李丹 杜夢(mèng)潭 修明霞 劉興健 張志芳 李軼女
(1. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所,北京 100081;2. 乳山市果茶蠶工作站,煙臺(tái) 264500)
干擾素(interferons,IFNs)是病毒或其他誘生劑刺激機(jī)體后產(chǎn)生的高活性糖蛋白,具有廣譜的抗病毒、抗腫瘤及免疫調(diào)節(jié)活性。1957年,英國(guó)病毒生物學(xué)家Isaacs在流感病毒實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),經(jīng)病毒感染的細(xì)胞會(huì)產(chǎn)生某種因子,可以干擾病毒在其它細(xì)胞中的復(fù)制,因此將其命名為干擾素[1]。近年來(lái),干擾素在病毒學(xué)、腫瘤學(xué)、細(xì)胞學(xué)等多個(gè)領(lǐng)域成為研究熱點(diǎn),已經(jīng)被應(yīng)用于治療畜禽的病毒性疾病及腫瘤性疾病,并取得良好的效果[2]。此外,由于其治療周期短、能有效預(yù)防繼發(fā)感染、減少抗生素使用等優(yōu)點(diǎn),越來(lái)越受到人們的重視。
根據(jù)其結(jié)合的特異性受體差異,干擾素可被分為I型、Ⅱ型和Ⅲ型。I型干擾素有IFN-α、IFN-β等,IFN-α根據(jù)氨基酸序列不同,又將分為IFN-α-2a、IFN-α-1b、IFN-α-2b等,I型干擾素具有很強(qiáng)的抗病毒和抗腫瘤活性,對(duì)病毒感染引起的免疫反應(yīng)發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用。目前,I型干擾素的研究被廣泛關(guān)注,已經(jīng)成為病毒學(xué)、腫瘤學(xué)等多個(gè)學(xué)科的研究熱點(diǎn)。Ⅱ型干擾素為IFN-γ,其主要功能是誘導(dǎo)主要組織相容性復(fù)合體(MHC)類抗原的表達(dá)和進(jìn)行免疫調(diào)節(jié),但其抗病毒作用弱于I型干擾素[3]。I型干擾素與Ⅱ型干擾素在理化特性及生物學(xué)活性上具有明顯的差異,如I型干擾素能夠耐受pH 2.0的酸性條件,而Ⅱ型干擾素則會(huì)失活[4]。Ⅲ型干擾素為IFN-λ,于2013年首次被發(fā)現(xiàn)[5-6],具有廣譜的抗病毒及免疫調(diào)節(jié)活性[7]。
IFN-α屬于I型干擾素,具有高度的同源性和明顯的種族特異性,人的干擾素由約165個(gè)氨基酸殘基組成,分子量約為19 kD[8-9],主要由B淋巴細(xì)胞及部分巨噬細(xì)胞產(chǎn)生[10]。IFN-α可以通過(guò)增強(qiáng)NK細(xì)胞活性、促進(jìn)B細(xì)胞增生來(lái)提高體液免疫活性,實(shí)現(xiàn)一定的抗病毒作用。此外,IFN-α可上調(diào)Th細(xì)胞上白細(xì)胞介素受體、主要組織相容性復(fù)合體 I、Ⅱ類分子的表達(dá),增強(qiáng)CD8+細(xì)胞毒性T細(xì)胞應(yīng)答,通過(guò)多種病毒相互作用途徑調(diào)節(jié)免疫活性[11]。由于IFN-α具有良好抗病毒及免疫調(diào)節(jié)作用,近年來(lái)被廣泛應(yīng)用于臨床[12-14],如抗病毒、抗腫瘤、免疫調(diào)節(jié)等[15]。
小反芻獸疫病毒(peste des petits ruminants virus,PPRV),屬于副黏病毒科、麻疹病毒屬,是一種單股負(fù)鏈RNA病毒,主要感染山羊、綿羊等小反芻動(dòng)物[16],給全球畜牧業(yè)的發(fā)展帶來(lái)嚴(yán)重的損失[17]。本研究將羊α干擾素基因序列進(jìn)行優(yōu)化合成,利用桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)在家蠶中進(jìn)行表達(dá),根據(jù)細(xì)胞病變抑制法在BHK-VSV*GFP系統(tǒng)中檢測(cè)其抗病毒活性,并對(duì)其抑制小反芻獸疫病毒增殖活性進(jìn)行測(cè)定。
大腸桿菌(Escherichia coli)感受態(tài)細(xì)胞Trans 5α購(gòu)自北京全式金生物技術(shù)有限公司;高保真DNA聚合酶購(gòu)自南京諾唯贊生物科技有限公司;BamH I、EcoR I限制性內(nèi)切酶、T4DNA連接酶、DNA Marker購(gòu)自Thermo Scientific公司;實(shí)驗(yàn)用家蠶(JY1)來(lái)自中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蠶業(yè)研究所;脂質(zhì)體購(gòu)自Invitrogen公司;DMEM培養(yǎng)基、胎牛血清(FBS)購(gòu)自Gibco公司;病毒基因組提取試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒、瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒購(gòu)自北京天根生化科技有限公司;桿狀病毒轉(zhuǎn)移載體pVL1393、失活拯救型穿梭質(zhì)粒reBmBac、家蠶卵巢細(xì)胞系(BmN)、重組表達(dá)綠色熒光蛋白的水皰型口炎病毒(VSV- GFP)、幼地鼠腎細(xì)胞(BHK)皆由本實(shí)驗(yàn)室保存;小反芻獸疫病毒疫苗(Clone9株)購(gòu)自天康生物技術(shù)有限公司;其他試劑均為國(guó)產(chǎn)或進(jìn)口分析純。
1.2.1 目的基因的優(yōu)化合成 從GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中查找目前已公布的羊α干擾素所有亞型的氨基酸序列,利用MEGA軟件[18]進(jìn)行序列比對(duì),篩選最優(yōu)氨基酸序列,并通過(guò)SignalP、TMHMM軟件對(duì)其進(jìn)行信號(hào)肽預(yù)測(cè)及跨膜區(qū)分析,選擇分泌效率高的信號(hào)肽序列。根據(jù)家蠶密碼子偏好性對(duì)相應(yīng)基因序列進(jìn)行優(yōu)化合成,在其上游添加Kozak序列提高翻譯效率,下游添加終止密碼子終止翻譯。利用DNAMAN進(jìn)行酶切位點(diǎn)分析后,將該序列5′端添加BamH I酶切位點(diǎn),3′端添加EcoR I酶切位點(diǎn)便于克隆操作,優(yōu)化后的序列交由南京金斯瑞生物科技有限公司合成。合成后的基因序列連接在pUC57載體上,命名為pUC57-OviIFN-α。
1.2.2 pVL1393-OviIFN-α轉(zhuǎn)移載體的構(gòu)建 將合成后的質(zhì)粒pUC57-OviIFN-α及桿狀病毒轉(zhuǎn)移載體pVL1393利用 BamH I、EcoR I于 37℃酶切 30 min,pUC57- OviIFN-α酶切產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳將大小不同的片段分離,用膠回收試劑盒回收OviIFN-α基因片段。pVL1393酶切產(chǎn)物經(jīng)85℃滅活10 min后,與OviIFN-α片段以1∶6的比例混合,在T4DNA連接酶的作用下,于25℃連接10 min,轉(zhuǎn)化大腸桿菌Trans 5α感受態(tài)細(xì)胞,在含有氨芐抗性(60 μg/mL)的LB固體培養(yǎng)基中篩選陽(yáng)性菌落。挑取單菌落于4.5 mL含有相同濃度氨芐的LB液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)約12 h,利用質(zhì)粒提取試劑盒提取質(zhì)粒,并用BamH I、EcoR I對(duì)重組質(zhì)粒進(jìn)行酶切鑒定,鑒定正確的質(zhì)粒送至北京睿博興科生物技術(shù)有限公司測(cè)序,并將其命名為pVL1393-OviIFN-α。
1.2.3 重組桿狀病毒的構(gòu)建及在家蠶中的表達(dá) 將轉(zhuǎn)移載體pVL1393-OviIFN-α與失活拯救型穿梭質(zhì)粒reBmBac利用脂質(zhì)體介導(dǎo)的轉(zhuǎn)染法共轉(zhuǎn)染家蠶BmN細(xì)胞,于27℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)約5.5 d,待大量細(xì)胞病變后收取細(xì)胞培養(yǎng)液,即重組病毒,置于4℃保存,經(jīng)毒株純化實(shí)驗(yàn)后,保存為毒種。將重組病毒液按照105PFU /頭注射5齡起蠶,同時(shí)設(shè)置親本病毒感染的家蠶作為對(duì)照,待達(dá)到家蠶預(yù)期的表達(dá)高峰時(shí)收取表達(dá)產(chǎn)物。利用試劑盒提取蠶血淋巴中的基因組DNA,設(shè)計(jì)引物對(duì)病毒基因組DNA中OviIFN-α部分片段進(jìn)行PCR鑒定。上游引物 5′-CTGCGACTTGCCACACAACCAC-3′;下游引物5′-TTACGGTGAAGCCAAATCGCCG-3′,預(yù)期擴(kuò)增出片段大小為520 bp。
1.2.4 重組羊干擾素α的抗病毒活性檢測(cè) 將表達(dá)樣品用PBS稀釋10倍后進(jìn)行超聲破碎,12 000 r/min離心10 min,取上清液用0.22 μm的濾膜過(guò)濾,在BHK細(xì)胞中利用微量細(xì)胞病變抑制法檢測(cè)干擾素對(duì)VSV病毒復(fù)制的抑制作用,具體操作步驟參考文獻(xiàn)[19]中的方法。根據(jù)VSV*GFP在495 nm處有吸收峰的特點(diǎn),在顯微鏡中對(duì)各組熒光情況進(jìn)行觀察并統(tǒng)計(jì),利用Reed-Muench法計(jì)算干擾素的抗病毒活性。
1.2.5 PPRV病毒滴度測(cè)定 將BHK細(xì)胞以104cell/孔鋪于96孔板中,置于37℃、5% CO2培養(yǎng)箱培養(yǎng)24 h,將PPRV疫苗株從10-1進(jìn)行10倍倍比稀釋至10-10,每孔100 μL加到上述96孔板中,同時(shí)設(shè)置空白細(xì)胞對(duì)照組,每天通過(guò)光學(xué)顯微鏡觀察細(xì)胞狀態(tài),利用Reed-Muench法計(jì)算PPRV病毒的TCID50。
1.2.6 干擾素抑制PPRV增殖活性檢測(cè) 將表達(dá)樣品以適當(dāng)倍數(shù)稀釋后以上述1.2.4中的方法在BHK細(xì)胞中孵育24 h,棄掉上清液,加入100 TCID50的PPRV 疫苗株病毒,于37℃、5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)約36 h,觀察細(xì)胞狀態(tài),待病毒對(duì)照組全部發(fā)病時(shí)開始記錄,通過(guò)Reed-Muench法計(jì)算羊α干擾素半數(shù)抑制PPRV所需的單位數(shù)。
將查找的羊α干擾素氨基酸序列進(jìn)行序列比對(duì)發(fā)現(xiàn),序列號(hào)為CAA41790.1及CAA41791.1的氨基酸序列與其它亞型一致性較高。對(duì)其進(jìn)行信號(hào)肽預(yù)測(cè)及跨膜區(qū)分析顯示,其1-23位為信號(hào)肽,無(wú)跨膜區(qū)。我們選擇登錄號(hào)為CAA41790.1的信號(hào)肽,其余序列選擇登錄號(hào)為CAA41791.1的氨基酸序列。羊α干擾素由195個(gè)氨基酸組成,根據(jù)家蠶密碼子偏好性對(duì)相應(yīng)基因序列進(jìn)行優(yōu)化,去除原始序列中高GC含量區(qū),使得GC含量達(dá)到49.92%。CAI值為0.94,表明該基因序列的密碼子使用情況較為理想,優(yōu)化后的基因序列包含588個(gè)堿基。將合成的OviIFN-α經(jīng)過(guò)BamH I、EcoR I雙酶切后連接在轉(zhuǎn)移載體pVL1393上,經(jīng)轉(zhuǎn)化、挑斑篩選出陽(yáng)性菌落,提質(zhì)粒進(jìn)行酶切鑒定,鑒定結(jié)果如圖1所示,在580 bp及大于9 600 bp附近分別出現(xiàn)清晰條帶,與預(yù)期結(jié)果一致。將其送至北京睿博興科生物技術(shù)有限公司測(cè)序,測(cè)序結(jié)果與目的序列相符,表明成功構(gòu)建pVL1393-OviIFN-α轉(zhuǎn)移載體。

圖1 重組質(zhì)粒的酶切鑒定Fig. 1 Enzyme digestion identification of recombinant plasmid
為了確定目的基因是否成功重組到桿狀病毒基因組中,并能在家蠶中復(fù)制,將羊α干擾素處理組及對(duì)照組家蠶的表達(dá)產(chǎn)物提取病毒基因組DNA,并設(shè)計(jì)引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果如圖2所示,以O(shè)viIFN-α樣品基因組DNA為模板時(shí),PCR擴(kuò)增出與預(yù)期大小一致的清晰條帶,而對(duì)照中則沒(méi)有條帶出現(xiàn),表明目的基因成功重組到桿狀病毒基因組中。

圖2 重組病毒感染家蠶后蠶血淋巴中目的基因的PCR鑒定Fig.2 PCR identification of the target gene in the hemolymph of the silkworm infected with the recombinant virus
采用微量細(xì)胞病變抑制法對(duì)羊α干擾素抑制VSV病毒活性進(jìn)行檢測(cè),當(dāng)100 TCID50單位的VSV病毒感染細(xì)胞后,在熒光顯微鏡下可以觀察到綠色熒光(圖3-C),加入少量干擾素時(shí)可部分抑制病毒感染,顯微鏡中會(huì)出現(xiàn)少量熒光(圖3-B),而當(dāng)干擾素濃度較高時(shí)能完全抑制病毒復(fù)制,則不會(huì)有熒光出現(xiàn)(圖3-A),空白細(xì)胞對(duì)照組同樣不會(huì)出現(xiàn)熒光(圖3-D)。我們從病毒對(duì)照組8個(gè)復(fù)孔全部發(fā)病時(shí)開始記錄,其結(jié)果如表1所示,當(dāng)蠶血樣品稀釋1.0×104倍時(shí)能夠完全抑制VSV*GFP病毒感染,無(wú)熒光蛋白產(chǎn)生;稀釋4.0×104倍時(shí)不能完全抑制病毒感染,部分產(chǎn)生熒光蛋白,稀釋3.2×105倍時(shí)已不能抑制病毒感染,復(fù)孔中都有大量熒光蛋白產(chǎn)生,經(jīng)統(tǒng)計(jì)后其熒光產(chǎn)生情況如表1所示,利用Reed-Muench法對(duì)其抗病毒效價(jià)進(jìn)行計(jì)算。通過(guò)多次實(shí)驗(yàn)得出重組羊α干擾素的表達(dá)量為6.5×105U/mL左右。

表1 重組羊α干擾素在BHK細(xì)胞中抑制VSV*GFP病毒活性檢測(cè)Table 1 Recombinant goat interferon alpha inhibits VSV*GFP virus activity in BHK cells

圖3 不同濃度干擾素處理組后BHK細(xì)胞感染VSV增殖情況Fig. 3 Proliferation of BHK cells infected with VSV after treatment with different concentrations of interferon
PPRV感染BHK細(xì)胞36 h時(shí),出現(xiàn)明顯的細(xì)胞病變效應(yīng)(cytopathic effect,CPE),細(xì)胞收縮,形態(tài)發(fā)生改變,并出現(xiàn)聚集現(xiàn)象,形成合胞體。觀察各孔細(xì)胞病變情況并記錄,結(jié)果如表2所示,利用Reed-Muench法計(jì)算其TCID50,為每1 mL 106TCID50。

表2 PPRV的TCID50測(cè)定結(jié)果Table 2 TCID50 measurement results of PPRV
將不同濃度的羊α干擾素用于抑制PPRV病毒在BHK細(xì)胞中的復(fù)制,抑制情況分為以下4種:PPRV感染BHK細(xì)胞病毒后,出現(xiàn)明顯的合胞體(圖4-A);當(dāng)加入干擾素能完全抑制PPRV增殖,細(xì)胞不發(fā)生病變(圖4-B);當(dāng)干擾素能部分抑制PPRV復(fù)制時(shí),細(xì)胞出現(xiàn)少量合胞體;空白細(xì)胞對(duì)照組則不會(huì)發(fā)生病變(圖4-C)。以病毒組復(fù)孔半數(shù)發(fā)生病變?yōu)槠瘘c(diǎn)開始觀察,以病毒組復(fù)孔全部發(fā)生病變?yōu)榻y(tǒng)計(jì)終點(diǎn),記錄合胞體出現(xiàn)情況,利用Reed-Muench法對(duì)羊α干擾素抑制PPRV病毒效價(jià)進(jìn)行計(jì)算。結(jié)果顯示,干擾素對(duì)PPRV復(fù)制的半抑制濃度IC50為 136.93 U。

圖4 羊α干擾素抑制BHK細(xì)胞感染PPRV增殖效果圖Fig. 4 Effects of OviIFNα on inhibiting the proliferation of BHK cells infected with PPRV
家蠶桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)是目前廣泛應(yīng)用于表達(dá)外源蛋白的真核表達(dá)系統(tǒng),本研究利用本實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建的家蠶桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)[20]表達(dá)羊α干擾素。該系統(tǒng)將家蠶桿狀病毒BmNPV進(jìn)行基因修飾,并缺失其復(fù)制所必須的ORF1629基因,構(gòu)建相應(yīng)的失活拯救型穿梭載體pVL1393,使得共轉(zhuǎn)染時(shí)只有外源基因插入的桿狀病毒才能進(jìn)行復(fù)制,該策略使重組效率理論上提高到100%,為羊α干擾素的高效表達(dá)奠定了基礎(chǔ)。另外,相對(duì)于原核表達(dá)系統(tǒng)來(lái)說(shuō),家蠶桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)作為真核表達(dá)系統(tǒng),具有乙酰化、糖基化等翻譯后修飾功能,產(chǎn)物結(jié)構(gòu)與天然蛋白相似,有利于生產(chǎn)具有更高比活的羊α干擾素。本研究利用家蠶桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)的羊α干擾素,在BHK-VSV*GFP系統(tǒng)中檢測(cè)到其表達(dá)量可達(dá)6.5×105U/mL。由于本實(shí)驗(yàn)室在之前的豬、雞、犬等干擾素的活性檢測(cè)實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),家蠶幼蟲或蠶蛹的蛋白,正常桿狀病毒及其表達(dá)產(chǎn)物在細(xì)胞病變抑制法中都無(wú)抗病毒活性[20-21],因此在檢測(cè)干擾素抗病毒活性時(shí),沒(méi)有設(shè)置正常蠶血組作為對(duì)照。此外,由于羊α干擾素具有很強(qiáng)的種屬特異性,該抑制實(shí)驗(yàn)應(yīng)當(dāng)在相應(yīng)羊來(lái)源細(xì)胞系進(jìn)行,但由于成熟的羊來(lái)源的細(xì)胞系較為稀少,故先選擇鼠源細(xì)胞(BHK)進(jìn)行抑制實(shí)驗(yàn),因此,該干擾素在羊來(lái)源細(xì)胞中對(duì)病毒復(fù)制的抑制效果仍需進(jìn)一步確認(rèn)。
信號(hào)肽在外源蛋白的分泌時(shí)發(fā)揮重要作用,它能引導(dǎo)新生肽段穿越真核生物的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜,避免產(chǎn)物大量聚集在細(xì)胞中,影響細(xì)胞活性。因此,在家蠶桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)中表達(dá)羊α干擾素時(shí)需要保留信號(hào)肽序列。但不同的信號(hào)肽序列有不同的分泌和切割能力,通過(guò)查找GenBank中羊α干擾素不同亞型的信號(hào)肽序列,根據(jù)信號(hào)肽剪切位點(diǎn)得分及S值變化趨勢(shì),篩選出分泌效率高的信號(hào)肽序列登錄號(hào)為(CAA41790.1)用于本次表達(dá)實(shí)驗(yàn)。
I型干擾素是機(jī)體固有免疫應(yīng)答中一類重要的細(xì)胞因子,具有廣譜的抗病毒及抗腫瘤等作用[22]。干擾素α屬于I型干擾素中重要的一種,它既能抑制病毒復(fù)制,又能調(diào)節(jié)宿主免疫功能,其對(duì)各種類型細(xì)胞的功能都有廣泛的影響。研究表明,病毒感染早期給予外源性IFN-α,可以激活干擾素誘導(dǎo)的抗病毒狀態(tài),并使NK細(xì)胞表達(dá)穿孔素和顆粒酶A,從而增加宿主抗病毒的能力[23]。因此,本實(shí)驗(yàn)選擇α干擾素進(jìn)行抗病毒活性研究,表達(dá)具有高效、廣譜抗病毒活性的羊α干擾素。
多年來(lái),小反芻獸疫疫情不斷在國(guó)內(nèi)及周邊國(guó)家出現(xiàn),對(duì)全球的羊養(yǎng)殖業(yè)造成了極大的威脅,減毒活疫苗是目前市場(chǎng)上常用的方法,但其具有安全性低,不能區(qū)分自然感染動(dòng)物與免疫動(dòng)物等缺點(diǎn),為小反芻獸疫疫情的防控帶來(lái)了很大的困難,而干擾素具有毒副作用小、抗原性弱,可反復(fù)使用等優(yōu)點(diǎn),對(duì)病毒性感染引起的疫情防控具有積極地作用。近年來(lái),干擾素已經(jīng)被廣泛用于多種動(dòng)物的抗病毒作用研究,并取得了一定的進(jìn)展,目前市場(chǎng)上商品化的豬、犬、雞等重組干擾素產(chǎn)品已應(yīng)用于實(shí)踐。本實(shí)驗(yàn)將羊α干擾素用于抑制小反芻獸疫病毒增殖研究,結(jié)果顯示僅需136.93 U就可以對(duì)PPRV 病毒的復(fù)制產(chǎn)生明顯的抑制作用,該結(jié)果有望為小反芻獸疫疫情防控提供新的方法。
本研究利用家蠶桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)了羊α干擾素,經(jīng)BHK-VSV*GFP系統(tǒng)檢測(cè)到該干擾素具有較強(qiáng)的抗病毒活性,為大量生產(chǎn)廉價(jià)且高效的羊α干擾素提供了一種新的方法。另外,該干擾素在對(duì)PPRV病毒的抑制實(shí)驗(yàn)中顯示出較強(qiáng)的抗病毒作用,為干擾素用于PPRV疫情的防控提供了理論基礎(chǔ)。