實時熒光定量PCR技術(shù)原理及在食品檢測中的應(yīng)用

史曉霞

摘要：PCR技術(shù)主要工作是分析食品樣品中微生物的指令基因，從而辨別食品樣品當中微生物的種類及數(shù)量，以達到食品檢驗工作的目的。本文主要分析實時熒光定量PCR技術(shù)的技術(shù)原理及其在食品檢測中的具體應(yīng)用，僅供參考。

關(guān)鍵詞：實時熒光定量PCR技術(shù);食品檢測;應(yīng)用

一、實時熒光定量PCR技術(shù)

1.傳統(tǒng)PCR技術(shù)

微生物檢測中的PCR技術(shù)就是聚合酶鏈式反應(yīng)，又稱為無細胞分子克隆技術(shù)。在微生物檢測中應(yīng)用PCR技術(shù)檢測食品安全，首先要搜集微生物中的細菌細胞，將細胞中的DNA進行分解，然后根據(jù)微生物中所持有的特點設(shè)計所需的引物，最后運用電泳法技術(shù)檢測細菌中DNA的排列順序。在微生物檢測中運用PCR技術(shù)檢測細菌具有靈敏度高及特異性強等優(yōu)勢，可以快速檢測出食品中含有的細菌種類及狀態(tài)。

2.實時熒光定量PCR技術(shù)原理

實時熒光定量技術(shù)基礎(chǔ)在于：實時定量PCR技術(shù)與傳統(tǒng)PCR技術(shù)相比，基本原理相同，主要區(qū)別是其定量體系。將熒光染料或熒光基團加入到PCR反應(yīng)體系中，使之具有特定波長。利用熒光信號，可對整個聚合酶反應(yīng)過程進行實時自動檢測和監(jiān)測。測量到的信號將被用來作為聚合酶鏈反應(yīng)周期熒光閾值的坐標。

實時熒光定量PCR的定量方法中主要包括：（1）絕對的定量措施，通過構(gòu)建合理的基因序列標準，并對其進行一系列的定量檢測工作，將標準品進行合理的稀釋工作之后，可以獲得多個不同稀釋之后的Ct數(shù)值。（2）相對定量：其主要是檢測人員不需要做一些額外的標準曲線，其具有簡便、省時等優(yōu)勢。

檢測擴增產(chǎn)物時，若應(yīng)用常規(guī)PCR技術(shù)只能檢測終點，實時熒光定量PCR技術(shù)是將熒光基團融入到PCR反應(yīng)系統(tǒng)中，對熒光信號強度進行觀測從而觀察實驗全過程，其中指數(shù)增長階段數(shù)據(jù)分析最為適用，并且樣品DNA含量與Ct值（循環(huán)數(shù)）二者間的關(guān)系為線性，因此，樣品的定量分析可在完成標準曲線制定后開展。實時熒光定量PCR可分為SYBRGreenreal-timePCR和Taq[1]Manreal-timePCR。SYBRGreenreal-timePCR熒光染料可以實現(xiàn)以特異性方式插入DNA雙鏈中，并將熒光信號輸出，SYBR熒光染料未插入DNA雙鏈中則分子不會出現(xiàn)熒光，對于熒光信號觀察過程中通過熒光信號的強弱程度來確定PCR產(chǎn)物含量。DNA擴增后，該技術(shù)可以通過溶解曲線對單堿基突變進行檢驗。TaqManreal-timePCR熒光強度改變是通過熒光標記探針的熒光基團解離來實現(xiàn)的。在探針完整的情況下，猝滅基團可以將報告基團的熒光信號吸收;而擴增過程中，探針被酶切，2個基團分離，故產(chǎn)生熒光信號并被接收，最終通過熒光信號的強弱來觀測產(chǎn)物的形成。這樣的方式主要特點是模板與探針融合和水解使特異性更強，而且不需要進行電泳，簡化了流程，可實現(xiàn)單個反應(yīng)將多種肉類同時進行鑒定的目的。

二、實時熒光定量PCR技術(shù)在食品檢測中的應(yīng)用

1、動物源性檢測

以TaqManreal-timePCR為基礎(chǔ)，根據(jù)牦牛細胞色素B基因設(shè)計特異性引物和探針，并與其他動物物種的DNA進行擴增，結(jié)果表明，擴增曲線僅牦牛能夠形成，并且與其他物種DNA之間不存在交叉反應(yīng)，靈敏度可達到0.001%，對牛肉的摻假檢測具有重要意義。李亮等[45]則利用牛線粒體和16SrDNA內(nèi)參基因進行相應(yīng)的試驗，并通過標準曲線計算出樣品中牛的DNA水平和總DNA水平，以此計算出回收率（平均回收率為98.62%）。由于線粒體DNA在不同組織中拷貝數(shù)不同，而細胞核DNA具有高度保守性和一致性，且在同一物種的不同細胞中拷貝數(shù)基本一致。所以目標基因的設(shè)立除了線粒體，還可以是核基因。此外，利用單拷貝核基因設(shè)計引物和探針并運用熒光定量PCR的方法進行了羊肉的摻假檢測，由于在之前的研究中發(fā)現(xiàn)，若僅應(yīng)用標準曲線進行定量會存在一定的誤差，因此，該試驗中引入了1個常數(shù)（修正因子）將摻假肉中的DNA濃度轉(zhuǎn)化為目標肉類所占的比例，以此提高肉類摻假檢測的準確性。

2、食源性致病菌檢測

沙門氏菌是食物中最重要的食源性病原菌之一。數(shù)據(jù)顯示，沙門氏菌在我國及世界各地的食物中毒病原菌中占很大比例，對人類和動物造成極大傷害，導(dǎo)致食物中毒、傷害、腸胃炎等諸多疾病。通過對inva基因設(shè)計引物，用熒光染料法建立沙門氏菌RTQ-PCR檢測方法，結(jié)果顯示沙門氏菌檢測下線達到101cfu/ml，靈敏度高，可以快速、準確地檢測肉制品中的沙門氏菌，操作簡單，耗時短。采用實時熒光定量pcr方法對生豬肉、生雞肉、生菜沙拉和羊乳制品中沙門氏菌的檢測進行了比較。結(jié)果表明，該方法快速、有效、檢測范圍廣，符合國際標準，具有實用價值。

3、轉(zhuǎn)基因食品檢測

隨著大量轉(zhuǎn)基因食品進入市場，轉(zhuǎn)基因食品的標簽和安全性問題越來越受到人們的關(guān)注。傳統(tǒng)的檢測方法存在著靈敏度低、操作繁瑣、誤報率高等缺點。建立準確、快速、靈敏的鑒別方法已成為當今研究的熱點。實時熒光定量PCR技術(shù)作為一種新技術(shù)，在分子水平上檢測轉(zhuǎn)基因成分具有較高的準確性，因此廣泛應(yīng)用于轉(zhuǎn)基因成分的定性、品種鑒定和含量檢測。利用轉(zhuǎn)基因小麥外源片段和染色體邊界序列設(shè)計引物，建立了實時熒光PCR檢測轉(zhuǎn)基因小麥b73-6-1、b72-8-11b和b102-1-2品系，同時以轉(zhuǎn)基因玉米、大豆、水稻和非轉(zhuǎn)基因小麥為對照，結(jié)果表面該方法特異性好，靈敏度可達0.01%（m/m），為檢測具有同樣外源基因的不同轉(zhuǎn)基因小麥品系提供了一種更高效的方法，具有很大的應(yīng)用價值。

結(jié)語

本文主要從傳統(tǒng)PCR技術(shù)入手，重點分析了實時熒光定量PCR技術(shù)的應(yīng)用原理，及其在食品檢測中的具體應(yīng)用，包括在動物源性檢測、轉(zhuǎn)基因食品檢測以及食源性致病菌檢測中的應(yīng)用，研究表明，實時熒光定量PCR技術(shù)在食品檢測中的應(yīng)用優(yōu)勢較為明顯，且滿足當代食品安全發(fā)展需要。

參考文獻

[1]高鑫，朱武洋，盧學(xué)新.實時熒光定量PCR在病毒檢測中的應(yīng)用[J].中國人獸共患病學(xué)報，2018，34（07）：660-667.