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無創性結直腸癌生物標志物概要

2018-01-26 02:04:15梁媛紫徐軍發黃華藝
分子診斷與治療雜志 2018年1期
關鍵詞:檢測

梁媛紫 徐軍發★ 黃華藝

結直腸癌(colorectal cancer,CRC)是全球3大常見的惡性腫瘤之一[1?2]。絕大部分CRC的發生、發展是一個多步驟、多階段、多基因參與的過程,是外在環境因素和機體內在遺傳因素相互作用的結果。CRC早期癥狀不明顯,通常出現臨床癥狀時已發展為難治愈的階段,因此被稱為“沉默”的疾病[3]。CRC篩查5年存活率約為90%[4]。大多數結直腸癌是由息肉發展而來,即結直腸息肉為癌前病變疾病,如果息肉能在早期被發現并去除,就能預防結直腸癌的發生。因此,結直腸癌的早期診斷尤顯重要。

分子標志物的檢測是臨床CRC篩查的一個很有前景的方法。然而,目前可用于檢測早期CRC疾病進展的有效分子標志物不多,檢測的靈敏度和特異性不理想仍然是亟待解決的問題。從技術上來說,檢測CRC的手段可分為有創性和無創性檢測2種技術,兩者各有優缺點。隨著研究的不斷深入,CRC分子標志物在CRC患者治療效果的監測、個性化治療方案的選擇和預后的評估中日益受到重視。為了合理使用現有的CRC標志物,本文根據文獻報道,對無創性CRC標志物的臨床應用價值、檢測的難易度和不足之處進行簡要概括。

1 糞便隱血試驗

愈創木脂法糞便隱血試驗(guaiac?based fecal occult blood test,gFOBT)是目前國內外最常用的結直腸癌篩查方法之一。對于檢測CRC,gFOBT靈敏度為65%,特異度為 77.87%[5],具有簡便、快速、無創、檢測費用低等優點,也是唯一經前瞻性、隨機對照試驗證實有效的檢測方法,能使CRC的死亡率降低11%~33%[6]。雖然gFOBT的靈敏度和特異度都不高,且易受食物和藥物影響出現假陽性,但由于檢測的方便性和實用性,仍然受到臨床的青睞。

2 糞便血紅蛋白檢測

糞便免疫化學檢測(fecal immunochemical test,FIT),其原理是建立在針對人血紅蛋白抗原的基礎上的特異性抗原?抗體反應。在無癥狀的CRC高危人群中靈敏度為80%,特異度為90.12%[5]。FIT避免了gFOBT易受藥物和食物影響的特點,具有更高的靈敏度,小量糞便樣本即可檢測。研究發現,FIT對大腸癌及腺瘤性息肉的檢出率更高,且由于其對患者無飲食和藥物的限制,患者更傾向于 FIT[7?8]。為預防CRC的發生,美國預防服務工作組(U.S.Preventive Services Task Force,USPSTF)推薦每年應進行一次FIT檢測。綜合方法學性能和實用性等方面的比較,FIT的優勢比gFOBT大。

3 基于糞便CRC相關檢測

3.1 基于基因突變的DNA檢測

糞便DNA檢測是針對人血紅蛋白和特異性基因改變的非侵入性篩查檢測,多年來CRC常見的基因突變頻率一直是人們關注的焦點。基因APC和P53突變可作為 CRC 預后不良的標志物[9?10];基因KRAS、BRAF和PIK3CA突變檢測是抗表皮生長因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)治療的依據,根據檢測結果評估CRC患者是否適合使用相應的靶向治療藥物[11]。其他常見的突變基因有ARID1A、SMAD4、CTNNB1、TGFBR2、SOX9、FAM123B和ERBB2,這些突變基因通過干擾關鍵信號通路(包括Wnt?β?連環蛋白通路、EGF?MAPK通路、PI3K和TGF?β通路等)的功能或阻礙DNA復制、修復等功能,促進CRC的發生發展[12]。在糞便異常脫落細胞中小碎片癌組織即可發現DNA點突變,通過相關DNA檢測便可對CRC進行篩查,故糞便DNA檢測比血液DNA檢測簡單。

近年來關于CRC篩查試劑盒的研發越來越多,其中Cologuard是美國食品藥物管理局(Food and Drug Administration,FDA)批準的首個非侵入性CRC篩查試劑盒,通過分析糞便異常DNA和血紅蛋白對CRC進行篩查,總靈敏度為92.3%,特異度為87%,其靈敏度比FIT高[13]。此外,由中山大學附屬第六醫院研發的大腸癌糞便無創篩查試劑盒“長安心”,對糞便中CRC和癌前腺瘤的異常基因標志物的檢出率分別超過90%和60%[14],這在CRC的篩查、診斷、治療和預后評估等領域取得一定的突破和發展。

3.2 基于表觀遺傳學的DNA檢測

由于遺傳和表觀遺傳變異共同影響CRC的發展,DNA甲基化生物標志物的使用對提高目前CRC的篩查、診斷、治療和預后評估具有很大的潛在價值。經獨立驗證且深入研究的CRC診斷 基因有VIM、SEPT9、ITGA4、OSM4、GATA4和NDRG4[15],理論上這些甲基化標志物與長分散元件1(long interspersed element 1,LINE1)甲基化聯合檢測的靈敏度比FIT的靈敏度高;而經獨立驗證的預 后 基 因 有myopodin、KISS1、TMEFF2、HLTF、hMLH1、APAF1、BCL2和p53[15]。甲基孕激素受體(methylated progesterone receptor,mPGR)和 O6?甲基鳥嘌呤?DNA 甲基轉移酶(O6?methylguanine?DNA methyltransferase,mMGMT)是糞便獨有的生物標志物[16]。與血液標本相比,糞便中大量超甲基化基因的檢出率高。因此,糞便DNA甲基化標志物可能比血液中的生物標志物更有篩查價值。

3.3 基于遺傳特征的CRC檢測

已知,5%~10%CRC由無蒂鋸齒狀腺瘤(sessile serrated adenoma,SSA)和鋸齒狀腺瘤演變而來。這2種腺瘤經過一系列組織學和分子學的改變,逐漸由腺瘤發展為CRC[17]。基于基因和基因表型的變化,CRC的衍生途徑至少可分為3條:CpG島甲基化表型(CpG island methylator phenotype,CIMP)途徑(闡釋了一些以右半結腸息肉為主的息肉從SSA發展為CRC的過程)、微衛星不穩定性(microsatellite instability,MSI)途徑和染色體不穩定性(chromosomal instability,CIN)途徑,后2條途徑標志著腺瘤轉化為CRC。

CRC主要由染色體不穩定性途徑引起,CIN導致染色體拷貝數改變是CRC的一個標志。染色體隔離缺陷、端粒酶功能缺失、DNA損傷等功能障礙都會導致染色體不穩定和雜合性丟失。研究發現,染色體 1p36、1p12、1q21、9p13、14q11、16p13 和16p12缺失在年輕CRC患者中更易見,而染色體7q11和7q22增多在老年患者中更易見[18]。另外,基因p53和BUBR1表達異常與CIN的發生有關[19]。然而,機體內導致CIN基因突變的類型和模式更為復雜,有待進一步研究。

錯配修復系統(mismatch repair,MMR)對DNA復制校正意義重大,主要由MLH1,MSH2,MSH6和PMS2這4個錯配修復基因構成。MMR任何一個蛋白功能喪失都會導致微衛星不穩定性,從而有可能導致癌癥發生。MSI反映了DNA錯配的修復能力,因此MSI是引發CRC的一個途徑[20]。Lynch綜合征(又稱遺傳性非息肉性結直腸癌)通常表現為基因MLH或MSH2的突變,而散發性CRC與基因hMLH1甲基化有關。新提出的MSI標志物基因組由BAT?25、BAT?26、NR21、NR24和NR27組成,其中微衛星高度不穩定表型(microsatellite instability?high,MSI?H)CRC定義為5個標志物中至少有2個顯示不穩定,而大部分散發性CRC缺乏MSI特征,定義為微衛星穩態[20]。

SSA是鋸齒狀腫瘤形成途徑的癌前病變。基因的異常插入或缺失等會引起基因組不穩定,大多情況下會導致高頻微衛星不穩定性(MSI?H)腺癌的發生,其中基因BRAF的突變和SLC5A8的高甲基化就是引起MSI?H腺癌的重要影響因素[21]。

CRC的各種遺傳途徑共同作用并單獨存在,同一個腫瘤通常由多重途徑同時作用[22]。因此,CRC的遺傳學改變因素復雜,相應的生物標志物也復雜多樣,這給CRC的檢測帶來一定的挑戰性。

3.4 基于多種標志物組套檢測

多靶位糞便 DNA(multitarget stool DNA,MT?sDNA)測試于2014年被批準作為CRC平均風險的篩查項目,隨后被FDA納入醫療報銷項目[23]。盡管MT?sDNA檢測對CRC早期篩查具有高度靈敏度,美國預防服務工作小組(USPSTF)在2015年10月草案建議將該檢測僅視為“可替代”或“可能有用的臨床篩選”試驗[24]。第一代MT?sDNA原型測試(包括KRAS基因突變,VIM、NDRG4、BMP3及TFPI2甲基化,β?肌動蛋白和血紅蛋白)檢測CRC的靈敏度為87%,進展性腺瘤(advanced adenoma,AA)54%~92%(具體取決于息肉的大小)[25]。更為精準的第二代MT?sDNA自動化測試(包括KRAS基因突變,NDRG4及BMP3甲基化,β?肌動蛋白和血紅蛋白)檢測CRC的靈敏度為95%~97%,AA為57%~83%,AA的靈敏度取決于腺瘤的大小[25]。整體上,MT?sDNA檢測CRC的靈敏度為93%,AA和無蒂鋸齒狀腺瘤為42%~66%(具體取決于息肉的大小),總體特異度為87%~90%。與gFOBT及FIT相比,MT?sDNA試驗的檢出率更高,但是檢測成本昂貴。許多數據表明,每3年進行一次MT?sDNA檢測其性能和成本達到最優化[26]。

3.5 基于蛋白質和RNA的檢測

糞便中蛋白質和RNA作為早期篩查和診斷CRC的生物標志物越來越受關注。其中腫瘤M2型丙酮酸激酶(tumor M2 pyruvate kinase,M2?PK)來源于大腸腫瘤細胞,而免疫層析M2型丙酮酸激酶(immunochromatographic fecal tumor M2 pyruvate kinase,iM2?PK)是潛在的篩查 CRC 的生物標志物。Kim等[27]檢測CRC患者的iM2?PK值,所得的CRC靈敏度為92.8%,腺瘤靈敏度為69.4%。通過與免疫層析糞便隱血試驗(immunological fecal oc?cult blood test,iFOBT)及糞便M2?PK酶聯免疫吸附試驗比較,三者中iM2?PK值的靈敏度最高,且由于其檢測快速方便,是很有前景的CRC篩查標志物。鈣衛蛋白(calprotectin)是中性粒細胞和巨噬細胞胞漿來源的含鈣蛋白,是一種糞便中穩定的炎性標志物。對于可疑的CRC患者具有較高的陰性預測值[28],鈣衛蛋白的檢測有望提高CRC的檢出率。

此外,糞便微小RNA(miRNA)也可用于CRC的早期診斷,如 miR?29a、miR?223 和 miR?224[29]。糞便蛋白質和RNA的檢測在一定程度上提高了CRC的檢出率,但目前這些發現仍在研究階段,還未在臨床上實踐應用。

3.6 基于微生物組的檢測

腸道菌群失調與腸道腫瘤的發生和發展有關。CRC患者腸道菌群組成與健康人群腸道菌群組成不一樣,與不同黏膜的基因表達譜相關[30]。CRC患者腸道菌群主要包括梭桿菌、脆弱類桿菌和致病性大腸桿菌等[31]。這些病原微生物在腸道局部黏膜定植啟動CRC,微生物在黏膜周圍不斷定植引起后續變化,從而促進疾病的進展。因此,篩查這些病原微生物有望能對CRC進行早期診斷或預防性干預[32]。然而,宿主與病原菌之間相互作用的機制仍不太清楚,由于黏膜相關微生物與糞便微生物不同,目前對于選定哪種樣本的微生物篩查CRC還未達成共識。以上闡述歸納于表1。

4 血液相關CRC標志物

4.1 異常DNA甲基化標志物

近年來,血漿中CRC相關的異常DNA甲基化標志物已投入大量研究,其中血漿SEPT9甲基化(mSEPT9)是研究熱點。SEPT9是隔膜蛋白家族中的一員,與胞質分裂及細胞周期調控有關。mSEPT9試驗多應用于CRC的早期診斷,靈敏度為76.6%,特異度為95.9%,聯合血漿癌胚抗原檢測敏感度為86.4%,聯合FIT靈敏度達94.4%[33],mSEPT9還可能是CRC治療檢測和預后判斷的標志物[34]。此外,基因BCAT1和IKZF1甲基化的聯合檢測CRC的靈敏度為77%,特異度為92.4%。由于2個基因都與腫瘤的生長及侵襲性相關,聯合的甲基化程度與腫瘤進展的程度相關,可用于CRC的分期評估[35]。血漿異常DNA甲基化標志物的聯合檢測可提高CRC的檢測率。

表1 糞便中CRC相關生物標志物Table 1 Stool CRC biomarkers

4.2 RNA標志物

RNA的種類較多,如信使RNA(mRNA)、微RNA(miRNA)和長鏈非編碼RNA(LncRNA)等,具有胞外性能穩定,且易于提取和保存等優點,在不同體液中均可研究。在腫瘤組織中,RNA表達高度異常,因此RNA更適合應用于腫瘤性能分析的研究。實時定量PCR(real time quantitative PCR,qPCR)是最先用于測定mRNA表達微陣列譜的方法,后來逐漸被下一代基因測序(next generation sequencing,NGS)技術取代。NGS技術具有簡單、成本低和快速等優點,且能精準地測出整個轉錄組的序列[36]。

4.3 miRNA標志物

miRNA是一類內生的、長度約為20~24個核苷酸的小RNA,在細胞內具有多種重要的調節功能,與癌癥的發展及轉移有關,血清miRNA是潛在的CRC預后生物標志物[37]。miRNA對腫瘤細胞具有正調節和負調節作用,可表現為原癌基因、抑癌基因或者兩者兼為。miR?17?3p、miR?92、miR?29a、miR?141、miR?21、miR?152、miR?7和 miR?92a等與晚期CRC有關[38?41],提示預后差;miR?143、miR?195、miR?146a?5p、miR?140、miR?375和miR?577可抑制CRC的發展和轉移[42?47],有望成為CRC的替代治療藥物。然而,對于標本的采集、miRNA的提純和分析的方法還未標準化,限制了miRNA的有效測試。

4.4 lncRNA標志物

lncRNA的長度大于200 nt,具有mRNA樣結構。lncRNA通過干預mRNA的活性參與CRC的發展、侵襲和轉移過程,對CRC早期診斷、預后、耐藥和抗輻射等發揮重要作用。lncRNA直接與蛋白質結合以調節其活性或改變其定位,與內源RNA競爭通過抑制RNA聚合酶和調節基因表達來影響下游基因的表達,具有激活或抑制癌細胞的雙重作用[48]。Li等[49]發現共有 21 個相關 lncRNA在結直腸癌組織和癌旁組織中的表達異常,其中7 個變化明顯:AFAP1?AS1、BCAR4、H19、HOXA?AS2、MALAT1和 PVT1在 CRC組織中上調,ADAMTS9?AS2下調,提示CRC患者預后不良。lncRNA有望成為CRC的診斷和治療靶點。

4.5 循環腫瘤DNA標志物

循環腫瘤 DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)是新興的無創多功能的體液活檢生物標志物,與CRC的早期診斷、治療靶點的選擇、癌細胞轉移的檢測以及抗治療等相關[50]。CRC患者血液中出現ctDNA是其復發和總生存期評估的一個指標[51]。ctDNA檢測未來在臨床到底能否應用,還有待更深入的研究。

表2 血液中CRC相關生物標志物Table 2 Blood?based CRC biomarkers

4.6 干細胞CRC標志物

腫瘤干細胞可分化成更成熟的腫瘤細胞,具有自我更新的能力,與腫瘤的發生、發展、轉移和復發相關,是腫瘤產生耐藥性的主要原因[52]。干細胞作為 CRC 標志物有 Nanog、Oct?4、Sox?2、lgr?5、CD133、CD24、CD29、ALDH1、EpCAM、CD44、CD166和CD26,通常用于干細胞的分離鑒定。此外 ,ALDH1、CD24、CD44、CD133、CD166、Ep?CAM、lgr?5、Nanog和Sox?2可對CRC的病理分期、治療、癌癥復發和患者的生存率等進行評估[53]。腫瘤干細胞是診斷和治療CRC新的研究方向。

4.7 血清(漿)可溶性蛋白CRC標志物

包括歐洲癌癥和營養前瞻性研究在內的多項前瞻性研究發現,血清或血漿中高濃度的C反應蛋白(c?reactive protein,CRP)與CRC風險升高有關,高水平CRP可能與CRC的發生有直接關系[54]。血清癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA)和CA19?9與CRC 的嚴重程度及轉移有關[55]。另外,血管內皮細胞生長因子C(vascular endothelial growth factor,VEGF?C)的過度表達與CRC患者的總生存期相關[56];細胞角化因子20(cytokeratin 20,CK20)與CRC的治療有關[57]。單個可溶性蛋白標志物用于診斷CRC時,往往缺乏敏感性,而多個標志物聯合檢測可提高敏感性。如胰島素樣生長因子結合蛋白2(insulin like growth factor binding protein?2,IGFBP2)、Dickkopf?3(DKK3)和丙酮酸激酶 M2(pyruvate kinase M2,PKM2)可用于診斷CRC[58];甲基化FOXE1和SYNE1也是潛在的 CRC診斷標志物[59]。可溶性蛋白具有易于取材、檢測方便、易于自動化和重復性好的優點,易于推廣應用。以上闡述歸納于表2。

5 結語

一項理想的檢測應具有高度依從性、靈敏度和特異度、微創并保持一定的成本效益。CRC篩查仍存在許多局限性,例如來自組織(手術創傷性)和無創性(或微創性)的標本,其檢測結果之間的一致性問題,但隨著臨床研究的逐漸深入,在對CRC患者治療反應性的預測、個性化治療方案的選擇和預后的評估中,分子標志物也日益受到重視。本文所列舉的無創性CRC標志物中,糞便隱血試驗仍然是目前結直腸癌最主要的無創篩查方法,其他標志物雖然有很大潛在性,但真正應用于臨床檢測的不多。有些生物標志物靈敏度高,但特異度不高,或相反;有些則成本昂貴,且臨床意義不大,如一些基因檢測;標志物的聯合檢測雖然在一定程度上提高了CRC的檢出率,但關于項目的組合難以達成共識。因此無創性CRC標志物在臨床實踐方面仍存在許多需要解決的問題。總的來說,目前用于檢測CRC方法的靈敏度和特異性不夠理想,檢測操作繁瑣和成本高仍然是亟待解決的問題。

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