單細胞測序預(yù)測化療的有效性

在最近一項研究中，來自密歇根大學(xué)的Jun Hee Lee 博士課題組使用一種單細胞RNA 測序的技術(shù)，首次展示了單個癌細胞群中的各個細胞對化學(xué)療法引起的DNA 損傷的基因表達差異。他們發(fā)現(xiàn)，這些反應(yīng)可以被分為三類：激控制細胞死亡，細胞分裂或應(yīng)激反應(yīng)。相關(guān)結(jié)果發(fā)表在最近的《Cell Reports》雜志上。

“不同命運的細胞實際上具有完全不同的基因激活圖譜，而這些不同的‘轉(zhuǎn)錄組學(xué)格局’決定了化療對DNA 造成損傷后細胞的命運。”

該研究分析了來自三種結(jié)腸癌細胞系的10,000 多個細胞。這些細胞首先接受化學(xué)藥物治氟尿嘧啶的處理，之后對其基因表達圖譜進行了分別分析。“以前我們認為，DNA 損傷會導(dǎo)致相當(dāng)均勻的轉(zhuǎn)錄反應(yīng)，而我們的發(fā)現(xiàn)表明，不同的DNA 損傷反應(yīng)基因伴隨著不同的細胞命運走向。如果我們了解到某些亞群具有特定特征的細胞能夠在其他細胞死亡時存活下來，那么科學(xué)家們可能會尋找專門針對這些細胞的治療方法”。

由公共衛(wèi)生學(xué)院生物統(tǒng)計學(xué)副教授Hyun Min Kang 博士領(lǐng)導(dǎo)的研究小組，也正在在線提供其數(shù)據(jù)供其他研究人員使用。“例如，其他科學(xué)家可以檢查化學(xué)療法治療前后在單個細胞中如何表達單個基因，以及特定基因的表達與化療劑量或其他基因的表達如何相關(guān)，研究人員還可以使用該在線工具測試新的假設(shè)并生成新的數(shù)據(jù)，因此有可能促進對DNA 損傷反應(yīng)的未來研究。”