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核酸免提取HBV-DNA檢測方法性能評價

2018-08-16 07:53:10張春嬌仲崇明
實驗與檢驗醫(yī)學(xué) 2018年4期
關(guān)鍵詞:血清檢測方法

張春嬌,仲崇明

(南京中醫(yī)藥大學(xué)連云港附屬醫(yī)院檢驗科,江蘇 連云港222004)

乙型病毒肝炎是由乙型肝炎病毒(HBV)引起的一種世界性傳染疾病[1]。血液中乙型肝炎病毒DNA(HBV-DNA)可反映患者體內(nèi)病毒活動狀況,對臨床診斷、判斷預(yù)后、指導(dǎo)用藥及治療監(jiān)測起到了重要作用[2-4]。中國是病毒性肝炎的高發(fā)地區(qū)[5]。快速、簡便、特異、靈敏的實驗室檢測技術(shù)對HBVDNA 檢測非常重要[6-12]。 目前,檢測 HBV-DNA 方法較多,其中,煮沸法操作步驟繁瑣,快速而性能良好的方法才能較好適應(yīng)臨床需求。核酸免提取方法操作簡便,本文通過分析核酸免提取HBVDNA熒光定量PCR法的精密度、準(zhǔn)確度、線性、最低檢測限,并將結(jié)果與傳統(tǒng)煮沸法進行比對,評價該法的檢測性能。

1 材料與方法

1.1 質(zhì)控血清及標(biāo)準(zhǔn)血清為北京康徹斯坦生物技術(shù)有限公司產(chǎn)品,15例患者血清標(biāo)本來源于我院診治患者。

1.2 儀器與試劑 ABI-7500熒光定量基因擴增儀購于美國應(yīng)用生物技術(shù)有限公司,八連管離心機購于蘇州潤達(dá)生物技術(shù)有限公司,免提取核酸法試劑及標(biāo)準(zhǔn)品均購于湖南圣湘生物技術(shù)有限公司,批號2017013。煮沸法試劑及標(biāo)準(zhǔn)品均購于西安天隆生物技術(shù)有限公司,批號20160902。

1.3 方法

1.3.1 HBV-DNA提取與檢測 煮沸核酸提取法,按照天隆公司HBV-DNA熒光定量PCR檢測試劑盒說明書要求操作。核酸免提取法,按照湖南圣湘生物技術(shù)公司HBV-DNA熒光定量PCR檢測試劑盒說明書要求操作。

1.3.2 驗證指標(biāo)及驗證方法

1.3.2.1 精密度 選用高、中、低三個濃度陽性血清為待測樣本,各重復(fù)測定10次,計算SD、CV。以YY/T1182-2010《核酸擴增檢測用試劑(盒)》精密度要求(CV<5%)為評價標(biāo)準(zhǔn)。

1.3.2.2 準(zhǔn)確度 具有溯源性定值血清 (北京康徹斯坦生物技術(shù)有限公司產(chǎn)品),HBV-DNA含量分別 為 4.6E+06IU/ML,1.41E+03IU/ML 分 別 重 復(fù) 3次檢測,計算測量平均值與認(rèn)定值偏差,以YY/T1182-2010《核酸擴增檢測用試劑(盒)》準(zhǔn)確度要求絕對值偏差不超過0.5個對數(shù)數(shù)量值為評判標(biāo)準(zhǔn)。

1.3.2.3 線性范圍 以煮沸法檢測 3.71E+8 IU/ML強陽性血清作為初始標(biāo)本,依次向下10倍梯度稀釋至 3.71E7 IU/ML、3.71E6 IU/ML、3.71E5 IU/ML、3.71E4 IU/ML、3.71E3 IU/ML、3.71E2 IU/ML、3.71E1 IU/ML,每個樣本(8 個)分別測定 3 次,取對數(shù)值后計算均值,將均值與理論值作線性回歸分析(Y為理論值,X為實測值),得出線性回歸分析Y=A+BX和相關(guān)系數(shù)R,以YY/T1182-2010《核酸擴增檢測用試劑(盒)》線性要求≥0.98為評判標(biāo)準(zhǔn)。

1.3.2.4 最低檢出限 根據(jù) YY/T1182-2010 《核酸擴增檢測用試劑(盒)》6.8.2 條款要求,采用乙肝兩對半全陰血清稀釋康徹斯坦定值質(zhì)控品1.41E+03IU/ML,稀釋47倍,使其達(dá)到湖南圣湘生物技術(shù)有限公司試劑聲明的最低檢出限(30IU/ML),進行25次重復(fù)檢測,以至少22次結(jié)果檢測出數(shù)值為最低檢出限通過。

1.3.2.5 將2017年8月13日我院基因擴增實驗室接收的15份血清嚴(yán)格按照煮沸法和免提取法說明書操作。比較兩種結(jié)果一致性,并將陽性結(jié)果取對數(shù)值,做相關(guān)性分析。

2 結(jié)果

2.1 精密度 高、中、低3個濃度的精密度變異系數(shù)均小于5%。該檢測方法符合YY/T1182-2010《核酸擴增檢測用試劑(盒)》精密度變異系數(shù)CV<5%的要求,也符合廠家要求,見表1。

表1 精密度評價

2.2 準(zhǔn)確度 示值 4.6E+6IU/ML、1.4E+3IU/ML 定值血清測量值均值分別為 5.75E+6IU/ML,1.9E+3IU/ML,符合 YY/T1182-2010《核酸擴增檢測用試劑(盒)》5.4.2a 檢測國家標(biāo)準(zhǔn)品(或參考品)/國際標(biāo)準(zhǔn)品(或參考品),絕對值偏差不超過±0.5個對數(shù)值的要求,見表2。

表2 準(zhǔn)確度評價(示值、允許范圍、測量值為對數(shù)值)

2.3 線性 HBV-DNA 在 3.71E1 IU/ML-3.71E8IU/ML 范圍內(nèi)有良好線性關(guān)系 Y=0.987X+0.071,R=0.99,符合 YY/T1182-2010《核酸擴增檢測用試劑(盒)》相關(guān)系數(shù)R≥0.98的要求,也滿足試劑盒線性范圍要求,如圖1。

2.4 最低檢出限 示值 30IU/ML(對數(shù)值為 1.48)的樣本25次檢測結(jié)果有24次出現(xiàn)定量值,對數(shù)均值 1.53,與廠家聲明的最低檢出限(30IU/ML)相符合。

2.5 兩種方法檢測結(jié)果的比對,以煮沸法為參照X,以免提取法檢測結(jié)果為Y,兩方法結(jié)果相關(guān)性分析,Y=0.979X+0.134,R=0.99,相關(guān)性良好,如圖2。煮沸法為陽性的標(biāo)本,免提取法均為陽性,煮沸法為陰性的標(biāo)本,有一例免提取法為陽性,且結(jié)果為78IU/ML,低于煮沸法的最低檢出限100IU/ML。說明免提取法的靈敏度比煮沸法要高。

圖1 線性評價

圖2 兩種方法比對

3 討論

核酸免提取HBV-DNA實時熒光定量PCR檢測性能評估結(jié)果顯示:高、中、低濃度的精密度變異系數(shù)分 0.8%、1.51%和 2.89%低于煮沸法[8,11,12];準(zhǔn)確度與標(biāo)準(zhǔn)品的偏差分別為0.02和0,明顯低于煮沸法[8,11,12];線性驗證的相關(guān)系數(shù) R=0.99,與煮沸法沒有區(qū)別;最低檢出限為30IU/ML,明顯低于煮沸法[8,11,12]的最低檢出限.核酸免提取方法可以及時準(zhǔn)確檢測出低拷貝的病毒,達(dá)到早診斷,早治療的目的。對15例患者血清用兩種方法同時進行檢測結(jié)果顯示兩種方法相關(guān)性良好,說明兩種方法都可應(yīng)用于臨床,核酸免提取法有更好的精密度,準(zhǔn)確度和靈敏度。本文使用核酸免提取方法精密度、準(zhǔn)確度、線性范圍、最低檢出限均符合YY/T1182-2010《核酸擴增檢測用試劑(盒)》的要求,也符合廠家說明書的要求。

目前,國內(nèi)試劑主要采用煮沸法提取HBVDNA,然后通過實時熒光定量PCR檢測DNA載量。 煮沸法測量 HBV-DNA 的性能驗證報告[8,11,12,13]顯示煮沸法操作步驟繁多,需要高溫裂解及高速離心沉淀,很容易造成DNA裂解不完全或離心沉淀不徹底,而造成DNA提取及檢測結(jié)果誤差,吸取廢液轉(zhuǎn)移反應(yīng)管時也很容易造成DNA的丟失及交叉污染。免提取核酸方法使用的核酸釋放劑,無需高溫裂解,且整個反應(yīng)過程在一個管中進行,無需移液,減少了反應(yīng)步驟,縮短了操作時間,提高了工作效率。且避免了核酸的丟失、交叉污染和人工誤差,提高了檢測結(jié)果的準(zhǔn)確度、靈敏度和可重復(fù)性[14,15]。

綜上所述,核酸免提取HBV檢測方法具有精密度高,準(zhǔn)確度好,靈敏度好,操作簡便等優(yōu)點,實驗操作及檢測性能能較好地滿足臨床需求。

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