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山羊粒細胞-巨噬細胞集落刺激因子基因克隆

2020-10-22 12:09:16王楠劉明國萬雙秀李金芮李翌姜勛昊姜莉莉
中國畜禽種業 2020年10期
關鍵詞:分析

王楠 劉明國 萬雙秀 李金芮 李翌 姜勛昊 姜莉莉*

(1,菏澤學院藥學院 274015;2,山東省鄆城誠信醫院 274700)

粒細胞-巨噬細胞集落刺激因子(GM-CSF) 是機體重要的免疫調節因子,能促進造血前體細胞的存活和分化[1,2]。GCSF可刺激特定骨髓前體細胞增殖、分化成粒細胞,刺激多能干細胞的增殖和分化,誘導單核細胞和巨噬細胞的形成[3,4]。作為免疫刺激劑,GM-CSF 可直接作用于免疫細胞,具有較強的免疫增強效果[5,6]。GM-CSF 作為一種理想的免疫佐劑,能增強腫瘤疫苗的免疫效果。GM-CSF 對動物機體的抗感染免疫過程具有高效調節作用,能有效增強機體對疾病的免疫抵抗力,抑制腫瘤惡化、炎癥、自身免疫性疾病的作用。GM-CSF 還參與了卵泡發育和排卵等生理過程[7],研究表明,GM-CSF 在PI3K/AKT通路中也發揮重要作用[8,9]。本研究克隆山羊GM-CSF 基因,并對其進行序列和生物信息學分析預測,為進一步研究GMCSF 的功能及抗病毒的分子機制提供有價值的參考。

1 材料與方法

1.1 試劑與儀器

RNAsimple 總RNA 提取試劑盒、FastKing cDNA 合成試劑盒、質粒小提試劑盒、DNA 聚合酶、D2000 DNA Marker、DNA回收試劑盒、DH5α 感受態、pGM-T 載體,T4 DNA 連接酶,均購自TIANGEN 公司;LB 培養基,購自Solarbio 公司;PCR儀、全自動數碼凝膠成像儀、臺式高速冷凍離心機。

1.2 引物設計

參考Genbank 中已發表的山羊CM-GSF 基因序列(登錄號:X_53561.1),設計GM-CSF 基因RT-PCR 擴增引物F/R,F:5’-ATGTGGCTGCAGAACCTGCTTC-3’;R:5’-CACTTCTGGACTGGTTCCCAG-3’,引物由華大基因生物科技有限公司合成。

1.3 PCR 擴增CM-GSF 基因

Trizol 法提取山羊脾臟組織RNA 并反轉錄成cDNA。以提取的cDNA 為模板,用引物F/R 擴增CM-GSF 基因。PCR 反應體系50μl:2×Taq PCR MasterMix 25μl,cDNA 模板1μl,上下游引物各2μl,ddH2O 20μl。PCR 反應程序為:94℃預變性5min,94℃變性30s,50℃退火30s,72℃延伸30s,共3077 個循環;72℃延伸10min,PCR 產物經1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測,膠回收產物送華大基因公司進行序列測定。

1.4 CM-GSF 編碼氨基酸序列理化特性分析

使用在線工具ProtParam 分析CM-GSF 編碼氨基酸理化特性。

2 試驗結果

2.1 GM-CSF 基因PCR 擴增

PCR 擴增產物經過瓊脂糖凝膠電泳檢測,如附圖所示,擴增基因片段在500bp 左右,與預期結果一致。

2.2 GM-CSF 基因核苷酸序列分析

用DNA Star 軟件分析印度黑羚GM-CSF 基因的核苷酸序列,結果表明,GM-CSF 基因的CDs 區全長435bp,其中胞嘧啶(C)在四種堿基中含量最高。A(23.3%)、C(31.1%)、G(24.2%)、T(21.4%),且(G+C)%為55.3%,高于(A+T)%,說明GM-CSF 編碼區的DNA 雙鏈較穩定。

2.3 GM-CSF 基因編碼氨基酸序列理化特性分析

使用在線工具ProtParam 對GM-CSF 的編碼氨基酸序列分析,結果表明印度黑羚的GM-CSF 蛋白分子化學式為C727H1141N187O217S10,理論等電點為5.76。在編碼的144個氨基酸中含量最多氨基酸是Leu (L),占比11.8%,含量最低的是Tyr(Y),占比1.4%。編碼蛋白的不穩定系數為47.27,推測,該蛋白為不穩定蛋白。在哺乳動物網織紅細胞內的半衰期為30h,脂肪系數為81.87,蛋白質的疏水性預測為-0.160。

3 討論

GM-CSF 是一種具有種屬特異性且極具開發潛力的造血生長因子。近年來,因其對免疫系統具有多項調節功能,已被研發成為免疫佐劑或抗腫瘤治療藥廣泛在臨床實踐中應用,多項臨床實踐反饋的結果也已證實其是一種低毒且高效的免疫佐劑,具有提高疫苗免疫原性的作用。因GM-CSF 可由多種免疫細胞(巨噬細胞、巨細胞、纖維細胞、T 細胞、內皮細胞等)分泌,故可通過誘導小細胞癌分化的途徑來抑制腫瘤的惡化,有效降低免疫激活因子和炎性細胞因子活性,進而調節免疫反應,故又被稱之為分化誘導器[10]。GM-CSF 基因也可通過刺激樹突狀細胞和B 細胞等來分泌細胞因子,并與所生成的細胞因子產生協同作用,以達到增強免疫效用的功能[11]。本研究成功擴增山羊GM-CSF 基因,研究成果對深入研究山羊GM-CSF 基因及其功能具有重要意義,為高效、安全免疫佐劑的研發奠定基礎。

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