利用cBioPortal分析P53在肌層浸潤型膀胱癌中的表達、突變及臨床意義

梁維朝，高偉偉*

（桂平市人民醫院腫瘤科，廣西 貴港 537200）

膀胱癌的發病率越來越高，是男性第四種常見的癌種，嚴重危害人類的健康[1]。膀胱癌發生機制與基因突變及新生血管形成密切相關。p53突變在尿路上皮腫瘤最常見的遺傳事件。p53是一種充分表征的腫瘤抑制基因， p53突變與腫瘤進展和預后有關[2]。本研究應用TCGA數據庫提供的數據分析p53在肌層浸潤型膀胱癌中的表達、突變及臨床意義。

1 資料與方法

1.1 數據材料收集

從http://www.cBioPortal.org/中下載413例 TCGA 數據庫提供的肌層浸潤型膀胱癌臨床資料數據及p53 RNASeq V2的數據，進行分析。

1.2 數據集篩選與臨床參數資料相關研究

將標本樣品的ID號將病人信息整合成EXCEL表格，刪除缺失或部分資料缺失的數據，按照p53表達值從高到底排列，取中位數為截點，分低表達組206例，高表達組201例，分析p53的表達與臨床之間的相關性。

1.3 統計學處理方法

使用SPSS 22.0處理數據。計數資料以率（%）表示，比較采用x2檢驗，以P＜0.05表示有統計學意義。采用Spearman相關分析p53基因表達與相關因素之間關系等。將有統計學意義的指標納入cox模型行多因素分析。

2 結 果

2.1 突變情況

413例肌層浸潤型膀胱癌患者，P53突變比率50%(207/413)；在207例p53基因突變病例中，錯義突變占77.8%（161/207），截短突變32.9%(68/207)，錯義突變+截短突變22例，框移突變1例。

2.2 p53的表達與臨床病理資料及突變的相關性

p53的表達與 AJCC P TNM分期、腫瘤遠處轉移、淋巴結轉移，臨床分期在Spearman相關分析中呈負相關（P＜0.05），而與腫瘤淋巴管浸潤和病理分級呈正相關（P＜0.05），p53的表達與突變無相關性。t檢驗得出，P53按膀胱癌腫瘤病理分型低級別（2510.44±960.50）和高級別（1669.41±968.28）的表達有差異（P＜0.05），其余AJCC p TNM分期、臨床分期、突變的p53的表達沒有差異（P＞0.05）。

2.3 p53表達與肌層浸潤型膀胱癌患者預后分析

Kaplan-Meier檢驗法分析p53表達與肌層浸潤型膀胱癌患者總生存期、無病生存期無顯著統計學意義（P＞0.05），P53的表達可能與肌層浸潤型膀胱癌的預后無關.與cBioPortal分析結果一致。

2.4 p53與肌層浸潤型膀胱癌預后的 COX 多因素分析

將單因素分析中對預后有影響的指標納入多因素COX分析，結果提示腫瘤淋巴結轉移及浸潤，腫瘤遠處轉移是影響肌層浸潤型膀胱癌預后的獨立不良因素（P＜0.05），而P53在肌層浸潤型膀胱癌的表達以及發生突變，并不是影響肌層浸潤型膀胱癌預后的獨立因素。

3 討 論

大多數膀胱癌來自尿路上皮細胞，大約75%的患者是非肌層浸潤型膀胱癌，而肌層肌層浸潤型膀胱癌約占比25%。盡管醫療技術不斷發展，但肌層浸潤型膀胱癌患者的治療和預后基本沒有改變。P53可分為野生型和突變型。對于突變型P53，突變方式較多等。而野生型P53為正?；?，其編碼的p53蛋白半衰期短，免疫組化難以檢測；突變型編碼的p53蛋白空間構象發生改變，半衰期延長，免疫組化可測出較高的P53蛋白表達量，故如果免疫組會測到較高的p53表達量則可以判斷為突變型P53基因。p53可作為細胞內的一個強大的轉錄因子,當DNA發生損傷時，p53可被不同的信號通路激活并保持穩定, 增強其下游多種基因的轉錄而引起細胞周期阻滯、凋亡或衰老, 以保持細胞基因組的完整性，清除損傷細胞，這些生物學作用取決于不同的應激信號和細胞類型。

本次研究的樣本中，約半數發生了p53基因突變，發生了錯義突變、截短突變，少部分樣本錯義突變和截短突變同時存在，發生突變率高。行p53突變與肌層浸潤型膀胱癌患者的預后分析，p53的表達與AJCC pTNM分期、腫瘤遠處轉移、淋巴結轉移，臨床分期呈負相關（P＜0.05），而與腫瘤淋巴管浸潤和病理分級中呈正相關（P＜0.05），與突變無相關性（P＞0.05）。生存分析提示，有無突變對肌層浸潤型膀胱癌患者無病生存期及總生存期無影響（P＞0.05）。認為p53的突變對膀胱癌復發的預測無多大的作用。但也有學者認為P53的突變可作為評估膀胱癌預后的指標[3-4]，這與本次研究結果不一致。筆者分析本次研究的樣本，全部有肌層浸潤，分期靠后患者病例數較多，可能是樣本差異導致結果的不一致。而其中的機制，值得深入研究。p53是一個經典的抑癌基因，在多種癌癥中與患者預后相關。在肌層浸潤型膀胱癌的研究中，其相關性卻存在爭議。本次研究肌層浸潤型膀胱癌P53突變患者與未突變患者行生存分析顯示，兩者的總生存期、無病生存期尚不能認為有差異（P＞0.05）。目前為止，還沒有充分證據認為p53突變可以作為判斷肌層浸潤型膀胱癌預后的獨立因素。

綜上所述， P53在肌層浸潤型膀胱癌中發生突變率高，在突變組中和未突變組中生存期和無病生存期未能發現有明確差異,尚不能認為p53突變可影響肌層浸潤型膀胱癌的預后。