位基因分布(χ2=4.708，P<0.05)在2型糖尿病組和對(duì)照組之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。在顯性遺傳模式下以及在加性遺傳模式下，rs2971672的基因型分布在2型糖尿病組和對(duì)照組之間的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(顯性遺傳模式下OR=1.74，95%CI：1.17～2.57，P<0.01；加性遺傳模式下OR=1.51，95%CI：1.06～2.14，P<0.05)。GCK基因3個(gè)位點(diǎn)中的rs2971672和rs2300587有一個(gè)LD域，其中TC、TA、CA3種主要單體型，單體型TA和CA均降低個(gè)體患2型糖尿病的風(fēng)險(xiǎn)，OR值分別為0.81(95%CI:0.66～1.00，P<0.05)和0.78(95%CI:0.62～0.98，P<0.05)。結(jié)論在漢族人群中，GCK基因區(qū)域的rs2971672位點(diǎn)與糖尿病遺傳易感性密切相關(guān)，而rs2268573、rs2300587位點(diǎn)與糖尿病遺傳易感性無(wú)明確相關(guān)性。rs2971672和rs2300587的LD域單體型TA和CA均降低個(gè)體患2型糖尿病的風(fēng)險(xiǎn)。

2型糖尿病；基因；葡萄糖激酶；多態(tài)性，單核苷酸

糖尿病是一組由胰島素分泌不足或新陳代謝紊亂所導(dǎo)致的高血糖病。據(jù)估計(jì)，2013年在中國(guó)就有9 800萬(wàn)糖尿病患者，居世界首位[1]。遺傳因素在糖尿病的發(fā)生和發(fā)展中起重要作用。全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)是一種通過(guò)對(duì)大規(guī)模人群進(jìn)行測(cè)試、統(tǒng)計(jì)，從而發(fā)現(xiàn)與疾病表型或相關(guān)性狀關(guān)聯(lián)的遺傳位點(diǎn)的關(guān)聯(lián)研究[2]，一般以單核苷酸多態(tài)性(SNPs)作為標(biāo)記物[3]。近年……