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GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387單核苷酸多態(tài)性與冠狀動(dòng)脈粥樣硬化性心臟病的相關(guān)性研究

2018-01-31 07:34:41周爽尤昕
關(guān)鍵詞:冠心病研究

周爽,尤昕

(延邊大學(xué)附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科,吉林 延吉 133000)

冠狀動(dòng)脈粥樣硬化性心臟病(coronary atherosclerotic heart disease,CAD)(簡(jiǎn)稱冠心病)是1種全球范圍內(nèi)常見(jiàn)的慢性病,已經(jīng)成為導(dǎo)致人類(lèi)死亡的最主要病因之一。冠心病的發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,目前普遍認(rèn)為受環(huán)境和遺傳兩大因素的共同影響,隨著分子遺傳生物學(xué)的迅速發(fā)展,對(duì)其遺傳因素方面的研究也越來(lái)越受到重視[1]。自人類(lèi)基因組計(jì)劃實(shí)施以來(lái),人們對(duì)冠心病有更加深入了解,文獻(xiàn)表明,遺傳因素在冠心病發(fā)病過(guò)程中的貢獻(xiàn)高達(dá)50%[2]。近年來(lái),全基因組關(guān)聯(lián)分析(genome-wide association studies,GWAS)被廣泛應(yīng)用于復(fù)雜多基因疾病的研究之中,以單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)為基礎(chǔ)的全基因組關(guān)聯(lián)分析已成為研究冠心病遺傳易感性的主流方法,通過(guò)該方法研究發(fā)現(xiàn)的冠心病相關(guān)基因位點(diǎn)已達(dá)50多個(gè)[3]。GUCY1A3基因位于4號(hào)染色體q32.1,長(zhǎng)77353 bp,含有13個(gè)外顯子,編碼690個(gè)氨基酸,這些氨基酸組成可溶性鳥(niǎo)苷酸環(huán)化酶(soluble guanylate cyclase,sGC)的(α1亞基。GUCY1A3基因已被認(rèn)為在CAD的高遺傳風(fēng)險(xiǎn)中發(fā)揮著重要作用[4]。可溶性鳥(niǎo)苷酸環(huán)化酶(soluble guanylyl cyclase,sGC)作為1種信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)酶廣泛分布于人體中,并介導(dǎo)心血管系統(tǒng)的許多生理過(guò)程,例如促進(jìn)血管平滑肌舒張,抑制血小板聚集和血管重構(gòu)等,因此sGC成為維持心血管穩(wěn)態(tài)的關(guān)鍵酶[5]。該試驗(yàn)選取GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387進(jìn)行研究,分析其單核苷酸多態(tài)性與延邊地區(qū)漢族人群CAD遺傳易感性之間的關(guān)系,為開(kāi)展針對(duì)性的人群預(yù)防提供新線索,同時(shí)也為延緩或防止CAD的發(fā)生提供更多的理論依據(jù)。

1 資料與方法

1.1 研究對(duì)象

選取延邊大學(xué)附屬醫(yī)院心血管內(nèi)科住院且相互之間無(wú)血緣關(guān)系的漢族冠心病患者204例,均符合世界衛(wèi)生組織制定的缺血性心臟病的診斷標(biāo)準(zhǔn),且經(jīng)冠狀動(dòng)脈造影檢查證實(shí)至少1支冠脈狹窄≥50%。對(duì)照組201例選自延邊大學(xué)附屬醫(yī)院健康體檢科體檢結(jié)果正常,且通過(guò)詢問(wèn)病史、輔助檢查等明確排除心血管疾病的健康人。通過(guò)查閱病案資料、問(wèn)卷訪談等形式收集研究對(duì)象的基本資料及既往病史等,所有研究對(duì)象均簽署知情同意書(shū)。

1.2 試劑

DNA提取試劑盒(美國(guó)Promega公司),SNaPshot試劑盒:ABI PRISM SNa Pshot Multiplex Kit(美國(guó)ABI公司),Taq酶:KAPA Taq Hot Start DNA Polymerase(Kapabiosystems公司),SAP 酶(Fermentas公司)、ExoI酶和CIP酶(NEB公司),瓊脂糖(美國(guó)Invitrogen公司)。

1.3 儀器與設(shè)備

Beckman Allgre 21R高速冷凍離心機(jī)(Beckman公司),BC-subMIDI電泳儀(北京六一儀器廠),JY300 C電泳槽(北京君意東方電泳設(shè)備有限公司),Bio Sens SC 810B凝膠成像儀(上海山富科學(xué)儀器有限公司),PTC-100PCR儀(MJ公司),ABI 9700擴(kuò)增儀(ABI公司),3730XL測(cè)序儀(美國(guó)ABI公司)。

1.4 試驗(yàn)方法

研究對(duì)象的GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387的基因型及等位基因的檢測(cè)過(guò)程主要包括設(shè)計(jì)合成引物、提取DNA、預(yù)擴(kuò)增、預(yù)擴(kuò)增產(chǎn)物純化、延伸反應(yīng)、延伸產(chǎn)物純化、上機(jī)檢測(cè)及整理分析數(shù)據(jù)。根據(jù)Genbank獲得的GUCY1A3基因所在序列的信息,應(yīng)用Primer 5.0軟件設(shè)計(jì)rs7692387位點(diǎn)的特異性引物。正向引物:5'-CACTTCACTGTGGAAAC(C/T)GAG-3',反向引物:5'-GTGCCTACAATGATGCCTGG-3'。入選的研究對(duì)象均在清晨空腹?fàn)顟B(tài)下采集外周靜脈血2 ml于抗凝管中,室溫?fù)u勻后置-20℃冰箱冷凍保存?zhèn)溆茫捎肈NA提取試劑盒按使用說(shuō)明書(shū)提取并純化DNA。以聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增含有目的位點(diǎn)的基因片段。PCR反應(yīng)體系包含提取 DNA(10~20 ng/μl)2 μl,2.5×BufferⅣ 4.0 μl,Taq(5 u/L)0.15 μl,引物(5 μmol,F(xiàn)+R)1.5 μl,加去離子水至10 μl。PCR擴(kuò)增條件為95℃預(yù)變性5 min,95℃變性 30 s,60℃退火 30 s,72℃延伸 30 s,共35個(gè)循環(huán),72℃終末延伸10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳質(zhì)檢。將所得產(chǎn)物用ExoI酶消化后純化再加入延伸體系,延伸體系包括消化后預(yù)擴(kuò)增產(chǎn)物1.2 μl,Primers Mix 2 μl,ABI Mix 0.5 μl,10×Buffer I 0.4 μl,加去離子水至5 μl。將所得延伸產(chǎn)物純化后加入3730XL測(cè)序儀,采用美國(guó)ABI公司開(kāi)發(fā)的Sna Pshot技術(shù)進(jìn)行檢測(cè),該技術(shù)是基于熒光標(biāo)記單堿基延伸原理的1種分型技術(shù)。最后應(yīng)用分析軟件將檢測(cè)所得的原始數(shù)據(jù)文件進(jìn)行整理分析。

1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

數(shù)據(jù)分析采用SPSS 22.0統(tǒng)計(jì)軟件,計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,組間比較采用t檢驗(yàn),計(jì)數(shù)資料采用χ2檢驗(yàn)。兩組研究對(duì)象的基因型分布采用Hardy-Weinberg遺傳平衡定律檢驗(yàn)其是否具有群體代表性。等位基因頻率及基因型頻率分布差異情況采用χ2檢驗(yàn)進(jìn)行分析。應(yīng)用Logistic回歸分析校正混雜因素對(duì)冠心病的影響,并計(jì)算值和95%可信區(qū)間(95%CI),以檢測(cè)GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387單核苷酸多態(tài)性和冠心病的相關(guān)性,以雙側(cè)P <0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 研究對(duì)象的一般臨床資料比較

冠心病組和對(duì)照組在性別、年齡、BMI、收縮壓、舒張壓、糖尿病史、TC及TG方面比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P <0.05),研究對(duì)象平均年齡符合冠心病的高發(fā)年齡。冠心病組高血壓、吸煙史及LDL-C均高于對(duì)照組,HDL-C低于對(duì)照組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P <0.05)。見(jiàn)表 1。

表1 兩組的臨床資料比較

2.2 基因測(cè)序結(jié)果

研究對(duì)象的GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387共有3種基因型(見(jiàn)圖1):純合子GG、AA,雜合子GA,純合子基因型顯示的峰型是單峰,雜合子基因型顯示的峰型是套峰。延伸體系中包含4種熒光標(biāo)記的ddNTP,分別用藍(lán)色、黑色、綠色、紅色代表延伸加入ddGTP、ddCTP、ddATP及ddTTP的延伸產(chǎn)物,根據(jù)峰的顏色可得知摻入的堿基種類(lèi),從而確定該樣本的基因型。

2.3 兩組GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387單核苷酸多態(tài)性與冠心病的關(guān)系

兩組分別進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn),兩組研究對(duì)象GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387基因型頻率的觀察值與理論預(yù)測(cè)值比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P <0.05),表明該研究的人群符合Hardy-Weinberg遺傳平衡定律。GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387 G/A多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果顯示,冠心病組GG基因型頻率高于對(duì)照組,而對(duì)照組GA+AA基因型頻率高于冠心病組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P <0.05),G和A 2等位基因頻率分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P <0.05)。見(jiàn)表2。

2.4 GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387的基因型與冠心病患病風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估

將研究對(duì)象作為整體進(jìn)行分析,以GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387的基因型(GG=1,GA+AA=2)、年齡、性別、BMI、高血壓、糖尿病、吸煙史、收縮壓、舒張壓作為自變量,有無(wú)冠心病(有=1,無(wú)=0)作為因變量建立Logistic回歸模型。結(jié)果顯示,排除可能與冠心病有關(guān)的一些混雜因素后,GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387的GG基因型與GA+AA基因型比較,其可增加冠心病的患病風(fēng)險(xiǎn)2.327,P=0.039),表明GG基因型可能是冠心病發(fā)病的易感基因型。見(jiàn)表3。

圖1 GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387的基因型測(cè)序結(jié)果

表2 GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387基因型頻率及等位基因頻率分布比較

表3 GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387的基因型與冠心病的Logistic回歸分析

2.5 GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387的等位基因與冠心病患病風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估

將研究對(duì)象作為整體進(jìn)行分析,以GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387 的等位基因(A=1,G=2)、年齡、性別、BMI、高血壓、糖尿病、吸煙史、收縮壓、舒張壓作為自變量,有無(wú)冠心病(有=1,無(wú)=0)作為因變量建立Logistic回歸模型。結(jié)果顯示,排除可能與冠心病有關(guān)的一些混雜因素后,GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387的A等位基因與G等位基因比較,其可降低冠心病的患病風(fēng)險(xiǎn)表明A等位基因可能是冠心病的保護(hù)性基因。見(jiàn)表4。

表4 GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387的等位基因與冠心病的Logistic回歸分析

3 討論

冠心病是嚴(yán)重影響人類(lèi)健康和生活質(zhì)量的心血管疾病之一,其發(fā)病率和死亡率逐年上升,如今已成為我國(guó)城鄉(xiāng)居民疾病死亡的首要原因[6]。冠心病是1種多基因疾病,遺傳因素對(duì)其發(fā)生和發(fā)展有影響,該基因的多態(tài)性和冠心病之間的關(guān)系是目前研究的主要方向。基因多態(tài)性反映基因的選擇性表達(dá),是人類(lèi)基因組在抵御不良環(huán)境影響過(guò)程中的1種適應(yīng)性表現(xiàn),包括SNP、DNA重復(fù)序列多態(tài)性以及DNA片段長(zhǎng)度多態(tài)性,在疾病易感性和人體對(duì)疾病的抵抗力等方面發(fā)揮重要作用[7]。SNP是基因多態(tài)性中最常見(jiàn)的1種,已被列為對(duì)復(fù)雜性疾病產(chǎn)生影響的最主要因素之一[8]。已有研究證實(shí),單個(gè)或多個(gè)基因的遺傳易感性會(huì)對(duì)CAD的發(fā)病產(chǎn)生直接影響,且不同地域、種族或同種族不同地域人口的CAD易感性具有差異[9]。全基因組關(guān)聯(lián)分析檢測(cè)到GUCY1A3基因座常見(jiàn)的非編碼區(qū)突變與CAD之間具有很強(qiáng)的關(guān)聯(lián)性[10]。GUCY1A3基因是編碼sGC的α1亞基,sGC是NO-sGC-cGMP信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中的關(guān)鍵酶,大部分以α1/β1異二聚體的形式廣泛分布于許多實(shí)質(zhì)臟器及各種組織細(xì)胞中[11]。當(dāng)體內(nèi)的sGC被NO激活,激活的sGC可以將GTP轉(zhuǎn)化為cGMP,后者則作為細(xì)胞內(nèi)調(diào)節(jié)信息的傳遞者,介導(dǎo)舒張血管、降低血壓及促進(jìn)Na+排泄等正常生理活動(dòng)[12]。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)研究也證明,若將大鼠的sGCα1、α2或sGCβ1基因敲除,其血管平滑肌舒張、血壓調(diào)節(jié)及血小板聚集等方面的功能均會(huì)較正常對(duì)照組產(chǎn)生不同程度的紊亂,部分會(huì)發(fā)生嚴(yán)重疾病,甚至死亡[13]。與之類(lèi)似,心血管系統(tǒng)疾病患者體內(nèi)的NO-sGC-cGMP信號(hào)通路也常為紊亂狀態(tài),其根本原因是NO在病理狀態(tài)下被清除,導(dǎo)致通路中最重要的第二信使cGMP無(wú)法被正常激活,從而不能發(fā)揮其正常生理功能[14]。綜上,NO-sGC-cGMP通路在心血管疾病的發(fā)生和發(fā)展過(guò)程中顯得尤為重要,其將成為多種心血管系統(tǒng)疾病(如冠心病、心肌梗死、心力衰竭和慢性肺心病等)有效治療靶標(biāo)[15]。

本研究結(jié)果顯示,入選的研究對(duì)象基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律,表明所收集的樣本基本能代表延邊地區(qū)漢族人群GUCY1A3基因多態(tài)性分布。本研究中冠心病組GG基因型頻率高于對(duì)照組,而對(duì)照組GA+AA基因型頻率高于冠心病組,有差異。應(yīng)用Logistic回歸分析排除年齡、性別、BMI、高血壓、糖尿病、吸煙史、收縮壓、舒張壓該混雜因素的作用后,有差異,與基因型為GA+AA者比較,基因型為GG者其患CAD的危險(xiǎn)性增加,表明GG基因型很可能是延邊地區(qū)漢族人群冠心病發(fā)病的易感基因型。GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387的A等位基因頻率分布在對(duì)照組中高于CAD組,而G等位基因頻率分布在CAD組中高于對(duì)照組,有差異。應(yīng)用Logistic回歸分析排除年齡、性別、BMI、高血壓、糖尿病、吸煙史、收縮壓及舒張壓該混雜因素的影響后,有差異,與攜帶G等位基因比較,攜帶A等位基因可降低冠心病的患病風(fēng)險(xiǎn),表明A等位基因可能是延邊地區(qū)漢族人群冠心病的保護(hù)性基因。

本研究在一定程度上為冠心病易感人群的篩選及保護(hù)提供理論依據(jù),從而根據(jù)不同個(gè)體的基因多態(tài)性實(shí)施針對(duì)性的早期干預(yù),對(duì)冠心病的預(yù)防及個(gè)性化治療具有重要意義。同時(shí)由于國(guó)內(nèi)外對(duì)GUCY1A3基因位點(diǎn)rs7692387的研究較少,該試驗(yàn)的結(jié)果仍需在擴(kuò)大樣本含量的基礎(chǔ)上,對(duì)不同種族、不同地域的人群進(jìn)行更加深入的研究。

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