家禽腸道菌群多樣性及其與宿主的相互關(guān)系

朱春紅，陶志云，劉宏祥，徐文娟，宋衛(wèi)濤，章雙杰，李慧芳

(江蘇省家禽科學(xué)研究所，江蘇揚(yáng)州 225125)

腸道微生物的結(jié)構(gòu)組成是自然選擇的結(jié)果。腸道中存在3種生命形式：細(xì)菌、古生菌和真菌。其中最主要的是細(xì)菌類(lèi)，通常定義為腸道菌群，腸道菌群的建立和組成也呈現(xiàn)一定的規(guī)律性。從細(xì)菌定居能力上講，主要由三大類(lèi)組成，最主要的一類(lèi)是正常菌群，在消化道中密度很高，占消化道細(xì)菌的絕大部分，主要由專(zhuān)性厭氧菌組成；一部分是暫時(shí)在動(dòng)物腸道中生存，在消化道中的密度很低，由外籍菌群和環(huán)境菌群構(gòu)成，以需氧和兼性厭氧菌為主；還有一部分細(xì)菌不能適應(yīng)腸道環(huán)境或動(dòng)物體不需要，隨糞便排出體外。從與宿主的關(guān)系上講，主要分為互利共生(symbiosis)、同食共生(commensal)及致病性(pathogenic)。在正常情況下，腸道微生物和宿主之間處于互利共生的關(guān)系。

家禽(雞、鴨、鵝)是重要肉蛋蛋白產(chǎn)品的來(lái)源，家禽腸道健康，特別是腸道菌群影響下的營(yíng)養(yǎng)健康、腸道免疫健康，是保證家禽生產(chǎn)的重要方面，該研究從營(yíng)養(yǎng)健康、免疫影響角度綜述家禽腸道健康和家禽健康生產(chǎn)的維護(hù)。

1 家禽腸道微生物菌群的多樣性

2005年，Eckburg等[1]通過(guò)宏基因組研究發(fā)現(xiàn)，腸道微生物在系統(tǒng)發(fā)育地位上基本分屬厚壁菌門(mén)(Firmicutes)、擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes)、變形菌門(mén)(Proteobacteria)、放線菌門(mén)(Actinobacteria)、疣微菌門(mén)(Verrucomicrobia)、梭菌肝門(mén)(Fusobacteria)六大門(mén)，其中厚壁菌門(mén)和擬桿菌門(mén)為主要優(yōu)勢(shì)菌群。上述主要優(yōu)勢(shì)菌群，在遺傳距離不一的物種中，核心菌群上保持著一定程度上的一致。……