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福建柏實時熒光定量PCR內(nèi)參基因的選擇

2021-03-19 02:15:04,*
林業(yè)科學研究 2021年1期
關鍵詞:分析質(zhì)量

,*

(1. 福建農(nóng)林大學園林學院,福建 福州 350002;2. 福建農(nóng)林大學林學院,福建 福州 350002)

實時熒光定量PCR(RT-qPCR)指在PCR 反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR 進程,最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法,具有準確性高、特異性好、試驗過程簡便等特點[1-2]。熒光定量試驗結果的準確性和可靠性取決于特定引物的擴增效率、cDNA的純度以及內(nèi)參基因的穩(wěn)定性等,穩(wěn)定的內(nèi)參基因能夠使目的基因的定量分析結果準確、特異性好[3-4]。在不同植物間或同一植物不同組織部位間內(nèi)參基因的表達穩(wěn)定性有一定差異,通常會選擇在植物生命活動全過程或外界環(huán)境變化時都能表達相對穩(wěn)定、受環(huán)境影響較小的管家基因(Housekeeper gene),如肌動蛋白(Actin)、泛素蛋白(Ubiquitin)和甘油醛-3-磷酸脫氫酶(GAPDH)等[5-6]。

福建柏(Fokienia hodginsii(Dunn)Henry et Thomas)為柏科福建柏屬,為我國特有種屬,分布在福建、廣東、云南、廣西等我國南部省份[7];其樹干通直、樹型優(yōu)美、四季常青、適應性強、抗性較好、材性穩(wěn)定、結構細膩,是我國優(yōu)良的材用-景觀兩用型樹種之一。不僅如此,福建柏精油中含有多種藥用、化工價值的成分,開發(fā)利用價值高[8]。但福建柏的研究集中于混交造林、成分分析等方面,隨著研究的深入,分子生物學研究必不可少,如功能基因、轉(zhuǎn)錄因子的表達分析等研究,均涉及到使用熒光定量PCR 技術檢測目的基因的相對表達情況。本研究從福建柏轉(zhuǎn)錄組中選擇了8 個管家基因作為候選內(nèi)參基因,包括肌動蛋白-7(Actin-7,ACT7)、泛素蛋白(Ubiquitin,UBQ)、延長因子……

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