王鵬
64位博士組團盯上基因數據分析,能讓癌癥變得可控嗎
王鵬
2月3日,已臨近新年,余偉師還在公司忙得不可開交。下午5點,見完投資人,他又匆匆趕回微軟創投加速器工作。目前,他和他的創始團隊10多名成員都在這里辦公。賽福基因是入駐微軟創投加速器的第7期項目之一。這份機會也來之不易,1400份申請,最后只有20個項目成功入圍。
當然,歷經半年,他們不得不從這里搬走,一是因為他們將從微軟創投加速器“畢業”,新的項目將入駐,二是因為公司的核心團隊將陸續回國,他們需要更大的“戰場”。
A.他們是誰?
這是一支跨專業有機整合了64位海外華人博士的技術團隊,創始人兼CEO余偉師曾是美國國立衛生研究院科學家,技術總監劉湘濤是耶魯大學應用數學博士,市場負責人賈洪濤是俄亥俄州立大學生物醫學博士,運營負責人梁萌萌是南加州大學病理生物學博士。
B.他們在做什么?
打造一個基因數據智能分析平臺,為醫生、患者提供精準的疾病分類和診療建議,將癌癥轉為可控慢性病,為亞健康人群提供個性化健康管理措施。
C.融資狀況?
已完成天使輪融資,但尚未對外披露具體投資方和投資金額。
中國近年來癌癥及患病人群劇增,“我們國家每5分鐘有21人因為癌癥死亡,每5分鐘有35人被診斷為癌癥,我們肩上的責任還很重。”余偉師說。
十年前,還在讀碩士的余偉師就已經開始研究基因與疾病、基因與癌癥的關系。2005年至2010年,他先后在國際知名雜志上發表了7篇基因與遺傳疾病、基因和癌癥發生相關的論文。2011年,他進入美國國立衛生研究院從事博士后研究,主要研究干細胞和誘導干細胞分化的表觀遺傳學機制。期間他又發表了數篇具有國際影響力的文章,并獲得了美國政府近150萬美元的個人科研經費,以及晉升為研究員和杰出人才通道的綠卡申請機會。
然而十載寒窗,余偉師逐漸認識到疾病,尤其是癌癥治療的復雜性,是他一個人每天待在實驗室里永遠也無法讀懂的世界。要想真正解決人類面臨的這一難題,他必須走出實驗室,和更多志同道合的專家們一起,充分接觸臨床,去和醫生們合作親自解決各種問題。
由于“人種差異大”,余偉師認為歐美基因庫案例雖然對人類疾病的了解有著重要的作用,但對中國人參考價值有限,一種“多年的知識儲備無用武之地”的落寞油然而生,與此同時,身邊不斷有朋友或者親屬死于癌癥的噩耗傳來,回國創業的念頭在他心里生根發芽。
在一些聚會上,他和身邊的華人博士交流,發現大家都深有同感,他們都迫切的希望能將自己所學應用到實踐中去,能幫助到那些正處于疾病痛苦中的同胞。“探索之路漫漫,有了同伴的互相攙扶,我立刻就不感到孤單了。”
考慮到中國基因數據分析市場成本高、時效低,且精準解析的維度欠缺。余偉師決心建立中國人自己的自動化數據分析平臺。
在美國,2013年余偉師和他的4個同伴一起組建了早期團隊,最初的目的也很簡單,就是想利用他們在醫學領域的跨學科的優勢準確高效地解析人類基因組大數據,為醫生、患者提供精準的疾病分類和診療建議。
2013年10月,余偉師團隊接收了一份來自廣東省中山醫院的病例全基因數據,這是他們的第一次團隊協作。
接到第一單,余偉師等5人興奮得不得了,連軸轉工作了一周,在數據提供方隱去臨床診斷結果的前提下,他們通過分析該患者的基因數據最終將此病例判斷為“結腸癌”患者,并給出了藥物治療的方案。而同時參與這次基因大數據分析的另外一家國際知名機構花了一個月的時間最終卻給出了一個“樣本出錯”的結論。(應余偉師要求,此處隱去該機構名稱。)
余偉師介紹稱,進行基因大數據分析除了要過硬的專業知識和算法外,還要能夠判斷哪些信號是雜質和噪音,“因為癌旁正常組織和腫瘤組織并不是絕對單一的,當醫學領域的不同學科的人交叉合作時,就擁有了更強的辨別能力”。
2014年,余偉師團隊完成了第一階段的技術攻克,并在美國與各大癌癥中心進行臨床測試,同時也與國內多家知名醫院完成了技術測試。經過短短兩年時間,當初的5人團隊已經壯大成64個分別來自分子醫學、生物信息學、分子遺傳學等各個研究領域的國際頂尖人才。
他們利用生物信息學與云計算正在開發出智能化、全自動的基因數據分析系統平臺,在實現復雜基因數據的精準解析度基礎上,能使成本降低50%~80%。
2015年10月,余偉師放棄了在美國所獲得的一切成果,回國加入了創業大潮,“我們希望能夠團結帶動更多的科學家投入到這個事業中,幫助醫生實現精準治療,將癌癥真正轉變為可控的慢性病”。
據余偉師介紹,在目前的64位國際頂尖人才中,有20多人已成為賽福基因的核心成員,據不完全統計,團隊核心成員在精準醫療領域發表的論文600篇之多,其中生物信息學基因數據分析相關論文200余篇。
未來核心成員會陸續回國參與到公司的全職經營中來,賽福基因也為他們預留了豐厚的股權作為激勵。而其他成員多在美國各大癌癥研究機構工作,以基因公司科學顧問的角色繼續通力合作為賽福基因提供技術支持。
也在此時,正好趕上微軟創投加速器招收項目,微軟創投大中華區負責人杜楓介紹稱,微軟創投加速器招收項目有三個標準:一是廣闊的市場,二是團隊要最有可能解決這個問題,三是技術要具有領先性。
“賽福基因剛好具備這三點,所以他們可以從1400份申請中脫穎而出,成為了微軟創投加速器第7期項目中唯一的生物醫學方向的團隊。”杜楓說。
目前,賽福基因主要為醫院和醫療科研單位提供基因大數據分析服務,所以他們也是一家B2B的公司,“現在國內有很多機構具備了基因檢測能力,也誕生了很多基因檢測公司,但是卻缺乏專業的生物信息分析的團隊,我們可以直接和他們對接”。
在對接醫院方面,賽福基因的服務對象有兩個,一個是給臨床醫生提供患者的個性化治療建議,另一個是基于臨床案例給醫院提供大數據樣本的分析報告。
“北京大學腫瘤醫院的沈琳副院長曾搜集了15對胃腸間質瘤的樣本,這是胃癌里面非常罕見的一種疾病,我們幫他做了基因數據分析后,對于她未來的臨床治療起到了很大的幫助,她也特別滿意。”
在數據來源上,主要由醫院、第三方檢測機構、體檢中心等幾方面提供。為了讓記者更形象地理解基因數據分析的難度,余偉師打了個比方,如果對一個人進行全基因組測序,根據測序深度不同,大概會產生300G到1000G的內容,而賽福基因要做的就是從1000G的內容中挖掘出幾KB的關鍵信息,供醫院和科研機構使用。
“當我們生物信息團隊將突變的基因位點篩查出來后,分子醫學和遺傳學的博士團隊就發揮作用了,他們深耕于人類疾病的不同領域,知曉不同的位點和疾病之間的關聯,最終和臨床信息相結合,輔助醫生制定更精準的治療方案。”余偉師說。
在余偉師看來,他們團隊強大的基因數據分析能力得益于團隊成員的學科交叉,“特別是癌癥是一種復雜的基因組疾病,要想篩查出涉及疾病的關鍵位點,就必須具備過濾基因數據噪音的能力以及對疾病信號通路的精確把握,這需要不同專業的頂尖人才的相互碰撞和探討交流,才能完成。”
杜楓介紹稱,基因產業是新興產業,目前就像一片汪洋大海上浮出了幾個小島,剩下的大部分信息還在水下,“所以基因行業還沒有A+B一定等于C,只有A+B可能會推導出C”。
“基因數據分析其實就像在繪制海圖,把大洋上的島嶼一個個挖掘并連接起來,怎么才能連接起來時,很多人都在探索的問題,賽福基因走得稍微早一點,他們將這些醫學領域的教授和博士聯結起來,其他人要繪制‘海圖’也得這么做。”杜楓說。
在余偉師看來,賽福基因能順利走上基因數據分析的商業化道路與基因檢測技術的日益成熟,成本也大幅度降低密不可分,因為這使普通患者基因測序成為可能。
2003年,進行一次個人的全基因測序需要30億美金;2011年,喬布斯患胰腺癌,進行DNA測序花費10萬美元,雖然價格縮水了10000倍,但依舊非常人所能承受;2015年基因測序的費用降到了1000美金,價格再次大幅降低,參與測序的人數增加為基因數據分析提供了商業化可能。
值此契機,余偉師決定在該領域深挖,他也看到了一個案例一個案例地去進行基因數據分析的低效和繁瑣,為了讓基因數據更高效地實現精準解析,他們正在籌劃構建一個基因數據的智能分析系統,醫生和科研人員在該系統中自助式的導入樣本數據,利用后臺的算法模型,就可以高效地得到自己想要的分析結果。
余偉師介紹稱,利用生物信息學與云計算開發出智能化、全自動的基因數據分析系統平臺,使成本降低50% ~80%,能實現復雜基因數據的精準解析度。
長期而言,賽福基因還希望在智能分析系統基礎上建立一個可視化系統及云服務端口,使醫生與科學家之間的交流效率提升到一個新的次元。“在這個智能分析平臺上,我們還會對亞健康人能夠提供一些個性化的健康管理的措施,給醫藥研究院提供動態的數據分析,加強精準醫療在癌癥治療上的應用。”
近兩年來,世界各國政府紛紛以各種方式支持精準醫療計劃發展,加速該領域的產業化。其中,基因檢測被《時代》雜志評選為“50項最重要發明”榜首,業內普遍認為精準醫療計劃將催生上萬億的市場,其中基因檢測服務業五年內或達到百億級。
在余偉師看來,精準醫療計劃處于疾病診療的風口,將會全面推動傳統醫療的變革,掀開疾病個體化治療的新篇章。“隨著精準醫療時代的開啟,無論是B端還是C端都將前景廣闊,對此我們深信不疑。”
不過,余偉師也表示看到了目前國內市場的魚龍混雜,沒有出現相關的行業標準,“目前賽福基因公司正在贏得國內相關權威部門的支持,我們正在積極地與此行業的各方進行磋商,希望能憑借我們在美國參與精準醫療計劃積累的經驗幫助中國在基因測序整體行業的發展貢獻自己的力量。”
(稿件來源:《新京報》)