幽門螺桿菌感染者胃內菌群特征分析

彭賢慧，周麗雅，何利華，宋志強，張建中

1.中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所，傳染病控制國家重點實驗室，北京 102206； 2.浙江省杭州市感染性疾病診治協同創新中心； 3.北京大學第三醫院消化科

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幽門螺桿菌感染者胃內菌群特征分析

彭賢慧1，2，周麗雅3，何利華1，2，宋志強3，張建中1，2

1.中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所，傳染病控制國家重點實驗室，北京 102206； 2.浙江省杭州市感染性疾病診治協同創新中心； 3.北京大學第三醫院消化科

目的 通過比較幽門螺桿菌(Helicobacter pylori，H.pylori)感染者和H.pylori陰性健康人群胃內菌群差異，探討H.pylori對胃內菌群的影響。方法 30例H.pylori感染者和30名H.pylori陰性健康志愿者胃黏膜標本，經組織研磨勻漿后提取基因組，對16S rDNA基因V3-V4高變區進行擴增，構建小片段文庫，基于Illumina HiSeq 2000測序平臺，利用250 bp Paired-End的方法進行雙末端測序。下機數據經過生物信息處理后，得到有效序列，以97%一致性將序列聚類成為OTUs，經聚類及物種注釋后獲得每個樣本在各分類水平的分布情況。比較分析兩組樣品α多樣性差異和β多樣性差異。統計分析兩組在各分類水平相對豐度變化情況。尋找因H.pylori感染引起相對豐度發生顯著變化的物種。結果 與H.pylori陰性對照組相比，H.pylori陽性組α多樣性顯著降低。β多樣性結果顯示，組內的菌群結構相似度高，而組間的菌群相似度較低。H.pylori陰性對照組內優勢菌屬為Shewanella、Streptococcus、Escherichia、Pseudomonas、Prevotella、Neisseria、Oscillospira；而H.pylori陽性組內優勢菌屬為Helicobacter、Prevotella、Pseudomonas、Fusobacterium和Streptococcus。H.pylori陽性組內Streptococcus、Prevotella、Fusobacterium、Campylobacter、Porphyromonas、Rothia、Neisseria、Heamophilus[Prevotella]、Veillonella、Leptotrichia、Actinomyces、Bulleidia相對豐度顯著升高；而陰性對照組Shewanella顯著升高。結論H.pylori能夠顯著影響胃黏膜菌群結構，H.pylori可能與胃內菌群共同促進消化性潰瘍、萎縮性胃炎、胃癌、MALT淋巴瘤的發生、發展。……