李 宏,劉萌萌,唐中偉,李友蓮
(1.山西農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,山西太谷030801;2.山西農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,山西太谷030801)
隨著基因組學(xué)和代謝工程技術(shù)的不斷發(fā)展,各種代謝途徑的關(guān)鍵酶基因得到廣泛的研究,相關(guān)的工程酵母也逐漸被大家關(guān)注。酵母與動(dòng)物、植物都為真核生物,具有生長(zhǎng)繁殖較快、代謝周期較短、容易分離和培養(yǎng)等特點(diǎn),可廣泛應(yīng)用于構(gòu)建真核生物模型,研究相關(guān)目的基因的功能等。釀酒酵母是單細(xì)胞真核微生物,屬于酵母屬(Saccharomyces)釀酒酵母種(Saccharomyces cerevisiae)。工程酵母INVSC1就是釀酒酵母中的一個(gè)重要代表種,又稱釀酒酵母INVSC1(CerevisiaeINVSC1),它生長(zhǎng)繁殖較快,代謝周期較短,發(fā)酵工藝簡(jiǎn)單,成本低廉,容易分離和培養(yǎng),而且全基因組比較小,遺傳代謝背景比較清楚,具有完整的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)和控制嚴(yán)密的基因表達(dá)調(diào)控系統(tǒng)機(jī)制,是外源基因[1]表達(dá)最為理想的真核生物表達(dá)系統(tǒng),由于易于對(duì)其基因組進(jìn)行連鎖分析、分子克隆及序列檢測(cè)等,所以,還可廣泛應(yīng)用于構(gòu)建真核生物模型和繪制更加詳細(xì)而精準(zhǔn)的遺傳譜圖,為人類的遺傳疾病治療和檢測(cè)水平提供強(qiáng)有力的支撐。
油脂是高級(jí)脂肪酸與甘油形成的酯,即三脂酰甘油(TAG)。三脂酰甘油的生物合成途徑主要是甘油-3-磷酸(Gly3P)和脂酰輔酶A(acyl-CoA)為前體并在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)酰基轉(zhuǎn)移酶作用下通過(guò)多步生物反應(yīng)合成的。其最后一步反應(yīng)在二脂酰甘油酰基轉(zhuǎn)移酶(DGAT)作用下形成。三脂酰甘油還可由PDAT途徑合成,即磷脂和二酰甘油在磷脂二酰甘油酰基轉(zhuǎn)移酶(PDAT)的作用下反應(yīng)生成TAG和溶血磷脂[2-3]。
H1246是酵母突變體TAG缺陷型的酵母菌株,該菌株中調(diào)控編碼TAG合成的DGA1(編碼DGAT)、LRO1基因(編碼PDAT)以及ARE1和ARE2基因(編碼膽固醇脂的合成)均已被敲除,可用于鑒定植物、動(dòng)物和微藻等真核生物三脂酰甘油(TAG)合成途徑中DGAT或PDAT的活性[4-5]。三脂酰甘油(TAG)可以由DGAT和PDAT途徑合成[6],由于H1246是TAG缺陷型酵母菌株,因而,不能通過(guò)上述途徑合成和積累TAG。而工程酵母INVSC1是正常型的酵母菌株,可以合成和積累TAG,用來(lái)驗(yàn)證相關(guān)目的基因的功能等。
近年來(lái),在工程酵母的研究與應(yīng)用方面取得了長(zhǎng)足的進(jìn)展。如趙偉軍[7]利用代謝工程技術(shù)對(duì)工業(yè)釀酒酵母菌株合成S-腺苷蛋氨酸(SAM)的代謝網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行優(yōu)化和改造,大幅度提高了該工業(yè)菌株生產(chǎn)SAM的能力;傅盈盈等[8]以油菜菌核病原菌為試驗(yàn)病菌,工程酵母INVSC1在溫度28℃條件下培養(yǎng)繁殖20 h后,經(jīng)測(cè)定,當(dāng)接種量為5% 時(shí),INVSC1對(duì)油菜菌核病原菌的抑菌效果最好;李媛等[9]通過(guò)對(duì)釀酒酵母基因工程菌的構(gòu)建和工藝優(yōu)化的研究以及加強(qiáng)對(duì)細(xì)胞代謝工程、基因組學(xué)、蛋白組學(xué)的商討,從而獲取了更多酵母的相關(guān)基因信息;王珍[10]通過(guò)對(duì)圓紅冬孢酵母細(xì)胞內(nèi)的DGAT基因進(jìn)行鑒定和功能性分析,確定了產(chǎn)油酵母圓紅冬孢酵母中只有RtDGATb具有DGAT的活性,并和油脂積累相關(guān)聯(lián),是調(diào)控油脂積累過(guò)程中的關(guān)鍵因素。這些成果為工程酵母各個(gè)方面的研究奠定了基礎(chǔ)。
本研究以工程酵母INVSC1和H1246為研究材料,通過(guò)培養(yǎng)并測(cè)定INVSC1與H1246的生長(zhǎng)曲線,經(jīng)尼羅紅染色、蘇丹黑染色、總脂肪酸含量測(cè)定、脂肪酸分析及薄層色譜分析等研究,分析工程酵母INVSC1與H1246的生長(zhǎng)狀況及目標(biāo)化合物積累情況,旨在為后期油脂代謝相關(guān)基因功能驗(yàn)證等分子生物學(xué)試驗(yàn)提供基礎(chǔ),同時(shí)為酵母互補(bǔ)試驗(yàn)提供一定的科學(xué)依據(jù)。
供試工程酵母INVSC1和H1246由山西農(nóng)業(yè)大學(xué)分子農(nóng)業(yè)與生物能源研究所提供。
1.2.1 生長(zhǎng)趨勢(shì)測(cè)定
1.2.1.1 培養(yǎng)基的配制及接種 分別稱取4 g酵母膏、8 g蛋白胨、8 g無(wú)水葡萄糖于1 000 mL容量瓶中,向容量瓶中加入400 mL蒸餾水,振蕩使其混合均勻制備為YPD液體培養(yǎng)基。將液體培養(yǎng)基于滅菌鍋高溫(120℃)高壓(33.78 kPa)中滅菌20 min。在已滅菌的YPD液體培養(yǎng)基中分別接入20μL工程酵母INVSC1和H1246菌種。
1.2.1.2 菌液濃度的測(cè)定 將接完菌的液體培養(yǎng)基于溫度30℃、轉(zhuǎn)速180 r/min的空氣浴振蕩器中振蕩,每2 h用移液槍分別吸取工程酵母INVSC1和H1246的培養(yǎng)基液體3 mL于2個(gè)比色皿中,以未接種酵母的YPD液體培養(yǎng)基作為對(duì)照,用紫外可見(jiàn)分光光度計(jì)測(cè)量其吸光度[11]并記錄數(shù)據(jù)。
1.2.2 工程酵母INVSC1和H1246菌株的尼羅紅染色[12]觀察 將INVSC1與H1246的菌液離心并將二者菌株匯集起來(lái),蒸餾水洗滌二者的沉淀,稀釋菌體沉淀,將菌液OD600調(diào)整至0.2~0.3(菌液濃度過(guò)高影響染色效果)。分別向菌液中依次加入菌液100μL、蒸餾水850μL、二甲基亞砜(DMSO)50μL、尼羅紅染液(5 mg/mL)10μL,強(qiáng)烈振蕩混合均勻5 s,避光染色1 min,用熒光相差顯微鏡觀察藍(lán)色激發(fā)光下酵母的染色情況,并記錄結(jié)果。
1.2.3 酵母中性油脂的檢測(cè) 將INVSC1與H1246的菌液離心并將二者菌株收集起來(lái),然后用蒸餾水洗滌二者的沉淀,并將菌體沉淀稀釋,將菌液OD600調(diào)整至0.4~0.5。用無(wú)菌水重懸菌體沉淀,混合均勻后5 000 r/min離心5 min,倒掉上清液,分別向INVSC1與H1246的離心管中加入3 mL 0.3% 的蘇丹黑[13-14]染液,染色15 min后于8 000 r/min下離心3 min后去掉上清液,分別向離心管中加入10 mL 70% 的酒精溶液混合均勻后離心去掉上清液,重復(fù)3次。用無(wú)菌水重懸菌體沉淀測(cè)OD580值,并記錄數(shù)據(jù)。
1.2.4 工程酵母INVSC1和H1246目標(biāo)化合物的提取與分析
1.2.4.1 總脂肪酸的提取 分別稱取50 mg充分研磨的工程酵母INVSC1與H1246酵母粉末于50 mL離心管中,加入7.5 mL的氯仿-甲醇(體積比為1∶2)混合溶劑,將離心管置于溫度37℃、轉(zhuǎn)速200 r/min的空氣浴振蕩器中抽提24 h。離心后收集上層有機(jī)相,向剩余的樣品殘?jiān)偌尤?.5 mL的氯仿-甲醇(體積比為1∶2)混合溶劑重復(fù)抽提12 h,并離心收集上層有機(jī)相,抽提3次并合并有機(jī)相。向收集上層有機(jī)相的離心管中加入5 mL氯仿溶液,9 mL 1% 的氯化鈉溶液,混合均勻后8 000 r/min離心10 min,收集下層有機(jī)相到已經(jīng)稱質(zhì)量的指形管中,水浴鍋加熱至有機(jī)相揮發(fā)并用烘箱烘干,冷卻至室溫后稱取指形管質(zhì)量,計(jì)算脂肪酸總量[15-17]。每組3次重復(fù)。
總脂肪酸含量=(提取后總質(zhì)量-提取前管質(zhì)量)/酵母菌粉質(zhì)量 (1)
1.2.4.2 酵母脂肪酸成分分析 通過(guò)高速冷凍離心機(jī)將工程酵母INVSC1與H1246酵母冷凍24 h即可得到二者的干燥菌體。用分析天平分別稱取100 mg工程酵母INVSC1與H1246的干燥菌體并用液氮將其研磨成粉末,之后向工程酵母INVSC1與H1246中分別加入1.5 mL提取buffer(含2.5% 濃硫酸的甲醇,V/V),并且用水浴鍋80℃溫浴2 h,待二者冷卻至室溫后分別向其中加入2 mL 0.9% (V/V)氯化鈉和1 mL正己烷,輕輕振蕩混合均勻后在室溫條件下4 000 r/min離心10 min。取二者上清液并真空抽干,將沉淀用50μL乙酸乙酯溶解。在提取過(guò)程中加10μL C17∶0內(nèi)標(biāo)。
通過(guò)GC System測(cè)定工程酵母INVSC1與H1246酵母的脂肪酸含量。色譜柱采用BPX-70柱,毛細(xì)柱采用30 mm×0.25 mm,設(shè)定GC的升溫程序:初始溫度設(shè)定為120℃并保持1 min,色譜柱的溫度以10℃/min的速率上升至150℃,然后再以4℃/min的速率讓色譜柱溫度上升至230℃并保持10 min。分別取其1μL樣品上樣后檢測(cè)其脂肪酸含量[18]。每組3次重復(fù)。
1.2.5 薄層色譜分析(TLC) 在硅膠板的下端1.5 cm處用毛細(xì)管依次均勻點(diǎn)上TAG標(biāo)樣、工程酵母INVSC1和H1246總脂肪酸,點(diǎn)樣斑點(diǎn)直徑不大于0.5 cm,每樣間隔2.5 cm,待斑點(diǎn)溶劑揮發(fā)干后將硅膠板放入展開(kāi)劑(按照正己烷∶乙醚∶甲酸=40∶1∶1(體積比))飽和的層析缸中進(jìn)行展開(kāi)。當(dāng)上行展開(kāi)溶劑前沿距硅膠板上端約2 cm處時(shí),將硅膠板取出并晾干[19]。等展開(kāi)劑揮發(fā)后,將硅膠板放置于染色碘缸中進(jìn)行染色,確定斑點(diǎn)位置。每組3次重復(fù)。
微生物生長(zhǎng)曲線一般包括遲緩期、對(duì)數(shù)期、穩(wěn)定期3個(gè)階段。從圖1可以看出,工程酵母INVSC1與H1246的生長(zhǎng)時(shí)期有著明顯的區(qū)別,INVSC1在0~8 h處于遲緩期,8~18 h處于對(duì)數(shù)期,18~28 h處于穩(wěn)定期;H1246在0~12 h處于遲緩期,12~22 h處于對(duì)數(shù)期,22~28 h處于穩(wěn)定期。由此可知,在相同的生長(zhǎng)條件下,工程酵母INVSC1比H1246生長(zhǎng)快,先進(jìn)入對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期和穩(wěn)定期。此外,從圖1還可以看出,工程酵母生長(zhǎng)的每個(gè)階段有不同的特點(diǎn),遲緩期測(cè)定的濃度與剛開(kāi)始時(shí)測(cè)定濃度一樣;對(duì)數(shù)期菌的生長(zhǎng)速度大大加快,單位時(shí)間內(nèi)菌液的濃度增加量保持一致并達(dá)到最大值;穩(wěn)定期測(cè)定的菌液濃度增加量最小,基本上為0。
從圖2可以看出,通過(guò)明場(chǎng)和熒光場(chǎng)的比較,工程酵母INVSC1經(jīng)過(guò)尼羅紅染色細(xì)胞呈橘紅色,內(nèi)部有明亮的油滴,因?yàn)槟崃_紅會(huì)與中性油脂發(fā)生結(jié)合,并且在藍(lán)色激發(fā)光下發(fā)出熒光。而H1246經(jīng)過(guò)尼羅紅染色后細(xì)胞也呈橘紅色,但是內(nèi)部未見(jiàn)到油滴。
經(jīng)蘇丹黑染色后工程酵母INVSC1與H1246中性油脂被染成了黑色,蘇丹黑附著在油脂上,故吸光度會(huì)提高。將2種酵母的初始懸浮液OD值都調(diào)至0.4左右,染色后,工程酵母INVSC1的OD580值明顯比H1246高,工程酵母INVSC1的OD580值在0.9左右,而H1246的OD580值在0.65左右(圖3)。
2.4.1 脂肪酸的提取結(jié)果 由圖4可知,工程酵母INVSC1的總脂肪酸含量明顯比H1246的高,工程酵母INVSC1的總脂肪酸含量大約在20% 左右,而H1246的總脂肪酸含量大約在10% 左右。
2.4.2 酵母脂肪酸各成分分析 從圖5、6可以看出,工程酵母INVSC1含有3種不同的脂肪酸,H1246則含有2種不同的脂肪酸,而它們的目的峰分離效果較為明顯,基線也比較平穩(wěn),沒(méi)有重疊和拖尾等現(xiàn)象,能夠準(zhǔn)確判斷脂肪酸的類型及其相對(duì)含量,它們的出峰時(shí)間依次為C16∶0(棕櫚酸)、C16∶1(棕櫚油酸)、C18∶1(油酸)、C18∶2(亞油酸),每種脂肪酸所對(duì)應(yīng)的峰面積越大,相對(duì)濃度越高,含量就越高[20]。
由表1和圖7可知,工程酵母INVSC1中棕櫚酸和油酸相對(duì)含量較高,而棕櫚油酸的相對(duì)含量非常低,幾乎沒(méi)有,所以,INVSC1中脂肪酸的主要成分是棕櫚酸(C16∶0)和油酸(C18∶1),而H1246中棕櫚酸(C16∶0)和亞油酸(C18∶2)的含量很少,幾乎沒(méi)有。

表1酵母脂肪酸組分分析
由圖8可知,工程酵母INVSC1在硅膠板上有明顯的TAG,而H1246則沒(méi)有,即酵母INVSC1能正常合成積累TAG,而H1246則不能。
本研究通過(guò)培養(yǎng)工程酵母并測(cè)定其生長(zhǎng)曲線,經(jīng)尼羅紅染色、蘇丹黑染色、總脂肪酸含量測(cè)定、酵母脂肪酸成分分析以及薄層色譜分析等一系列試驗(yàn),結(jié)果表明,在相同的生長(zhǎng)條件下,工程酵母INVSC1合成的油脂多,H1246基本上不合成油脂,可以比較出正常酵母和缺陷酵母合成和積累油脂的能力,即正常酵母比缺陷酵母產(chǎn)油脂能力強(qiáng),從而為后期油脂代謝相關(guān)基因功能驗(yàn)證等分子生物學(xué)試驗(yàn)提供研究材料和研究基礎(chǔ)。陽(yáng)天泉等[3-4]在研究小桐子磷脂二酰甘油酰基轉(zhuǎn)移酶時(shí),通過(guò)工程酵母的互補(bǔ)試驗(yàn)得出,INVSC1能合成積累TAG,而H1246不能,且他在研究煙草二脂酰甘油酰基轉(zhuǎn)移酶基因時(shí),通過(guò)TLC層析試驗(yàn)、尼羅紅染色、酵母油脂含量試驗(yàn)也得出了這個(gè)結(jié)論。譚太龍等[18]通過(guò)薄層色譜分析試驗(yàn)研究得出,INVSC1能合成積累TAG,而H1246則不能。本試驗(yàn)所獲得結(jié)果和前人的研究結(jié)果是一致的。
本研究還表明,工程酵母INVSC1與H1246的脂肪酸成分及含量也各不相同,可以提取不同的脂肪酸應(yīng)用于分子生物學(xué)試驗(yàn)、醫(yī)療保健、農(nóng)藥含量檢測(cè)等方面,為工程酵母INVSC1與H1246的進(jìn)一步研究奠定研究基礎(chǔ)。