魏丹丹, 謝中藝, 楊帆帆, 林立萍, 黃新祥, 張盈
(江蘇大學醫學院, 江蘇 鎮江 212013)
傷寒沙門菌(Salmonellaentericaserovar Typhi,S. Typhi)屬于腸桿菌科沙門菌屬,人類是其唯一的感染宿主[1]??山浖S口途徑傳播感染人體引起消化系統感染,緊接著S. Typhi侵入腸壁淋巴組織并沿著淋巴管進入腸系膜淋巴組織,并被巨噬細胞吞噬,S. Typhi能夠在巨噬細胞內存活和增殖,通過淋巴液及血液循環擴散到全身造成系統性感染[2]。
OmpR是雙組分調節系統EnvZ/OmpR中的調節蛋白,磷酸化的OmpR參與許多信號傳導[3]。研究表明,OmpR對酸應激、滲透壓調節、上皮細胞侵襲能力等有重要意義[4],并且也是細菌氧化應激調控網絡的一部分[5]。EnvZ/OmpR雙組分系統也可通過沙門氏菌致病島2(SalmonellaPathogenicity Island-2,SPI-2)調控Ⅲ型分泌系統(T3SS)的表達,從而影響細菌的毒力[6]。本研究利用ompR基因缺陷株(ΔompR)及回補株(C-ΔompR),探討OmpR對S. Typhi巨噬細胞內生存能力的影響,并通過分析OmpR對細菌巨噬細胞內生存能力相關的SPI-2中3個操縱子首基因ssrA、ssrB和spiC的調控關系來研究其分子機制。
1.1.1 菌株與質粒S. Typhi野生株GIFU10007(WT)由日本岐阜大學醫學院微生物學教研室饋贈;S. Typhi空載體對照株(WT-pBAD33),ompR缺陷帶空質粒株(ΔompR-pBAD33),ompR回補株(C-ΔompR),ompR-pET28a-BL21重組蛋白表達菌由本實驗室制備及保存;pBAD33質粒(氯霉素抗性)、pBAD33-ompR(ompR回補質粒);pHRP309-ssrA、pHRP309-ssrB和pHRP309-spiC分別為ssrA、ssrB和spiC基因啟動子序列與pHRP309中的lacZ基因相連。
1.1.2 主要試劑 巨噬細胞THP-1購自上海生科院細胞庫;Trizol試劑為Invitrogen公司產品; 逆轉錄試劑盒、SYBR熒光定量試劑盒、快速DNA消化試劑盒均為TaKaRa公司產品;凝膠阻滯實驗(EMSA)上樣緩沖液為碧云天生物技術有限公司產品;β-半乳糖苷酶活性檢測試劑盒為Promega公司產品。
1.1.3 主要儀器 核酸紫外檢測儀(德國Eppendorf公司);凝膠成像系統(英國SynGene公司);ABI2720型PCR儀,高速冷凍離心機以及CO2細胞培養箱均為美國Thermo公司產品;熒光定量PCR儀,電轉化儀Gene Pulsero Ⅱ以及酶標儀均為美國Bio-Rad公司產品。
1.1.4 引物 基因特異性引物由蘇州泓訊生物科技有限公司合成,序列見表1(下劃線表示酶切位點)。

表1 特異性引物名稱及相應序列
1.2.1 細菌培養 將WT-pBAD33、ΔompR-pBAD33以及C-ΔompR接種于液體LB培養基中,37℃,250 r/min培養過夜作為種子液。按1 ∶100將種子液轉接至新鮮的LB培養液中培養至對數早期[D(600 nm)約為0.4],加入0.2%(w/v)L-阿拉伯糖繼續培養30 min以誘導ompR的表達。
1.2.2 THP-1胞內生存實驗 THP-1細胞用含10%胎牛血清的RPMI 1640培養液,在37℃、5% CO2培養箱靜置培養。細胞培養板中每孔接種5×105細胞,加入150 ng/mL佛波乙酯誘導THP-1細胞分化48 h,誘導率約為70%。實驗前1 h給細胞換上新鮮的RPMI 1640培養液。將WT-pBAD33、ΔompR-pBAD33和C-ΔompR菌株按“1.2.1”所述培養誘導后,按MOI=10 ∶1加入THP-1細胞培養板中培養1 h。每孔加入100 μg/mL慶大霉素后繼續培養1 h殺死胞外菌,棄上清液,PBS洗3次,將全部孔分為3等份。1/3孔內加入1 mL 0.5%(v/v)Triton X-100裂解細胞,適當稀釋后涂在LB平板,37℃過夜培養后計數平板上的菌落并乘以稀釋倍數記為T0;后2/3孔棄去1/2體積的培養液并加入等量新鮮培養液繼續分別培養12 h和24 h,然后同樣的方法計數菌落數記為T12和T24。計算并比較不同菌株的T12/T0和T24/T0(分別代表12 h和24 h細菌在巨噬細胞胞內存活能力)。實驗進行3次生物學重復。
1.2.3 RNA提取和實時熒光定量PCR(qRT-PCR) 將WT-pBAD33和ΔompR-pBAD33分別接種至液體LB培養基,培養至對數早期,離心收集菌體。Tri-zol法提取細菌總RNA,取1 μg總RNA,DNA消化試劑盒消化基因組DNA后利用逆轉錄試劑盒將其逆轉錄為cDNA。使用ssrA、ssrB和spiC特異性引物進行qRT-PCR,以16 S rRNA為內參基因,采用相對定量法分析各基因mRNA表達水平。每組設有平行樣,實驗重復3次。
1.2.4 β-半乳糖苷酶活性檢測 以S. Typhi基因組DNA為模板,利用特異性引物(序列見表1)PCR擴增目的片段,與pHRP309質粒進行雙酶切后酶連,將產物熱擊至DH5α感受態細胞中,篩選陽性克隆提取質粒測序,序列比對完全正確后,將LacZ重組載體分別電轉至WT和ΔompR感受態細胞中,PCR驗證后,即菌株構建成功。將攜帶有LacZ重組質粒的WT和ΔompR培養至對數中期,離心棄上清, 預冷的 PBS洗滌2次后重懸。超聲儀破菌,β-半乳糖苷酶活性檢測酶聯板孔中分別加入WT和ΔompR上清液,加入30 μL檢測液后混勻,37℃靜置至溶液完全變黃,記錄反應時間,加入反應終止液混勻,利用酶標儀檢測混合液的D(415 nm)值和D(595 nm)值。實驗3次生物學重復。Miller Units的數值用來表示β-半乳糖苷酶活性,計算公式如下:Miller單位= 106×稀釋倍數×[D(415 nm)-D(595 nm)]×1.75/[體積(μL)×作用時間(min)×D(600 nm)]。
1.2.5 OmpR蛋白的表達及純化 接種ompR-pET28a-BL21重組蛋白表達菌至液體LB培養基中培養至對數期[D(600 nm)約為0.6],加入1 mmol/L IPTG,30℃,100 r/min誘導6 h。收集菌體后超聲波破碎,離心(13 400 r/min,4℃,30 min),收集上清,用Ni柱純化后轉入透析袋中冰上透析,用PEG2000吸去透析袋中部分水分以濃縮蛋白,測濃度后使用SDS-PAGE分析其純度,置于-80℃保存。
1.2.6 凝膠阻滯實驗 以WT基因組DNA為模板,PCR特異性擴增ssrA、ssrB和spiC基因起始密碼子上游約500 bp的啟動子區域序列并純化,16 S DNA作為陰性對照(引物見表1)。已純化的His-OmpR蛋白溶液加入含20 mmol/L新鮮乙酰磷酸鹽的結合緩沖液,室溫孵育10 min使OmpR磷酸化,結合體系配制完成后,分別加入100 ng各基因啟動子區DNA片段,30℃溫育30 min后進行6%聚丙烯酰胺凝膠電泳,溴化乙啶染色后于凝膠成像儀顯影且分析結果。
利用GraphPad Prism 6.0統計軟件分析數據,多組間均數比較采用單因素方差分析,兩組間均數比較采用t檢驗。P<0.05表示差異有統計學意義。
為了研究OmpR對細菌巨噬細胞內生存力的影響,使用WT-pBAD33、ΔompR-pBAD33和C-ΔompR菌株進行THP-1胞內生存力實驗。結果顯示,ΔompR-pBAD33在巨噬細胞內的生存力相較于WT-pBAD33顯著降低,而C-ΔompR生存能力較ΔompR-pBAD33部分恢復(P<0.01,圖1),說明ompR的缺失可使S. Typhi在巨噬細胞內的生存能力下降。

a: P<0.05,b: P<0.01,與同時間點WT-pBAD33比較
選擇與巨噬細胞內生存能力密切相關的SPI-2中3個操縱子的首基因ssrA、ssrB和spiC進行qRT-PCR分析,結果顯示,ΔompR-pBAD33中ssrA、ssrB和spiC的mRNA水平較WT-pBAD33明顯降低(P<0.01)。進一步利用β-半乳糖苷酶活性檢測實驗研究OmpR對ssrA、ssrB和spiC轉錄活性的影響,結果顯示,ΔompR中ssrA、ssrB和spiC的β-半乳糖苷酶活性比WT明顯降低(P<0.01)。見圖2。以上結果表明,OmpR正向調控ssrA、ssrB和spiC的轉錄。

a:P<0.05,b:P<0.01,與WT-pBAD33比較
圖2 qRT-PCR和β-半乳糖苷酶活性實驗檢測ssrA、ssrB和spiC的mRNA水平
為了獲得OmpR蛋白,使用BL21表達菌株表達His-OmpR蛋白。如圖3所示,經1 mmol/L IPTG誘導后,His-OmpR蛋白的表達量較未誘導明顯增加,并且在上清液中有His-OmpR蛋白的存在,說明表達了可溶性的蛋白;經Ni柱純化后,只有單一的目的條帶,說明去除了其他非目的蛋白;進一步經濃縮后,使用相同體積的蛋白樣進行SDS-PAGE,條帶明顯加深,說明蛋白濃度明顯增加,達到了濃縮的目的。

M:蛋白分子量標準參照物
利用凝膠阻滯實驗檢測His-OmpR蛋白與ssrA、ssrB和spiC基因啟動子區域的相互作用。如圖4所示:His-OmpR與ssrA、ssrB和spiC的啟動子區域均有結合,且兩者的結合均呈現劑量依賴性。以上結果表明,OmpR蛋白能直接與ssrA、ssrB和spiC的啟動子區域結合來調節這些基因的表達。

16S DNA:陰性對照,1~8泳道分別加入濃度依次遞增的蛋白
圖4ssrA、ssrB和spiC的凝膠阻滯實驗
S. Typhi是常見的腸道致病菌,可感染人體消化系統進而侵入淋巴系統引起全身癥狀[7]。S. Typhi感染人體后能夠逃避免疫系統的殺傷,在被巨噬細胞吞噬后仍然能夠存活且具有復制能力[8]。
S. Typhi在吞噬細胞內的復制是由SPI-2控制,SPI-2編碼的T3SS-2在巨噬細胞內起作用。T3SS可將效應蛋白穿過吞噬體膜輸送至宿主細胞的胞質中,對細菌在真核細胞內的存活有著重要作用[9]。目前認為,參與SPI-2基因表達調控的雙組分系統共有3套:EnvZ/OmpR、SsrA/SsrB和PhoP/PhoQ。SsrA/SsrB中的反應調節因子SsrB可激活SPI-2結構基因的表達[10]。SpiC蛋白(也稱為SsaB蛋白)是由SPI-2編碼的含127個氨基酸的蛋白質。SpiC蛋白作為T3SS2的效應蛋白,既可介導其他效應器的分泌,也能通過干擾宿主Hook3和(或)Tassc蛋白的活性,抑制含沙門氏菌的噬菌體與溶酶體和吞噬體的融合。spiC突變體無法在巨噬細胞內復制,并且對小鼠的毒力減弱[11]。OmpR調節蛋白在ssrA和ssaB的基因區域富集,說明OmpR與SPI-2之間有著復雜的聯系[12]。本文選擇SPI-2中3個操縱子的首基因ssrA、ssrB和spiC,通過qRT-PCR和β-半乳糖苷酶活性實驗發現 OmpR可促進這些基因的轉錄。進一步的EMSA實驗顯示,磷酸化的OmpR可直接與ssrA、ssrB和spiC基因啟動子區域結合。綜上所述,OmpR能夠直接調節巨噬細胞內生存力相關基因ssrA、ssrB和spiC的表達,從而增強S. Typhi在巨噬細胞內的生存能力。此研究為進一步探討OmpR的功能及相關分子調控機制奠定了基礎。