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基于TaqMan實時熒光PCR檢測鮮肉及加工制品中的鴨源性成分

2020-10-20 07:33:58劉國強海小羅建興
農業與技術 2020年14期

劉國強 海小 羅建興

摘要:禽源性成分檢測既可以預防禽流感又能分析肉類的摻假問題。本研究參考行業標準(SN/T 2727-2010),對鴨和其它12種不同源性動物DNA進行特異性檢測;將鴨來源DNA模板原液進行梯度稀釋確定其檢出限,同時進行靈敏度實驗和摻假實驗;在加工制品中檢測其適用性。結果表明:此引物和探針特異性強,只針對鴨有特異性擴增曲線,對其它12種動物源性無擴增曲線;當鴨模板DNA濃度為10fg·μL-1時,仍能檢測到鴨源性,靈敏度可達到1%,同時可以很好地檢測摻假;此引物和探針在加工制品中檢測結果良好,適用于加工肉制品的檢測。本實驗通過所建立標準曲線y=-3.4554x+42.663,R2=0.9942,其PCR擴增效率為95%,可以有效地進行定量。同時利用靈敏度檢測可以判斷此方法的摻假檢測能力較強。綜上所述,本研究可以有效檢測鴨源性的摻假問題,并能為標準提供一定的借鑒。

關鍵詞:鴨源性成分;特異性;檢出限;靈敏度;加工制品;定量檢測

中圖分類號:S-3

文獻標識碼:A

作者簡介:劉國強(1994-),男,本科,研究實習員。研究方向:動物源性成分檢測和轉基因成分檢測;通訊作者郭梁(1986-),男,博士,助理研究員。研究方向:動物源性成分檢測和轉基因成分檢測以及微生物資源開發。

肉類是人們飲食中不可缺少的一部分,其含有多種營養物質(如蛋白質、脂肪以及微量元素等)[1,2]。目前在肉及肉制品的生產和運輸中會時常發生一些摻假的問題[3-6],如將雞、鴨肉(低價肉)摻雜到牛、羊肉(高價肉)中。動物源性檢測技術針對上述問題,除了能保護消費者合法權益、維持市場公平交易機制,還能預防動物來源性疾病的傳播(瘋牛病、口蹄疫、牛海綿狀腦病等)[7-10]。

目前,動物源性檢測技術建立在對樣品蛋白質、脂肪酸以及核酸等種屬特異分子鑒別肉與肉制品的動物來源[11-15]。動物源性檢測所涉及的技術手段包括電泳[16,17]、免疫組化[18,19]、質譜[20]、色譜[21]、聚合酶鏈式反應(Polymerase Chain Reaction, PCR)[22,23]。因為脫氧核糖核酸(DNA)的熱穩定性[24],使得以DNA為基礎的PCR技術成為了檢測動物源性檢測主流技術[25,26]。其中,熒光染料(SYBR Green 或Eva Green)[27,28]和TaqMan探針[29,30]成為了PCR檢測的主要技術。探針技術因為其種屬特異性探針提高了實時熒光PCR的擴增效率和特異性,從而快速并且準確地得到檢測結果。

本文參考行業標準(SN/T 2727-2010)[31],建立肉與肉制品中鴨源性成分的TaqMan實時熒光PCR檢測方法,保證鴨源性成分的快速檢測,規范食品市場。

1材料與方法

1.1樣品準備

鮮肉及加工肉制品均購買于本地農貿市場,鮮肉包括鴨肉、羊肉、牛肉、豬肉、馬肉、鹿肉、驢肉、兔肉、狗肉、鵪鶉肉、雞肉、火雞肉和鴿子肉。加工肉制品包括口口丫鴨翅根、口口丫蜜汁烤腿、金鑼火腿腸、肉粒多火腿腸、尚清齋烤腸、蒙羊羊肉干、呼納斯牛肉干。樣品采集處理去除脂肪,并用滅菌水清洗,置于-20℃保存。

1.2試劑

TransStart Probe qPCR SuperMix (北京全式金生物技術有限公司);實時熒光定量PCR引物和探針合成(北京睿博興科公司);Takara MiniBEST Universal基因組提取試劑盒(寶生物工程(大連)有限公司)。

1.3儀器

Eppendorf 5418R Centrifuge高速臺式離心機(德國Eppendorf AG公司);Nanodrop 2000c 核酸蛋白測定儀(美國Thermo Fisher公司);7300plus實時熒光PCR擴增儀(美國ABI公司)。

1.4方法

1.4.1引物和探針

引物和探針均由北京睿博興科公司合成。引物與探針序列如下表1。

1.4.2DNA提取

取1.1準備好的鮮肉和肉制品樣品,利用Takara MiniBEST Universal基因組提取試劑盒其DNA,利用Nanodrop 2000c核酸蛋白分析儀測量其濃度,將母液稀釋至100ng·μL-1左右,保存于-20℃。

1.4.3反應體系與反應條件

反應體系(總體積20μL):TransStart Probe qPCR SuperMix 10μL,左右引物各1μL,探針1μL,模板2μL,補ddH2O至20μL。

反應條件:95℃5min,1個循環;95℃5s,60℃30s,45個循環,在每次循環退火時收集熒光信號。

1.4.4特異性實驗

分別取鴨、羊、牛、豬、馬、鹿、驢、兔、狗、鵪鶉、雞、火雞和鴿子13種不同源性動物DNA模板進行鴨源性特異性分析實驗。

1.4.5檢出限檢測實驗

從100ng·μL-1的鴨肉模板DNA稀釋液加滅菌ddH2O開始稀釋,每1/10稀釋1次,共稀釋7次。分別為100ng·μL-1、10ng·μL-1、1ng·μL-1、0.1ng·μL-1、0.01ng·μL-1、0.001ng·μL-1、0.0001ng·μL-1、0.00001ng·μL-1的鴨肉模板DNA稀釋液進行檢出限檢測實驗。

1.4.6靈敏度和模擬摻假實驗

將鴨肉DNA與羊肉DNA以一定比例混合,制成鴨肉DNA含量分別為1%、5%、10%、30%、70%、90%、95%、99%的混合DNA樣品,進行模擬摻假檢測實驗,同時依照1.4.3反應體系對該方法的靈敏度進行分析,每次實驗設3個平行。

1.4.7數據處理

利用Real-Time PCR Software 對結果進行擴增曲線和循環(Cycle threshold,Ct)的分析。每次實驗結果都是3個平行實驗的平均值±標準差表示。

2結果與分析

2.1特異性實驗

將鴨、羊、牛、豬、馬、鹿、驢、兔、狗、鵪鶉、雞、火雞、鴿子的模板DNA(如圖1、表2所示),分別利用鴨的引物和探針進行實時熒光定量PCR實驗,特異性擴增結果如圖2所示,PCR擴增產物經過瓊脂糖凝膠電泳處理之后如圖3所示,產物條帶均為單一條帶,無非特異性擴增,說明引物和探針組合具有較高的特異性。由圖2和表2可以看出,僅鴨的樣品出現典型擴增曲線,Ct值為14.01±0.18(鴨肉樣品1),13.92±0.35(鴨肉樣品2),13.86±0.12(鴨肉樣品3),13.78±0.43(鴨肉樣品4),13.74±0.07(鴨肉樣品5),其它12種動物(其它肉樣:羊、牛、豬、馬、鹿、驢、兔、狗、鵪鶉、雞、火雞和鴿子)均未有出現典型擴增曲線且Ct值均為0。

2.2檢出限檢測實驗

通過鴨引物和探針對100ng·μL-1、10ng·μL-1、1ng·μL-1、0.1ng·μL-1、0.01ng·μL-1、0.001ng·μL-1、0.0001ng·μL-1、0.00001ng·μL-18個不同質量濃度梯度的樣品DNA進行熒光定量PCR擴增實驗。結果如圖4所示和表3所示。由圖4和表3可知,稀釋至0.00001ng(即10fg)的鴨基因組DNA模板(3個平行實驗)出現典型擴增曲線,Ct值為38.37±0.19;以擴增結果Ct<40時判定為確認檢出,上述結果表明此探針已達到檢出限度,說明鴨特異性引物和探針的檢測限度可達到10fg。

2.3定量檢測

利用100ng·μL-1、10ng·μL-1、1ng·μL-1、0.1ng·μL-1、0.01ng·μL-1、0.001ng·μL-1、0.0001ng·μL-1、0.00001ng·μL-1的鴨肉模板DNA稀釋液,進行引物和探針的檢測,制作鴨源性定量檢測標準曲線,如圖5所示。所得鴨的特異性探針的標準曲線為y=-3.4554x+42.663,R2=0.9942。由于PCR擴增效率E(%)=[10(-1/slope)-1]×100,其PCR擴增效率為95%,PCR效率的接受范圍在90%~110%[32,33],對應于回歸斜率在-3.1~-3.6,R2值≥0.98。綜上所述,此方法具有較好的定量檢測能力。

2.4靈敏度實驗

因為鴨肉經常被摻雜到羊肉中,所以本實驗通過鴨引物和探針對鴨組分DNA和羊組分DNA混合樣(鴨組分含量分別為1%、5%、10%、30%、70%、90%、95%、99%)進行模擬摻假實驗,結果如圖6所示,具體數值如表4所示。由圖6和表4可知,當混合DNA樣品中鴨組分含量為1%時,出現典型的擴增曲線,Ct值為27.34±0.71。因為當混合DNA樣品中鴨組分含量為1%時,3個平行中均出現典型的擴增曲線,所以可以證明此探針對鴨肉摻假羊肉檢測效果明顯,同時上述結果能充分證明此引物和探針具有較高的靈敏度。

2.5加工肉制品的檢測

提取1.1中已處理好加工肉制品的DNA,進行實驗。其擴增曲線結果和Ct值如表5和圖7所示。

3討論

與實時熒光PCR技術相比,普通PCR檢測的普遍弱點就是耗時長[25-27],檢測人員常常需要花費大量時間來對實驗進行重復工作,而且一個實驗結果通常都需要進行一系列實驗才能得出。而實時熒光定量PCR由于添加了TaqMan探針和熒光信號,使得其靈敏度與特異性都高于普通PCR,特別是檢測大批量樣品時其優勢尤為明顯。實時熒光定量PCR不僅能夠實時監測,同時得到檢測的結果迅速,在1~2h就可以得到結果,而且結果簡單直觀,易于分析。

本研究通過出入境檢驗檢疫行業標準(SN/T 2727-2010)合成檢測鴨源性成分的引物和探針,通過實驗探索了最佳的反應體系和反應條件。創新點在于基于行業標準,增加了特異性實驗、檢出限實驗、模擬摻假實驗和適用性實驗,并且通過建立標準曲線來評價方法的定量檢測能力。本研究對鴨、羊、牛、豬、馬、鹿、驢、兔、狗、鵪鶉、雞、火雞和鴿子13種不同源性動物進行特異性實驗。結果顯示,只有鴨肉有特異性擴增,其它動物均沒有;將鴨來源的DNA模板原液進行濃度梯度稀釋,分別為100ng·μL-1、10ng·μL-1、1ng·μL-1、0.1ng·μL-1、0.01ng·μL-1、0.001ng·μL-1、0.0001ng·μL-1、0.00001ng·μL-1的鴨肉模板DNA稀釋液進行檢出限檢測實驗,檢出限為10fg;建立標準曲線,其PCR擴增效率為95%,在90%~110%,標準曲線R2=0.9942≥0.98可以評價此引物和探針定量檢測能力較好。同時還將鴨模板DNA與羊模板DNA按照1%、5%、10%、30%、70%、90%、95%、99%體積比例混合來模擬摻假實驗。結果顯示,鴨模板DNA體積比例為1%時仍可以檢測到鴨源性,同時證明此引物和探針的靈敏度可達1%。通過實時熒光PCR在鴨翅根、蜜汁烤腿、金鑼火腿腸、肉粒多火腿腸、尚清齋烤腸、蒙羊羊肉干、呼納斯牛肉干進行適用性實驗,只有在具有鴨源性的鴨翅根和蜜汁烤翅中才能檢測到鴨源性,說明此引物和探針適用性較好。

本方法的檢出限為10fg,在本研究中的引物和探針組合與已報道的研究相比具有較大的優勢,同時檢出限已超越了之前的研究[37-39]。林彥星等[40]建立了實時熒光定量PCR檢測畜禽肉制品中的鴨源性成分,可檢測到1.0pg鴨源DNA的存在;金萍等[41]基于鴨線粒體細胞色素Cytb基因建立了肉制品中鴨源性成分檢測的Real-time PCR檢測方法,檢出限為8pg;史艷宇等[42]建立了一種快速、特異、靈敏的鴨源性成分檢測方法,其檢出限為1.0mg;張弛等[43]建立肉制品中鴨源性成分定性和定量檢測的檢出限達到1.78pg;張秀平等[44]設計可特異檢測鴨肉成分的引物和探針,其檢出限為1pg;程欣[45]建立了添加有擴增內標的用于檢測食品中鴨肉成分的實時熒光PCR方法,可檢出0.05ng的鴨DNA;董洋洋[46]建立了鑒別鴨肉單一成分的實時熒光PCR的方法檢測快速準確,檢出限可達0.2ng。上述研究的檢出限均低于本研究。

綜上所述,此方法具有較強的特異性、較高的靈敏度和適用性廣等特點??梢杂行z測摻假,從而維護消費者權益和防止禽類疾病的傳播,為推動肉類食品領域向透明化、標準化發展提供技術支持。

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(責任編輯 李媛媛)

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