周 威,洪 舟,符兆英
(1.延安大學醫學院免疫教研室,陜西 延安716000;2.西安市第五醫院急診科,陜西 西安 710082)
人DEP 結構域包含5(Dishevelled,Egl-10,and pleckstrin domain-containing protein 5,DEPDC5)基因位于22號染色體長臂1區2帶2亞帶至1區2帶3亞帶,具有GTP酶活性。DEPDC5與NPRL2和NPRL3結合形成復合體GATOR1后可以抑制mTORC1活性,進而調控哺乳動物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)功能的發揮[1]。 大量研究表明DEPDC5與神經發育、癲癇的發生、治療及預后相關:DEPDC5基因表達與大腦及神經元發育有關——shRNA下調DEPDC5基因表達可激活mTORC1信號,促進神經細胞的增殖和神經元樹突的形成[2],并且,DPEPDC5基因突變與癲癇的發生,癲癇患者的腦損傷、腦發育不良、抗癲癇藥物的不良預后等相關[3-5]。mTORC1屬于蛋白絲/蘇氨酸激酶,在腫瘤發生發展過程中mTORC1通過PI3K/Akt/mTOR和Ras/Raf/MEK/ERK通路調節腫瘤細胞生長、凋亡、侵襲和遷移的作用已被廣泛報道[6-8]。然而,作為mTORC1的負性調節因子,DEPDC5相關的腫瘤研究報道還相對較少,但已有報道顯示DEPDC5與肝炎病毒感染導致的肝細胞癌相關[9-11];胃腸道中,DEPDC5突變失活與胃腸道間質瘤的形成相關[12];并且DEPDC5的磷酸化可使其對mTORC1的抑制作用降低,進而促進腫瘤細胞的生長[13]。DEPDC5及其下游基因mTORC1在腫瘤中的作用提示,DEPDC5可能在腫瘤發生發展過程中發揮作用。研究[14]表明:DEPDC5高表達與消化道腫瘤發生相關,為進一步探究DEPDC5在腫瘤發生發展中的作用,本文對DEPDC5基因表達與胃癌侵襲、遷移及凋亡的關系進行了探究,現報告如下。
1.1 實驗材料 人胃癌細胞株MKN-28為延安大學醫學院醫學實驗研究中心保存。細胞培養用胎牛血清購自BI公司(以色列);RPMI-1640、Trizol購自賽默飛 (美國);轉染試劑jetPRIME購自Polyplus (法國);逆轉錄試劑盒PrimeScriptTM1st Strand cDNA Synthesis Kit購自TaKaRa(日本);熒光定量PCR試劑盒購自康潤生物(中國),Transwell 小室購自康寧(美國),Annexin V-FITC/PI細胞凋亡檢測試劑盒購自貝博生物有限公司(中國),Caspase 3和β-actin購自博士德公司(中國)。DEPDC5的小干擾RNA(siRNA-DEPDC5)和陰性對照siRNA(siRNA-NC)購自上海吉瑪基因(中國)。熒光定量引物由奧科鼎盛生物科技有限公司(中國)合成。
1.2 實驗方法
1.2.1 細胞培養及處理:MKN-28細胞培養于含10%胎牛血清的RPMI-1640培養液中。細胞培養條件為37 ℃,5% CO2。使用jetPRIME轉染試劑,按試劑說明書進行siRNA的轉染,轉染4 h后更換培養基。siRNA-DEPDC5干擾序列為,sense:5’-AAGGACUUCACGGACUUCUGC-3’,anti-sense:5’-GCAGAAGUCCGUGAAGUCCUU-3’,siRNA-NC的序列為,sense:5’-CCATCGCAACCUCGAUCGCAU-3’,anti-sense:5’-AUGCGAUCGAGGUUGCGA-
UGG-3’。
1.2.2 凋亡檢測:細胞轉染36 h后,依試劑說明書處理細胞并對其進行染色,流式細胞儀檢測各組細胞的凋亡情況。
1.2.3 熒光定量PCR(q-PCR)檢測DEPDC5基因相對表達量變化:首先用Trizol裂解法提取各細胞樣本中的總RNA。以上述總RNA為模板,用Oligo dT,和隨機引物按試劑說明書合成cDNA片段。之后,以反轉錄所得cDNA為模板,GAPDH為內參基因,用熒光定量PCR試劑盒RealStar SYBR Green qPCR Power Mixture分別檢測DEPDC5在不同處理組中的表達變化。定量引物序列為:DEPDC5-F,5’- AGTGTTCCGGCTGAGACCTTA-3’;DEPDC5-R,5’-CCACGGCCAATATACTGATCCT-3’;GAPDH-F,5’- GGAGCGAGATCCCTCCAAAAT;GAPDH-R:5’-GGCTGTTGTCATACTTCTCATGG-3’。DEPDC5基因的相對表達量以2-ΔΔCt進行計算,結果以3次實驗的計算結果的平均值表示。
1.2.4 Western blot檢測Caspase 3表達:細胞轉染36 h后,分別收集各處理組細胞,用含全蛋白酶抑制劑的RIPA裂解液裂解細胞,BCA蛋白定量后進行蛋白電泳,濕轉法進行蛋白質轉印,10%脫脂奶粉封閉,4 ℃過夜孵育,TBST洗滌3次,每次10 min,室溫孵育第二抗體2 h,TBST洗滌3次,每次15 min,用G-Box采集圖片,Image J測定各個條帶的光密度值。
1.2.5 劃痕實驗:細胞轉染12 h后,用無菌槍頭以十字性進行劃痕,拍照記錄。待細胞繼續培養24 h后,明場拍照記錄,觀察不同處理組細胞的遷移能力變化。
1.2.6 Transwell小室:細胞轉染24 h后,將其接種于無血清培養基的Transwell小室中(上室),下室用含20%胎牛血清的RPMI-1640進行培養。48 h后,用多聚甲醛固定細胞,結晶紫染色,普通光學顯微鏡下進行觀察不同處理組細胞侵襲能力的變化。

2.1 RNA干擾DEPDC5基因表達對胃癌細胞凋亡的影響 見表1。與對照siRNA轉染組(siRNA-NC)相比,siRNA-DEPDC5干擾DEPDC5基因表達后,胃癌細胞的凋亡率顯著增加(P<0.01)。siRNA干擾DEPDC5時胃癌細胞DEPDC5的表達量降低(圖1A)。對凋亡相關蛋白Caspase 3的Western blot檢測(圖1B,左)及灰度值變化分析(圖1B,右)顯示,RNA干擾DEPDC5基因表達后,Caspase 3基因表達量增加(P<0.01)。

表1 不同處理組胃癌細胞凋亡情況(%)
2.2 RNA干擾DEPDC5基因表達對胃癌細胞侵襲、遷移的影響 為進一步探究DEPDC5對胃癌生長的影響,采用Transwell和劃痕實驗檢測了siRNA-DEPDC5干擾DEPDC5基因表達時胃癌細胞侵襲、遷移能力的變化,結果顯示:與轉染siRNA-NC對照組胃癌細胞相比,siRNA-DEPDC5干擾DEPDC5基因表達后MKN-28細胞的侵襲(圖2A)、遷移能力無顯著變化(圖2B),提示DEPDC5基因表達可能與胃癌的進展無關。
哺乳動物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)屬于絲/蘇氨酸蛋白激酶,是一種進化上十分保守的蛋白激酶,有兩種蛋白復合體類型mTORC1和mTORC2,能夠通過生長因子、氨基酸和能量等信號的整合調控細胞生長和新陳代謝。其中,mTORC1由mTOR、Raptor、PRAS40、mLST8和Deptor構成[15],其主要信號通路有兩條:Ras/Raf/MEK/ERK和PI3K/Akt/mTOR,能夠調節細胞生長、存活、血管生成和蛋白質翻譯。

注:**P<0.01A:qPCR檢測siRNA干擾DEPDC5時胃癌細胞DEPDC5的表達量;B:Western blot檢測siRNA干擾DEPDC5后Caspase 3基因的表達變化(左),以灰度值表示其相對變化(右)圖1 RNA干擾DEPDC5對凋亡蛋白Caspase 3表達影響

A:不同處理條件下胃癌細胞侵襲能力的變化(結晶紫染色,×200);B:不同處理條件下胃癌細胞遷移能力的變化(明場,×4)圖2 RNA干擾DEPDC5對胃癌細胞侵襲和遷移能力的影響
PI3K/Akt/mTOR通路對生長因子敏感,與腫瘤的發生發展密切相關;Ras/Raf/MEK/ERK與能量代謝相關,能夠間接調節mTOR的活性。mTORC2由mTOR、Rictor、PROTOR、mLST8、mSIN1和Deptor構成,在細胞生存、細胞骨架形成、多肽、糖類、脂質的降解等方面發揮作用[16]。腫瘤發生發展過程中,已有研究顯示多種腫瘤細胞內存在mTOR通路的異常,該通路活性變化可引起癌基因和抑癌基因的活性改變,參與腫瘤的發生、侵襲和遷移。mTOR能夠調節TGF-β通路活性調節細胞增殖、分化,通過Bcl-2、細胞色素C和自噬相關基因的表達調節腫瘤細胞發生程序性及自噬性凋亡[17-18]。mTOR在腫瘤發生發展中的作用使其成為潛在的腫瘤治療靶點[19]。
DEPDC5是mTORC1的負性調控因子——DEPDC5基因缺陷可引起mTORC1信號的增加[20],磷酸化DEPDC5可使其對mTORC1的抑制作用解除[13],并且在體實驗顯示,使用雷帕霉素抑制mTORC1活性可挽救小鼠神經元DEPDC5缺失導致的行為和生化缺陷[21],DEPDC5對mTORC1活性的影響提示其可能作為mTOR的調控因子參與mTOR相關疾病的發生和發展。在腫瘤研究中,盡管已有研究顯示,DEPDC5參與了病毒感染引起的肝癌發生[9-11,22-23],且DEPDC5基因突變與胃腸間質瘤形成過程相關[11]。但因DEPDC5基因轉錄本較多,其在腫瘤發生發展中的表達變化還不甚清楚,有關DEPDC5在腫瘤發生發展中的作用及作用機制還鮮見報道。探究DEPDC5表達量與腫瘤發生發展的關系和DEPDC5在腫瘤生長中的作用,對揭示腫瘤發生發展的機制具有一定的積極意義。
項目組前期通過TCGA數據分析發現DEPDC5基因表達與胃癌的發生相關,胃癌發生過程中DEPDC5基因的表達增加,高DEPDC5基因表達的胃癌患者生存期較短,提示DEPDC5基因表達變化可能與胃癌的發生發展相關,為探究DEPDC5在胃癌發生發展中的作用,本研究通過體外RNA干擾實驗證實,DEPDC5基因表達可能與胃癌的發生相關,并且DEPDC5基因表達與胃癌細胞的遷移和侵襲無關——RNA干擾DEPDC5表達時,胃癌細胞凋亡增加,但侵襲和遷移能力未發現顯著變化。然而,研究對DEPDC5在胃癌發生中的作用是否與mTORC1相關通路有關并未進行探究。此外,DEPDC5有多個轉錄本,研究并未對各轉錄本進行區分,未來還需進一步對DEPDC5不同轉錄本在胃癌發生中的作用及作用機制進行探究。顯然,以上問題的闡明將會增加我們對DEPDC5參與胃癌發生機制的理解,并為利用DEPCDC5-mTORC1相關通路進行腫瘤的預防和治療提供理論基礎。