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研究生等溫滴定量熱實驗課的教學探討

2018-12-11 09:54:08張玉蘋裘令瑛陶艷春
教育教學論壇 2018年49期

張玉蘋 裘令瑛 陶艷春

摘要:針對等溫滴定量熱技術(shù)是研究分子間相互作用的重要手段,在等溫滴定量熱實驗課中,教師針對本單位的研究體系,從學生的角度出發(fā),采用多種教學方式,重點向?qū)W生介紹儀器的注意事項、操作步驟、數(shù)據(jù)分析三方面內(nèi)容,使儀器的價值得到充分發(fā)揮,更好地為科研工作者提供數(shù)據(jù)支持。

關(guān)鍵詞:等溫滴定量熱;熱力學;分子間作用;教學討論

中圖分類號:G643 文獻標志碼:A 文章編號:1674-9324(2018)49-0261-02

等溫滴定量熱法(Isothermal Titration Calorimetry,ITC)是近年來發(fā)展起來的研究分子間相互作用的重要方法,其中包括蛋白和蛋白,蛋白和核酸,蛋白和小分子,蛋白和金屬離子,靶分子和藥物分子,酶和抑制劑,抗體和抗原等之間的相互作用[1-6]。ITC通過測定分子價鍵的打開和形成過程中吸收和釋放的熱量來獲取分子間相互作用的定性和定量信息,如:結(jié)合常數(shù)(KD)、反應(yīng)化學計量(n)、反應(yīng)焓變(ΔH)和反應(yīng)熵變(ΔS)等。由于此方法具有較高靈敏度、較好重現(xiàn)性、測試直接、無需標記等特點,被廣泛的應(yīng)用于基礎(chǔ)科學研究和藥物研發(fā)等多個領(lǐng)域[7,8]。目前,許多高校、研究所、藥企也都將ITC作為研究分子間相互作用、確認藥-靶結(jié)合和改造藥物的黃金標準技術(shù)。隨著國家對科學研究的資金投入,高校和研究所對貴重科研儀器的購買增多,如何高效使用等溫滴定量熱儀更好地服務(wù)于科研工作者,是科研單位需要認真思考的問題。下面結(jié)合實際經(jīng)驗,以ITC200型超微量等溫滴定量熱儀為例,從儀器的注意事項、操作步驟、數(shù)據(jù)分析三方面,談?wù)勅绾螌W生進行規(guī)范的等溫滴定量熱實驗教學。

一、儀器的使用注意事項

將等溫滴定量熱儀對研究生開放使用,一方面能提高儀器的利用率,充分發(fā)揮儀器的使用價值;另一方面能促進學生與儀器親密接觸,及時獲取實驗數(shù)據(jù),為開展高水平的科學研究奠定基礎(chǔ)。由于等溫滴定量熱儀屬于高端精密儀器,其原理及操作較為復(fù)雜,一旦操作使用不當,易造成儀器損壞,后果不堪設(shè)想,所以,有必要對每一位測試學生進行詳細的儀器理論講解與嚴格的上機操作培訓(xùn)。

首先,要讓上機操作的學生掌握儀器的原理、結(jié)構(gòu)組成,熟悉測試流程及詳細的操作步驟,掌握數(shù)據(jù)的處理分析等。例如,ITC200型超微量等溫滴定量熱儀的組成部件主要包括塔臺、注射針、反應(yīng)滴定針、樣品反應(yīng)池、清洗樣品反應(yīng)池的小型機械泵、高速旋轉(zhuǎn)的攪拌器、檢測器、控制器、清洗用的溶液甁以及用于連接控制器的電腦等。其中,用于測試的反應(yīng)滴定針由石英玻璃制成,易破碎,使用前應(yīng)仔細檢測是否破裂,測試過程中,謹記輕拿輕放,將金屬接頭插入固定支架上的鏈接孔時,輕輕擰緊即可,切勿用力擰死。比如,實驗前應(yīng)確認樣品池、參比池、注射器等部件的干凈,一定要依次用甲醇、蒸餾水、緩沖液對它們進行清洗,在水滴水實驗的噪音水平達到測試要求后才可以開始測試樣品。

其次,介紹正常儀器操作中可能出現(xiàn)的異常情況,這些情況的出現(xiàn)不僅會影響儀器的狀態(tài),還會對實驗數(shù)據(jù)以及后面的學生的實驗造成影響。比如儀器設(shè)備要求環(huán)境潔凈且無震動,測試時人為帶來的強光、氣流波動、儀器震動等,都將會影響測量結(jié)果,產(chǎn)生測試誤差。再如,嚴禁學生私自使用U盤拷貝數(shù)據(jù),一旦有病毒帶入將會導(dǎo)致主機癱瘓,造成實驗數(shù)據(jù)丟失甚至重裝儀器控制軟件的風險,這將會影響學生的數(shù)據(jù)采集和科研成果的發(fā)表,所以我們要求學生用光盤刻錄存儲數(shù)據(jù)已保證儀器的正常使用。以上事例要反復(fù)強調(diào),否則會對學生、老師及實驗室造成極大的影響。

二、測試操作步驟

為了讓學生更加明白儀器的組成與原理、測試流程、操作方法、注意事項等,教師應(yīng)采用理論與實踐相結(jié)合的方式,通過測試某一樣品為例詳細講解,提高教學效果。下面以美國通用電氣公司生產(chǎn)的ITC200型超微量等溫滴定量熱儀為事例展開討論,具體測試操作步驟如下。①采用水滴水實驗,確認儀器樣品池是否干凈。②選擇合適的緩沖液,準備待測樣品。③根據(jù)待測樣品特性進行實驗設(shè)計,由儀器軟件給出預(yù)估實驗結(jié)果圖,以及推薦使用的樣品濃度。④樣品池加樣、參比池加超純水、滴定注射器加樣。⑤設(shè)置實驗參數(shù)(如總注射次數(shù)、樣品池溫度、滴定時間間隔、攪拌器轉(zhuǎn)速、單次滴定體積、兩次滴定的時間間隔、數(shù)據(jù)輸出頻率)。⑥測試結(jié)束后,保存實驗數(shù)據(jù)文件和實驗參數(shù)文件,并重復(fù)步驟1做好儀器的清潔。

實驗的成功主要取決于兩點:一是儀器的干凈程度,二是待測樣品的配制。教師應(yīng)詳細介紹如何確認樣品池是否干凈。比如,先向樣品池、參比池、滴定注射器加入超純水,接著采用水滴水的實驗確認是否干凈,只有噪音水平達到測試要求才可以開始測試樣品。若樣品池太臟可采用去垢劑、高溫泡洗。準備待測樣品時,教師需重點強調(diào)滴定物與被滴定物間的緩沖液、pH、鹽濃度、DMSO濃度等保持完全一致,并且要在同一緩沖液中透析或者置換大分子和配體。雖然DMSO對小分子有助溶效果,但也要控制量,最好不要超過5%,不然會破壞蛋白,對于水溶性太差的樣品,可借助超聲、加溫、調(diào)pH等方法。在確定樣品濃度后,依次對樣品池、參比池、滴定注射器加樣。此部分內(nèi)容不僅要詳細介紹,還要有教師與學生的互動,通過理論與實際動手操作,讓學生掌握加樣的流程與細節(jié)。實驗結(jié)束后,在Setup模式下分別點擊Data File Path與Setup File Path中的文件夾名稱,保存實驗數(shù)據(jù)文件和實驗參數(shù)文件。然后取出樣品池中的樣品,做好樣品池和滴定注射器的清洗。

三、數(shù)據(jù)處理分析

等溫滴定量熱法直接測量的是生物化學結(jié)合過程中釋放或吸收的熱量,通過計算給出結(jié)合常數(shù)(KD)、反應(yīng)化學計量(n)、焓(ΔH)和熵(ΔS)。因此,可以結(jié)合實例介紹數(shù)據(jù)分析的步驟,讓學生掌握數(shù)據(jù)處理分析的方法,尤其是如何扣除背景部分。具體的數(shù)據(jù)分析步驟如下:①將ITC實驗結(jié)果文件導(dǎo)入Origin軟件;②對原始數(shù)據(jù)進行積分,并刪除錯誤的點數(shù)據(jù);③利用點對點或最后幾個點扣除背景,并運用合適的結(jié)合模型擬合數(shù)據(jù);④觀察擬合效果,利用軟件計算得出結(jié)合常數(shù)(KD)、反應(yīng)化學計量(n)、焓(ΔH)和熵(ΔS)。在講解此部分內(nèi)容時,如何扣除背景應(yīng)重點強調(diào)。如點對點扣除背景時,“Cell Vol”樣品池體積的數(shù)值是不能更改的。再如用最后幾個點扣除背景時,需先觀察NDH的最后4—5滴的結(jié)果,與參照實驗結(jié)果類似且數(shù)值穩(wěn)定后,方可進行后續(xù)處理。在選擇模型擬合數(shù)據(jù)時,應(yīng)將技巧介紹給學生,如反復(fù)多次點擊直至Chi-Sqr值不再減小為止,以此提高擬合效果。對于擬合效果不好時,應(yīng)重點講解如何處理,比如調(diào)整滴定物或者被滴定物的濃度,重新實驗以達到好的擬合效果。

四、結(jié)束語

等溫滴定量熱技術(shù)是研究分子之間相互作用的重要手段,高速地推動著生物動力學與熱力學的蓬勃發(fā)展,尤其是在研究藥物—蛋白、蛋白—蛋白、酶催化等方面。作為實驗課教師應(yīng)該針對科研單位的研究體系,從學生的角度出發(fā),采用多種教學方式,安排實驗教學內(nèi)容,使等溫滴定量熱儀的價值得到充分發(fā)揮,并更好地為科研工作者提供有力的數(shù)據(jù)支持。

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