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急性缺血性卒中患者血清miRNA-148a表達水平檢測及其臨床價值預探索

2019-12-31 02:05:58郭桂珍韓榮勝王有清劉慶春
中國卒中雜志 2019年11期
關鍵詞:信號水平研究

郭桂珍,韓榮勝,王有清,劉慶春

急性缺血性卒中(acute ischemic stroke,AIS)是神經內科最常見的危重癥之一,其致死率和致殘率均較高[1]。據統計數據顯示,我國每年新增卒中患者近200萬例,其中接近80%為缺血性卒中[2-3]。因此,進一步探討AIS可能的分子標志物顯得十分重要。微小RNA(microRNA,miRNA)是一類長度為19~25 bp的小分子RNA,可在轉錄后水平對基因表達進行負調控,從而參與細胞增殖、分化、凋亡等多種生物學過程[4]。miRNA-148a定位于7號染色體7p15.2,與炎癥免疫性疾病和腫瘤的發生發展密切相關[5]。近期研究也發現,miRNA-148a可調節組織的缺血預適應損傷,并與創傷性腦損害的病理過程有關[6-7]。然而,關于miRNA-148a在AIS中的表達水平及臨床價值尚未見報道。本研究通過分析AIS患者外周血血清的miRNA-148a水平及臨床資料,以探討miRNA-148a在AIS發病和病情評估方面的潛在價值;同時,運用生物信息學方法預測miRNA-148a可能的調節機制,為后續研究提供理論基礎。

1 研究對象與方法

1.1 研究對象 本研究為前瞻性研究,選取2017年10月-2018年4月青海省第五人民醫院神經內科收治的AIS患者42例為觀察組,其中男性25例,女性17例,平均年齡62.4±9.3歲。納入標準:①年齡40~85歲,首次發病且發病至入院時間<12 h;②AIS的診斷符合2014年中國急性缺血性卒中診治指南[3]。排除標準:①合并出血性卒中、顱內血管畸形等神經系統疾??;②合并心絞痛、心肌梗死、感染、炎癥免疫性疾病、惡性腫瘤、血液病等;③嚴重心力衰竭、嚴重肝腎功能不全者;④近期口服免疫抑制劑、糖皮質激素或細胞毒性藥物。選取于本院體檢中心接受體檢且確定無全身疾病者42例為健康對照組,根據年齡和性別與觀察組進行1∶1匹配。本研究經醫院倫理委員會批準,所有研究對象均知情同意。

1.2 資料收集 收集年齡、性別、高血壓史、糖尿病史、吸煙史等基本臨床資料,記錄AIS患者發病至入院的時間,并根據顱內MRI結果計算梗死灶最大層面直徑。其中,直徑<1.5 cm為腔隙性腦梗死,1.5~5.0 cm為中等面積腦梗死,>5.0 cm為大面積腦梗死[8]。收集患者生化指標檢測結果,包括LDL-C、HDL-C、入院血糖、Cr、hs-CRP等。

所有研究對象至醫院后即刻抽取其肘靜脈血5 mL于非抗凝管中,3000 g×15 min離心,取上清液分裝于離心管中并儲存于-80 ℃冰箱,以便統一檢測miRNA-148a水平。采用Trizol裂解液提取血清樣本的總RNA,RNA反轉錄合成cDNA。然后以cDNA為模板采用實時定量聚合酶鏈反應技術進行基因片段擴增,儀器為Bio-Rad iQ5實時熒光定量聚合酶鏈反應儀。其中,miRNA-148a的上游引物序列為5'-TCAGTGCACTACAGAACTTTGT-3',下游引物序列為5'-GCTGTCAACGATACGCT ACGT-3'。U6核小分子RNA作為內參基因,其上游引物序列為5'-CGCTTCGGCAGCACAT ATA-3',下游引物序列為5'-TTCACGAAT TTGCGTGTCAT-3'。反應條件為:95 ℃預變性30 s,40個循環(95 ℃ 5 s、60 ℃ 30 s、72 ℃ 30 s)。miRNA-148a的相對表達量采用2-ΔΔCt法計算。

1.3 公共數據分析 從基因表達綜合數據庫(Gene Expression Omnibus,GEO)(https:// www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)下載數據集GSE55937[9]。該數據集共收集24例AIS患者和24例健康對照者的外周血樣本,采用Affymetrix公司的Multispecies miRNA-3 Array芯片進行檢測,平臺號為GPL16384。下載數據為CEL格式,采用R軟件的affy包進行背景校正、數據標準化和log2轉換后用于后續分析。

1.4 生物信息學分析 采用miRDB、miRTar Base和TargetScan數據庫分別對miRNA-148a的靶基因進行預測,其結果取交集后得到最終的靶基因。采用Cytoscape 3.6.0軟件構建miRNA-148a的靶基因調控網絡。然后,利用DAVID 6.8在線工具對靶基因進行富集分析,包括基因本體論(gene ontology,GO)-生物學過程、京都基因和基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信號通路,其結果用超幾何分布進行統計學檢測。

1.5 統計學方法 采用GraphPad 6.0軟件進行統計學分析。采用Kolmogorov-Smirnov法進行正態檢測,所有計量資料均符合正態分布,用表示,其組間比較采用獨立樣本t檢驗。計數資料用頻數(%)表示,其組間比較采用χ2檢驗。采用Spearman相關性檢驗分析miRNA-148a水平與AIS患者臨床資料之間的關系。繪制miRNA-148a對AIS診斷的受試者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲線,以曲線下面積反映其診斷效能。P<0.05為差異具有統計學意義。

2 結果

2.1 miRNA-148a在急性缺血性卒中患者中的表達 AIS組患者入院時的血清miRNA-148a相對表達量為0.76±0.23,而健康對照組的miRNA-148a相對表達量為1.02±0.21,差異具有統計學意義(t=5.392,P<0.001)。ROC曲線分析提示,miRNA-148a診斷AIS的曲線下面積為0.79(95%CI0.70~0.89,P<0.001)(圖1)。

2.2 miRNA-148a與急性缺血性卒中患者臨床資料的相關性 根據AIS患者miRNA-148a相對表達量的中位數將其分為低水平組(<0.74,n=21)和高水平組(≥0.74,n=21),結果表明兩組患者的腦梗死面積、HDL-C和hs-CRP水平存在顯著差異(表1)。Spearman相關性分析提示AIS患者的miRNA-148a水平與腦梗死面積(r=-0.34,P=0.03)和hs-CRP(r=-0.43,P=0.005)均負相關,而與其他臨床資料無關。

2.3 GSE55937數據集中miRNA-148a的表達在公共數據集G SE55937中,A IS患者的miRNA-148a相對表達量為1.93±0.46,而對照組的miRNA-148a相對表達量為2.52±1.00,差異具有統計學意義(t=2.64,P=0.011)。ROC曲線分析表明,miRNA-148a診斷AIS的曲線下面積為0.69(95%CI0.54~0.84,P=0.022)(圖2)。

2.4 生物信息學分析 miRDB、miRTarBase和TargetScan 三個數據庫同時預測到58個miRNA-148a的靶基因,包括WNT10B、DNMT1等(圖3)。GO和KEGG富集分析提示,這些靶基因主要涉及的生物學過程包括細胞凋亡的正向調控、神經元分化以及凋亡相關的線粒體膜蛋白插入的正向調控等,主要涉及的信號通路包括叉頭框轉錄因子O亞族信號通路、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B信號通路、轉化生長因子-β信號通路等(表2)。

表1 不同miRNA-148a水平組急性缺血性卒中患者的臨床資料比較

圖2 GSE55937數據集中miRNA-148a的表達情況(左)及其診斷急性缺血性卒中的受試者工作曲線(右)

圖3 miRNA-148a的靶基因預測(左)及其調控網絡(右)

3 討論

目前,AIS的發病率在我國乃至世界范圍內仍居高不下,嚴重威脅人類健康并加重社會負擔。因此,尋找AIS有效的生物標志物有重要臨床意義。外周血miRNA相對穩定、不易降解且其檢測方法較為敏感、準確,可作為臨床疾病潛在診斷和病情鑒別的新型標志物[10]。既往研究提示,miRNA在神經系統發育和功能上起到重要作用[11]。miRNA與神經系統疾病的關系也是近年來的熱點研究問題,而腦血管疾病患者的外周血miRNA也存在不同程度的差異表達。例如,Lili Zeng等[12]的研究發現AIS患者外周血的miRNA-210表達水平較對照組顯著下降,尤其在發病后第7天和第14天更為明顯,可能是診斷AIS的潛在標志物之一。而Jingru Wang等[13]近期的研究提示,miRNA-148/152家族的另一成員miRNA-148b可通過影響Wnt信號通路蛋白,從而參與AIS后的腦組織修復過程。本研究通過分析AIS患者的臨床數據和公共數據庫數據,均發現miRNA-148a在AIS患者中水平降低,且在一定程度上可反映腦梗死嚴重程度和炎癥水平。

表2 miRNA-148a靶基因的富集分析

通過生物信息學分析,本研究共預測到58個miRNA-148a的靶基因,包括WEN10B、DNMT1等。有研究表明,miRNA-148a可通過與WEN10B直接結合,進而抑制Wnt/β-catenin通路[14]。而DNMT1是miRNA-148a的重要的靶基因[15]。抑制DNMT1則有助于保護腦缺血性損傷[16]。以上這些靶基因主要涉及細胞凋亡、FoxO信號通路、PI3K-Akt通路等分子機制。近年來的觀點認為,腦缺血核心區以壞死為主,而缺血程度較輕的半暗帶則以凋亡性死亡為主,因此細胞凋亡也是腦缺血造成神經系統損傷的重要機制[17]。FoxO信號通路參與調控細胞抗氧化應激、DNA修復和凋亡等過程[18]。Deyuan Li等[19]研究表明,FoxO信號通路蛋白FOXO3a與腦缺血缺氧模型大鼠的神經細胞凋亡有關,而PI3K-Akt通路則是調節AIS信號轉導的重要機制之一,應用PI3K抑制劑LY294002可降低磷酸化的Akt水平,增加腦梗死體積[20]。因此,miRNA-148a可能通過調控WEN10B、DNMT1等靶基因,影響細胞凋亡和FoxO、PI3K-Akt等信號通路,從而參與AIS的發生發展。

在GEO數據庫的GSE55937數據集中,AIS組miRNA-148a的表達水平也明顯低于對照組,且miRNA-148a對AIS具有一定的診斷效能,表明本研究的結論相對穩定。此外,本研究利用多個miRNA數據庫對miRNA-148a的靶基因進行預測,其預測的結果也相對可靠。但本研究仍有以下不足:①臨床數據的樣本較小且為單中心研究,因此可能導致結果有一定的偏倚;②所采集的樣本均為外周血血清樣本,不能明確腦組織中miRNA-148a的表達情況,但如前所述,外周血miRNA相對穩定,其檢測方法較為敏感準確;③因本研究重點關注miRNA-148a在AIS早期的變化,故未對其進行連續監測,不能明確AIS患者發病后miRNA-148a的動態水平。

綜上所述,A IS患者發病早期的血清miRNA-148a降低,在一定程度上可反映腦梗死程度和炎癥水平,可能涉及細胞凋亡和FoxO、PI3K-Akt等信號通路。因此,miRNA-148a可能在AIS的診斷及病情評估方面具有一定參考價值。

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