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基因芯片高通量對ALDH2基因多態性檢驗及生活習慣與胃癌易感性的關系

2017-06-26 11:21:10徐建國
實用癌癥雜志 2017年3期
關鍵詞:胃癌差異分析

徐建國

?

基因芯片高通量對ALDH2基因多態性檢驗及生活習慣與胃癌易感性的關系

徐建國

目的 通過基因芯片高通量研究ALDH2基因多態性的檢驗以及以ALDH2基因多態性研究結果與生活習慣和胃癌易感性的相關性研究。方法 隨機選161例胃癌患者相關資料作為研究組資料,以及150例正常人群體檢資料作為對照組資料,通過DNA芯片的高通量測序研究ALDH2基因多態性檢驗以及患者生活習慣一般資料。結果 檢測結果表明,吸煙和飲酒、熱食速食暴食、喜好腌制與辛辣食物等都可能是消化道癌癥的危險因素,所有患者對比結果顯示:男性吸煙更多,飲酒熱食速食暴食生活習慣方面男女比例相差不多,喜好腌制與辛辣食物以女性比例多于男性;所有患者ALDH2基因多態性分為3種,3種基因多態性組間比較,差異顯著,P<0.05;男女患者ALDH2基因多態性遺傳平衡性檢驗結果分析,差異顯著,P<0.05。DNA芯片的高通量測序研究ALDH2基因多態性檢驗結果表示,ALDH2基因多態性中基因分布差異與胃癌易感以及不良生活習慣評分均呈正相關性。結論 通過DNA芯片的高通量測序研究ALDH2基因多態性檢驗,對胃癌早期診斷有臨床效用價值,并且生活習慣與ALDH2基因多態性檢驗存在相關性,且與胃癌易感性存在相關性因素。

基因芯片;ALDH2基因;多態性檢驗;易感性;生活習慣;胃癌

(ThePracticalJournalofCancer,2017,32:435~437)

惡性腫瘤的臨床研究過程中發現,胃癌在所有惡性腫瘤中位居首位,并且其患病機制存在地域性區別,并且呈現地域集中性發病趨勢[1]。本研究通過使用DNA芯片的高通量測序對ALDH2基因多態性進行檢驗分析,以及通過ALDH2基因多態性檢驗評估ALDH2的失活情況以及對生活習慣對胃癌易感性的相關性進行了研究,現報告如下。

1 資料與方法

1.1 臨床資料

隨即選取于2013年8月至2014年10月期間本院收治的161例胃癌患者(研究組),所有患者均依照2010年版胃癌診斷標準(WS 316-2010) 為依據,使用數字化X線胃腸造影技術確診為胃癌。男性87例,女性74例,患者年齡在57~62歲,平均年齡(60.13±2.19)歲,且所有患者一般資料比較無特殊差別,具有研究分析意義。同時選取同一時期在本院進行體檢的健康人150例作為對照,以該150例健康人資料作為對照組。

1.2 研究方法

隨機選取金華地區的161例胃癌患者,利用基因芯片技術高通量、高效率的研究ALDH2基因多態性和生活習慣與胃癌易感性的關聯,同時對基因與環境在胃癌發生中的交互作用進行探索,從而為分析對環境致癌因素敏感的個體、進行食管癌高危人群風險判斷、制定金華地區乃至我國胃癌預防干預措施等提供科學依據,以降低胃癌的發病率和死亡率。

1.3 檢測指標

對患者入院前5年內可能導致消化道癌癥的不良生活習慣資料進行統計對比。ALDH2基因檢測指標主要選取芯片上核苷酸微陣列,檢測待測供試品中的互補序列,并且檢測過程中以短寡聚核苷酸作為靶標。其中生活習慣資料對比健康人的生活習慣[2]。

1.4 統計學方法

應用SPSS 12.0軟件進行統計學分析,先進行χ2檢驗,對比組間差異性后,再進行logistic回歸分析的多因素分析,以P<0.05,差異具有統計學意義。

2 結果

2.1 兩組入院前5年內消化道癌癥的危險因素生活習慣資料比較

結果顯示:男性吸煙比例更高,飲酒熱食速食暴食生活習慣方面男女比例相差不多,喜好腌制與辛辣食物女性比例高于男性,且在吸煙和飲酒以及喜好腌制與辛辣食物方面,男女間比例也存在差異顯著性,但研究組不良生活習慣比例明顯高于對照組,見表1。

表1 兩組患者入院前5年內可能是消化道癌癥的危險因素生活習慣比較(例,%)

2.2 研究組ALDH2基因多態性遺傳平衡性檢驗結果分析

所有患者ALDH2基因多態性分為3種,3種基因多態性對比,差異顯著;男女患者ALDH2基因多態性遺傳平衡性檢驗結果比較,P<0.05,見表2。

表2 ALDH2基因多態性遺傳平衡性檢驗結果分析(例,%)

2.3 ALDH2等位基因在兩組中分布

研究組與對照組ALDH2*1頻數分別為262與226,頻率分別為75.4%與81.4%;ALDH2*2頻數分別為63與83,頻率分別為24.6%和18.6%。等位基因在2組中的分布差異無統計學意義(χ2=14.96,P=0.01)。

2.4 胃癌易感的多因素分析

ALDH2基因多態性檢驗結果分析發現:基因型、等位基因的分布差異以及不良生活習慣為胃癌易感因素(P<0.05),見表3。

表3 胃癌易感多因素分析

3 討論

在胃癌的臨床相關性研究中發現,胃癌的致病因素中,不僅僅只存在于基因方面的病變[3]。而且因為其地域性性質存在分析表明,地域性存在的不良生活習慣問題會對胃癌發病有一定的促進作用和相關性,但具體縣慣性影響在以往的研究過程中,并無確切的病理學證據,因為無對應的檢測方法證明不良的生活習慣會直接導致胃癌的發生[4-5]。本實驗中采取分析ALDH2基因多態性,在胃癌患者的基因相關性研究中發現,ALDH2基因是肝臟中酒精氧化代謝過程的關鍵酶,而且存在眾多的同工酶[6]。所以在研究過程中可以將ALDH2基因多態性作為胃癌的標志性物質進行檢驗和分析。而檢驗和分析ALDH2基因多態性本研究主要采用DNA芯片作為檢測方法,DNA芯片(DNA芯片)作為1種快速、高效、高通量的檢測方法,已經成為基因組計劃時代最重要的技術[7]。

本研究過程的研究結果表明ALDH2基因多態性在胃癌患者中確實存在,其中檢驗結果分析以基因型為GG的基因異常分布最多,并且與其他類型的基因組間比對存在差異顯著性,而等位基因分布差異以G等位基因分布差異明顯,與等位基因A組間比對存在差異顯著性,并且在基因型以及等位基因差異分析過程中發現,男女間比較,差異顯著。綜合分析結果表明吸煙和飲酒、熱食速食暴食、喜好腌制與辛辣食物等都可能是消化道癌癥的危險因素,所有患者對比結果顯示男性在吸煙的生活習慣更多,飲酒熱食速食暴食生活習慣方面男女比例相差不多,喜好腌制與辛辣食物以女性比例多于男性,且在吸煙和飲酒以及喜好腌制與辛辣食物方面; 所有患者ALDH2基因多態性分為3種,3種基因多態性組間比對,差異顯著性,男女患者ALDH2基因多態性遺傳平衡性檢驗結果分析結果組間比對,差異顯著。DNA芯片的高通量測序研究ALDH2基因多態性檢驗結果表示,ALDH2基因多態性中基因分布差異與胃癌癥狀評分以及不良生活習慣評分均呈正相關性。所以,易感性可能由于不良的生活習慣以及ALDH2基因多態性改變共同作用導致[8]。細胞中的DNA損傷的生物學后果,取決于DNA損傷的程度和細胞的修復能力。如果損傷得不到正確修復,就可能導致細胞功能的異常。DNA堿基的損傷可導致遺傳密碼子的變化,經轉錄和翻譯產生功能異常的蛋白,引起細胞功能的衰退、凋亡或發生惡性轉化;DNA交聯影響染色體的高級結構,妨礙基因的正常表達和調控,對細胞功能產生多種影響。因此,DNA損傷導致的基因組不穩定與腫瘤、衰老等多種疾病的發生有著密切關聯。眾多研究表明:DNA損傷一DNA修復異常一基因突變一腫瘤發生是貫穿腫瘤發生過程中的關鍵環節。DNA損傷修復體系相當復雜,目前己經發現某些惡性腫瘤的發生的與其易感性基因的多態性相關。

綜上所述,ALDH2基因多態性可以作為胃癌疾病的病理學標志物,所以理論上可以應用于胃癌的早期診斷并且通過ALDH2基因多態性的分析結果可以了解到,胃癌的易感性可能由于不良的生活習慣以及ALDH2基因多態性突變共同導致的結果[9]。本研究結果項目的實施將對人民身體健康、國家經濟發展、社會和諧穩定具有重大意義。

[1] 徐華明.老年胃癌患者的臨床特點分析〔J〕.中華老年醫學雜志,2013,11(6):1212-1214.

[2] 韋燕萍,高銘云,劉柳芳.營養干預對消化系統惡性腫瘤住院患者營養認知影響〔J〕.海南醫學,2013,5(11):680-682.

[3] 陳麗君,馬蕊梅,許 旺,等.寧夏回漢族環氧化酶2-1195G>A的分析〔J〕.寧夏醫科大學學報,2012,11(16):1110-1113.

[4] 姜愛仁,吳建中,高長明,等.亞甲基四氫葉酸還原酶A1298C基因多態和生活習慣相互作用與胃癌的易感性〔J〕.河北醫藥,2014,11(26):35-36.

[5] 劉 寧,張成武,王曉龍.中國人群GSTT1基因多態性與胃癌易感性關系的Meta分析〔J〕.中國普通外科雜志,2014,12(15):561-562.

[6] 李 龍,李 靜,鄭燕芳,等.胃癌患病風險基因研究進展〔J〕.腫瘤防治研究,2014,6(5):112-113.

[7] 李江奇,趙永勛,姜 雷,等.中國人群X線交錯互補修復基因1 Arg399Gln多態性與胃癌易感性關系的Meta分析〔J〕.蘭州大學學報(醫學版),2015,6(8):571-572.

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[9] 燕 速,白振忠,趙健信,等.CYP2E1 DraⅠ基因遺傳多態性與青海省胃癌人群易感性的相關性研究〔J〕.中國癌癥雜志,2013,4(30):773-774.

(編輯:吳小紅)

Genetic Polymorphisms of ALDH2 Gene and Susceptibility to Gastric Cancer by High Throughput Studies

XU Jianguo.

Qinghai People's Hospital,Xining,810001

Objective The ALDH2 gene polymorphism was studied by the high throughput of the gene chip,and the correlation between ALDH2 gene polymorphism and living habits and gastric cancer susceptibility were studied.Methods 161 patients with gastric cancer were selected as the study group,and 150 case of healthy patients was the control group.The DNA gene polymorphism and the correlation between ALDH2 gene polymorphism and susceptibility to gastric cancer were studied by high throughput sequencing of ALDH2 gene and ALDH2 gene polymorphism in the early diagnosis of gastric cancer.Results Test results showed that smoking and drinking,hot food fast food gluttony,preference of pickled and spicy food and so may be risk factors for cancer of the digestive tract,all comparative results of male patients showed more severe smoking habits,drinking hot fast food gluttony living habits almost the same proportion in men and women,preference of pickled and spicy food in the proportion of women than men,and smoking and drinking as well as pickled and spicy taste to food;ALDH2 polymorphism in all patients divided into 3 kinds,the 3 genes polymorphism groups had significant differences,P<0.05;ALDH2 gene polymorphism genetic balance of male and female patients test results analysis,the difference was significant,P<0.05.High-throughput sequencing studies ALDH2 polymorphism DNA chip test results genes expressed,ALDH2 gene polymorphism distribution between gene and gastric symptom score and bad habits rates were positively correlated.ALDH2 gene in gastric cancer patients compared with the control group,P<0.05.Conclusion The DNA chip high-throughput sequencing of ALDH2 Gene Test in the early diagnosis of gastric cancer in the process has very good clinical utility value and life habits and the ALDH2 Gene polymorphisms test correlation exists,and and susceptibility to gastric cancer exist correlation factors.

Gene chip;ALDH2 gene;Polymorphism;Susceptibility;Life habit;Gastric cancer

810001 青海省人民醫院

10.3969/j.issn.1001-5930.2017.03.026

R735.2

A

1001-5930(2017)03-0435-03

2016-05-04

2017-02-07)

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