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黃河鯉figla基因表達分析

2021-09-04 07:44:08呂茜茜馮世坤
河南水產 2021年3期

呂茜茜,馮世坤

(河南師范大學水產學院,河南新鄉 453007)

卵泡是哺乳動物卵巢上的基本發育單位,早期卵巢上的卵泡基因調控開始于生殖細胞簇和原始卵泡的形成。原始卵泡可以不斷生長,并發育為初級和次級卵泡。生殖系a因子(figla)是一個螺旋-環-螺旋堿性轉錄因子,在生殖細胞中特異性表達,是原始卵泡形成所必需的因子之一。在小鼠的雌性性腺中,figla最早表達于胚胎期的13.5 d,并參與后續卵泡與生殖細胞簇的發育過程[1]。figla的缺失會影響與減數分裂相關基因(Sycp5、Rad51、Ybx2)和與卵母細胞生長分化相關基因(Nobox、Lhx8、Taf4b)的表達,造成減數分裂的異常,損傷DNA并因此導致卵母細胞凋亡[2]。在缺乏figla的小鼠品系中,生殖細胞的遷移和增殖未受到影響,胚胎性腺發育正常,然而,在出生后卵母細胞會迅速凋亡,原始卵泡未能形成,最終導致雌鼠不孕[1]。

基于figla在哺乳類卵巢分化過程中的重要作用,水產科學工作者也展開了它在硬骨魚類中的研究。在青鳉(Oryzias latipes)中,figla基因在成魚卵巢中大量表達,但在成魚精巢中不表達[3]。另外,在其他硬骨魚類中也發現了figla在卵巢中大量表達的特征,例如大鱗海豬魚(Halichoeres poecilopterus)、挪威鮭魚(Atlantic salmon Salmo salar)、大菱鲆(Scophthalmus maximus)、原雌瀨魚(protogynous wrasse Halichoeres trimaculatus)、日本鰻鱺(Japanese ell Anguilla japonica)等。在黑綢(Acanthopagrus schlegeli)的研究中發現,在雄性支持細胞向雌性濾泡細胞轉化的過程中,figla作為關鍵控制因子,可能在黑綢的性逆轉中有重要作用[4]。在尼羅羅非魚(Oreochromis niloticus)中,figla基因僅在卵巢表達,在其他組織不表達;在XY個體過表達figla基因導致精子發生異常,暗示Fig.a通過抑制雄性精子發生,而在卵巢發育中有重要作用[5]。在斑馬魚中研究發現,figla在早期斑馬魚卵巢發育中起著重要的作用,在由卵母細胞形成單個卵泡的過程中尤為重要[6]。

黃河鯉(Cyprinus carpio haematopterus),是我國重要的淡水魚類,其雌魚較雄魚長得快。單性養殖可以提高產量,因而很有必要開展黃河鯉性別決定與分化分子機制研究。為了研究figla在黃河鯉卵巢分化過程中的作用,本實驗從已公布的鯉魚基因組數據中分離到figla序列,設計了ORF(Open reading frame)引物,以黃河鯉性腺為模板克隆了f igla基因的ORF序列,并通過同源性比對、系統進化分析等對其進行分析。通過RT-PCR實驗來分析figla在黃河鯉雌、雄魚不同組織,胚胎發育不同時期的表達情況,為后續figla基因功能研究奠定基礎。

1 材料和方法

1.1 實驗材料的收集

本實驗所用黃河鯉均取自河南師范大學水產養殖基地,選取健康成魚作為親魚進行培育。

在繁殖季節(每年4~6月份),挑選健康雌雄魚進行人工催產、授精[7],將得到胚胎在23±2℃,孵化過程中,定期取樣觀察胚胎發育情況,取不同發育時期(未受精、受精、囊胚期、原腸胚期、神經胚期、尾芽期、心跳期、出膜期)胚胎材料,提取總RNA。凝膠電泳檢測RNA完整性,ND-2000核酸蛋白儀測定其濃度及OD值。

1.2 黃河鯉fi gla基因ORF全長的克隆

根據NCBI上已公布鯉魚基因組數據,分離figla序列,并設計ORF相關引物(表1),成魚卵巢總RNA為模板,按照TaKaRa第一鏈cDNA合成試劑盒(RR047A)說明書操作,合成第一鏈cDNA,并用DNA酶去除基因組DNA,隨后以其為模板進行PCR,擴增黃河鯉figla。PCR條件如下:94°C預變性3 min,94°C變性30 s,59°C退火30 s,72°C延伸1 min,循環35圈;72°C延伸10 min。用1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產物,并純化,連接、轉化,將陽性菌落進行測序。基于已獲得的序列設計特異性引物(表1),使目的片段在400-600 bp左右,進行組織分布以及胚胎發育時期figla表達量檢測。

表1 所用引物序列

1.3 黃河鯉f i g la基因氨基酸序列及系統進化分析

將測序所得黃河鯉figla基因ORF序列,使用MEG軟件進行同源性比,利用在線網站(http://www.expasy.ch/tools/)推算其編碼氨基酸序列情況。分子系統進化樹用MEGA 6.0軟件鄰位相連法Neighbor-Joining(bootstrap values為1000)構建。

1.4 黃河鯉f i g la基因組織分布

選取健康成魚取各組織(腦、心臟、肌肉、肝臟、脾、腸、性腺、腎臟等),并提取總RNA,按照TaKaRa第一鏈cDNA合成試劑盒(RR047A)說明書進行逆轉錄合成cDNA,并以其10倍稀釋量作為RT-PCR模板。RT-PCR檢測figla在各組織表達情況。反應體系(20μL):rTaq酶0.3μL,buffer 2μL上、下游引物各0.5μL,cDNA模板2μL,ddH2O 14.7μL;反應程序:94°C預變性2 min;94℃10 s,60℃30 s,72℃30 s,共28個 循 環;72℃10 min,4℃10 min。以β-actin為內參。

1.5 黃河鯉f i g la基因在不同胚胎期的表達

以各胚胎期總RNA為模板逆轉錄成第一鏈cDNA檢測figla表達量。實驗方法參照1.1和1.4。

2 結果

2.1 氨基酸序列比對

使用MegAlign軟件對黃河鯉和其他物種的Figla氨基酸序列進行序列比對,發現與鯉科魚類相似性較高,與其他物種同源性較低。黃河鯉Figla與金線鲃Figla相似性最高(96%),然后為斑馬魚(84.1%),最低的是人(24.2%)。與其他脊椎動物一樣,黃河鯉Figla具有保守的bHLH結構域,但其它區域在不同物種之間的差異比較大(圖1)。

圖1 黃河鯉與其他脊椎動物的Figla氨基酸序列比對分析

黑色框框及劃線所指區域為“bHLH”DNA結合結構域保守區域,用灰色或黑色標記

2.2 系統進化分析

利用MEGA 6.0構建系統進化樹,黃河鯉Figla與其他硬骨魚類聚為一枝,其中與鯉科魚類具為一小支,這與其分類地位一致。

MEGA 6.0構建進化樹,以黃河鯉Max為外類群

圖2 脊椎動物Figla系統發生分析

2.3 組織分布

RT-PCR結果表明,figla在精巢及其他組織中均不表達,主要表達于卵巢(圖3)。

圖3 黃河鯉f igla在成體組織中的表達

2.4 不同胚胎期表達

以管家基因-actin作為參照基因,通過RT-PCR來檢測figla基因在黃河鯉胚胎發育過程中的表達情況。結果發現,figla在未受精、受精及卵裂期存在表達,而后figla幾乎不表達(圖4),暗示f igla可能是一個母源因子。

圖4 黃河鯉figla在胚胎中的表達

3 討論

已有的研究表明,在脊椎動物中,性腺的性別決定是一個高度受控的發育過程。轉錄因子Sry和Sox9以及Rspo1/Wnt/β-actin信號分別作為拮抗途徑,從胚胎未分化性腺的共同原基中驅動一系列分化發育后,形成卵巢或精巢。其中,雌、雄性通路的拮抗中占優勢的一方決定哺乳動物性別分化的方向。在雄性中,位于Y染色體的雄性性別決定基因Sry(sex-determining region on Y chromosome),于交配后12.5 d開始表達,并激活下游的特異基因Sox9和Fgf9,這些特異基因進一步誘導精巢的分化。而在雌性中,卵巢的分化方向則由既彼此獨立,又具有協同作用的Rspo1/Wnt/β-actin通路以及Fox12激活的雌激素合成通路決定著。在哺乳類,卵巢的分化和維持需要生殖細胞和體細胞的相互作用,在這種cross-talk過程中,生殖細胞f igla發揮重要作用[8]。在無脊椎動物向高等脊椎動物進化過程中,魚類處于進化的初始階段,其中硬骨魚物種數量占整個脊椎動物物種數量的一半。已有研究表明,在硬骨魚中,figla也是一個卵母細胞特定的標記因子[9]。

通過分離黃河鯉figla基因全長ORF序列,并進行Figla氨基酸序列比對后發現,黃河鯉Fig.a和其他物種的同源性較低。黃河鯉f igla的系進化分析中,與其他硬骨魚類聚為一枝,這與其分類地位相一致。與此同時,RT-PCR分析表明,黃河鯉figla在卵巢中大量表達,而在精巢等組織中均不表達,這種表達模式跟在小鼠,人類,斑馬魚,青鳉和牙鲆(Paralichthys olivaceus)中的figla的表達模式基本一致。

有報道表明在胚胎發育母源mRNA被逐步降解的同時,合子基因組激活并開始轉錄,如在小鼠中,母源mRNA的大量降解,以及合子基因的表達開始于受精后22 h左右和第一次細胞分裂結束時;而在斑馬魚中,這個過程發生在受精后2.75 h和第10次細胞分裂時[10]。通過對黃河鯉胚胎發育過程中figla的表達情況的研究,發現在未受精、受精及卵裂期三個時期均存在表達,而后figla幾乎不存在表達,暗示黃河鯉f igla可能是一個母源性因子。

綜上,本研究通過對黃河鯉Figla氨基酸序列分析、系統進化分析以及在雌雄魚不同組織、不同胚胎期表達的研究為進一步揭示figla在黃河鯉卵巢發育中功能奠定基礎。

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