基于基因數據庫分析CBΧ2在非小細胞肺癌中的表達及臨床意義

秦麗麗（通訊作者）

（大理大學基礎醫學院 云南 大理 671000）

肺癌在全世界發病率極高，在美國肺癌致死率排在癌癥病死率的首位，其中非小細胞肺癌(non-Small cell lung cancer，NSCLC)占大多數[1]。盡管近年來肺癌相關診療方法日益進步，但確診時患者大多已處于中晚期，預后仍未得到顯著改善。色素框同源物(Chromobox protein homolog，CBX) 是多梳蛋白家族(Polycomb grouPproteins，PcG)的重要成員，PcG家族是一種表觀遺傳調控復合物，以聚合轉錄抑制復合體的形式存在，在調控細胞周期、細胞信號轉導及腫瘤發生等方面發揮著重要作用[2]。其中CBΧ2基因活性與細胞周期依賴性調節相關，并在腫瘤的發生、發展中發揮著重要作用[3]。Oncomine數據庫是目前全球最大的癌基因芯片數據平臺，可以方便地進行靶基因差異表達挖掘分析。本研究利用該數據庫及Kaplan-Meier Plotters數據庫，通過二次薈萃分析CBΧ2在NSCLC中的表達及對預后的影響，為進一步研究其促進NSCLC惡性進展的作用機制提供線索并奠定理論基礎。

1.材料和方法

1.1 Oncomine數據庫提取數據

登錄Oncomine數據庫(https：//www.oncomine.Org/)，在該數據庫中設定檢索條件后提取數據。設定的篩選條件具體如：①“Cancer Type：Lung cancer”；②“Gene：CBΧ2”；③“Data Type：mRNA和DNA copy number”；④“Analysis Type：Cancer vs Normal Analysis”；⑤臨界值設定條件Pvalue＜1E-4，fold change＞2，gene rank=toP10%。

1.2 Kaplan-Meier Plotter進行患者生存周期分析

登錄Kaplan-Meier Plotter數據庫（http：//kmplot.com/analysis/）對NSCLC數據集進行在線生存分析。設定篩選條件如下：①“Cancer：Lung Cancer”；②“Gene：CBΧ2”；③“Survival：OS”。

1.3 統計學方法

正常組織與NSCLC組之間CBΧ2表達差異采用t檢驗。CBΧ2表達與NSCLC預后的關系采用Kaplan-Meier模型分析。所用數據采用Oncomine 數據庫和Kaplan-Meier Plotter 數據庫在線統計學分析，P＜0.05 認為差異具有統計學意義。

2.結果

2.1 CBΧ2在NSCLC中的表達結果

自2001年開始在Oncomine數據庫中共有13項研究涉及比較CBΧ2在 NSCLC組織和正常組織中的表達，共有1896個樣本，包括肺腺癌、鱗癌及大細胞肺癌與正常組織比較。文章分別發表于PNAS、Cancer research、science translational medicine、PLoS One等雜志。薈萃分析13項研究結果發現：與正常組織相比，CBΧ2基因在NSCLC中高表達(P＝2.93e-7)（圖1）。

圖1 CBΧ2在Oncomine數據庫中非小細胞肺癌中的表達

2.2 CBΧ2在不同NSCLC研究芯片中和正常組織之間的的表達差異

圖2所示為Oncomine數據庫中CBΧ2在不同NSCLC研究芯片中的表達結果。分別在Hou等[4]、weiss等[5]和selamat等[6]3項研究中，CBΧ2在NSCLC中的表達量高于正常組（P＜0.01）。

圖2 Oncomine 數據庫中CBΧ2 在不同非小細胞肺癌研究芯片中的表達(P均＜0.01)

2.3 CBΧ2與NSCLC患者預后的關系

為進一步明確CBΧ2表達與NSCLC預后之間的關系，利用Kaplan-Meier Plotter數據庫進行在線生存分析，結果顯示：CBΧ2表達水平與患者的生存時間呈現明顯負相關。與低表達組相比，CBΧ2高表達組NSCLC患者的總生存時間顯著降低（P=0.0027）（圖3）。

圖3 Kaplan-Meier Plotter 數據庫分析CBΧ2對非小細胞肺癌患者預后的影響

3.討論

肺癌是全世界最常見的惡性腫瘤之一，每年全球約有159萬患者死于此疾病，其中非小細胞肺癌是最主要的組織類型約占85%[7]。晚期NSCLC標準一線治療含鉑兩藥聯合方案化療雖可延長生存期，但療效不盡人意。隨著精準醫療時代的到來，NSCLC 的治療方案由傳統化療發展為個體化精準治療。雖近幾十年基于EGFR、ALK、ROS1 等肺腺癌驅動基因的靶向藥物極大地改善了肺腺癌患者的生存預后，但這些基因的突變僅存在于部分患者中[8]。因此，尋找NSCLC的新靶點，對于研發治療肺癌的新靶向藥物具有重要的臨床意義。多項研究表明多梳蛋白家族成員CBΧ2在腫瘤的惡性進展中發揮著重要作用。Chen等[9]通過對455例乳腺癌組織標本進行免疫組化分析發現CBΧ2在乳腺癌中的表達水平明顯高于癌旁組織，并且其異常高表達與乳腺癌的分期晚及預后不良相關。Clermont等[10]研究發現在轉移性前列腺癌和去勢抵抗性前列腺癌中CBΧ2異常高表達，揭示了CBΧ2能控制細胞增殖和轉移的許多關鍵調控因子的表達，從而促進其惡性增殖和侵襲轉移能力。目前CBΧ2與腫瘤的研究仍處于初步階段，其作用及機制仍需進一步探索。本文只是基于數據庫大樣本量對基因表達水平進行分析，缺乏對蛋白水平的進一步驗證.可以明確的是CBΧ2的表達與NSCLC患者預后相關，但其作用機制需要進一步的實驗證明。

綜上所述，我們通過對基因數據庫中腫瘤CBΧ2基因與NSCLC的相關信息深入挖掘分析，提示CBΧ2在NSCLC組織中高表達，且與NSCLC預后相關。本文結果為探索CBΧ2影響NSCLC進展機制奠定了理論基礎，同時CBΧ2的表達在一定程度上可作為反映NSCLC預后的重要生物標志物，可能為NSCLC早期診斷、判斷預后和治療提供臨床依據。