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植物內質網脅迫應答研究及進展探討

2018-10-31 07:10:28魏圓圓
科教導刊·電子版 2018年25期
關鍵詞:植物

魏圓圓

摘 要 本文以內質網脅迫為對象,就其在植物中應用進展作一探討。另外,本文還剖析了內質網脅迫與膜結合轉錄因子間所存在的關系,指出了在對內質網脅迫途徑進行研究中還沒有得到解決的問題,望能為深層化研究內質網脅迫與抗逆之間關系提供參考與依據。

關鍵詞 植物 內質網 脅迫應答

中圖分類號:Q503 文獻標識碼:A

在整個真核生物體系當中,蛋白質有著非常復雜的合成過程,而細胞質當中的核糖體為合成的核心場所。針對那些大分子蛋白,比如在整個細胞總蛋白中約占1/3的分泌蛋白,或者是膜蛋白等,需先進內質網,然后再根據實際需要,進行修飾與折疊,只有蛋白質經過正確、規范化的折疊與修飾,方能向細胞器中轉換(如細胞核、線粒體等),并將其生物功能最大化發揮出來。針對蛋白質整個折疊過程而言,不僅精細而且還比較復雜,易受外界影響,造成蛋白出現錯誤折疊,或者是難以折疊的情況。本文就植物內質網脅迫應答研究及進展作一探討。

1經典未折疊蛋白的基本應答途徑分析

1.1以IREl為介導的XBPmRNA非常規剪接途徑分析

在酵母中,IRE1乃是一個比較典型的內質網脅迫感應器,無論是在動物未折疊蛋白應答中,還是在植物應答中,均發揮著重要作用與地位。對于IRE1而言,其實為一個內質網駐留蛋白質,具有單次跨膜的特點,其不僅擁有內切核酸酶RNase活性,而且還有胞質激酶活性。在整個內質網當中,當未折疊蛋白質出現持續、不間斷累積時,對于此時的IRE1蛋白而言,其便會形成比較典型的多聚體,將IRE1所持有的蛋白激酶活性激活,且出現磷酸化,并使其內切核酸酶活性得到進一步激活;還需要指出的是,無論是動物XBP1,還是酵母HAC1,針對與之處于對應狀態的mRNA,實施非常規剪切處理,將一些核苷酸切掉,并對原有的蛋白形式進行重新編碼。針對此形式而言,其不僅擁有典型的轉錄激活活性,而且還擁有核定位信號,還可以進入細胞核,對蛋白折疊相應UPR基因進行調節,最終達到緩解內質網脅迫的目的。

1.2 ATF6-S2P水解的基本途徑

針對ATF6而言,其在整個哺乳動物體系中,實為一個bZIP家族跨膜轉錄因子(內質網II型),對于其N端來講,其多處于細胞質當中,在整個架構當中,其囊括有一個呈堿性狀態的亮氨酸拉鏈結構域,而對于C端來講,其多處于內質網腔。通常情況下,處于全長狀態的ATF6,會被BiP滯留,并且始終維持在內質網當中;還需要指出的是,基于內質網的影響及持續脅迫下,COPII會轉移ATF6,使其經膜泡,而持續運至高爾基體當中,然后由2個蛋白酶(S1P與S2P),實施分步酶切操作,完成酶切后,其形式會發生改變,其中不存在跨膜域,此時,經核定位信號,便會持續進入到細胞核中,將下游UPR相應基因表達予以激發;針對此種酶切方式來講,也業內又被稱作蛋白質水解方式。

1.3 PERK/ATF4-CHOP選擇翻譯性途徑分析

針對PERK來講,其實為一個能夠在內質網中定位,并且還含有跨膜域的一種激酶,針對C末端來講,其所處對象為胞質,而對于N末端來講,其方向所指的是內質網腔,從根本上來講,其擁有比較典型且具有獨特性的絲/蘇氨酸蛋白激酶活性,現階段,僅能在動物當中被發現。針對翻譯起始因子eIF2來講,其內部所含有的 亞基(eIF2 ),便會以一種獨特方式與GTP相結合,然后可以與tRNA融合在一起,對起始復合物進行翻譯。如果內質網處于應激狀態,針對此時的PERK磷酸,其在化真核起始因子eIF2 位置上,在絲氨酸排位上,處于第51位。針對eIF2 來講,當其已經被磷酸化之后,便會對翻譯起始復合物當中的GTP與GDP的交換進行有效抑制,在此過程中,其會對蛋白質相應翻譯施加抑制,還會對其合成進行相應抑制,因而能夠較大程度減少進入到內質網當中的蛋白。

2植物膜結合轉錄因子與內質網脅迫應答

2.1 AtbZIP28途徑分析

當處于正常狀態下,針對擬南芥膜結合轉錄因子(bZIP28)來講,經跨膜域,實現在ER當中的定位,當感應到脅迫后(內質網脅迫、高溫等),對于此時的bZIP28來講,其便會進入高爾基體中,并且還會分別被絲氨酸蛋白酶當中的S1P、S2P實施分步酶切處理,將跨膜域去掉;在實際操作中,通過對位信號進行核定,并進入到指定的細胞核中,并且還會對諸多與UPR之間存在關聯的基因進行上調,以此來更好的幫助蛋白折疊。在整個哺乳動物體系當中,對于ATF6而言,其會被BiP長期滯留于內質網中,基于內質網的影響、作用與脅迫下,COPII會借助于膜泡運輸,把ATF6持續向高爾基體傳送。在植物當中,大多經過預測明確是停靠于移動高爾基體(內質網出口位點),無需中間囊泡,便可以把內質網蛋白以一種合理方式向高爾基體轉運;雖然是這樣,許多報道指出,從內質網至高爾基體,在其整個轉運過程相關于COPII裝置。

2.2 AtbZIP60/OsbZIP74途徑分析

針對擬南芥bZIP60(水稻bZIP74)來講,其在具體的活化方式上,不同于AtbZIP28。對于AtbZIP60/OsbZIP74所持有的mRNA來講,其可以根據實際需要,形成二級發夾結構,并且還會被IRE1識別出來,于mRNA水平上,開展非常規剪切操作。在整個內質網當中,隨著未折疊蛋白質的持續、不間斷積累,IRE1蛋白便會根據實際情況,形成多聚體,將IRE1所對應的蛋白激酶活性激活,加速自體磷的持續酸化,從中推動內切核酸酶活性的不斷激活,還需要指出的是,通過對bZIP60mRNA中所存在的雙莖環結構激活,并將其中的23個核苷酸去除掉,勢必會造成閱讀框移碼,并且還會出現異常化的終止密碼子,受此影響,其便會被重新編碼,成為一個并沒有跨膜域的單純性的蛋白形式。針對形式來講,其不僅擁有轉錄激活活性,而且還有核定位信號,可以根據實際需要,進入到細胞核當中,并對UPR基因表達實施上調處理,實現細胞的更好生存。針對植物當中的IRE1蛋白來講,其與酵母與動物當中的IRE1蛋白序列向比較,存在著比較高的同源性,但需要指出的是,針對與IRE1蛋白相對應的剪接底物來講,其所持有的核苷酸序列,相比于酵母與動物的IRE1蛋白所持有的剪接底物核苷酸序列,存在著比較低的相似性。

2.3 NAC062途徑分析

針對真核的分泌系統來講,其主要由疏水區域、囊泡、內質網、高爾基體與質膜構成。針對NAC062來講,其在整個植物特異轉錄因子NAC家族當中,乃是其核心成員,針對其C-末端而言,其存在著比較典型的疏水跨膜域。針對內質網脅迫誘導劑TM來講,其能夠對NAC062實施誘導,使其表達上調,而針對此種上調而言,其在整個bzip60突變體當中,已經被全部抑制,但需要指出的是,如若其在bzip28突變體當中,則受到的影響較小;經酵母單雜交試驗以及EMSA實驗得知,針對bZIP60而言,其能夠與NAC062啟動子直接結合。當處于正常狀態下,NAC062能夠在質膜上實現定位,并且在內質網的作用與脅迫下,會被一種未知方式進行活化處理,從質膜向細胞核轉移,而針對已經活化的NAC062,其能夠與UPR基因所對應的啟動子相結合,對促細胞生存基因實施調控。

3植物細胞死亡因子與內質網脅迫應答

3.1異三聚體G蛋白

針對擬南芥異源三聚體G蛋白來講,當其持續被脅迫信號進行誘導時,其在整個程序性細胞死亡當中發揮著重要作用。針對異三聚體G蛋白來講,其主要由3中亞基組成,分別為 、 與 ,針對G 來講嗎,其擁有GTPase活性。有研究指出,在與內質網脅存在關聯的程序性細胞死亡中,異三聚體G蛋白均有一定參與。在整個擬南芥當中,當將G 敲除之后,如果培養基中含有內質網脅迫誘導劑,那么其相比于對照野生型和G ,有更好的生長價值,由此表明,在植物中,暗示G (AGB1)能夠一定程度加速細胞死亡,但在報道其作用機制方面卻并不多。現實當中,有報道指出,當敲除G 后,針對突變體而言,其相比于野生型對照,在具體的內質網脅迫誘導劑上,會變得更為的敏感,AGB1具有穩定與促進細胞生存的作用,但針對其作用機制而言,仍需開展深入研究。

3.2 Metacaspase

在整個哺乳動物體系當中,caspase在細胞凋亡發揮著關鍵作用。而在植物細胞當中,并無細胞凋亡情況出現。針對植物當中的Metacaspase而言,其盡管無caspase活性,但是,其被當作與動物細胞凋亡當中的caspase同源。在擬南芥當中,其共有metacaspase9個,其中,針對metacaspase-8而言,有研究指出,其受UVC、過氧化氫影響,已經出現大幅度上調,并將細胞死亡途徑激活。除此之外,無論是在植物木質部形成方面,還是在重金屬脅迫上,均能檢測到相關于PCD類的caspase活性。

4結語

綜上,針對蛋白折疊而言,其乃是真核細胞基礎生物學的整個過程表現。對于內質網而言,其實為真核細胞的核心細胞器,全部分泌蛋白以及諸多膜蛋白,均需基于內質網中來加工,只有這樣方能向其他細胞器轉運,然后分泌至細胞外,實現生物學功能的最大化發揮。隨著膜結合轉錄因子bZIP28、bZIP60的被發現,其為植物內質網脅迫領域的深入研究,開辟了新思路、新途徑。

參考文獻

[1] 張雙雙,劉建祥,陸孫杰.熱激轉錄因子HSFA1d參與植物內質網脅迫應答[J].中國科學:生命科學,2016,46(04):441.

[2] 陳清法,馮海霞,郭尚敬.內質網小分子量熱激蛋白的研究進展[J].安徽農業科學,2009,37(01):83-84.

[3] 曹廣燦,林一欣,薛梅真等.玉米種胚內質網脅迫相關基因對人工老化處理的響應[J].中國農業科學,2016,49(03):429-442.

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