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FRA-2 mRNA 表達及DNA 甲基化水平與代謝綜合征的相關性研究

2022-05-05 08:51:24杜晴晴侯澤鑫曹國磊李思源
上海交通大學學報(醫學版) 2022年3期
關鍵詞:因素水平分析

杜晴晴,侯澤鑫,李 軍,胡 穎,曹國磊,李思源

1.石河子大學醫學院,石河子 832002;2.石河子大學醫學院第一附屬醫院內分泌代謝科,石河子 832002;3.新疆醫科大學第四附屬醫院神志科,烏魯木齊 830099;4.新疆醫科大學附屬腫瘤醫院呼吸神經內科,烏魯木齊 830011

近年來,西方生活方式在全球范圍內日益流行,代謝綜合征(metabolic syndrome,MS)的患病率也隨之上升,其在一些發展中國家城市人口中的患病率往往高于發達國家,已成為一個全球性的威脅健康的重要問題。MS 是肥胖或超重、高血糖、胰島素抵抗等多種代謝異常構成的復雜的代謝異常癥候群。MS促進冠狀動脈粥樣硬化性心臟病、卒中及惡性腫瘤等疾病的發生,這些疾病造成的醫療保健成本和潛在的經濟活動損失成本,數以萬億計[1-2]。

DNA甲基化是一種重要的表觀遺傳修飾方式。有研究[3]發現,DNA 甲基化可能通過在啟動子區域的CpG 序列添加甲基來發揮作用,參與哺乳動物發育、代謝、穩態調節及肥胖和多種疾病的發生。DNA甲基化也可能與MS的發生有關[4]。Fos相關抗原-2(Fosrelated antigen-2,FRA-2)屬于轉錄因子激活蛋白1(activator protein-1,AP-1)家族,存在于動物的多種組織和細胞,參與細胞增殖、分化等過程;FRA-2的異常表達可導致疾病的發生和發展[5]。FRA-2參與哺乳動物能量平衡、糖脂代謝及胰島素抵抗的調節,與MS、糖尿病、動脈粥樣硬化等的發生有關[6-9]。到目前為止,FRA-2mRNA及DNA甲基化水平與MS的相關關系尚不清楚。本研究擬探討FRA-2mRNA及DNA甲基化水平與MS的關系,探究MS發生的分子機制以尋找MS防治的潛在靶點。

1 對象和方法

1.1 研究對象

選取2020年6月—2021年6月石河子大學醫學院第一附屬醫院內分泌代謝科就診的患者,根據《中國2 型糖尿病防治指南(2020 年版)》[10]對MS 的定義,將有MS 危險因素(高血糖、高血脂、高血壓、肥胖)≥3 項的患者納入MS 組(n=80),有MS 危險因素1~2 項的患者納入非MS 組(n=80)。MS 的診斷標準滿足以下≥3 項:①腰圍(waist circumference,WC)女性≥85 cm,男性≥90 cm。②確診高血壓,或收縮壓(systolic blood pressure,SBP) ≥130 mmHg或舒張壓(diastolic blood pressure,DBP)≥85 mmHg(1 mmHg=0.133 kPa)。③高密度脂蛋白膽固醇(high density lipoprotein cholesterol,HDL-C)<1.04 mmol/L。④三酰甘油(triacylglycerol,TAG) ≥1.7 mmol/L。⑤確診2 型糖尿病或空腹血糖(fasting plasma glucose,FPG)≥6.1 mmol/L。另外選取同期的健康體檢者納入對照組(無MS 危險因素,n=80)。各組排除具有以下情況人群:①各種嚴重肝、腎、心血管疾病者。②長期服用激素、免疫抑制劑者。③近期有外傷或手術者。④妊娠及哺乳期者。收集患者年齡、性別、體質量指數(body mass index,BMⅠ)等資料。本研究經石河子大學醫學院第一附屬醫院醫學倫理委員會批準(倫理審查號:KJ2020-142-01),所有參與的患者均簽署知情同意書。

1.2 研究方法

1.2.1 標本采集及生化檢測 所有研究對象均禁食12~14 h,晨起空腹抽取靜脈血2 管,每管約2 mL。一管為EDTA 抗凝管,備以后續DNA 及RNA 提取;另一管為真空采血管,經過混勻后9 000×g離心10 min,離心管收集上清液備用,然后均置于-80 ℃冰箱中凍存。使用全自動生化分析儀(AU5800,美國貝克曼公司)測定FPG、TAG、總膽固醇(total cholesterol,TC)、低密度脂蛋白膽固醇(low density lipoprotein cholesterol, LDL-C)、HDL-C,使用全自動電化學發光免疫分析儀(COBAS e 601,德國羅氏) 測定空腹胰島素(fasting serum insulin,FⅠNS)。使用穩態模型評估法來計算胰島素抵抗指數(homeostasis model assessment-insulin resistance,HOMA-ⅠR),公式為HOMA-ⅠR=FⅠNS×FPG/22.5。

1.2.2 RT-PCR 方法檢測FRA-2mRNA 表達 TRⅠzol法提取RNA,后按照cDNA 第一鏈合成試劑盒(美國APExBⅠO 公司) 說明書合成cDNA 模板,進行PCR 擴增。反應條件為:94 ℃4 min,72 ℃2 min,然后94℃20 s、56 ℃30 s、72 ℃60 s,進行35 個循環。加入1 對內參(β-actin)的特異性引物,同時擴增內參DNA(引物序列見表1)。使用GelDoc EZ 全自動凝膠成像分析系統(美國UVB公司)和2-ΔΔCT法分析FRA-2mRNA相對表達水平。

1.2.3 MALDⅠ-TOF-MS法檢測FRA-2DNA 甲基化水平 取200 μL血液樣本,提取DNA,使用NanoDrop分光光度儀定量檢測基因組DNA 的濃度及純度,以保證其DNA 濃度>50 ng/μL,純度[D(260 nm)/D(280 nm)]位于1.7~2.0 之間。依據EZ DNA 甲基化修飾處理試劑盒(D5001,美國Sequenom 公司)以及美國Sequenom 公司推薦的方式對基因組DNA 進行亞硫酸氫鹽修飾,反應條件為:95 ℃30 s,50 ℃15 min,進行20 個循環。PCR 擴增DNA,反應條件如下:94 ℃預熱4 min,72 ℃退火3 min,接下來45個循環(94 ℃20 s,56 ℃30 s,72 ℃1 min)。PCR產物在384-pad光譜芯片(美國Sequenom公司)上測定。引物序列見表1。

表1 PCR引物序列Tab 1 Primer sequences for PCR

使用MassARRAY 質譜儀(美國SEQUENOM公司)收集質譜圖,使用EpiTYPER v1.0.5 軟件生成各CpG 單元的甲基化數據。經由對比甲基化峰與非甲基化峰的強度來計算所檢測基因各CpG 單元相對的甲基化率。共檢測了10 個CpG 單元,分別為CpG 1、CpG 3、CpG 4.5、CpG 6.7、CpG 8、CpG 9.10、CpG 11、CpG 12.13.14、CpG 15.16.17、CpG 19。

1.3 統計學方法

采用SPSS 25.0 軟件進行數據分析。符合正態分布的定量資料以±s表示,方差分析示3 組間年齡差異有統計學意義,余資料采用協方差分析以校正年齡對組間臨床指標的影響;非正態分布定量資料以M(Q1,Q3)表示,采用Kruskal-WallisH檢驗;每增加1個危險因素,FRA-2DNA甲基化水平變化量采用線性回歸分析;指標間相關關系采用Spearman 相關分析。P<0.05為差異有統計學意義。

2 結果

2.1 組間一般資料比較

Kruskal-WallisH檢驗顯示,MS 組年齡高于對照組及非MS 組(P<0.05)。使用協方差分析校正年齡對組間臨床指標的影響后,發現MS 組BMⅠ、WC、DBP、SBP、FPG、TAG、TC、LDL-C、HOMA-ⅠR均高于對照組及非MS 組(P<0.05),HDL-C 低于對照組及非MS組(P<0.05)。結果見表2。

表2 3組間一般及臨床資料比較Tab 2 Comparison of general and clinical data among the three groups

2.2 組間FRA-2 mRNA表達水平比較

與對照組及非MS 組相比,MS 組FRA-2mRNA表達水平降低(均P=0.000)(圖1)。

圖1 3組間FRA-2 mRNA相對表達水平比較Fig 1 Comparison of relative expression levels of FRA-2 mRNA among the three groups

2.3 組間FRA-2 DNA甲基化水平比較

協方差分析結果(表3、圖2)顯示:與對照組相比,非MS 組及MS 組CpG 1(P=0.014,P=0.016)、CpG 3 (P=0.006,P=0.000)、CpG 12.13.14 (均P=0.000)、CpG 19(均P=0.000)甲基化水平上升;與非MS 組相比,MS 組CpG 4.5、CpG 6.7、CpG 8、CpG 9.10、CpG 15.16.17甲基化水平上升(均P=0.000)。

圖2 FRA-2 DNA甲基化水平聚類分層Fig 2 FRA-2 DNA methylation level clustering stratification

表3 各CpG單元DNA甲基化水平比較Tab 3 Comparison of DNA methylation levels in each CpG unit

2.4 FRA-2 DNA 甲基化水平與MS 危險因素個數的關系

以FRA-2DNA 甲基化水平(10 個CpG 單元的平均甲基化率)為因變量,以MS 的危險因素個數為自變量進行線性回歸分析。結果(圖3)顯示,MS 危險因素個數與FRA-2DNA 甲基化水平呈正相關(β=0.012,P=0.000),即危險因素每增加1 個,FRA-2DNA甲基化水平上升0.012%。

圖3 FRA-2 DNA甲基化水平與MS危險因素個數的關系Fig 3 Relationship between FRA-2 DNA methylation level and the number of MS risk factors

2.5 FRA-2 DNA 甲基化水平與MS 危險因素的相關性分析

Spearman 相關分析結果(表4)顯示,CpG 3、CpG 4.5、 CpG 6.7、 CpG 8、 CpG 9.10、 CpG 12.13.14、CpG 19 甲基化水平均與WC、SBP、DBP、FPG、TAG 呈正相關;CpG 1 和CpG 15.16.17 甲基化水平與WC、DBP、TAG 呈正相關;CpG 1、CpG 3、CpG 4.5、CpG 8、CpG 9.10、CpG 12.13.14、CpG 19甲基化水平與HDL-C呈負相關(均P<0.05)。

表4 FRA-2 DNA甲基化水平與MS危險因素的相關性分析Tab 4 Correlation analysis between FRA-2 DNA methylation level and MS risk factors

2.6 FRA-2 DNA甲基化水平與mRNA表達的相關性分析

Spearman相關分析的結果(圖4)所示,FRA-2DNA甲基化水平(10個CpG單元的平均甲基化率)與FRA-2mRNA表達水平呈負相關(r=-0.607,P=0.000)。

圖4 FRA-2 DNA甲基化水平與mRNA表達水平的相關性Fig 4 Correlation between FRA-2 DNA methylation level and mRNA expression level

3 討論

DNA 甲基化是一種重要的修飾方式,可以調控基因表達,在不改變分子一級結構的前提下發揮重要的生物學作用,其與高血糖、高血壓等心血管疾病的危險因素增多有關[11]。既往研究[12]發現,FRA-2蛋白參與了糖脂代謝紊亂及MS 的發生。目前關于FRA-2mRNA及DNA甲基化表達水平與MS相關性的報道較少。

趙天明等[13]通過流行病學分析發現,隨年齡的增加MS 的患病率上升。本研究結果顯示,與對照組及非MS 組相比,MS 組年齡更高;可能是由于隨著年齡增加,機體器官功能有所減退,MS 危險因素的成分增加,患病概率增大。CHⅠURAZZⅠ等[14]研究顯示,MS 人群表現為中心性肥胖、高血壓、高血糖、高血脂及胰島素抵抗的特征,與對照組及非MS組比較,MS 組WC、DBP、SBP、FPG、TAG、TC、LDL-C、HOMA-ⅠR 上升,HDL-C 降低;我們的研究數據與該研究相似。

通過RT-PCR 對研究對象FRA-2mRNA 進行檢測發現,MS 組FRA-2mRNA 表達水平顯著低于對照組及非MS 組,提示MS 的發生發展可能與FRA-2mRNA 表達下調有關。SAMBLAS 等[4]的研究發現,甲基化參與肥胖人群代謝及循環紊亂,缺氧誘導因子3A(hypoxia inducible factor 3A,HIF3A)、胰島素樣生長因子結合蛋白3 (insulin-like growth factor binding protein-3,IGFBP-3)、固醇調節元件結合轉錄因子1 (sterol regulatory element binding factor 1,SREBF1)、腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor,TNF)、 晝夜節律鐘(clock circadian regulator,CLOCK)等基因的甲基化水平可作為預測和評估MS的重要標志。我們進一步用MALDⅠ-TOF-MS 對外周血中FRA-2DNA甲基化水平進行檢測。結果表明,與對照組相比,MS 組多個CpG 單元甲基化水平上升,可以推測在MS發生中,FRA-2DNA 高甲基化可能起到重要作用。相關分析結果顯示,FRA-2基因9 個CpG 單元甲基化水平與WC、DBP、TAG 呈正相關,7 個CpG 單元甲基化水平與SBP 及FPG 呈正相關,7 個CpG 單元甲基化水平與HDL-C 呈負相關;推測FRA-2可能通過DNA 高甲基化的形式參與血糖、血脂、血壓等的調節,進而參與MS 發生發展的過程。既往研究[15]發現,FRA-2與糖尿病患者的FPG、TG的調節有關;本研究結果與之相似。

此外,本研究還發現,FRA-2DNA高甲基水平與MS 人群SBP 及DBP 升高之間存在相關性;該結果與以往研究[12]不同,可能與納入研究對象危險因素個數的差異性或不同的遺傳背景有關。近年來,有研究[16-17]報道,DNA甲基化可通過影響腎素-血管緊張素-醛固酮系統(renin-angiotensin-aldosteronesystem,RAAS)參與高血壓的發生,但FRA-2是否經該通路發揮作用有待進一步研究。全貞玉等[18]認為,MS的發生及嚴重程度與危險因素個數有關。本研究通過線性分析發現,危險因素每增加1個,FRA-2DNA甲基化水平上升0.012%,提示MS 患者FRA-2基因甲基化程度可能受危險因素個數的影響。XⅠE 等[19]研究發現,外周血單個核細胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)中,DNA 甲基化水平對mRNA 表達有調節作用,DNA可通過高甲基化的方式下調mRNA的表達,從而參與疾病的發生。本研究發現FRA-2DNA甲基化水平與mRNA表達呈負相關,提示FRA-2基因在MS 中可能具有相似的致病機制,但其具體的分子機制及信號通路,還需要進一步探索。

綜上所述,本研究發現FRA-2基因甲基化水平與MS發生具有一定的相關性,DNA 甲基化水平增高從而下調mRNA 表達可能在MS 發生中發揮作用。未來需要設計更大樣本量的多中心研究及前瞻性研究,以明確FRA-2與MS 發生的因果關系及FRA-2參與MS發生的機制。

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