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煙嘧磺隆降解菌Chryseobacterium sp. LAM-M5的分離、鑒定及其降解機(jī)理研究

2022-03-10 04:27:12馬青云江旭李情情宋金龍周義清阮志勇
生物技術(shù)通報(bào) 2022年2期
關(guān)鍵詞:除草劑檢測(cè)

馬青云 江旭 李情情 宋金龍 周義清 阮志勇,4,5

(1. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)資源與農(nóng)業(yè)區(qū)劃研究所/CAAS-CIAT可持續(xù)農(nóng)業(yè)聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室,北京100081;2. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院研究生院,北京100081;3. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院,北京 100141;4. 西藏農(nóng)牧學(xué)院資源與環(huán)境學(xué)院,林芝 860000;5. 煙臺(tái)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,煙臺(tái) 264005)

化學(xué)除草劑在保障糧食產(chǎn)量和質(zhì)量方面發(fā)揮了重要的支撐作用。然而,中國(guó)作為除草劑生產(chǎn)和使用大國(guó),每公頃農(nóng)田中除草劑的平均使用量為世界平均水平的 1.5-4 倍[1],除草劑殘留正成為限制中國(guó)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)綠色發(fā)展的瓶頸問題之一[2]。磺酰脲類除草劑屬于高效、低毒、高選擇性的新型除草劑,被廣泛應(yīng)用于水稻、玉米、小麥、大豆等田間雜草的防控,其用量也逐年遞增[3]。2015 年全世界磺酰脲類除草劑的銷售額已達(dá)20.19億美元,占整個(gè)除草劑市場(chǎng)的11.0%[4]。煙嘧磺隆是磺酰脲類除草劑的代表性品種(圖1),年銷售額達(dá)2.82億美元[5],由于其淋溶性較強(qiáng),易對(duì)土壤及地下水造成污染,對(duì)生態(tài)環(huán)境和人類健康存在潛在的威脅[6-8],同時(shí)影響輪作和后茬敏感作物,并危害水生生態(tài)系統(tǒng)的穩(wěn)定。

圖1 煙嘧磺隆化學(xué)結(jié)構(gòu)式[3]Fig.1 Chemical structural formula of nicosulfuron

煙嘧磺隆在自然環(huán)境中可通過化學(xué)水解[9]、微生物代謝[10]和光催化實(shí)現(xiàn)降解[11]。微生物代謝降解是實(shí)現(xiàn)煙嘧磺隆從環(huán)境中去除的最主要過程,也是最有效和環(huán)境友好的途徑。迄今為止,已經(jīng)從農(nóng)田土壤、工廠排污口、河流、活性污泥等多個(gè)生態(tài)系統(tǒng)中分離出了多個(gè)煙嘧磺隆降解菌株。Zhao 等[12]從磺酰脲類除草劑污染的農(nóng)田土壤中分離得到的糞產(chǎn)堿桿菌(Alcaligenes faecalis)ZWS11,在6 d內(nèi)對(duì)初始質(zhì)量濃度為 500 mg/L的煙嘧磺隆的降解率達(dá) 80% 以上。代鵬飛等[13]從農(nóng)藥廠的活性污泥中分離到一株能以煙嘧磺隆為唯一碳源生長(zhǎng)的假單胞菌(Pseudomonas)YN-8,在7 d內(nèi)對(duì)100 mg/L 的煙嘧磺隆降解率為65.4%。張國(guó)民等[14]從玉米田土壤中分離到一株紅假單胞菌(Rhodopseudomonas),在7 d內(nèi)對(duì)400 mg/L的煙嘧磺隆降解率為32.3%。Wang等[15]從人工濕地土壤中分離得到的克雷伯氏菌(Klebsiella)Y1,在 6 d內(nèi)對(duì)100 mg/L的煙嘧磺隆降解率為78.90%。Carles等[16]從煙嘧磺隆污染的農(nóng)田土壤中分離到一株(Pseudomonas fluorescens)SG-1,在1 d內(nèi)對(duì)2.5 mg/L的煙嘧磺隆降解率為77.5%。此外,研究人員還分離到了具有煙嘧磺隆降解能力的真菌,例如,F(xiàn)eng等[17]從活性污泥中分離到一株青霉菌(Penicillium)YC-WC1,在6 d內(nèi)能完全降解100 mg/L的煙嘧磺隆。許多研究人員從降解菌株中發(fā)現(xiàn)了多種降解相關(guān)的功能基因及酶,例如,李順鵬等[18]從嗜甲基菌(Methylophilussp.)S113 菌株中獲得了噻吩磺隆水解酶基因tsmE,該基因的表達(dá)產(chǎn)物在1 h 內(nèi)能夠?qū)?00 mg/L 的噻吩磺隆完全水解。Ruan等[19]對(duì)庫(kù)特氏屬(Kurthia huakuii)LAM0713菌株克隆得到一個(gè)新的酯酶基因sue,該基因的表達(dá)產(chǎn)物在 15 min 內(nèi)對(duì)50 mg/L的醚磺隆降解率達(dá)43.2%。宋金龍[20]從黃籃狀菌(Talaromyces flavus)LZMl中純化得到的黃素單加氧酶fmo,在15 min內(nèi)對(duì)50 mg/L煙嘧磺隆的降解率達(dá) 71.7%。

目前已報(bào)道的煙嘧磺隆降解菌的多樣性十分有限,僅集中在芽孢桿菌屬(Bacillus)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、克雷伯氏菌屬(Klebsiella)等幾個(gè)屬中,難以滿足不同環(huán)境條件下煙嘧磺隆污染的生物修復(fù)需求,因此,有必要從不同環(huán)境樣品中分離得到更多更豐富的煙嘧磺隆降解菌資源,并進(jìn)行功能評(píng)價(jià)及降解機(jī)理研究。本研究從合肥某煙嘧磺隆生產(chǎn)廠的活性污泥中分離并篩選得到一株能以煙嘧磺隆為唯一氮源生長(zhǎng)菌株,對(duì)其進(jìn)行分類鑒定和降解機(jī)理研究。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 樣品采集 供試樣品采自安徽合肥某磺酰脲類除草劑生產(chǎn)廠廢水處理池的活性污泥,采集后裝入滅菌自封袋中帶回實(shí)驗(yàn)室,用于煙嘧磺隆降解菌的分離。

1.1.2 主要試劑 煙嘧磺隆(分析純,> 95%)購(gòu)自上海阿拉丁有限公司,Taq DNA 聚合酶(MT201)、dNTPs、DNA Marker、所用引物購(gòu)自博邁德有限公司,乙腈(色譜純)等有機(jī)試劑均購(gòu)自美國(guó)Sigma-Aldrich公司。

1.1.3 培養(yǎng)基 GSM培養(yǎng)基:5.0 g葡萄糖,0.2 g NaCl,0.1 g CaCl2,0.5 g K2HPO4,0.2 g MgSO4·12H2O,pH 7.0,無 機(jī) 鹽 培 養(yǎng) 基:1.0 g Na3HPO4·12H2O,0.5 g K2HPO4,0.2 g MgSO4·12H2O,pH 7.0。在115℃條件下高壓滅菌20 min。牛肉膏蛋白胨固體培養(yǎng)基:3.0 g牛肉膏,10.0 g蛋白胨,5.0 g NaCl,20.0 g瓊脂,1 000 mL水,pH 7.4-7.6,121℃條件下高壓滅菌20 min,液體培養(yǎng)基中不加瓊脂。

1.2 方法

1.2.1 煙嘧磺隆降解菌的富集與篩選 取10 g污泥樣品添加到100 mL含終濃度為50 mg/L的煙嘧磺隆的無機(jī)鹽培養(yǎng)基中,于30℃、160 r/mim的搖床上避光培養(yǎng)30 d,然后以5%的接種比例將該體系轉(zhuǎn)接至100 mL含150 mg/L煙嘧磺隆的新鮮無機(jī)鹽培養(yǎng)基中,每次提高煙嘧磺隆濃度50 mg/L,并使煙嘧磺隆終濃度達(dá)到200 mg/L。馴化3個(gè)月后將培養(yǎng)液用無菌水進(jìn)行倍比稀釋后涂布到含50 mg/L煙嘧磺隆的無機(jī)鹽固體培養(yǎng)基上。將出現(xiàn)的菌落劃線純化后放置- 80℃冰箱保藏備用。

1.2.2 煙嘧磺隆降解菌的初步鑒定 將獲得菌株接種到牛肉膏蛋白胨固體培養(yǎng)基上,30℃恒溫培養(yǎng) 2 d后觀察菌落形態(tài),采用革蘭氏染色法確定菌株革蘭氏類型。將菌株接種于牛肉膏液體培養(yǎng)基中并置于30℃,160 r/mim的搖床上培養(yǎng)過夜,利用DNA提取試劑盒提取菌液DNA,經(jīng)1% 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)目的條帶,以該DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。利用細(xì)菌通用引物1492R和27F擴(kuò)增該菌株中的16S rRNA基因[21],純化的PCR產(chǎn)物由北京博邁德測(cè)序公司進(jìn)行測(cè)序。PCR反應(yīng)體系為(25 μL):模板DNA 1 μL;正向及反向引物各 1 μL;Taq PCR Mix 12.5 μL;ddH2O 8.5 μL。PCR 程序如下:95℃,初始變性 5 min;95℃,變性 30 s;55℃退火 30 s;72℃延伸 1.5 min,循環(huán) 30 次;72℃,延伸 10 min。將測(cè)序結(jié)果提交至EzBioCloud[22]進(jìn)行序列比對(duì),根據(jù)比對(duì)結(jié)果,選擇相似性高的菌株作為參比并下載相關(guān)模式菌株的16S rRNA基因序列,通過 CLUSTAL X[23]進(jìn)行多序列比對(duì),使用MEGA7.0[24]構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹確定該菌的分類地位。

1.2.3 菌株降解性能測(cè)定 將菌株LAM-M5接種于牛肉膏蛋白胨液體培養(yǎng)基中,于30℃,165 r/min的恒溫?fù)u床上避光培養(yǎng)48 h。將培養(yǎng)液在8 000 r/min的轉(zhuǎn)速下離心5 min,棄上清,收集菌體。用0.13mol/L磷酸鹽緩沖溶液(pH 7.2)洗滌菌體3次后重懸,以5.0%(V∶V)接種比例接入含終濃度50 mg/L煙嘧磺隆的GSM培養(yǎng)基中,于30℃、165 r/min條件下避光培養(yǎng),研究降解菌對(duì)煙嘧磺隆的降解效果,以未接種的相同體系作為空白對(duì)照,所有實(shí)驗(yàn)均重復(fù)3次,定期取樣檢測(cè)液體培養(yǎng)基中煙嘧磺隆殘留量。

煙嘧磺隆的測(cè)定采用高效液相色譜法[25],根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的保留時(shí)間定性、標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的峰面積外標(biāo)法定量。本實(shí)驗(yàn)采用Agilent 1200 LC高效液相色譜:色譜柱:Dikam Diam onsil C18,柱長(zhǎng) 250 mm×4.6 mm,內(nèi)徑5 μm;柱溫:30℃;流速1.0 mL/min;流動(dòng)相:乙腈∶水∶冰乙酸 =(30∶70∶0.05,V∶V∶V);進(jìn)樣量10 μL,檢測(cè)波長(zhǎng)245 nm。根據(jù)公式計(jì)算降解能力:降解率/% =[1 -(實(shí)測(cè)殘量/對(duì)照樣實(shí)測(cè)殘量)]× 100%[26]。

1.2.4 菌株降解煙嘧磺隆的特性研究 菌株的降解特性研究包括菌株在不同溫度、pH及接種量條件下對(duì)煙嘧磺隆的降解能力。設(shè)置不同溫度(15、20、25、30和35℃),不 同pH值(5、6、7、8和9)和不同接種量(0.0%、2.0%、4.0%、6.0%、8.0%和10.0%,V∶V),將菌株接種至不同條件下含煙嘧磺隆GSM培養(yǎng)基中作為處理組,以相同條件下不接入菌株為對(duì)照組,測(cè)定煙嘧磺隆殘余濃度計(jì)算菌株的降解率。

1.2.5 短鏈有機(jī)酸的鑒定 利用HPLC檢測(cè)并鑒定菌株LAM-M5在含煙嘧磺隆的GSM培養(yǎng)基中產(chǎn)生的短鏈有機(jī)酸情況,檢測(cè)條件:流動(dòng)相為磷酸二氫銨(0.02 mmol/L,pH 2.7)與甲醇的混合物(比例為85∶15,V∶V),進(jìn)樣量為10 μL,光電二極管陣列檢測(cè)器的波長(zhǎng)為210 nm,流速為1.0 mL/min,柱溫為30℃。以分析純級(jí)的草酸、L -蘋果酸、α-酮戊二酸、檸檬酸和富馬酸作為參照標(biāo)樣。

1.2.6 菌株LAM-M5降解煙嘧磺隆中間產(chǎn)物的檢測(cè) 將菌株LAM-M5按1.2.3的方法培養(yǎng)并制備OD600為1.0的菌懸液。取5.0%的LAM-M5菌懸液接種到含有50 mg/L煙嘧磺隆的GSM培養(yǎng)基,以相同條件但不接菌的GSM培養(yǎng)基作為空白對(duì)照,分別培養(yǎng)3 d后取樣,上述所有實(shí)驗(yàn)均設(shè)3次重復(fù)。使用配備電噴霧電離的Xevo三重四極桿(Xevo-TQD)質(zhì)譜儀(Waters Corp,Milford,MA,USA)進(jìn)行檢測(cè)。質(zhì)量模式m/z為100-450[27],Masslynx NTV的正模式(ESI +)和負(fù)模式(ESI -)的ESI源被用于收集和分析獲得的數(shù)據(jù)[28]。

1.2.7 菌株LAM-M5全基因組測(cè)序及分析 將菌株LAM-M5送至諾禾致源科技有限公司(北京,中國(guó))進(jìn)行基因組測(cè)序,具體流程參考文獻(xiàn)[29]。菌株全基因組測(cè)序完成后,分析菌株的基因組成分,分析預(yù)測(cè)編碼基因、非編碼 RNA、重復(fù)序列、CRISPR 等基因組成分,并使用KEGG、GO、Swissprot、NR、COG等數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)編碼基因序列進(jìn)行功能注釋。結(jié)合已報(bào)道降解相關(guān)的基因,搜索并分析該菌株中可能存在的與煙嘧磺隆降解相關(guān)的功能基因信息。

2 結(jié)果

2.1 煙嘧磺隆降解菌株的分離

將富集培養(yǎng)得到的富集液進(jìn)行煙嘧磺隆的降解驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)富集液對(duì)煙嘧磺隆幾乎無降解作用,接下來對(duì)富集液進(jìn)行平板稀釋涂布,共獲得18株細(xì)菌,其中菌株LAM-M5的降解能力最強(qiáng),在GSM培養(yǎng)基中7 d(30℃,5%接種量)對(duì)50 mg/L的煙嘧磺隆的降解率可達(dá)92.39%,選作后續(xù)研究菌株。

2.2 煙嘧磺隆降解菌株的鑒定

菌株LAM-M5在牛肉膏蛋白胨固體培養(yǎng)基上培養(yǎng)48 h后,菌落呈金黃色,不透明(圖2)。革蘭氏陰性,無鞭毛。

圖2 菌株LAM-M5在牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基平板上的菌落形態(tài)Fig.2 Colony morphology of strain LAM-M5 on the beef extract peptone medium plate

將菌株LAM-M5的16S rRNA基因序列(1 505 bp)提交至Genbank數(shù)據(jù)庫(kù)中(序列登錄號(hào)為:MW647553)。將該基因序列信息在EzBiocloud網(wǎng)站上進(jìn)行比對(duì),結(jié)果表明,LAM-M5的16S rRNA基因序列與Chryseobacterium lacusYLOS41T相似性最高,達(dá)到99.93%。利用 NJ(neighbor joining method)法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖3)可以看出,菌株LAM-M5與來自Chryseobacterium屬的菌株聚在一起,因此,初步將該菌株鑒定為Chryseobacteriumsp. LAM-M5。自NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中下載菌株Chryseobacterium lacusYLOS41T的全基因組信息,通過OrthoANIu algorithm(https://www.ezbiocloud.net/tools/ani)分析菌株間的平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)。結(jié)果表明,菌株LAM-M5的基因組序列與Chryseobacterium lacusYLOS41T的ANI值是97.74%,利 用Genome-to-Genome Distance Calculator 2.1(http://ggdc.dsmz.de/)計(jì)算菌株間的DNA雜交同源性(DNA-DNA hybridization,DDH),菌株LAM-M5與Chryseobacterium lacusYLOS41T間的DDH值為79%,兩個(gè)數(shù)值均高于定義同種的閾值(ANI 95%-96%和DDH 70%)[30],因此將該菌株LAM-M5鑒定為Chryseobacterium lacus,這是首次關(guān)于金黃桿菌屬(Chryseobacterium)菌株降解煙嘧磺隆的報(bào)道。

圖3 基于16S rRNA基因序列構(gòu)建的NJ系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.3 Neighbour-joining phylogenetic tree based on the 16S rRNA gene sequences

2.3 煙嘧磺隆的降解特性

LAM-M5可以在較寬的pH值范圍(5-9)內(nèi)降解煙嘧磺隆(圖4-A),降解率隨pH值的降低而增加。初始pH值為6.0時(shí),菌株LAM-M5對(duì)煙嘧磺隆的降解效果最佳,可達(dá)92.39%。在第3天時(shí),開始對(duì)50 mg/L煙嘧磺隆表現(xiàn)出明顯的降解,此時(shí)體系pH值開始下降;第7天時(shí),體系pH值降至3.5,此時(shí)菌株LAM-M5對(duì)50 mg/L的煙嘧磺隆降解率達(dá)到92.39%。菌株LAM-M5對(duì)溫度具有較好的適應(yīng)性,它在15℃-35℃范圍內(nèi)均能降解煙嘧磺隆,且降解效率隨溫度增加而增加(圖4-B),在35℃時(shí)降解效果最佳,達(dá)到98.39%。菌株LAM-M5的初始接種量對(duì)煙嘧磺隆的降解率也有影響,隨著接種量的增加,降解效率有明顯的增加,初始接種量為10% 時(shí),降解效率最高,達(dá)到99.6%。

圖4 不同pH值(A)、溫度(B)、接種量(C)對(duì)菌株LAM-M5 降解煙嘧磺隆降解率的影響Fig.4 Effects of different pH(A),temperature(B)and initial inoculum ratio(C)on the degradation of nicosulfuron by strain LAM-M5

同時(shí)驗(yàn)證了菌株LAM-M5對(duì)其他田間常用除草劑的降解,例如,磺酰脲類除草劑氯嘧磺隆和三酮類除草劑硝磺草酮,在相同的培養(yǎng)條件和降解體系內(nèi),菌株LAM-M5對(duì)這兩類除草劑在7 d內(nèi)均無降解。

2.4 菌株LAM-M5降解煙嘧磺隆過程中產(chǎn)生的短鏈有機(jī)酸的鑒定

本研究中,菌株LAM-M5在含煙嘧磺隆的GSM培養(yǎng)基中培養(yǎng)時(shí),體系pH值在7 d之內(nèi)從7.0降至3.0左右(圖5)。利用HPLC對(duì)菌株的培養(yǎng)液進(jìn)行了檢測(cè),在培養(yǎng)液中檢測(cè)到了大量L -蘋果酸,由于煙嘧磺隆在酸性條件下極不穩(wěn)定,推測(cè)菌株LAM-M5通過代謝葡萄糖產(chǎn)生大量L-蘋果酸,降低環(huán)境pH值,從而使煙嘧磺隆發(fā)生脲橋斷裂而降解。

圖5 LAM-M5降解煙嘧磺隆過程中pH值的變化Fig.5 Change of pH value during the nicosulfuron degradation by strain LAM-M5

2.5 菌株LAM-M5降解煙嘧磺隆代謝產(chǎn)物的檢測(cè)及其代謝途徑的推測(cè)

通過高效液相色譜與質(zhì)譜聯(lián)用[31],對(duì)菌株LAM-M5在含煙嘧磺隆的GSM液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)3 d后的中間代謝產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)與分析。ESI源檢測(cè)結(jié)果表明,在陰離子和陽(yáng)離子模式下,共檢測(cè)到5個(gè)片段,質(zhì)荷比分別為409m/z,259m/z,228m/z,156m/z,304m/z。根據(jù)已報(bào)道的代謝途徑及中間產(chǎn)物的化學(xué)結(jié)構(gòu)[31-33],對(duì)檢測(cè)片段的物質(zhì)類型和產(chǎn)生途徑進(jìn)行了推斷,其中陰離子模式中的259.44m/z(2-(N-氨基甲酰磺酰磺酰基)- N,N-二甲基丙酰胺)是由于磺酰脲橋C-N鍵的斷裂產(chǎn)生,并進(jìn)一步斷裂酰胺鍵產(chǎn)生228.38m/z(2-氨基磺酰基-N,N-二甲基丙酰胺)。陽(yáng)離子模式下質(zhì)荷比為304.18m/z(N-(4,6-二甲氧基嘧啶-2-基氨基甲酰基)-1-(甲基亞氨基)甲磺酰胺)的產(chǎn)生是由于煙嘧磺隆中吡啶環(huán)的開環(huán)[34];在陽(yáng)離子模式下檢測(cè)到的155.41m/z(2-氨基-4,6-二甲氧基嘧啶)產(chǎn)物是由304.18m/z產(chǎn)物的磺酰脲橋的酰胺鍵斷裂產(chǎn)生。綜上,推測(cè)得出了菌株LAM-M5在GSM培養(yǎng)基中對(duì)煙嘧磺隆可能的降解途徑(圖6)。

圖6 菌株LAM-M5降解煙嘧磺隆的代謝途徑Fig .6 Proposed metabolic pathways of nicosulfuron degradation by strain LAM-M5

2.6 菌株LAM-M5基因組分析

2.6.1 菌株LAM-M5基因組測(cè)序數(shù)據(jù)分析 通過對(duì)菌株LAM-M5的基因、重復(fù)序列、非編碼 RNA 等的預(yù)測(cè),獲得了該菌株基因組的組成基本情況信息(表1)。菌株LAM-M5的基因總長(zhǎng)度為5.704 Mb,基因組中含基因數(shù)量達(dá)6 366個(gè),平均長(zhǎng)度 896 bp。串聯(lián)重復(fù)序列共 280個(gè),總長(zhǎng)為 17 086 bp,占基因組全長(zhǎng)的 0.2707%。小衛(wèi)星序列 211個(gè),微衛(wèi)星序列 0個(gè),tRNA 121個(gè),rRNA 14個(gè)。

表1 LAM-M5的基因組組分結(jié)果統(tǒng)計(jì)Table 1 Genomic characteristics of strain LAM-M5

2.6.2 菌株LAM-M5對(duì)煙嘧磺隆降解酶基因的預(yù)測(cè) 在該研究中,對(duì)菌株LAM-M5進(jìn)行基因組Swiss-port的數(shù)據(jù)庫(kù)分析,同時(shí)結(jié)合已報(bào)道的煙嘧磺隆的降解基因分析,對(duì)菌株LAM-M5中可能參與煙嘧磺隆降解的相關(guān)基因進(jìn)行了預(yù)測(cè),結(jié)果如表2所示。

表2 菌株LAM-M5 基因組中7個(gè)降解酶相關(guān)的基因Table 2 7 genes related to degradation enzymes in the genome of strain LAM-M5

3 討論

煙嘧磺隆長(zhǎng)期使用造成的殘留會(huì)對(duì)土壤及地下水造成污染,對(duì)生態(tài)環(huán)境和人類健康存在潛在的威脅,同時(shí)損害后茬敏感農(nóng)作物,并危害水生生態(tài)系統(tǒng)的穩(wěn)定性。因此尋找高效、環(huán)境友好、經(jīng)濟(jì)的除草劑污染環(huán)境治理方法十分迫切。微生物修復(fù)技術(shù)無毒、無殘留,避免了二次污染,是消除煙嘧磺隆殘留及保障農(nóng)產(chǎn)品安全的有效途徑之一。目前已經(jīng)從各種環(huán)境樣本中通過富集馴化等方式獲得了許多煙嘧磺隆的降解資源。但是這些降解資源僅限于環(huán)境中的優(yōu)勢(shì)屬,例如芽孢桿菌屬(Bacillus),假單胞菌屬(Pseudomonas)等。環(huán)境中存在著豐富的微生物資源,許多具有降解功能的菌株資源未被發(fā)掘,可嘗試通過培養(yǎng)組學(xué)[35]的方法獲得更多的煙嘧磺隆降解的菌株資源,豐富除草劑的微生物降解資源庫(kù)。本實(shí)驗(yàn)從某煙嘧磺隆生產(chǎn)廠的活性污泥中,分離出一株煙嘧磺隆高效降解菌株LAM-M5,通過16S rRNA的基因序列比對(duì),初步將菌株鑒定為Chryseobacterium lacusLAM-M5。

在已報(bào)道的煙嘧磺隆微生物降解途徑與相關(guān)機(jī)制中,煙嘧磺隆主要通過脲橋上的C-N鍵斷裂完成降解。Zhao等[12]在糞產(chǎn)堿桿菌(Alcaligenes faecalisZWS11)對(duì)煙嘧磺隆的降解產(chǎn)物中檢測(cè)到了N,N-二甲基-2-氨基磺酰基-3-吡啶甲酰胺和2-氨基-4,6-二甲氧基嘧啶,并由此推斷這兩個(gè)降解產(chǎn)物是由磺酰脲橋的C-N鍵斷裂直接得到的。Zhang等[36]根據(jù)粘質(zhì)沙雷氏菌(Serratia marcescensN80)對(duì)煙嘧磺隆的主要降解產(chǎn)物推測(cè)了其降解途徑,其中化合物N,N-二甲基-2-氨基磺酰基-3-吡啶甲酰胺和2-氨基-4,6-二甲氧基嘧啶均是在微生物作用下直接從煙嘧磺隆獲得,分別來自于磺酰脲橋上 C-N 鍵的斷裂。現(xiàn)有的研究發(fā)現(xiàn),不同種類微生物對(duì)煙嘧磺隆的降解途徑均存在差異,并導(dǎo)致所產(chǎn)生的中間降解產(chǎn)物有所不同[37],但是幾乎所有的煙嘧磺隆降解體系中都能直接檢測(cè)到產(chǎn)物N,N-二甲基-2-氨基磺酰基-3-吡啶甲酰胺和2-氨基-4,6-二甲氧基嘧啶,表明這兩種化合物是在微生物作用下直接由煙嘧磺隆產(chǎn)生的。但是在本研究中,檢測(cè)到的2-氨基-4,6-二甲氧基嘧啶并不能在菌株LAM-M5的作用下直接獲得,而是由中間產(chǎn)物N-(4,6-二甲氧基嘧啶-2-基氨基甲酰基)-1-(甲基亞氨基)酰胺鍵斷裂后生成的。表明菌株LAM-M5對(duì)煙嘧磺隆的降解過程和機(jī)制不同于糞產(chǎn)堿桿菌和粘質(zhì)沙雷氏菌。

在以前的報(bào)道中,對(duì)黃籃狀真菌(Talaromyces flavusLZM1)[21]和臘狀芽孢桿菌(Bacillus cereus)[32]降解煙嘧磺隆的代謝產(chǎn)物進(jìn)行了比較深入的研究。這兩個(gè)菌在降解煙嘧磺隆過程中均能直接產(chǎn)生259.44 m/z(2-氨基磺酰基-N,N-二甲基煙酰胺),304.18 m/z(N-(4,6-二甲氧基嘧啶-2-基氨基甲酰基)-1-(甲基亞氨基)甲磺酰胺)和另外一個(gè)346m/z(2-(1-(4,6-二甲氧基-嘧啶-2-)-脲基)-N,N-二甲基-煙酰胺)產(chǎn)物,說明這兩個(gè)菌均能通過3種途徑降解煙嘧磺隆。而在本研究中,雖然我們嘗試不同時(shí)間取樣和改變檢測(cè)條件,但是346 m/z這個(gè)產(chǎn)物卻始終檢測(cè)不到,說明菌株LAM-M5對(duì)煙嘧磺隆的降解過程和機(jī)制不同于黃籃狀真菌和臘狀芽孢桿菌。

同時(shí)監(jiān)測(cè)到該菌株與煙嘧磺隆共培養(yǎng)過程中,體系的pH值從7.0減少到3.0,環(huán)境酸化,而煙嘧磺隆在酸性條件下極不穩(wěn)定,從而造成煙嘧磺隆的脲橋發(fā)生斷裂,推測(cè)這可能是一種微生物自我保護(hù)機(jī)制。通過對(duì)菌株的全基因組信息分析,發(fā)現(xiàn)該菌株的基因序列中含有大量已報(bào)道的參與煙嘧磺隆降解過程的功能基因,如水解酶[19]、氧化酶[37]、酯酶[38]、過氧化氫酶[39]等。

4 結(jié)論

從活性污泥中獲得了一株煙嘧磺隆的高效降解菌,初步鑒定為Chryseobacterium lacusLAM-M5,該菌最適的降解條件為35℃,pH 6.0,接種量10%時(shí)菌株對(duì)50 mg/L的煙嘧磺隆降解率最高可達(dá) 92.39%。菌株在以葡萄糖為碳源時(shí),通過產(chǎn)生大量的L-蘋果酸導(dǎo)致體系內(nèi)pH值下降,造成煙嘧磺隆脲橋斷裂。菌株Chryseobacterium lacusLAM-M5對(duì)煙嘧磺隆具有較高的降解能力。

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