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胃癌組織中α肌動蛋白4表達及其對胃癌AGS細胞遷移的影響*

2021-08-02 02:56:20杜洪夏英金泳韋四喜夏萬松李紅羽袁婷黃海
貴州醫科大學學報 2021年7期
關鍵詞:數據庫分析

杜洪, 夏英, 金泳, 韋四喜,, 夏萬松, 李紅羽, 袁婷, 黃海*

(1.貴州醫科大學附屬醫院 臨床檢驗中心, 貴州 貴陽 550004; 2.貴州醫科大學 醫學檢驗學院, 貴州 貴陽 550004; 3.貴州中醫藥大學第一附屬醫院 檢驗科, 貴州 貴陽 550001)

胃癌(gastric cancer, GC)是全球高發腫瘤之一,2020年全球癌癥統計報告顯示GC發病率為5.6%、排第5位,死亡率為7.7%、排第4位[1]。我國GC發病率居亞洲首位,也是我國僅次肺癌的第2大高發腫瘤[2-4]。GC的侵襲和遷移往往伴隨著患者病情的惡化,同時也是GC患者生存率低、預后較差的主要原因之一[5-6]。因此,尋找介導GC發生發展的關鍵因素,并確定其作為新的預后生物標志物或治療靶點成為當務之急。α肌動蛋白4(actinin alpha 4,ACTN4)定位于人染色19q13.2,基因跨度38647649~38731589,可通過與絲狀肌動蛋白(actin-filament,F-actin)相互作用從而維持細胞骨架的完整性并調控細胞運動[7]。有研究報道,ACTN4與肺癌、乳腺癌等腫瘤的發生、發展及侵襲轉移密切相關[8-13],認為ACTN4可通過上皮間質轉化而促進GC細胞的轉移,有促癌作用[14],但機制尚不清楚。因此,本研究通過生物信息學分析GC中ACTN4基因的表達和意義,并對ACTN4進行GC細胞系及組織驗證,檢測ACTN4敲低對GC細胞遷移的影響,為研究ACTN4在GC發生發展、轉移中的作用和機制提供線索,現將結果匯報如下。

1 材料與方法

1.1 實驗材料

1.1.1細胞系和組織來源 GC細胞系AGS、MKN45、HGC-27、MGC803及正常胃黏膜細胞系GES-1購自中國科學院細胞庫,293T細胞由上海交通大學金衛林教授實驗室惠贈。選取胃腸外科手術20例GC患者GC組織,同時取相鄰癌組織間隔5 cm以上癌旁組織作為對照;患者男13例、女7例,年齡38~85歲、平均(61.15±13.43)歲;組織標本均有唯一識別標記,留存于液氮中;本研究獲得醫院倫理道德委員會授權批準(2020倫審第106號)。

1.1.2主要試劑和儀器 UNlQ-10 柱式Trizol總RNA抽提試劑盒(上海生工生物),PrimeScriptTMRT reagent Kit with gDNA Eraser (Perfect Real Time)試劑盒和TB Green?Premix Ex TaqTMⅡ (Tli RNaseH Plus,日本Takara),聚氰基丙烯酸正丁酯(bicinchoninic acid,BCA)蛋白定量試劑盒和高效蛋白裂解液(radio immunoprecipitation assay,RIPA;北京索萊寶),慢病毒包裝質粒(中山大學孫逸仙紀念醫院贈予);LightCycler480熒光定量聚合酶鏈式反應(polymerase chain reaction,PCR)儀(瑞士羅氏),凝膠成像分析儀(美國BIO-RAD),臺式冷凍離心機和普通PCR儀(美國Thermo Fisher),倒置顯微鏡(日本NIKON)。

1.2 研究方法

1.2.1細胞培養 GC細胞系AGS、MKN45、HGC-27、MGC-803及正常胃黏膜細胞系GES-1細胞系生長于含10%胎牛血清、1%青霉素-鏈霉素抗生素的RPMI-1640培養基中,293T生長于含10%胎牛血清、1%青霉素-鏈霉素抗生素的DMEM培養基中,細胞系置于含5%CO2、37 ℃恒溫恒濕培養箱培養。

1.2.2生物信息學分析 亞拉巴馬大學癌癥數據庫(university of alabama cancer database,UALCAN)網站[15]分析癌癥基因組圖譜(the cancer genome atlas,TCGA)數據庫ACTN4相關基因的差異表達,同時數據庫分析ACTN4與GC淋巴結轉移和分期之間的相關性。

1.2.3RNA的提取及定量PCR UNlQ-10柱式Trizol總RNA抽提試劑盒提取細胞和組織總RNA,并使用Nanodrop 2000進行定量及純度測定,所提取RNA保存于-80 ℃。cDNA第一鏈合成用PrimeScriptTMⅡ 1st Strand cDNA Synthesis Kit試劑盒,保存于-20 ℃。TB Green?Premix Ex TaqTMⅡ(Tli RNaseH Plus)用于定量分析,熒光定量PCR儀反應擴增,以HPRT基因為內參,ACTN4基因擴增引物為ACTN4-F:5′-TGGAGGTCATATCAGGGGAGC-3′,ACTN4-R:5′-GAGACCAGCTTGACGCCTTT-3′, 采用熒光定量PCR技術(real-time quantitative PCR,qRT-PCR) 檢測正常胃黏膜細胞系GES-1,GC細胞系AGS、MKN45、HGC-27、MGC803及20對GC組織和癌旁組織中ACTN4基因的表達量。

1.2.4ACTN4慢病毒敲低模型的構建 將公司合成的短發夾RNA(short hairpin RNA,shRNA)質粒、慢病毒包裝質粒進行擴增。準備293T細胞,包病毒前1天更換新鮮無雙抗的培養基,配制轉染體系:opti-MEM 1.2 mL中加目的基因的質粒和包裝質粒摩爾比為1 ∶1,psPAS2 ∶Pmd2.G ∶shRNA plasmid為2(10 μg) ∶1(5 μg) ∶2(10 μg)制備質粒混合液,opti 1.2 mL中按1 ∶6 的比例加PEI 150 μL,靜置20 min。將上述混合液加無抗培養基5 mL,6~8 h后換液,加培養基10 mL;于轉染24、36、48及72 h各收1次病毒,0.45 μm濾頭過濾;GC AGS細胞鋪6孔板密度為60%~80%,設置非感染組和感染組,非感染組細胞加polybrene 2 μL、感染組細胞加病毒和polybrene 2 μL,24 h換液,細胞篩選、培養24 h,更換新鮮培養基,36 h加嘌呤霉素篩選;非感染組細胞全部被嘌呤霉素殺死則判斷慢病毒穩轉株構建成功。

1.2.5劃痕實驗 先用marker筆于6孔板背后做好標記,細胞按5×105個/孔接種使其均勻分布,5%CO2、37 ℃恒溫恒濕培養24 h,待細胞長滿后用10 μL槍頭垂直于直尺,于6孔板孔內劃2條垂直相交劃痕;磷酸緩沖鹽溶液(phosphate buffer saline,PBS)洗細胞3次,去除懸浮細胞,加入含有1%血清培養基;置于5%CO2、37 ℃恒溫恒濕培養箱培養,分別于0、24及36 h采用倒置顯微鏡觀察、拍照。

1.3 統計學分析

2 結果

2.1 生物信息學分析

課題組前期通過TCGA數據庫進行生物信息學分析發現ACTN4在GC中高表達,ACTN4高表達與腫瘤的淋巴結轉移和分期相關;同時Kaplan-Meier Plotter數據庫分析顯示ACTN4增高提示患者預后不良(P<0.05),綜合分析提示在GC中腫瘤細胞的淋巴結轉移及腫瘤分期與ACTN4表達相關,差異有統計學意義(P<0.05)。見圖1。

2.2 ACTN4 mRNA和蛋白的表達

結果顯示,AGS細胞系中ACTN4 mRNA的表達量明顯高于GES-1細胞系,差異有高度統計學意義(P<0.001);與GES-1細胞系相比,AGS細胞系中ACTN4蛋白表達量上調,差異有統計學意義(P<0.05);qRT-PCR檢測結果表明,20例GC組織中ACTN4 mRNA表達量較癌旁組織高表達,差異有統計學意義(P<0.05)。見圖2。

2.3 敲低ACTN4后對AGS細胞遷移的影響

運用shRNA慢病毒干擾技術構建AGS細胞系ACTN4基因低表達細胞模型,Western blot檢測ACTN4蛋白表達,結果顯示sh-KD1組和sh-KD2組AGS細胞ACTN4蛋白表達水平分別低于sh-NC組(P<0.05);劃痕實驗表明sh-KD1組和sh-KD2組AGS細胞24、36 h細胞劃痕愈合率均分別較sh-NC組降低(P<0.05或P<0.01)。

3 討論

ACTN4基因定位于染色體19q13.2,在腫瘤的轉移中扮演著重要的角色[16],課題組前期通過對公共數據庫的分析結果顯示,ACTN4基因在GC中高表達。數據庫分析結果顯示ACTN4基因高表達與腫瘤組織的淋巴結轉移呈正相關,顯示其與GC細胞的轉移等密切相關,生物信息學分析結果與已報道文獻大致相符[16]。此外,通過對TCGA數據庫進行進一步生物信息學分析顯示ACTN4在腫瘤組織中的高表達與分期呈正相關,但是不同分期之間差異無統計學意義(P>0.05);在生存預后分析中,結果顯示ACTN4高表達與預后呈負相關,表明ACTN4高表達可能提示患者預后不良。

注:A為TCGA數據庫中ACTN4在GC組織和正常組織中的表達,B為Kaplan-Meier Plotter數據庫分析中ACTN4基因與GC患者生存預后的關系,C、D為TCGA數據庫分析ACTN4表達與GC分期和淋巴結轉移的關系;與正常組織或Normal組比較,(1)P<0.001,(2)P<0.05。圖1 ACTN4生物信息學分析Fig.1 Bioinformatics analysis of ACTN4

注:A、B分別為GC組織和GC細胞系中ACTN4 mRNA水平定量結果,C和D分別GC細胞系中ACTN4蛋白表達和定量結果;(1)與癌旁組織比較,P<0.05;與GES-1細胞比較,(2)P<0.001,(3)P<0.05。圖2 GC細胞系、GC組織及癌旁組織中ACTN4 mRNA和蛋白的表達Fig.2 Expression of ACTN4 mRNA and protein in gastric cancer cell lines and tissues

注:A、B分別為ACTN4蛋白表達和定量結果,C、D分別為細胞劃痕愈合面積和劃痕愈合率結果;與同時點sh-NC組比較,(1)P<0.01,(2)P<0.05。圖3 敲低ACTN4后對AGS細胞遷移的影響Fig.3 Effect of ACTN4 knockdown in migration of AGS cells

通過qRT-PCR對腫瘤GC細胞系和GC組織ACTN4 mRNA和蛋白表達情況進行檢測,結果佐證ACTN4在GC中表達失調,與生物信息學分析結果相契合。ACTN4基因的表達失調往往預示著一些腫瘤侵襲轉移的發生和病情的惡化,有研究顯示ACTN4參與腫瘤細胞上皮間質轉化(epithelial mesenchymal transition,EMT)過程,進一步顯示其與腫瘤侵襲遷移的關系[14,17-20]。腫瘤細胞EMT過程能夠促進細胞的侵襲、遷移行為,而腫瘤細胞侵襲和遷移往往提示患者病情較重、預后較差。EMT是指細胞由上皮細胞向間質細胞過渡的一個生物學行為和狀態,主要表現為細胞形態由上皮樣多邊形向間質細胞樣長梭形過渡,細胞間粘附連接破壞,上皮標志物E鈣黏蛋白表達下調,間質細胞標志物N鈣黏蛋白、波形蛋白及相關轉錄因子鋅指E-box結合同源框1、Snail等表達上調,且EMT主要報道由Wnt/β-catenin等信號通路參與調節,進而促進細胞變形運動[10,21-25]。因此腫瘤細胞EMT被認為是腫瘤重要的生物學行為,是癌細胞轉移的前置狀態。本研究體外敲低ACTN4基因構建了AGS細胞系ACTN4敲低模型,并采用劃痕實驗對該模型遷移能力進行檢測,結果顯示敲低ACTN4后AGS細胞遷移能力減弱(P<0.05)。雖然研究中未檢測EMT相關指標的表達變化,但是在敲低ACTN4后細胞遷移能力減弱,變形運動能力減低則有力佐證了ACTN4促進GCAGS細胞的轉移。

結合生物信息學大數據預測結果分析表明,ACTN4在GC細胞系AGS中高表達,ACTN4高表達能夠促進AGS細胞系的遷移,與GC患者的生存預后呈負相關關系。本研究主要優勢在于通過生物信息學分析預測,并結合組織和細胞模型驗證以及構建慢病毒穩轉細胞系對GC中ACTN4基因的功能進行探索,但也存在一些不足,如未深入探索ACTN4的功能機制。

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