延邊株氣腫疽梭菌鞭毛蛋白FliA基因克隆及生物信息學分析

張永佳， 張 皓， 李成輝， 金 鑫

(延邊大學農學院，吉林 延吉 133002)

延邊株氣腫疽梭菌鞭毛蛋白FliA基因克隆及生物信息學分析

張永佳， 張 皓， 李成輝， 金 鑫*

(延邊大學農學院，吉林 延吉 133002)

根據氣腫疽鞭毛基因(GenBank登錄號：AB058932)的參考序列，PCR擴增并克隆延邊株氣腫疽梭菌鞭毛蛋白FliA基因。成功克隆后測序，并采用生物信息學方法對鞭毛蛋白FliA基因的蛋白質二級結構、結構功能域、三級結構及抗原表位等重要參數進行了預測和分析。結果表明：與AB058932序列相比，存在38處突變，核苷酸序列的同源性和氨基酸序列的同源性均為97%；FliA蛋白的理論等電點為6.99，不存在跨膜區和信號肽序列，二級結構以α-螺旋和β-折疊為主，主要有15個潛在B細胞抗原表位區，17個限制性CTL抗原表位區。本試驗為延邊株氣腫疽FliA蛋白功能的深入研究奠定了基礎。

氣腫疽梭菌；延邊株；FliA基因；克隆；生物信息學分析

氣腫疽梭菌(Clostridiumchauvoei)又稱肖氏梭菌、費氏梭菌，俗稱黑腿病桿菌，屬細菌綱芽孢桿菌科梭菌屬，為專性厭氧菌。是反芻動物細菌性傳染病—氣腫疽的病原菌。革蘭氏染色不規則，病料及幼齡培養物中呈革蘭氏陽性，而老齡培養菌則呈陰性。主要通過消化道和外傷感染，往往來不及治療就會導致病畜死亡。該病主要感染牛，感染癥狀為肌肉豐滿部位，如股部、臀部、腰部、肩部、頸部及胸部等，發生氣性水腫，呈暗紅棕色到黑色，按壓有捻發音，剖檢局部呈黑色，肌肉干燥呈海綿狀，病變肌肉與正常肌肉相間，局部骨骼肌、皮下和肌間結締組織發生出血或壞死性炎，并產生氣體。……